MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-031

Total Repeats: 67466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021837	A	6	6	22350	22355	100 %	0 %	0 %	0 %	525919446
502	NC_021837	CTA	2	6	22371	22376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525919446
503	NC_021837	TGAT	2	8	22389	22396	25 %	50 %	25 %	0 %	525919446
504	NC_021837	ATT	2	6	22397	22402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525919446
505	NC_021837	AAT	2	6	22409	22414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525919446
506	NC_021837	TA	3	6	22490	22495	50 %	50 %	0 %	0 %	525919446
507	NC_021837	TTACA	2	10	22590	22599	40 %	40 %	0 %	20 %	525919446
508	NC_021837	AAT	2	6	22604	22609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525919446
509	NC_021837	TACT	2	8	22610	22617	25 %	50 %	0 %	25 %	525919446
510	NC_021837	CT	3	6	22764	22769	0 %	50 %	0 %	50 %	525919446
511	NC_021837	ATTT	2	8	22791	22798	25 %	75 %	0 %	0 %	525919446
512	NC_021837	GAA	2	6	22859	22864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525919446
513	NC_021837	TCT	2	6	22871	22876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525919446
514	NC_021837	AAC	2	6	22877	22882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525919446
515	NC_021837	AC	3	6	22881	22886	50 %	0 %	0 %	50 %	525919446
516	NC_021837	CTC	2	6	22889	22894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525919446
517	NC_021837	ATA	2	6	22961	22966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525919446
518	NC_021837	A	7	7	22974	22980	100 %	0 %	0 %	0 %	525919446
519	NC_021837	T	6	6	23012	23017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021837	T	6	6	23059	23064	0 %	100 %	0 %	0 %	525916962
521	NC_021837	AAT	2	6	23092	23097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525916962
522	NC_021837	TTC	2	6	23138	23143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525916962
523	NC_021837	TCTT	2	8	23170	23177	0 %	75 %	0 %	25 %	525916962
524	NC_021837	T	6	6	23202	23207	0 %	100 %	0 %	0 %	525916962
525	NC_021837	GCA	2	6	23213	23218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525916962
526	NC_021837	T	6	6	23231	23236	0 %	100 %	0 %	0 %	525916962
527	NC_021837	CCT	2	6	23257	23262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_021837	TAA	2	6	23282	23287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_021837	TAAC	2	8	23289	23296	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
530	NC_021837	TATAA	2	10	23302	23311	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_021837	CTT	2	6	23330	23335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525916963
532	NC_021837	AGC	2	6	23341	23346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525916963
533	NC_021837	T	7	7	23369	23375	0 %	100 %	0 %	0 %	525916963
534	NC_021837	ATAA	2	8	23382	23389	75 %	25 %	0 %	0 %	525916963
535	NC_021837	AAT	2	6	23424	23429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525916963
536	NC_021837	AAT	2	6	23503	23508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525916963
537	NC_021837	ACA	2	6	23608	23613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525916963
538	NC_021837	ATGA	2	8	23633	23640	50 %	25 %	25 %	0 %	525916963
539	NC_021837	ACA	2	6	23693	23698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525916963
540	NC_021837	TCA	2	6	23729	23734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525916963
541	NC_021837	TAA	4	12	23765	23776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525916963
542	NC_021837	AGAA	2	8	23853	23860	75 %	0 %	25 %	0 %	525916963
543	NC_021837	TTCG	2	8	23918	23925	0 %	50 %	25 %	25 %	525916963
544	NC_021837	A	6	6	23942	23947	100 %	0 %	0 %	0 %	525916963
545	NC_021837	GTC	2	6	23998	24003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525916963
546	NC_021837	A	6	6	24025	24030	100 %	0 %	0 %	0 %	525916963
547	NC_021837	TGA	2	6	24031	24036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525916963
548	NC_021837	TCG	2	6	24086	24091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525916963
549	NC_021837	T	7	7	24102	24108	0 %	100 %	0 %	0 %	525916963
550	NC_021837	ATAA	2	8	24112	24119	75 %	25 %	0 %	0 %	525916963
551	NC_021837	AAT	3	9	24120	24128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525916963
552	NC_021837	CTAA	2	8	24187	24194	50 %	25 %	0 %	25 %	525916963
553	NC_021837	TAA	2	6	24243	24248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525916963
554	NC_021837	A	6	6	24247	24252	100 %	0 %	0 %	0 %	525916963
555	NC_021837	CTTTCT	2	12	24269	24280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525916963
556	NC_021837	AAAC	2	8	24284	24291	75 %	0 %	0 %	25 %	525916963
557	NC_021837	T	6	6	24453	24458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_021837	CAC	2	6	24660	24665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525916964
559	NC_021837	TCT	2	6	24734	24739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525916964
560	NC_021837	CTT	2	6	24768	24773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525916964
561	NC_021837	ACG	2	6	24886	24891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525916964
562	NC_021837	TCT	2	6	24944	24949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525916964
563	NC_021837	A	7	7	25043	25049	100 %	0 %	0 %	0 %	525916964
564	NC_021837	CTT	2	6	25054	25059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525916964
