MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes J1-220

Total Repeats: 69281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021830	GTG	2	6	218563	218568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525732939
5002	NC_021830	TAA	2	6	218611	218616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525732939
5003	NC_021830	AAAT	2	8	218673	218680	75 %	25 %	0 %	0 %	525732939
5004	NC_021830	GTT	2	6	218716	218721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525732939
5005	NC_021830	TAAA	2	8	218748	218755	75 %	25 %	0 %	0 %	525732939
5006	NC_021830	ATC	2	6	218766	218771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525732939
5007	NC_021830	T	6	6	218821	218826	0 %	100 %	0 %	0 %	525732939
5008	NC_021830	CTT	2	6	218905	218910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525732939
5009	NC_021830	TCT	2	6	219066	219071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525732939
5010	NC_021830	T	6	6	219077	219082	0 %	100 %	0 %	0 %	525732939
5011	NC_021830	CAC	2	6	219091	219096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525732939
5012	NC_021830	TTCA	2	8	219113	219120	25 %	50 %	0 %	25 %	525732939
5013	NC_021830	CAG	2	6	219160	219165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525732939
5014	NC_021830	TAA	2	6	219194	219199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525732939
5015	NC_021830	T	7	7	219261	219267	0 %	100 %	0 %	0 %	525732939
5016	NC_021830	TAG	2	6	219340	219345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732939
5017	NC_021830	TAAA	2	8	219349	219356	75 %	25 %	0 %	0 %	525732939
5018	NC_021830	TTC	2	6	219368	219373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525732939
5019	NC_021830	CAAA	2	8	219394	219401	75 %	0 %	0 %	25 %	525732939
5020	NC_021830	TTTCG	2	10	219413	219422	0 %	60 %	20 %	20 %	525732939
5021	NC_021830	TACG	2	8	219499	219506	25 %	25 %	25 %	25 %	525732939
5022	NC_021830	GGT	2	6	219507	219512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525732939
5023	NC_021830	T	6	6	219572	219577	0 %	100 %	0 %	0 %	525732939
5024	NC_021830	TAA	2	6	219604	219609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525732939
5025	NC_021830	CAT	2	6	219638	219643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525732939
5026	NC_021830	ACAA	2	8	219684	219691	75 %	0 %	0 %	25 %	525732939
5027	NC_021830	CTG	2	6	219700	219705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732939
5028	NC_021830	GTC	2	6	219723	219728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732939
5029	NC_021830	TAAA	2	8	219731	219738	75 %	25 %	0 %	0 %	525732939
5030	NC_021830	GTCA	2	8	219764	219771	25 %	25 %	25 %	25 %	525732939
5031	NC_021830	TAT	2	6	219956	219961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732939
5032	NC_021830	TTG	2	6	219962	219967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525732939
5033	NC_021830	TGT	2	6	219990	219995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525732939
5034	NC_021830	CTT	2	6	220027	220032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525732939
5035	NC_021830	T	6	6	220052	220057	0 %	100 %	0 %	0 %	525732939
5036	NC_021830	ATT	2	6	220065	220070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732939
5037	NC_021830	CAG	2	6	220108	220113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525732939
5038	NC_021830	AG	3	6	220163	220168	50 %	0 %	50 %	0 %	525732939
5039	NC_021830	TTG	2	6	220235	220240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525732939
5040	NC_021830	ACG	2	6	220245	220250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525732939
5041	NC_021830	GAT	2	6	220267	220272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732939
5042	NC_021830	ATAA	2	8	220292	220299	75 %	25 %	0 %	0 %	525732939
5043	NC_021830	CG	3	6	220301	220306	0 %	0 %	50 %	50 %	525732939
5044	NC_021830	AAG	2	6	220318	220323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732939
5045	NC_021830	TGT	2	6	220341	220346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525732939
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5047	NC_021830	GAAG	2	8	220397	220404	50 %	0 %	50 %	0 %	525732939
5048	NC_021830	ACCC	2	8	220459	220466	25 %	0 %	0 %	75 %	525732939
5049	NC_021830	GAA	2	6	220587	220592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732939
5050	NC_021830	TGT	2	6	220652	220657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525732939
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5052	NC_021830	ATTC	2	8	220712	220719	25 %	50 %	0 %	25 %	525732939
5053	NC_021830	ACC	2	6	220724	220729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525732939
5054	NC_021830	AT	3	6	220785	220790	50 %	50 %	0 %	0 %	525732939
5055	NC_021830	T	7	7	220802	220808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_021830	ATA	2	6	220815	220820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_021830	TTG	2	6	220840	220845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_021830	TATC	2	8	220893	220900	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5059	NC_021830	TTTATT	2	12	220979	220990	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525732940
5060	NC_021830	CAG	2	6	221042	221047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525732940
5061	NC_021830	TGCAGC	2	12	221157	221168	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525732940
5062	NC_021830	CTG	2	6	221180	221185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732940
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5065	NC_021830	CTT	2	6	221231	221236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525732940
5066	NC_021830	CTTT	2	8	221240	221247	0 %	75 %	0 %	25 %	525732940
5067	NC_021830	GCT	2	6	221287	221292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732940
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5071	NC_021830	TCA	2	6	221590	221595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525732940
5072	NC_021830	TGT	2	6	221598	221603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525732940
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5075	NC_021830	CTT	2	6	221657	221662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525732940
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5079	NC_021830	TAA	3	9	221744	221752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525732940
