MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes strain R2-502 plasmid

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021828	CT	3	6	611	616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021828	AT	3	6	1011	1016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021828	AT	3	6	1680	1685	50 %	50 %	0 %	0 %	525901168
4	NC_021828	AC	3	6	2439	2444	50 %	0 %	0 %	50 %	525901170
5	NC_021828	TC	3	6	4213	4218	0 %	50 %	0 %	50 %	525901173
6	NC_021828	TA	3	6	4356	4361	50 %	50 %	0 %	0 %	525901173
7	NC_021828	CT	3	6	4376	4381	0 %	50 %	0 %	50 %	525901173
8	NC_021828	GT	3	6	4388	4393	0 %	50 %	50 %	0 %	525901173
9	NC_021828	TC	3	6	4410	4415	0 %	50 %	0 %	50 %	525901173
10	NC_021828	AT	3	6	5198	5203	50 %	50 %	0 %	0 %	525901173
11	NC_021828	AT	3	6	5303	5308	50 %	50 %	0 %	0 %	525901173
12	NC_021828	TG	3	6	5511	5516	0 %	50 %	50 %	0 %	525901174
13	NC_021828	TG	3	6	5644	5649	0 %	50 %	50 %	0 %	525901174
14	NC_021828	CG	3	6	6006	6011	0 %	0 %	50 %	50 %	525901175
15	NC_021828	TC	3	6	7216	7221	0 %	50 %	0 %	50 %	525901176
16	NC_021828	TC	4	8	7879	7886	0 %	50 %	0 %	50 %	525901178
17	NC_021828	AG	4	8	8490	8497	50 %	0 %	50 %	0 %	525901179
18	NC_021828	CA	3	6	8954	8959	50 %	0 %	0 %	50 %	525901179
19	NC_021828	AT	3	6	9135	9140	50 %	50 %	0 %	0 %	525901179
20	NC_021828	AT	3	6	9347	9352	50 %	50 %	0 %	0 %	525901179
21	NC_021828	CT	3	6	12193	12198	0 %	50 %	0 %	50 %	525901183
22	NC_021828	AC	3	6	12587	12592	50 %	0 %	0 %	50 %	525901183
23	NC_021828	CT	3	6	13716	13721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021828	CT	3	6	13723	13728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021828	TA	3	6	14106	14111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021828	TA	4	8	14154	14161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021828	TA	3	6	14194	14199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021828	TA	3	6	14226	14231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021828	TA	3	6	14318	14323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021828	AT	3	6	14427	14432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021828	GA	3	6	14443	14448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021828	TA	3	6	14467	14472	50 %	50 %	0 %	0 %	525901185
33	NC_021828	TC	3	6	14847	14852	0 %	50 %	0 %	50 %	525901185
34	NC_021828	AT	3	6	15158	15163	50 %	50 %	0 %	0 %	525901185
35	NC_021828	TC	3	6	17084	17089	0 %	50 %	0 %	50 %	525901187
36	NC_021828	TA	3	6	17443	17448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021828	AT	3	6	17576	17581	50 %	50 %	0 %	0 %	525901188
38	NC_021828	CT	3	6	17935	17940	0 %	50 %	0 %	50 %	525901188
39	NC_021828	TA	3	6	17999	18004	50 %	50 %	0 %	0 %	525901188
40	NC_021828	TA	3	6	18221	18226	50 %	50 %	0 %	0 %	525901188
41	NC_021828	TA	3	6	18348	18353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021828	AT	3	6	18766	18771	50 %	50 %	0 %	0 %	525901189
43	NC_021828	TA	3	6	19193	19198	50 %	50 %	0 %	0 %	525901189
44	NC_021828	AT	3	6	19559	19564	50 %	50 %	0 %	0 %	525901189
45	NC_021828	TA	3	6	19580	19585	50 %	50 %	0 %	0 %	525901189
46	NC_021828	TC	3	6	19737	19742	0 %	50 %	0 %	50 %	525901189
47	NC_021828	TA	3	6	20058	20063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021828	TA	3	6	21299	21304	50 %	50 %	0 %	0 %	525901157
49	NC_021828	CG	3	6	22847	22852	0 %	0 %	50 %	50 %	525901158
50	NC_021828	TA	3	6	24354	24359	50 %	50 %	0 %	0 %	525901191
51	NC_021828	CT	3	6	25384	25389	0 %	50 %	0 %	50 %	525901192
52	NC_021828	AT	3	6	25765	25770	50 %	50 %	0 %	0 %	525901192
53	NC_021828	GC	3	6	25952	25957	0 %	0 %	50 %	50 %	525901192
54	NC_021828	AT	3	6	26037	26042	50 %	50 %	0 %	0 %	525901192
55	NC_021828	TA	3	6	26905	26910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021828	TA	4	8	26976	26983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021828	AT	4	8	26987	26994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021828	AG	3	6	27346	27351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021828	TC	3	6	28532	28537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021828	TC	3	6	29266	29271	0 %	50 %	0 %	50 %	525901162
