MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes J1816

Total Repeats: 67217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021829	TCA	2	6	216458	216463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721450
5002	NC_021829	GTC	2	6	216490	216495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721450
5003	NC_021829	ATA	2	6	216512	216517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721450
5004	NC_021829	TCCA	2	8	216589	216596	25 %	25 %	0 %	50 %	525721450
5005	NC_021829	TTG	2	6	216621	216626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721450
5006	NC_021829	CGC	2	6	216662	216667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525721450
5007	NC_021829	TGTTT	2	10	216694	216703	0 %	80 %	20 %	0 %	525721450
5008	NC_021829	T	6	6	216716	216721	0 %	100 %	0 %	0 %	525721450
5009	NC_021829	CTT	2	6	216770	216775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721450
5010	NC_021829	TC	3	6	216781	216786	0 %	50 %	0 %	50 %	525721450
5011	NC_021829	CTA	2	6	216818	216823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721450
5012	NC_021829	GTAT	3	12	216959	216970	25 %	50 %	25 %	0 %	525721450
5013	NC_021829	T	6	6	216970	216975	0 %	100 %	0 %	0 %	525721450
5014	NC_021829	AAT	2	6	217083	217088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721450
5015	NC_021829	CGA	3	9	217154	217162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721450
5016	NC_021829	TAA	2	6	217190	217195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721450
5017	NC_021829	TCTT	2	8	217227	217234	0 %	75 %	0 %	25 %	525721450
5018	NC_021829	TCT	2	6	217241	217246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721450
5019	NC_021829	ATG	2	6	217273	217278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721451
5020	NC_021829	GCA	2	6	217331	217336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721451
5021	NC_021829	TCT	2	6	217366	217371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721451
5022	NC_021829	ATC	2	6	217412	217417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721451
5023	NC_021829	AAT	2	6	217441	217446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721451
5024	NC_021829	AAT	2	6	217510	217515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721451
5025	NC_021829	TAAA	2	8	217523	217530	75 %	25 %	0 %	0 %	525721451
5026	NC_021829	GCA	2	6	217532	217537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721451
5027	NC_021829	CCA	2	6	217570	217575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525721451
5028	NC_021829	ATA	2	6	217591	217596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721451
5029	NC_021829	GCC	2	6	217659	217664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525721451
5030	NC_021829	TTTCT	2	10	217690	217699	0 %	80 %	0 %	20 %	525721451
5031	NC_021829	T	6	6	217728	217733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_021829	T	6	6	217772	217777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_021829	T	6	6	217816	217821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_021829	ATA	2	6	217822	217827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_021829	AAG	2	6	217832	217837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_021829	GAA	2	6	217851	217856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721452
5037	NC_021829	A	6	6	217855	217860	100 %	0 %	0 %	0 %	525721452
5038	NC_021829	TAA	2	6	217874	217879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721452
5039	NC_021829	AAG	2	6	217934	217939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721452
5040	NC_021829	ACT	2	6	217948	217953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721452
5041	NC_021829	TCCA	2	8	218002	218009	25 %	25 %	0 %	50 %	525721452
5042	NC_021829	A	6	6	218031	218036	100 %	0 %	0 %	0 %	525721452
5043	NC_021829	GCC	2	6	218068	218073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525721452
5044	NC_021829	ACC	2	6	218080	218085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525721452
5045	NC_021829	AAT	2	6	218092	218097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721452
5046	NC_021829	CAAT	2	8	218104	218111	50 %	25 %	0 %	25 %	525721452
5047	NC_021829	AAT	2	6	218164	218169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721452
5048	NC_021829	CAA	2	6	218287	218292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721452
5049	NC_021829	A	7	7	218304	218310	100 %	0 %	0 %	0 %	525721452
5050	NC_021829	TTA	2	6	218317	218322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721452
5051	NC_021829	TAA	2	6	218323	218328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721452
5052	NC_021829	A	6	6	218327	218332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_021829	TCAT	2	8	218341	218348	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5054	NC_021829	AAG	2	6	218349	218354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_021829	CTA	2	6	218403	218408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721453
