MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes J1-220

Total Repeats: 69281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021830	ACAT	2	8	24718	24725	50 %	25 %	0 %	25 %	525732813
502	NC_021830	ACAGTA	2	12	24852	24863	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525732814
503	NC_021830	TTA	2	6	24865	24870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732814
504	NC_021830	AGT	2	6	24872	24877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732814
505	NC_021830	ATT	2	6	24924	24929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732814
506	NC_021830	T	6	6	25010	25015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021830	AGG	2	6	25034	25039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021830	GGC	2	6	25042	25047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_021830	TGC	2	6	25058	25063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_021830	A	7	7	25078	25084	100 %	0 %	0 %	0 %	525732815
511	NC_021830	TACT	2	8	25100	25107	25 %	50 %	0 %	25 %	525732815
512	NC_021830	GAA	4	12	25197	25208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732815
513	NC_021830	AAAACA	2	12	25227	25238	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	525732815
514	NC_021830	TAG	2	6	25270	25275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732815
515	NC_021830	GAT	2	6	25290	25295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732815
516	NC_021830	CAG	2	6	25345	25350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525732815
517	NC_021830	AGA	2	6	25382	25387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732815
518	NC_021830	GCATGG	2	12	25408	25419	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525732815
519	NC_021830	AAG	2	6	25471	25476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732815
520	NC_021830	ATT	2	6	25624	25629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021830	GTT	2	6	25637	25642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021830	TTA	2	6	25643	25648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021830	CAAAG	2	10	25667	25676	60 %	0 %	20 %	20 %	525732816
524	NC_021830	T	6	6	25709	25714	0 %	100 %	0 %	0 %	525732816
525	NC_021830	GTT	2	6	25730	25735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525732816
526	NC_021830	ACA	2	6	25842	25847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525732816
527	NC_021830	TTG	2	6	25886	25891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525732816
528	NC_021830	AGA	2	6	25928	25933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732816
529	NC_021830	ACG	2	6	25942	25947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525732816
530	NC_021830	ATA	2	6	25948	25953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525732816
531	NC_021830	A	6	6	25987	25992	100 %	0 %	0 %	0 %	525732816
532	NC_021830	ACT	2	6	26000	26005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525732816
533	NC_021830	GATA	2	8	26027	26034	50 %	25 %	25 %	0 %	525732816
534	NC_021830	AGC	2	6	26036	26041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525732816
535	NC_021830	AAG	2	6	26101	26106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732816
536	NC_021830	AAT	2	6	26133	26138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_021830	AT	3	6	26167	26172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_021830	AGG	2	6	26245	26250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_021830	A	7	7	26264	26270	100 %	0 %	0 %	0 %	525732817
540	NC_021830	AAG	2	6	26278	26283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732817
541	NC_021830	CAG	2	6	26299	26304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525732817
542	NC_021830	CAT	2	6	26360	26365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525732817
543	NC_021830	TTA	2	6	26413	26418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732817
544	NC_021830	TGT	2	6	26423	26428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525732817
545	NC_021830	CGTT	2	8	26448	26455	0 %	50 %	25 %	25 %	525732817
546	NC_021830	TCA	2	6	26461	26466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525732817
547	NC_021830	CCA	2	6	26475	26480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525732817
548	NC_021830	A	6	6	26496	26501	100 %	0 %	0 %	0 %	525732817
549	NC_021830	CAAA	2	8	26533	26540	75 %	0 %	0 %	25 %	525732817
550	NC_021830	GT	3	6	26687	26692	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
551	NC_021830	AGG	2	6	26711	26716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021830	CAAA	2	8	26773	26780	75 %	0 %	0 %	25 %	525732818
553	NC_021830	AGA	2	6	26792	26797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732818
554	NC_021830	A	7	7	26814	26820	100 %	0 %	0 %	0 %	525732818
555	NC_021830	A	6	6	26880	26885	100 %	0 %	0 %	0 %	525732818
556	NC_021830	CAA	2	6	26892	26897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525732818
557	NC_021830	TGT	2	6	26909	26914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525732818
558	NC_021830	AAG	2	6	26977	26982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732818
559	NC_021830	GCT	2	6	26988	26993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732818
560	NC_021830	A	6	6	27028	27033	100 %	0 %	0 %	0 %	525732818
561	NC_021830	GGTT	2	8	27042	27049	0 %	50 %	50 %	0 %	525732818
562	NC_021830	ATG	2	6	27081	27086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732818
563	NC_021830	TGC	2	6	27266	27271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732818
564	NC_021830	TAG	2	6	27277	27282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732818
565	NC_021830	CTG	3	9	27325	27333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732818