61	NC_021828	AT	3	6	30163	30168	50 %	50 %	0 %	0 %	525901194
62	NC_021828	TA	3	6	30511	30516	50 %	50 %	0 %	0 %	525901195
63	NC_021828	TC	3	6	30519	30524	0 %	50 %	0 %	50 %	525901195
64	NC_021828	TC	4	8	31094	31101	0 %	50 %	0 %	50 %	525901196
65	NC_021828	CA	3	6	31350	31355	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021828	CA	3	6	31786	31791	50 %	0 %	0 %	50 %	525901163
67	NC_021828	GC	3	6	32109	32114	0 %	0 %	50 %	50 %	525901197
68	NC_021828	TA	3	6	32302	32307	50 %	50 %	0 %	0 %	525901197
69	NC_021828	TA	3	6	32916	32921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021828	TA	3	6	33284	33289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021828	TA	3	6	33295	33300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021828	GA	3	6	33900	33905	50 %	0 %	50 %	0 %	525901201
73	NC_021828	TC	3	6	34885	34890	0 %	50 %	0 %	50 %	525901202
74	NC_021828	AC	3	6	35093	35098	50 %	0 %	0 %	50 %	525901202
75	NC_021828	AG	3	6	35855	35860	50 %	0 %	50 %	0 %	525901202
76	NC_021828	AC	3	6	37734	37739	50 %	0 %	0 %	50 %	525901204
77	NC_021828	AC	3	6	37800	37805	50 %	0 %	0 %	50 %	525901204
78	NC_021828	TA	3	6	38040	38045	50 %	50 %	0 %	0 %	525901204
79	NC_021828	AG	3	6	38104	38109	50 %	0 %	50 %	0 %	525901204
80	NC_021828	GA	3	6	39589	39594	50 %	0 %	50 %	0 %	525901204
81	NC_021828	AG	3	6	40356	40361	50 %	0 %	50 %	0 %	525901204
82	NC_021828	AT	3	6	40663	40668	50 %	50 %	0 %	0 %	525901205
83	NC_021828	TA	4	8	40932	40939	50 %	50 %	0 %	0 %	525901205
84	NC_021828	AG	3	6	42728	42733	50 %	0 %	50 %	0 %	525901206
85	NC_021828	TG	3	6	43188	43193	0 %	50 %	50 %	0 %	525901206
86	NC_021828	TA	3	6	43711	43716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021828	AT	3	6	43777	43782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021828	AT	3	6	45298	45303	50 %	50 %	0 %	0 %	525901207
89	NC_021828	AT	3	6	45331	45336	50 %	50 %	0 %	0 %	525901207
90	NC_021828	AT	3	6	45446	45451	50 %	50 %	0 %	0 %	525901207
91	NC_021828	TA	3	6	46011	46016	50 %	50 %	0 %	0 %	525901208
92	NC_021828	GA	3	6	46045	46050	50 %	0 %	50 %	0 %	525901208
93	NC_021828	AT	4	8	46480	46487	50 %	50 %	0 %	0 %	525901208
94	NC_021828	TA	3	6	47397	47402	50 %	50 %	0 %	0 %	525901208
95	NC_021828	AT	3	6	47440	47445	50 %	50 %	0 %	0 %	525901208
96	NC_021828	TG	3	6	47488	47493	0 %	50 %	50 %	0 %	525901208
97	NC_021828	TA	3	6	47589	47594	50 %	50 %	0 %	0 %	525901208
98	NC_021828	AT	3	6	47609	47614	50 %	50 %	0 %	0 %	525901208
99	NC_021828	TA	3	6	47763	47768	50 %	50 %	0 %	0 %	525901208
100	NC_021828	CT	3	6	48040	48045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_021828	AG	3	6	48218	48223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021828	TA	3	6	48677	48682	50 %	50 %	0 %	0 %	525901209
103	NC_021828	AT	3	6	48823	48828	50 %	50 %	0 %	0 %	525901209
104	NC_021828	AG	3	6	48924	48929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021828	CT	4	8	49064	49071	0 %	50 %	0 %	50 %	525901166
106	NC_021828	CT	3	6	50209	50214	0 %	50 %	0 %	50 %	525901166
107	NC_021828	TC	3	6	51641	51646	0 %	50 %	0 %	50 %	525901210
108	NC_021828	AT	3	6	52291	52296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021828	CT	3	6	52504	52509	0 %	50 %	0 %	50 %	525901211
110	NC_021828	AT	3	6	52623	52628	50 %	50 %	0 %	0 %	525901211
111	NC_021828	TG	3	6	52747	52752	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021828	AT	3	6	53387	53392	50 %	50 %	0 %	0 %	525901167
113	NC_021828	GC	3	6	53914	53919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021828	TA	3	6	54089	54094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021828	TG	3	6	54747	54752	0 %	50 %	50 %	0 %	525901212
116	NC_021828	AT	3	6	56414	56419	50 %	50 %	0 %	0 %	525901214
117	NC_021828	TA	3	6	56708	56713	50 %	50 %	0 %	0 %	525901214
118	NC_021828	CT	3	6	56735	56740	0 %	50 %	0 %	50 %	525901214
119	NC_021828	TC	4	8	57116	57123	0 %	50 %	0 %	50 %	525901215
120	NC_021828	AT	3	6	57524	57529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.