5056	NC_021829	TTG	2	6	218496	218501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721453
5057	NC_021829	T	6	6	218550	218555	0 %	100 %	0 %	0 %	525721453
5058	NC_021829	TTA	2	6	218645	218650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721453
5059	NC_021829	T	6	6	218760	218765	0 %	100 %	0 %	0 %	525721453
5060	NC_021829	TGG	2	6	218794	218799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525721453
5061	NC_021829	TTC	2	6	218800	218805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721453
5062	NC_021829	GTTCCT	2	12	218828	218839	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525721453
5063	NC_021829	T	6	6	218928	218933	0 %	100 %	0 %	0 %	525721453
5064	NC_021829	TCG	2	6	218937	218942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721453
5065	NC_021829	ACA	2	6	218966	218971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721453
5066	NC_021829	GATT	2	8	218972	218979	25 %	50 %	25 %	0 %	525721453
5067	NC_021829	T	6	6	219055	219060	0 %	100 %	0 %	0 %	525721453
5068	NC_021829	TTG	2	6	219081	219086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721453
5069	NC_021829	ATT	2	6	219157	219162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721453
5070	NC_021829	ATC	2	6	219199	219204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721453
5071	NC_021829	TTG	2	6	219228	219233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721453
5072	NC_021829	CCA	2	6	219248	219253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525721453
5073	NC_021829	TAA	2	6	219267	219272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721453
5074	NC_021829	TAA	2	6	219365	219370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721453
5075	NC_021829	TAATG	2	10	219418	219427	40 %	40 %	20 %	0 %	525721453
5076	NC_021829	TAAT	3	12	219500	219511	50 %	50 %	0 %	0 %	525721453
5077	NC_021829	TAA	2	6	219567	219572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721453
5078	NC_021829	GTT	2	6	219617	219622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721453
5079	NC_021829	A	7	7	219658	219664	100 %	0 %	0 %	0 %	525721453
5080	NC_021829	CTG	2	6	219665	219670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721453
5081	NC_021829	T	7	7	219750	219756	0 %	100 %	0 %	0 %	525721453
5082	NC_021829	ATCT	2	8	219783	219790	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5083	NC_021829	CTTG	2	8	219806	219813	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5084	NC_021829	A	7	7	219842	219848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_021829	AATA	2	8	219887	219894	75 %	25 %	0 %	0 %	525721454
5086	NC_021829	ATCT	2	8	219936	219943	25 %	50 %	0 %	25 %	525721454
5087	NC_021829	AAT	2	6	219988	219993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721454
5088	NC_021829	ATT	2	6	220033	220038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721454
5089	NC_021829	TCT	2	6	220046	220051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721454
5090	NC_021829	GC	3	6	220092	220097	0 %	0 %	50 %	50 %	525721454
5091	NC_021829	TAA	2	6	220113	220118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721454
5092	NC_021829	TCA	2	6	220127	220132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721454
5093	NC_021829	AGTA	2	8	220152	220159	50 %	25 %	25 %	0 %	525721454
5094	NC_021829	AAATAC	2	12	220173	220184	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525721454
5095	NC_021829	CATT	2	8	220232	220239	25 %	50 %	0 %	25 %	525721454
5096	NC_021829	CCG	2	6	220296	220301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525721454
5097	NC_021829	ATTA	2	8	220303	220310	50 %	50 %	0 %	0 %	525721454
5098	NC_021829	CGC	2	6	220312	220317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525721454
5099	NC_021829	TTG	2	6	220320	220325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721454
5100	NC_021829	CTT	2	6	220353	220358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721454
5101	NC_021829	AT	3	6	220361	220366	50 %	50 %	0 %	0 %	525721454
5102	NC_021829	CTT	2	6	220401	220406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721454
5103	NC_021829	ATG	2	6	220409	220414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721454
5104	NC_021829	TCAT	2	8	220424	220431	25 %	50 %	0 %	25 %	525721454
5105	NC_021829	ACG	2	6	220489	220494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721454
5106	NC_021829	T	6	6	220626	220631	0 %	100 %	0 %	0 %	525721454
5107	NC_021829	TTAAT	2	10	220700	220709	40 %	60 %	0 %	0 %	525721455
5108	NC_021829	AAGC	2	8	220796	220803	50 %	0 %	25 %	25 %	525721455
5109	NC_021829	TTGGA	2	10	220809	220818	20 %	40 %	40 %	0 %	525721455
5110	NC_021829	TAA	2	6	220882	220887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721455
5111	NC_021829	CG	3	6	220907	220912	0 %	0 %	50 %	50 %	525721455