5080	NC_021830	T	7	7	221762	221768	0 %	100 %	0 %	0 %	525732940
5081	NC_021830	CTA	2	6	221825	221830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525732940
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5083	NC_021830	T	6	6	221937	221942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_021830	A	7	7	221985	221991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_021830	A	7	7	221996	222002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_021830	AGT	2	6	222025	222030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_021830	TCA	2	6	222088	222093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_021830	AGC	2	6	222133	222138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_021830	AAT	2	6	222142	222147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_021830	GATT	2	8	222150	222157	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_021830	ATG	2	6	222163	222168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_021830	AGA	2	6	222215	222220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732941
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5094	NC_021830	CTGGT	2	10	222377	222386	0 %	40 %	40 %	20 %	525732941
5095	NC_021830	CTT	2	6	222461	222466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525732942
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5098	NC_021830	A	6	6	222536	222541	100 %	0 %	0 %	0 %	525732942
5099	NC_021830	TGC	2	6	222565	222570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732942
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5104	NC_021830	ATA	2	6	222810	222815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525732942
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5106	NC_021830	TTGGTA	2	12	222903	222914	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525732942
5107	NC_021830	GTT	2	6	223049	223054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525732942
5108	NC_021830	GCA	2	6	223091	223096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525732942
5109	NC_021830	AATT	2	8	223125	223132	50 %	50 %	0 %	0 %	525732942
5110	NC_021830	CTG	2	6	223170	223175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732942
5111	NC_021830	ATG	2	6	223199	223204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732942
5112	NC_021830	ATA	2	6	223230	223235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_021830	A	6	6	223244	223249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_021830	T	7	7	223275	223281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_021830	T	8	8	223384	223391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_021830	TTG	2	6	223408	223413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_021830	T	6	6	223418	223423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_021830	T	7	7	223454	223460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_021830	AGGTG	2	10	223505	223514	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_021830	ATT	2	6	223563	223568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732943
5121	NC_021830	TTG	2	6	223579	223584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525732943
5122	NC_021830	CAA	2	6	223625	223630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525732943
5123	NC_021830	TAA	2	6	223633	223638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525732943
5124	NC_021830	GGA	2	6	223671	223676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525732943
5125	NC_021830	CCG	2	6	223682	223687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525732943
5126	NC_021830	AAGA	2	8	223695	223702	75 %	0 %	25 %	0 %	525732943
5127	NC_021830	AAC	2	6	223736	223741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525732943
5128	NC_021830	A	6	6	223746	223751	100 %	0 %	0 %	0 %	525732943
5129	NC_021830	ATT	2	6	223836	223841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732943
5130	NC_021830	T	6	6	223840	223845	0 %	100 %	0 %	0 %	525732943
5131	NC_021830	AGCA	2	8	223873	223880	50 %	0 %	25 %	25 %	525732943
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5133	NC_021830	A	6	6	223947	223952	100 %	0 %	0 %	0 %	525732943
5134	NC_021830	TAA	2	6	224017	224022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525732943
5135	NC_021830	TAAAT	2	10	224036	224045	60 %	40 %	0 %	0 %	525732943
5136	NC_021830	GAA	3	9	224061	224069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732943
5137	NC_021830	AAAGTA	2	12	224217	224228	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525732943
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5142	NC_021830	AAT	2	6	224657	224662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525732943
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5144	NC_021830	A	6	6	224718	224723	100 %	0 %	0 %	0 %	525732943
5145	NC_021830	ACGG	2	8	224739	224746	25 %	0 %	50 %	25 %	525732943
5146	NC_021830	CTG	2	6	224782	224787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732943
5147	NC_021830	TGA	2	6	224846	224851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525732943
5148	NC_021830	ATGA	2	8	224937	224944	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5149	NC_021830	T	7	7	224959	224965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5150	NC_021830	TATT	2	8	225000	225007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5151	NC_021830	TAA	2	6	225011	225016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5152	NC_021830	CTT	2	6	225026	225031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5153	NC_021830	TGG	3	9	225035	225043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5154	NC_021830	TAA	2	6	225059	225064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525732944
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5157	NC_021830	AGA	2	6	225221	225226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732944
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5168	NC_021830	GAAA	2	8	225447	225454	75 %	0 %	25 %	0 %	525732945
5169	NC_021830	AT	3	6	225474	225479	50 %	50 %	0 %	0 %	525732945
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5175	NC_021830	A	6	6	225677	225682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5176	NC_021830	ATT	2	6	225782	225787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732946