566	NC_021830	AAC	2	6	27365	27370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525732818
567	NC_021830	AGCT	2	8	27401	27408	25 %	25 %	25 %	25 %	525732818
568	NC_021830	T	6	6	27591	27596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_021830	TTG	2	6	27640	27645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_021830	AGA	2	6	27696	27701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732819
571	NC_021830	TTG	2	6	27740	27745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525732819
572	NC_021830	GAA	2	6	28021	28026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732819
573	NC_021830	CTAT	2	8	28066	28073	25 %	50 %	0 %	25 %	525732819
574	NC_021830	CTA	2	6	28118	28123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525732819
575	NC_021830	AAG	2	6	28142	28147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732819
576	NC_021830	AAG	2	6	28151	28156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732819
577	NC_021830	ACAA	2	8	28186	28193	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
578	NC_021830	A	6	6	28210	28215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_021830	TAT	2	6	28219	28224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_021830	GGA	2	6	28226	28231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_021830	GAA	2	6	28255	28260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732820
582	NC_021830	AAG	2	6	28277	28282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732820
583	NC_021830	GAA	3	9	28321	28329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732820
584	NC_021830	CTG	2	6	28340	28345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732820
585	NC_021830	CTGTAG	2	12	28352	28363	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525732820
586	NC_021830	CTG	3	9	28364	28372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732820
587	NC_021830	GCT	3	9	28378	28386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732820
588	NC_021830	CTG	2	6	28418	28423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732820
589	NC_021830	AAG	2	6	28481	28486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732820
590	NC_021830	AAG	2	6	28523	28528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732820
591	NC_021830	AGA	2	6	28539	28544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732820
592	NC_021830	GAA	2	6	28549	28554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732820
593	NC_021830	GAA	2	6	28570	28575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732820
594	NC_021830	T	6	6	28640	28645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_021830	AAGG	2	8	28729	28736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
596	NC_021830	TAC	2	6	28760	28765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525732821
597	NC_021830	ACG	2	6	28770	28775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525732821
598	NC_021830	ATT	2	6	28888	28893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732821
599	NC_021830	GTTG	2	8	28940	28947	0 %	50 %	50 %	0 %	525732821
600	NC_021830	TGG	2	6	29007	29012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525732821
601	NC_021830	GC	3	6	29023	29028	0 %	0 %	50 %	50 %	525732821
602	NC_021830	GAAA	2	8	29041	29048	75 %	0 %	25 %	0 %	525732821
603	NC_021830	ATT	2	6	29132	29137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732821
604	NC_021830	GGC	2	6	29249	29254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525732821
605	NC_021830	CTG	2	6	29259	29264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732821
606	NC_021830	GAA	2	6	29276	29281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732821
607	NC_021830	TATTT	2	10	29321	29330	20 %	80 %	0 %	0 %	525732821
608	NC_021830	A	7	7	29440	29446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_021830	AGA	2	6	29461	29466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_021830	TCTT	2	8	29548	29555	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
611	NC_021830	T	8	8	29567	29574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_021830	AAAT	2	8	29581	29588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_021830	GAC	2	6	29750	29755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525732822
614	NC_021830	ATT	2	6	29771	29776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732822
615	NC_021830	GGT	2	6	29837	29842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525732822
616	NC_021830	TG	3	6	29849	29854	0 %	50 %	50 %	0 %	525732822
617	NC_021830	GACAAT	2	12	29863	29874	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525732822
618	NC_021830	TTGG	2	8	29897	29904	0 %	50 %	50 %	0 %	525732822
619	NC_021830	TGTA	2	8	29925	29932	25 %	50 %	25 %	0 %	525732822
620	NC_021830	AC	3	6	30017	30022	50 %	0 %	0 %	50 %	525732822
621	NC_021830	ATTTG	2	10	30040	30049	20 %	60 %	20 %	0 %	525732822
622	NC_021830	TGG	2	6	30106	30111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525732822
623	NC_021830	ACC	2	6	30207	30212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525732822
624	NC_021830	AAG	2	6	30213	30218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732822
625	NC_021830	CTG	2	6	30270	30275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732822
626	NC_021830	A	6	6	30278	30283	100 %	0 %	0 %	0 %	525732822
627	NC_021830	CAA	2	6	30304	30309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525732822
628	NC_021830	GTGAGC	2	12	30318	30329	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525732822
629	NC_021830	ATT	2	6	30381	30386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732822
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631	NC_021830	TG	3	6	30497	30502	0 %	50 %	50 %	0 %	525732822
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