5112	NC_021829	TGA	2	6	220956	220961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721455
5113	NC_021829	TCG	2	6	220982	220987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721455
5114	NC_021829	ATC	2	6	221002	221007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721455
5115	NC_021829	ATTC	2	8	221114	221121	25 %	50 %	0 %	25 %	525721455
5116	NC_021829	ATA	2	6	221128	221133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721455
5117	NC_021829	CTT	2	6	221186	221191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721455
5118	NC_021829	ATA	2	6	221206	221211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721455
5119	NC_021829	AAT	2	6	221251	221256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721455
5120	NC_021829	GCTT	2	8	221337	221344	0 %	50 %	25 %	25 %	525721455
5121	NC_021829	GC	3	6	221445	221450	0 %	0 %	50 %	50 %	525721455
5122	NC_021829	T	6	6	221573	221578	0 %	100 %	0 %	0 %	525721455
5123	NC_021829	T	6	6	221584	221589	0 %	100 %	0 %	0 %	525721455
5124	NC_021829	T	6	6	221606	221611	0 %	100 %	0 %	0 %	525721455
5125	NC_021829	ACT	2	6	221715	221720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721456
5126	NC_021829	T	7	7	221737	221743	0 %	100 %	0 %	0 %	525721456
5127	NC_021829	CTA	2	6	221755	221760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721456
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5132	NC_021829	CAT	2	6	221863	221868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721456
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5134	NC_021829	GTC	2	6	221975	221980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721456
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5203	NC_021829	TCAAAC	2	12	225161	225172	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525721460
5204	NC_021829	AAT	2	6	225226	225231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721460
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5206	NC_021829	AAAT	2	8	225287	225294	75 %	25 %	0 %	0 %	525721460
5207	NC_021829	TTAAT	2	10	225456	225465	40 %	60 %	0 %	0 %	525721460
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5215	NC_021829	TCC	2	6	225758	225763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525721460
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5217	NC_021829	A	7	7	225819	225825	100 %	0 %	0 %	0 %	525721460
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5222	NC_021829	GAT	2	6	226020	226025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721460
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5224	NC_021829	CTT	2	6	226083	226088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721460
5225	NC_021829	TGC	2	6	226118	226123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721460
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5227	NC_021829	T	6	6	226147	226152	0 %	100 %	0 %	0 %	525721460
5228	NC_021829	TTG	2	6	226162	226167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721460
5229	NC_021829	T	6	6	226278	226283	0 %	100 %	0 %	0 %	525721460
5230	NC_021829	AAC	2	6	226311	226316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721460
5231	NC_021829	CTG	2	6	226390	226395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721460
5232	NC_021829	TCA	2	6	226404	226409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721460
5233	NC_021829	CTC	2	6	226417	226422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5234	NC_021829	TA	3	6	226469	226474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5235	NC_021829	A	7	7	226501	226507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5236	NC_021829	A	7	7	226530	226536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5237	NC_021829	A	7	7	226571	226577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5238	NC_021829	TAT	2	6	226604	226609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5239	NC_021829	T	6	6	226624	226629	0 %	100 %	0 %	0 %	525721461
5240	NC_021829	AAT	2	6	226645	226650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721461
5241	NC_021829	CAA	2	6	226674	226679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721461
5242	NC_021829	AT	3	6	226700	226705	50 %	50 %	0 %	0 %	525721461
5243	NC_021829	A	6	6	226858	226863	100 %	0 %	0 %	0 %	525721461
5244	NC_021829	ATA	2	6	226874	226879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721461
5245	NC_021829	TAA	3	9	226921	226929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721461
5246	NC_021829	CCA	2	6	226994	226999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525721461
5247	NC_021829	ACC	2	6	227116	227121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525721461
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5249	NC_021829	TAA	2	6	227170	227175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721461
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5377	NC_021829	GTA	2	6	231947	231952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721465
