MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes J1816

Total Repeats: 42273

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021829	AAT	2	6	11	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021829	ACA	2	6	21	26	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021829	ATA	2	6	45	50	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021829	CAT	2	6	62	67	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021829	TTA	2	6	75	80	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021829	CCA	2	6	88	93	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_021829	CAT	2	6	166	171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021829	AAT	2	6	248	253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021829	TAA	2	6	320	325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021829	CAA	2	6	357	362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723660
11	NC_021829	TAA	2	6	608	613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723660
12	NC_021829	ATT	2	6	793	798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723660
13	NC_021829	AAG	2	6	971	976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525723660
14	NC_021829	CAT	2	6	990	995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723660
15	NC_021829	ATA	2	6	1007	1012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723660
16	NC_021829	CCT	2	6	1087	1092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525723661
17	NC_021829	TGT	2	6	1159	1164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723661
18	NC_021829	TAA	2	6	1315	1320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723661
19	NC_021829	AAT	2	6	1324	1329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723661
20	NC_021829	GAA	2	6	1387	1392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525723661
21	NC_021829	TCA	2	6	1474	1479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723661
22	NC_021829	TCT	2	6	1498	1503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723661
23	NC_021829	TCA	2	6	1527	1532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723661
24	NC_021829	GTT	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723661
25	NC_021829	CCA	2	6	1593	1598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525723661
26	NC_021829	TCA	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723661
27	NC_021829	AGA	2	6	1790	1795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525723661
28	NC_021829	CTT	2	6	1888	1893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723661
29	NC_021829	TAT	2	6	1915	1920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723661
30	NC_021829	ATT	2	6	1955	1960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723661
31	NC_021829	GCA	2	6	2041	2046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021829	GAT	2	6	2047	2052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021829	ATT	2	6	2136	2141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021829	TGA	2	6	2154	2159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021829	CCT	2	6	2185	2190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_021829	ATT	2	6	2311	2316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021829	ATA	2	6	2342	2347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021829	ATA	2	6	2422	2427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021829	AAT	2	6	2469	2474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021829	TAA	2	6	2544	2549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021829	AAT	2	6	2615	2620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021829	CGA	2	6	2659	2664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021829	CGT	2	6	2675	2680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021829	TCA	2	6	2694	2699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021829	TTA	2	6	2751	2756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723662
46	NC_021829	TCA	2	6	2979	2984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723662
47	NC_021829	TCC	2	6	3081	3086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_021829	ATT	2	6	3103	3108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021829	AGG	2	6	3158	3163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021829	ATT	2	6	3205	3210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021829	AAT	2	6	3212	3217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021829	CAT	2	6	3247	3252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021829	TTA	2	6	3348	3353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021829	GAT	2	6	3381	3386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021829	ATT	2	6	3453	3458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021829	ATA	2	6	3550	3555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723663
57	NC_021829	ATC	2	6	3641	3646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723663
58	NC_021829	GAT	2	6	3649	3654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723663
59	NC_021829	TCT	2	6	3672	3677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723663
60	NC_021829	ATT	2	6	3689	3694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723663
61	NC_021829	ATC	2	6	3696	3701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723663
62	NC_021829	TTA	2	6	3723	3728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723663
63	NC_021829	TGT	2	6	3739	3744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723663
64	NC_021829	ATT	3	9	3884	3892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723663
65	NC_021829	ATA	2	6	3911	3916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723663
66	NC_021829	TTA	2	6	3925	3930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723663
67	NC_021829	AAT	2	6	3985	3990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723663
68	NC_021829	CTT	2	6	4007	4012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723663
69	NC_021829	TGT	2	6	4017	4022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723663
70	NC_021829	TTA	2	6	4071	4076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723663
71	NC_021829	TCC	2	6	4082	4087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525723663
72	NC_021829	TCT	2	6	4092	4097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723663
73	NC_021829	GAT	2	6	4144	4149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723663
74	NC_021829	CAA	2	6	4178	4183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723663
75	NC_021829	TTA	2	6	4225	4230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021829	TAT	2	6	4242	4247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021829	CAT	2	6	4288	4293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021829	CTT	2	6	4325	4330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723664
79	NC_021829	ATT	2	6	4399	4404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723664
80	NC_021829	TTC	2	6	4419	4424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723664
81	NC_021829	TAA	2	6	4444	4449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723664
82	NC_021829	CAT	2	6	4557	4562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723664
83	NC_021829	TAG	2	6	4576	4581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723665
84	NC_021829	TAT	2	6	4600	4605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723665
85	NC_021829	TTA	2	6	4627	4632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723665
86	NC_021829	TAA	2	6	4685	4690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723665
87	NC_021829	AAC	2	6	4748	4753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723665
88	NC_021829	TGT	2	6	4928	4933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723666
89	NC_021829	TTC	2	6	4952	4957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723666
90	NC_021829	TTC	2	6	4998	5003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723666
91	NC_021829	AAT	2	6	5057	5062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021829	GGT	2	6	5140	5145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021829	AAT	2	6	5209	5214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723667
94	NC_021829	GTT	2	6	5236	5241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723667
95	NC_021829	CAT	2	6	5253	5258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723667
96	NC_021829	TTG	2	6	5330	5335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723667
97	NC_021829	AAT	2	6	5343	5348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723667
98	NC_021829	ATA	3	9	5394	5402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723667
99	NC_021829	TAT	2	6	5509	5514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021829	ATC	2	6	5621	5626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
101	NC_021829	AAC	2	6	5660	5665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723668
102	NC_021829	TCT	2	6	5832	5837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723668
103	NC_021829	TCT	3	9	5856	5864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723668
104	NC_021829	CAA	2	6	6004	6009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723668
