MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-031

Total Repeats: 2221

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021837	CAAAA	2	10	700	709	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021837	CACCC	2	10	1221	1230	20 %	0 %	0 %	80 %	525916940
3	NC_021837	CAAGT	2	10	1660	1669	40 %	20 %	20 %	20 %	525916940
4	NC_021837	CACTG	2	10	2002	2011	20 %	20 %	20 %	40 %	525916940
5	NC_021837	AATCA	2	10	2037	2046	60 %	20 %	0 %	20 %	525916940
6	NC_021837	GCTAT	2	10	2271	2280	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_021837	AAATT	2	10	2725	2734	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021837	TGAAC	2	10	5255	5264	40 %	20 %	20 %	20 %	525916943
9	NC_021837	GTTTG	2	10	7029	7038	0 %	60 %	40 %	0 %	525916945
10	NC_021837	TATTT	2	10	8239	8248	20 %	80 %	0 %	0 %	525916946
11	NC_021837	TTTGA	2	10	15649	15658	20 %	60 %	20 %	0 %	525916954
12	NC_021837	TTTTG	2	10	16977	16986	0 %	80 %	20 %	0 %	525916957
13	NC_021837	AATTA	2	10	16995	17004	60 %	40 %	0 %	0 %	525916957
14	NC_021837	AATGG	2	10	18031	18040	40 %	20 %	40 %	0 %	525916958
15	NC_021837	TACTT	2	10	19306	19315	20 %	60 %	0 %	20 %	525916958
16	NC_021837	ATATT	2	10	21397	21406	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021837	TTACA	2	10	22590	22599	40 %	40 %	0 %	20 %	525919446
18	NC_021837	TATAA	2	10	23302	23311	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021837	TTTAA	2	10	27743	27752	40 %	60 %	0 %	0 %	525919448
20	NC_021837	AAAAT	2	10	28530	28539	80 %	20 %	0 %	0 %	525916965
21	NC_021837	ATGTC	2	10	29382	29391	20 %	40 %	20 %	20 %	525916966
22	NC_021837	AGCCT	2	10	32141	32150	20 %	20 %	20 %	40 %	525916968
23	NC_021837	AACAA	2	10	32541	32550	80 %	0 %	0 %	20 %	525916968
24	NC_021837	TTTTC	2	10	32636	32645	0 %	80 %	0 %	20 %	525916968
25	NC_021837	GATTG	2	10	34672	34681	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021837	ATTGT	2	10	35175	35184	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021837	AAGAA	2	10	39078	39087	80 %	0 %	20 %	0 %	525916976
28	NC_021837	CGTTT	2	10	39516	39525	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_021837	GATTT	2	10	40047	40056	20 %	60 %	20 %	0 %	525919449
30	NC_021837	GGTAA	2	10	40593	40602	40 %	20 %	40 %	0 %	525919450
31	NC_021837	GATTT	2	10	40724	40733	20 %	60 %	20 %	0 %	525919450
32	NC_021837	CATAG	2	10	41022	41031	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_021837	AAAAT	2	10	41186	41195	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021837	ACTAT	2	10	42894	42903	40 %	40 %	0 %	20 %	525919451
35	NC_021837	GCATG	2	10	46130	46139	20 %	20 %	40 %	20 %	525916978
36	NC_021837	TTCAG	2	10	49419	49428	20 %	40 %	20 %	20 %	525916981
37	NC_021837	AAGAA	2	10	50555	50564	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021837	ACCGG	2	10	53877	53886	20 %	0 %	40 %	40 %	525916984
39	NC_021837	AATAA	2	10	54929	54938	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021837	AATTA	2	10	57054	57063	60 %	40 %	0 %	0 %	525916987
41	NC_021837	TTTTC	2	10	57135	57144	0 %	80 %	0 %	20 %	525916987
42	NC_021837	TTTGT	2	10	57145	57154	0 %	80 %	20 %	0 %	525916987
43	NC_021837	ACCAA	2	10	60516	60525	60 %	0 %	0 %	40 %	525916990
44	NC_021837	TGGAC	2	10	60838	60847	20 %	20 %	40 %	20 %	525916990
45	NC_021837	GCACA	2	10	61347	61356	40 %	0 %	20 %	40 %	525916990
46	NC_021837	TATTC	2	10	63284	63293	20 %	60 %	0 %	20 %	525916992
47	NC_021837	GATAA	2	10	65257	65266	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021837	GCAAA	2	10	65477	65486	60 %	0 %	20 %	20 %	525916994