5378	NC_021829	TTGC	2	8	231965	231972	0 %	50 %	25 %	25 %	525721465
5379	NC_021829	GC	3	6	232019	232024	0 %	0 %	50 %	50 %	525721465
5380	NC_021829	ACG	2	6	232041	232046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721465
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5384	NC_021829	GAA	2	6	232140	232145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721465
5385	NC_021829	TTTC	2	8	232169	232176	0 %	75 %	0 %	25 %	525721465
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5397	NC_021829	TTGT	2	8	232873	232880	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5398	NC_021829	GTT	2	6	232894	232899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5401	NC_021829	TAA	2	6	233062	233067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5402	NC_021829	ATC	2	6	233078	233083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5403	NC_021829	AC	3	6	233087	233092	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5404	NC_021829	TAT	2	6	233134	233139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5405	NC_021829	A	7	7	233145	233151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5406	NC_021829	A	8	8	233214	233221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5407	NC_021829	TTA	2	6	233255	233260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721466
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5410	NC_021829	GTTCC	2	10	233359	233368	0 %	40 %	20 %	40 %	525721466
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5432	NC_021829	TAGA	2	8	234498	234505	50 %	25 %	25 %	0 %	525721466
5433	NC_021829	ATAA	2	8	234598	234605	75 %	25 %	0 %	0 %	525721466
5434	NC_021829	GCC	2	6	234621	234626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525721466
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5451	NC_021829	TGA	2	6	235640	235645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721467
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5455	NC_021829	TTG	2	6	235771	235776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721467
5456	NC_021829	TAATTC	2	12	235777	235788	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525721467
5457	NC_021829	ACT	2	6	235820	235825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721467
5458	NC_021829	ACTG	2	8	235837	235844	25 %	25 %	25 %	25 %	525721467
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5460	NC_021829	TAAT	2	8	235959	235966	50 %	50 %	0 %	0 %	525721467
5461	NC_021829	TTC	2	6	235972	235977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721467
5462	NC_021829	CTA	2	6	236011	236016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5466	NC_021829	TTCA	2	8	236221	236228	25 %	50 %	0 %	25 %	525721468
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5471	NC_021829	GTG	2	6	236373	236378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525721468
5472	NC_021829	TTTC	2	8	236613	236620	0 %	75 %	0 %	25 %	525721468
5473	NC_021829	AAT	2	6	236641	236646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721468
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5475	NC_021829	A	6	6	236740	236745	100 %	0 %	0 %	0 %	525721468
5476	NC_021829	AT	3	6	236792	236797	50 %	50 %	0 %	0 %	525721468
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5480	NC_021829	TCC	2	6	236937	236942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525721469
5481	NC_021829	GC	3	6	236965	236970	0 %	0 %	50 %	50 %	525721469
5482	NC_021829	TCCA	2	8	237107	237114	25 %	25 %	0 %	50 %	525721469
5483	NC_021829	A	6	6	237120	237125	100 %	0 %	0 %	0 %	525721469
5484	NC_021829	TCGT	2	8	237193	237200	0 %	50 %	25 %	25 %	525721469
5485	NC_021829	CTT	2	6	237202	237207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721469
5486	NC_021829	ATC	2	6	237273	237278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721469
5487	NC_021829	T	6	6	237301	237306	0 %	100 %	0 %	0 %	525721469
5488	NC_021829	GAA	2	6	237402	237407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721469
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5490	NC_021829	TA	3	6	237444	237449	50 %	50 %	0 %	0 %	525721469
5491	NC_021829	AAAATT	2	12	237650	237661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721469
5492	NC_021829	T	7	7	237679	237685	0 %	100 %	0 %	0 %	525721469
5493	NC_021829	CTA	2	6	237733	237738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721469
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5496	NC_021829	A	6	6	238055	238060	100 %	0 %	0 %	0 %	525721469
5497	NC_021829	ATT	2	6	238070	238075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721469
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5499	NC_021829	TAC	3	9	238120	238128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721469
5500	NC_021829	ATA	2	6	238182	238187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721469

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