105	NC_021829	TAT	3	9	6019	6027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723668
106	NC_021829	TAC	2	6	6083	6088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
107	NC_021829	TCA	2	6	6099	6104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
108	NC_021829	ATA	2	6	6246	6251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723668
109	NC_021829	ATG	2	6	6295	6300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723668
110	NC_021829	TAC	2	6	6335	6340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
111	NC_021829	CAG	2	6	6352	6357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525723668
112	NC_021829	TCC	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525723668
113	NC_021829	TAG	2	6	6366	6371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723668
114	NC_021829	AAT	2	6	6418	6423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723668
115	NC_021829	ATA	2	6	6543	6548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723668
116	NC_021829	CAG	2	6	6586	6591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525723668
117	NC_021829	CTA	2	6	6664	6669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
118	NC_021829	CAT	2	6	6757	6762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
119	NC_021829	TAT	2	6	6862	6867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723668
120	NC_021829	TCA	2	6	6900	6905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
121	NC_021829	TCA	2	6	6936	6941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
122	NC_021829	TAA	2	6	7079	7084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723668
123	NC_021829	TAA	2	6	7099	7104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723668
124	NC_021829	CTA	2	6	7134	7139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
125	NC_021829	ATA	2	6	7283	7288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723668
126	NC_021829	TTC	2	6	7328	7333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723668
127	NC_021829	TAA	2	6	7432	7437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723668
128	NC_021829	TGA	2	6	7490	7495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723668
129	NC_021829	TGC	2	6	7538	7543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525723668
130	NC_021829	CAA	2	6	7616	7621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723668
131	NC_021829	ATC	2	6	7622	7627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
132	NC_021829	TTC	2	6	7634	7639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723668
133	NC_021829	TTG	2	6	7913	7918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723669
134	NC_021829	AAT	2	6	8044	8049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723669
135	NC_021829	CTA	2	6	8075	8080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723669
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261	NC_021829	CTT	2	6	17703	17708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721272
262	NC_021829	GCA	2	6	17711	17716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721272
263	NC_021829	TCG	2	6	17780	17785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721272
264	NC_021829	AAT	2	6	17836	17841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721272
265	NC_021829	ACA	2	6	17861	17866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721272
266	NC_021829	TCA	2	6	17949	17954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721272
267	NC_021829	ATC	2	6	17992	17997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721272
268	NC_021829	TCT	2	6	18017	18022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_021829	TTA	2	6	18049	18054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_021829	ATA	3	9	18062	18070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_021829	CAC	2	6	18085	18090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
272	NC_021829	TAA	2	6	18092	18097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_021829	ATC	2	6	18142	18147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721273
274	NC_021829	AAG	2	6	18212	18217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721273
275	NC_021829	ATC	2	6	18235	18240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721273
276	NC_021829	TCT	2	6	18278	18283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721273
277	NC_021829	TCG	2	6	18317	18322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721273
278	NC_021829	CTT	2	6	18375	18380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721273
279	NC_021829	TAA	2	6	18454	18459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721273
280	NC_021829	TCA	2	6	18513	18518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721273
281	NC_021829	AGT	2	6	18536	18541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_021829	CGC	2	6	18656	18661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525721274
283	NC_021829	CTT	2	6	18691	18696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721274
284	NC_021829	TGT	2	6	18722	18727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721274
285	NC_021829	TAA	2	6	18830	18835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721274
286	NC_021829	AAT	2	6	18859	18864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721274
287	NC_021829	GTA	2	6	18889	18894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721274
288	NC_021829	ACA	2	6	18927	18932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721274
289	NC_021829	ATC	2	6	18935	18940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721274
290	NC_021829	ACT	2	6	18942	18947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721274
291	NC_021829	GTA	2	6	19044	19049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721274
292	NC_021829	ATA	2	6	19084	19089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721274
293	NC_021829	TTG	3	9	19148	19156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721274
294	NC_021829	GAA	2	6	19160	19165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721274
295	NC_021829	TCT	2	6	19206	19211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721274
296	NC_021829	TGC	2	6	19235	19240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721274
297	NC_021829	CTT	2	6	19285	19290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721274
298	NC_021829	CTT	2	6	19314	19319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721274
299	NC_021829	GCT	2	6	19326	19331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721274
300	NC_021829	AAT	2	6	19429	19434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721274
301	NC_021829	AAC	2	6	19562	19567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721274
302	NC_021829	CTT	2	6	19723	19728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721274
303	NC_021829	CAC	2	6	19739	19744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
304	NC_021829	CTG	2	6	19780	19785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525723674
305	NC_021829	TCT	2	6	19827	19832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723674
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309	NC_021829	ATC	2	6	20376	20381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723674
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311	NC_021829	CTT	2	6	20461	20466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723674
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313	NC_021829	TCA	2	6	20517	20522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723674
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319	NC_021829	TCA	2	6	20896	20901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723674
320	NC_021829	CTT	2	6	21192	21197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723675
321	NC_021829	CAT	2	6	21322	21327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723675
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325	NC_021829	TCA	2	6	21737	21742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723675
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333	NC_021829	TAT	2	6	22419	22424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721275
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337	NC_021829	TCC	2	6	22751	22756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525721275
338	NC_021829	CAT	2	6	22798	22803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721275
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364	NC_021829	ATT	2	6	24366	24371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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383	NC_021829	TAT	2	6	25568	25573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723677
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385	NC_021829	ATA	2	6	25752	25757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723677
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499	NC_021829	ATA	2	6	33617	33622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723682
500	NC_021829	AAT	2	6	33771	33776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723682

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