49	NC_021837	TATCG	2	10	66340	66349	20 %	40 %	20 %	20 %	525919457
50	NC_021837	TTATT	2	10	67216	67225	20 %	80 %	0 %	0 %	525919457
51	NC_021837	ATTTT	2	10	67350	67359	20 %	80 %	0 %	0 %	525919457
52	NC_021837	AGGAA	2	10	72342	72351	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021837	TCCGT	2	10	73505	73514	0 %	40 %	20 %	40 %	525916998
54	NC_021837	CATCC	2	10	77758	77767	20 %	20 %	0 %	60 %	525917002
55	NC_021837	TAAAG	2	10	78579	78588	60 %	20 %	20 %	0 %	525917002
56	NC_021837	TTTCC	2	10	79724	79733	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_021837	TTTCA	2	10	80316	80325	20 %	60 %	0 %	20 %	525917003
58	NC_021837	CCAAA	2	10	80870	80879	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_021837	TTTCT	2	10	82276	82285	0 %	80 %	0 %	20 %	525919461
60	NC_021837	CTATA	2	10	84110	84119	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_021837	ATTTT	2	10	84400	84409	20 %	80 %	0 %	0 %	525917005
62	NC_021837	CACCT	2	10	87301	87310	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_021837	ACCAG	2	10	88430	88439	40 %	0 %	20 %	40 %	525917011
64	NC_021837	TAGCT	2	10	88517	88526	20 %	40 %	20 %	20 %	525917011
65	NC_021837	CCCTA	2	10	91645	91654	20 %	20 %	0 %	60 %	525917013
66	NC_021837	TCATT	2	10	92010	92019	20 %	60 %	0 %	20 %	525917013
67	NC_021837	CTTTC	2	10	95154	95163	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_021837	TCGAT	2	10	96282	96291	20 %	40 %	20 %	20 %	525917016
69	NC_021837	TTTGT	2	10	98204	98213	0 %	80 %	20 %	0 %	525917019
70	NC_021837	AAAAT	2	10	98250	98259	80 %	20 %	0 %	0 %	525917019
71	NC_021837	TGTTT	2	10	99093	99102	0 %	80 %	20 %	0 %	525917020
72	NC_021837	AATTC	2	10	99943	99952	40 %	40 %	0 %	20 %	525917020
73	NC_021837	TCGTA	2	10	100527	100536	20 %	40 %	20 %	20 %	525917020
74	NC_021837	ATCGT	2	10	101197	101206	20 %	40 %	20 %	20 %	525917021
75	NC_021837	CCGTC	2	10	102800	102809	0 %	20 %	20 %	60 %	525917021
76	NC_021837	TAAGT	2	10	104220	104229	40 %	40 %	20 %	0 %	525917022
77	NC_021837	TATAC	2	10	106231	106240	40 %	40 %	0 %	20 %	525917026
78	NC_021837	TTCCG	2	10	106753	106762	0 %	40 %	20 %	40 %	525917026
79	NC_021837	TTTTA	2	10	107223	107232	20 %	80 %	0 %	0 %	525919463
80	NC_021837	ACGTC	2	10	109199	109208	20 %	20 %	20 %	40 %	525917029
81	NC_021837	AAAAT	2	10	111015	111024	80 %	20 %	0 %	0 %	525917032
82	NC_021837	GATTC	2	10	111134	111143	20 %	40 %	20 %	20 %	525917032
83	NC_021837	GTTTA	2	10	112913	112922	20 %	60 %	20 %	0 %	525917035
84	NC_021837	TTGCT	2	10	114061	114070	0 %	60 %	20 %	20 %	525917035
85	NC_021837	GCATC	2	10	114893	114902	20 %	20 %	20 %	40 %	525917036
86	NC_021837	AATTT	2	10	118229	118238	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021837	TGATT	2	10	118617	118626	20 %	60 %	20 %	0 %	525917039
88	NC_021837	TAAAA	2	10	120227	120236	80 %	20 %	0 %	0 %	525919465
89	NC_021837	TTATT	2	10	127026	127035	20 %	80 %	0 %	0 %	525917046
90	NC_021837	CCAGT	2	10	131012	131021	20 %	20 %	20 %	40 %	525919469
91	NC_021837	ATTTC	2	10	131538	131547	20 %	60 %	0 %	20 %	525919469
92	NC_021837	CAGCC	2	10	132267	132276	20 %	0 %	20 %	60 %	525919470
93	NC_021837	TGAAG	2	10	132841	132850	40 %	20 %	40 %	0 %	525919470
94	NC_021837	TTTTA	2	10	134043	134052	20 %	80 %	0 %	0 %	525919472
95	NC_021837	GTTTC	2	10	134542	134551	0 %	60 %	20 %	20 %	525919473
96	NC_021837	TGTTT	2	10	134687	134696	0 %	80 %	20 %	0 %	525919473
