MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes J1816

Total Repeats: 67217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021829	GA	3	6	41749	41754	50 %	0 %	50 %	0 %	525721281
1002	NC_021829	TAT	2	6	41932	41937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721281
1003	NC_021829	AAC	2	6	41966	41971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721281
1004	NC_021829	TAA	2	6	41975	41980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721281
1005	NC_021829	ACG	2	6	42029	42034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721281
1006	NC_021829	TAC	2	6	42110	42115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721281
1007	NC_021829	TTA	2	6	42207	42212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721281
1008	NC_021829	CTA	2	6	42286	42291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721281
1009	NC_021829	ATC	2	6	42416	42421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721281
1010	NC_021829	GCA	2	6	42486	42491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721281
1011	NC_021829	CTA	2	6	42544	42549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721281
1012	NC_021829	TGA	2	6	42555	42560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721281
1013	NC_021829	AAAT	2	8	42587	42594	75 %	25 %	0 %	0 %	525721281
1014	NC_021829	TCA	2	6	42649	42654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721281
1015	NC_021829	CTTT	2	8	42723	42730	0 %	75 %	0 %	25 %	525721281
1016	NC_021829	CCG	2	6	42768	42773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525721281
1017	NC_021829	TTC	2	6	42824	42829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721281
1018	NC_021829	CTT	2	6	42832	42837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721281
1019	NC_021829	CTT	2	6	42967	42972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721281
1020	NC_021829	ACG	2	6	42980	42985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721281
1021	NC_021829	TAT	2	6	43061	43066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721281
1022	NC_021829	TCT	2	6	43158	43163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721281
1023	NC_021829	AATA	2	8	43168	43175	75 %	25 %	0 %	0 %	525721281
1024	NC_021829	TTTTGA	2	12	43183	43194	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525721281
1025	NC_021829	ACGC	2	8	43204	43211	25 %	0 %	25 %	50 %	525721281
1026	NC_021829	CTA	2	6	43243	43248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721281
1027	NC_021829	T	6	6	43253	43258	0 %	100 %	0 %	0 %	525721281
1028	NC_021829	T	7	7	43270	43276	0 %	100 %	0 %	0 %	525721281
1029	NC_021829	CCT	2	6	43277	43282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_021829	T	7	7	43363	43369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021829	TA	3	6	43384	43389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021829	ATT	2	6	43425	43430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_021829	TTCT	2	8	43431	43438	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_021829	A	7	7	43507	43513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_021829	TAAT	2	8	43522	43529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021829	TTC	2	6	43537	43542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_021829	T	6	6	43556	43561	0 %	100 %	0 %	0 %	525721282
1038	NC_021829	CT	3	6	43575	43580	0 %	50 %	0 %	50 %	525721282
1039	NC_021829	CAT	2	6	43650	43655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721282
1040	NC_021829	CCA	2	6	43678	43683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525721282
1041	NC_021829	TAA	2	6	43688	43693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721282
1042	NC_021829	CCA	2	6	43735	43740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525721282
1043	NC_021829	TAA	2	6	43745	43750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721282
1044	NC_021829	AGG	2	6	43793	43798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525721282
1045	NC_021829	GAA	2	6	43848	43853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721282
1046	NC_021829	ATA	2	6	43864	43869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721282
1047	NC_021829	AC	3	6	43883	43888	50 %	0 %	0 %	50 %	525721282
1048	NC_021829	TTC	2	6	43893	43898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721282
1049	NC_021829	CAA	2	6	43901	43906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721282
1050	NC_021829	AAT	2	6	43911	43916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721282
1051	NC_021829	GT	3	6	43924	43929	0 %	50 %	50 %	0 %	525721282
1052	NC_021829	ACC	2	6	43986	43991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525721282
1053	NC_021829	AATT	2	8	44012	44019	50 %	50 %	0 %	0 %	525721282
1054	NC_021829	CTT	2	6	44030	44035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721282
1055	NC_021829	AAT	3	9	44148	44156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721282
1056	NC_021829	AATT	2	8	44172	44179	50 %	50 %	0 %	0 %	525721282
1057	NC_021829	ATA	3	9	44212	44220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721282
1058	NC_021829	CAA	2	6	44221	44226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721282
1059	NC_021829	ATA	2	6	44239	44244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721282
1060	NC_021829	ATC	2	6	44331	44336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721282
1061	NC_021829	TTC	2	6	44350	44355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721282
1062	NC_021829	AAT	2	6	44376	44381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721282
1063	NC_021829	ATT	2	6	44448	44453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721282
1064	NC_021829	TAA	2	6	44481	44486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721282
1065	NC_021829	ATTAAC	2	12	44509	44520	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525721282
1066	NC_021829	TAT	2	6	44525	44530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721282
1067	NC_021829	AAT	2	6	44615	44620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721282
1068	NC_021829	ATA	2	6	44671	44676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721282