565	NC_021837	TTA	2	6	25095	25100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_021837	A	7	7	25105	25111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021837	T	6	6	25132	25137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_021837	T	7	7	25148	25154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_021837	GA	3	6	25157	25162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
570	NC_021837	TAC	2	6	25196	25201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_021837	TTA	2	6	25224	25229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_021837	A	7	7	25229	25235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_021837	A	6	6	25273	25278	100 %	0 %	0 %	0 %	525919447
574	NC_021837	CTT	2	6	25291	25296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525919447
575	NC_021837	ACA	2	6	25373	25378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525919447
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578	NC_021837	CTC	2	6	25549	25554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525919447
579	NC_021837	CTGT	2	8	25660	25667	0 %	50 %	25 %	25 %	525919447
580	NC_021837	TAC	2	6	25706	25711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525919447
581	NC_021837	AAG	2	6	25726	25731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525919447
582	NC_021837	AGC	2	6	25846	25851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525919447
583	NC_021837	AGA	2	6	25991	25996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525919447
584	NC_021837	CA	3	6	26118	26123	50 %	0 %	0 %	50 %	525919447
585	NC_021837	AGA	2	6	26225	26230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525919447
586	NC_021837	T	6	6	26241	26246	0 %	100 %	0 %	0 %	525919447
587	NC_021837	ATT	3	9	26248	26256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525919447
588	NC_021837	AAT	2	6	26271	26276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525919447
589	NC_021837	TTA	2	6	26384	26389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525919447
590	NC_021837	GAT	2	6	26433	26438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525919447
591	NC_021837	TAC	2	6	26453	26458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525919447
592	NC_021837	TTG	2	6	26515	26520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525919447
593	NC_021837	ATT	2	6	26537	26542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525919447
594	NC_021837	TTTG	2	8	26577	26584	0 %	75 %	25 %	0 %	525919447
595	NC_021837	CA	3	6	26663	26668	50 %	0 %	0 %	50 %	525919447
596	NC_021837	CT	3	6	26793	26798	0 %	50 %	0 %	50 %	525919447
597	NC_021837	ATT	2	6	26823	26828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525919447
598	NC_021837	AGT	2	6	26873	26878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525919447
599	NC_021837	TAA	3	9	26936	26944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525919447
600	NC_021837	AAT	2	6	26999	27004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525919447
601	NC_021837	CAA	2	6	27005	27010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525919447
602	NC_021837	TAA	2	6	27035	27040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_021837	CTA	2	6	27054	27059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_021837	TTG	2	6	27114	27119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525919448
605	NC_021837	GGAA	2	8	27130	27137	50 %	0 %	50 %	0 %	525919448
606	NC_021837	ATT	2	6	27160	27165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525919448
607	NC_021837	TAG	2	6	27184	27189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525919448
608	NC_021837	TTA	2	6	27231	27236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525919448
609	NC_021837	CAA	2	6	27272	27277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525919448
610	NC_021837	CAA	2	6	27313	27318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525919448
611	NC_021837	A	6	6	27342	27347	100 %	0 %	0 %	0 %	525919448
612	NC_021837	CAG	2	6	27348	27353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525919448
613	NC_021837	ATT	2	6	27367	27372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525919448
614	NC_021837	TC	3	6	27385	27390	0 %	50 %	0 %	50 %	525919448
615	NC_021837	GCT	2	6	27418	27423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525919448
616	NC_021837	AGA	2	6	27565	27570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525919448
617	NC_021837	TAT	2	6	27573	27578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525919448
618	NC_021837	A	6	6	27583	27588	100 %	0 %	0 %	0 %	525919448
619	NC_021837	GAAAAA	2	12	27628	27639	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525919448
620	NC_021837	GAAA	2	8	27683	27690	75 %	0 %	25 %	0 %	525919448
621	NC_021837	CAT	2	6	27700	27705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525919448
622	NC_021837	TGT	2	6	27715	27720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525919448
623	NC_021837	TTTAA	2	10	27743	27752	40 %	60 %	0 %	0 %	525919448
624	NC_021837	ATGA	2	8	27836	27843	50 %	25 %	25 %	0 %	525919448
625	NC_021837	AGA	2	6	27853	27858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525919448
626	NC_021837	AAG	2	6	27888	27893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525919448
627	NC_021837	TAA	2	6	27925	27930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525919448
628	NC_021837	ATT	2	6	27958	27963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525919448
629	NC_021837	AGT	2	6	27977	27982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525919448
630	NC_021837	ATTC	2	8	27997	28004	25 %	50 %	0 %	25 %	525919448
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