97	NC_021837	TTGTT	2	10	138213	138222	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021837	ATCAC	2	10	139642	139651	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_021837	GTGAA	2	10	146860	146869	40 %	20 %	40 %	0 %	525917061
100	NC_021837	GGCAA	2	10	147885	147894	40 %	0 %	40 %	20 %	525917062
101	NC_021837	CTTAA	2	10	148958	148967	40 %	40 %	0 %	20 %	525917064
102	NC_021837	AATGG	2	10	149131	149140	40 %	20 %	40 %	0 %	525917064
103	NC_021837	CAACC	2	10	149498	149507	40 %	0 %	0 %	60 %	525917065
104	NC_021837	TGAAG	2	10	150801	150810	40 %	20 %	40 %	0 %	525917066
105	NC_021837	AATTT	2	10	152807	152816	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021837	AGTTT	2	10	153167	153176	20 %	60 %	20 %	0 %	525919475
107	NC_021837	CTGTT	2	10	153373	153382	0 %	60 %	20 %	20 %	525919475
108	NC_021837	TCATT	2	10	154374	154383	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_021837	TTTTA	2	10	154788	154797	20 %	80 %	0 %	0 %	525919478
110	NC_021837	CTGTA	2	10	156283	156292	20 %	40 %	20 %	20 %	525919479
111	NC_021837	TGATA	2	10	158820	158829	40 %	40 %	20 %	0 %	525919479
112	NC_021837	AAGTT	2	10	160327	160336	40 %	40 %	20 %	0 %	525919479
113	NC_021837	TTGGA	2	10	160558	160567	20 %	40 %	40 %	0 %	525919479
114	NC_021837	AATCT	2	10	162377	162386	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_021837	AAATG	2	10	162558	162567	60 %	20 %	20 %	0 %	525919481
116	NC_021837	AACTA	2	10	162774	162783	60 %	20 %	0 %	20 %	525919481
117	NC_021837	ATTTT	2	10	163474	163483	20 %	80 %	0 %	0 %	525919481
118	NC_021837	TATTT	2	10	164729	164738	20 %	80 %	0 %	0 %	525917069
119	NC_021837	ATTTC	2	10	169869	169878	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_021837	TTGGC	2	10	170758	170767	0 %	40 %	40 %	20 %	525917070
121	NC_021837	CTTGA	2	10	172102	172111	20 %	40 %	20 %	20 %	525917071
122	NC_021837	TCAAA	2	10	173395	173404	60 %	20 %	0 %	20 %	525917073
123	NC_021837	CACTT	2	10	176634	176643	20 %	40 %	0 %	40 %	525917075
124	NC_021837	ATTTC	2	10	177132	177141	20 %	60 %	0 %	20 %	525917075
125	NC_021837	TTTCT	2	10	178163	178172	0 %	80 %	0 %	20 %	525917076
126	NC_021837	CCCGT	2	10	178494	178503	0 %	20 %	20 %	60 %	525917077
127	NC_021837	AAGCA	2	10	178775	178784	60 %	0 %	20 %	20 %	525917077
128	NC_021837	CCATT	2	10	179984	179993	20 %	40 %	0 %	40 %	525917079
129	NC_021837	AAGTA	2	10	182698	182707	60 %	20 %	20 %	0 %	525919485
130	NC_021837	AGACT	2	10	184409	184418	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_021837	TTCAT	2	10	184997	185006	20 %	60 %	0 %	20 %	525919487
132	NC_021837	AAATA	2	10	186518	186527	80 %	20 %	0 %	0 %	525919488
133	NC_021837	AAACA	2	10	191299	191308	80 %	0 %	0 %	20 %	525917083
134	NC_021837	AAAGT	2	10	191411	191420	60 %	20 %	20 %	0 %	525917083
135	NC_021837	AACGA	2	10	191461	191470	60 %	0 %	20 %	20 %	525917083
136	NC_021837	CAAAA	2	10	195055	195064	80 %	0 %	0 %	20 %	525917085
137	NC_021837	TCAAA	2	10	195067	195076	60 %	20 %	0 %	20 %	525917085
138	NC_021837	ACCAA	2	10	195933	195942	60 %	0 %	0 %	40 %	525917086
139	NC_021837	ATCTA	2	10	196185	196194	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_021837	CAAAT	2	10	196225	196234	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_021837	TAACC	2	10	197052	197061	40 %	20 %	0 %	40 %	525917087
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151	NC_021837	TTTTC	2	10	206650	206659	0 %	80 %	0 %	20 %	525917094
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198	NC_021837	TTACC	2	10	282218	282227	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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