1069	NC_021829	TTC	2	6	44798	44803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_021829	TAT	2	6	44805	44810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_021829	AGA	2	6	44835	44840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_021829	CCT	2	6	44845	44850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_021829	T	6	6	44863	44868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_021829	CAAA	2	8	44882	44889	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_021829	A	7	7	44887	44893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_021829	A	6	6	44902	44907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_021829	ATT	2	6	44931	44936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721283
1078	NC_021829	T	6	6	44935	44940	0 %	100 %	0 %	0 %	525721283
1079	NC_021829	CTT	2	6	45003	45008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721283
1080	NC_021829	ATCT	2	8	45193	45200	25 %	50 %	0 %	25 %	525721283
1081	NC_021829	ATTT	2	8	45313	45320	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_021829	TG	3	6	45400	45405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_021829	AAAAC	2	10	45476	45485	80 %	0 %	0 %	20 %	525721284
1084	NC_021829	TAA	2	6	45493	45498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721284
1085	NC_021829	AGT	2	6	45595	45600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721284
1086	NC_021829	T	7	7	45676	45682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_021829	CAT	2	6	45707	45712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_021829	GCT	2	6	45781	45786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_021829	AAG	2	6	45822	45827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_021829	TCC	2	6	45918	45923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_021829	CAA	2	6	46082	46087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_021829	T	6	6	46136	46141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_021829	ATG	2	6	46145	46150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_021829	GTT	3	9	46168	46176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_021829	CCA	2	6	46183	46188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_021829	AGA	2	6	46194	46199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_021829	ACT	2	6	46275	46280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_021829	ATT	2	6	46281	46286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_021829	ATC	2	6	46341	46346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_021829	TGT	2	6	46362	46367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_021829	CTT	2	6	46370	46375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_021829	GTT	3	9	46378	46386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_021829	T	6	6	46430	46435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021829	TGT	2	6	46439	46444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_021829	TTG	2	6	46455	46460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021829	CTC	2	6	46501	46506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_021829	AAG	2	6	46511	46516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021829	AAT	2	6	46535	46540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_021829	T	6	6	46547	46552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_021829	CAT	2	6	46553	46558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_021829	ACC	2	6	46563	46568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_021829	TACT	2	8	46574	46581	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1113	NC_021829	ATT	2	6	46629	46634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_021829	A	7	7	46664	46670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_021829	AT	4	8	46726	46733	50 %	50 %	0 %	0 %	525721285
1116	NC_021829	CAG	2	6	46738	46743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721285
1117	NC_021829	TGC	2	6	46757	46762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721285
1118	NC_021829	CGTT	2	8	46770	46777	0 %	50 %	25 %	25 %	525721285
1119	NC_021829	T	7	7	46789	46795	0 %	100 %	0 %	0 %	525721285
1120	NC_021829	GGAT	2	8	46804	46811	25 %	25 %	50 %	0 %	525721285
1121	NC_021829	TTC	2	6	46859	46864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721285
1122	NC_021829	T	6	6	46883	46888	0 %	100 %	0 %	0 %	525721285
1123	NC_021829	GTTT	2	8	46895	46902	0 %	75 %	25 %	0 %	525721285
1124	NC_021829	TCT	2	6	47043	47048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721285
1125	NC_021829	AGT	2	6	47066	47071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721285
1126	NC_021829	TTGG	2	8	47137	47144	0 %	50 %	50 %	0 %	525721285
1127	NC_021829	TG	3	6	47156	47161	0 %	50 %	50 %	0 %	525721285
1128	NC_021829	ATA	2	6	47166	47171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721285
1129	NC_021829	CGT	2	6	47263	47268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721285
1130	NC_021829	TTC	2	6	47330	47335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721285
1131	NC_021829	TCT	2	6	47355	47360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721285
1132	NC_021829	GAT	2	6	47393	47398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721285
1133	NC_021829	CAC	2	6	47473	47478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525721285
1134	NC_021829	TTC	2	6	47561	47566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721285
1135	NC_021829	TCA	2	6	47649	47654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721285
1136	NC_021829	CTT	2	6	47674	47679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721285
1137	NC_021829	CTA	2	6	47737	47742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721285
1138	NC_021829	CTT	2	6	47758	47763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721285
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1161	NC_021829	TCC	2	6	48650	48655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1162	NC_021829	TAT	2	6	48687	48692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1163	NC_021829	T	7	7	48740	48746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1164	NC_021829	CTTT	2	8	48757	48764	0 %	75 %	0 %	25 %	525721286
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1251	NC_021829	ACT	2	6	52160	52165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721290
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1253	NC_021829	CAA	2	6	52251	52256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721290
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1255	NC_021829	CCT	2	6	52318	52323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525721291
1256	NC_021829	TTC	2	6	52338	52343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721291
1257	NC_021829	GGT	2	6	52353	52358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525721291
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