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5179	NC_021830	CTT	2	6	225952	225957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525732946
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5181	NC_021830	T	7	7	226091	226097	0 %	100 %	0 %	0 %	525732947
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5193	NC_021830	AAATA	2	10	226408	226417	80 %	20 %	0 %	0 %	525732947
5194	NC_021830	AATG	2	8	226441	226448	50 %	25 %	25 %	0 %	525732947
5195	NC_021830	TAAT	2	8	226494	226501	50 %	50 %	0 %	0 %	525732947
5196	NC_021830	TG	3	6	226541	226546	0 %	50 %	50 %	0 %	525732947
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5199	NC_021830	A	6	6	226746	226751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5221	NC_021830	GGT	2	6	227610	227615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5231	NC_021830	AGAA	2	8	228005	228012	75 %	0 %	25 %	0 %	525732949
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5242	NC_021830	GTG	2	6	228510	228515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5243	NC_021830	GGAAA	2	10	228631	228640	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5244	NC_021830	A	7	7	228682	228688	100 %	0 %	0 %	0 %	525732950
5245	NC_021830	ATC	2	6	228742	228747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525732950
5246	NC_021830	A	6	6	228760	228765	100 %	0 %	0 %	0 %	525732950
5247	NC_021830	GT	3	6	228844	228849	0 %	50 %	50 %	0 %	525732950
5248	NC_021830	AGA	2	6	228929	228934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732950
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5250	NC_021830	TCA	2	6	228989	228994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525732950
5251	NC_021830	AAG	2	6	229069	229074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732950
5252	NC_021830	TTA	2	6	229117	229122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732950
5253	NC_021830	GC	3	6	229136	229141	0 %	0 %	50 %	50 %	525732950
5254	NC_021830	TAA	2	6	229160	229165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525732950
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5372	NC_021830	TTA	2	6	234053	234058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732954
5373	NC_021830	AGA	2	6	234063	234068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732954
5374	NC_021830	ATT	2	6	234095	234100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732954
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5376	NC_021830	ATT	2	6	234126	234131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732954
5377	NC_021830	AAG	2	6	234224	234229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525732954
5378	NC_021830	A	6	6	234268	234273	100 %	0 %	0 %	0 %	525732954
5379	NC_021830	CTG	2	6	234283	234288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732954
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5381	NC_021830	AT	3	6	234393	234398	50 %	50 %	0 %	0 %	525732954
5382	NC_021830	CA	3	6	234519	234524	50 %	0 %	0 %	50 %	525732954
5383	NC_021830	CAA	2	6	234541	234546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525732954
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5385	NC_021830	A	6	6	234646	234651	100 %	0 %	0 %	0 %	525732954
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5393	NC_021830	ACA	3	9	235055	235063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525732954
5394	NC_021830	AGAA	2	8	235106	235113	75 %	0 %	25 %	0 %	525732954
5395	NC_021830	TATT	2	8	235127	235134	25 %	75 %	0 %	0 %	525732955
5396	NC_021830	T	8	8	235144	235151	0 %	100 %	0 %	0 %	525732955
5397	NC_021830	TTC	3	9	235194	235202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525732955
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5399	NC_021830	CAG	2	6	235219	235224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525732955
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5402	NC_021830	CTAG	2	8	235392	235399	25 %	25 %	25 %	25 %	525732955
5403	NC_021830	TTGG	2	8	235418	235425	0 %	50 %	50 %	0 %	525732955
5404	NC_021830	T	6	6	235472	235477	0 %	100 %	0 %	0 %	525732955
5405	NC_021830	TCT	2	6	235518	235523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525732955
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5407	NC_021830	CCAAA	2	10	235573	235582	60 %	0 %	0 %	40 %	525732955
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5416	NC_021830	AATA	2	8	235859	235866	75 %	25 %	0 %	0 %	525732955
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5422	NC_021830	TAT	2	6	236058	236063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5423	NC_021830	AAAAC	2	10	236206	236215	80 %	0 %	0 %	20 %	525732956
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5428	NC_021830	TTAG	2	8	236477	236484	25 %	50 %	25 %	0 %	525732956
5429	NC_021830	A	7	7	236489	236495	100 %	0 %	0 %	0 %	525732956
5430	NC_021830	TG	3	6	236522	236527	0 %	50 %	50 %	0 %	525732956
5431	NC_021830	TGC	2	6	236599	236604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525732956
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5434	NC_021830	GA	3	6	236694	236699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5435	NC_021830	ATT	2	6	236727	236732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525732957
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5451	NC_021830	T	7	7	237492	237498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5452	NC_021830	A	6	6	237546	237551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5453	NC_021830	AAC	2	6	237583	237588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5465	NC_021830	TAA	2	6	238104	238109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5467	NC_021830	TAA	2	6	238169	238174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5469	NC_021830	AG	3	6	238235	238240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5472	NC_021830	GCAAAA	2	12	238341	238352	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525735360
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5481	NC_021830	AAG	2	6	238618	238623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525735360
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5495	NC_021830	CGA	2	6	239374	239379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525735360
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