MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817

Total Repeats: 9024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021827	CAGG	2	8	327	334	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021827	GTTC	2	8	393	400	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021827	GTTT	2	8	548	555	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021827	GTTT	2	8	763	770	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021827	CGAT	2	8	987	994	25 %	25 %	25 %	25 %	525896798
6	NC_021827	ATAA	2	8	1176	1183	75 %	25 %	0 %	0 %	525896798
7	NC_021827	GGTT	2	8	1265	1272	0 %	50 %	50 %	0 %	525896798
8	NC_021827	ATCC	2	8	1667	1674	25 %	25 %	0 %	50 %	525896798
9	NC_021827	GACG	2	8	2359	2366	25 %	0 %	50 %	25 %	525896798
10	NC_021827	CCAA	2	8	3080	3087	50 %	0 %	0 %	50 %	525896799
11	NC_021827	TTTC	2	8	3283	3290	0 %	75 %	0 %	25 %	525896799
12	NC_021827	TTCC	2	8	4241	4248	0 %	50 %	0 %	50 %	525896801
13	NC_021827	TAAA	2	8	4422	4429	75 %	25 %	0 %	0 %	525896801
14	NC_021827	TTCC	2	8	4584	4591	0 %	50 %	0 %	50 %	525896802
15	NC_021827	TCTT	2	8	4808	4815	0 %	75 %	0 %	25 %	525896802
16	NC_021827	CAAA	2	8	4864	4871	75 %	0 %	0 %	25 %	525896802
17	NC_021827	ATTT	2	8	6119	6126	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021827	CTAT	2	8	7111	7118	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021827	TAAT	2	8	7139	7146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021827	TTTA	2	8	7212	7219	25 %	75 %	0 %	0 %	525896804
21	NC_021827	GTTT	2	8	8130	8137	0 %	75 %	25 %	0 %	525896805
22	NC_021827	CGAG	2	8	8219	8226	25 %	0 %	50 %	25 %	525896805
23	NC_021827	TTTC	2	8	9862	9869	0 %	75 %	0 %	25 %	525896806
24	NC_021827	TTCA	2	8	9899	9906	25 %	50 %	0 %	25 %	525896806
25	NC_021827	CCAT	2	8	10149	10156	25 %	25 %	0 %	50 %	525896806
26	NC_021827	ATTG	2	8	10892	10899	25 %	50 %	25 %	0 %	525896806
27	NC_021827	TTTG	2	8	10997	11004	0 %	75 %	25 %	0 %	525896806
28	NC_021827	CTAT	2	8	11383	11390	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021827	TGTT	2	8	11414	11421	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021827	AATT	2	8	11422	11429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021827	ATGC	2	8	11964	11971	25 %	25 %	25 %	25 %	525899282
32	NC_021827	TTTG	2	8	12271	12278	0 %	75 %	25 %	0 %	525899282
33	NC_021827	AGTA	2	8	12594	12601	50 %	25 %	25 %	0 %	525899282
34	NC_021827	TTGG	2	8	12908	12915	0 %	50 %	50 %	0 %	525899282
35	NC_021827	CCTT	2	8	13386	13393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_021827	AATT	2	8	13467	13474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021827	TCGA	2	8	13901	13908	25 %	25 %	25 %	25 %	525896807
38	NC_021827	CCCA	2	8	14302	14309	25 %	0 %	0 %	75 %	525896808
39	NC_021827	TCCC	2	8	14455	14462	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_021827	ATTA	2	8	14974	14981	50 %	50 %	0 %	0 %	525896810
41	NC_021827	GGAA	2	8	15028	15035	50 %	0 %	50 %	0 %	525896810
42	NC_021827	TTGT	2	8	15248	15255	0 %	75 %	25 %	0 %	525896810
43	NC_021827	ATAA	2	8	15472	15479	75 %	25 %	0 %	0 %	525896810
44	NC_021827	AATT	2	8	16197	16204	50 %	50 %	0 %	0 %	525896810
45	NC_021827	CTTT	2	8	16618	16625	0 %	75 %	0 %	25 %	525896811
46	NC_021827	TTTG	2	8	17834	17841	0 %	75 %	25 %	0 %	525896811
47	NC_021827	TGTT	2	8	17988	17995	0 %	75 %	25 %	0 %	525896811
48	NC_021827	CTTG	2	8	18113	18120	0 %	50 %	25 %	25 %	525896811
49	NC_021827	CCAT	2	8	18121	18128	25 %	25 %	0 %	50 %	525896811
50	NC_021827	CCAA	2	8	18184	18191	50 %	0 %	0 %	50 %	525896811
51	NC_021827	GTTT	2	8	18434	18441	0 %	75 %	25 %	0 %	525896811
52	NC_021827	CATT	2	8	18956	18963	25 %	50 %	0 %	25 %	525896811
53	NC_021827	ACTT	2	8	19101	19108	25 %	50 %	0 %	25 %	525896811
54	NC_021827	TTTC	2	8	19370	19377	0 %	75 %	0 %	25 %	525896811
55	NC_021827	GCAG	2	8	19462	19469	25 %	0 %	50 %	25 %	525896811
56	NC_021827	TCGA	2	8	19905	19912	25 %	25 %	25 %	25 %	525896811
57	NC_021827	AAAG	2	8	19921	19928	75 %	0 %	25 %	0 %	525896811
58	NC_021827	ATTC	2	8	20166	20173	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_021827	AGTG	2	8	20624	20631	25 %	25 %	50 %	0 %	525896812
60	NC_021827	ATAG	2	8	21051	21058	50 %	25 %	25 %	0 %	525896813
61	NC_021827	CAAA	2	8	21555	21562	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021827	TTAT	2	8	21579	21586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021827	TCGT	2	8	21744	21751	0 %	50 %	25 %	25 %	525896814
64	NC_021827	ATAA	2	8	22121	22128	75 %	25 %	0 %	0 %	525896814
65	NC_021827	AACT	2	8	23827	23834	50 %	25 %	0 %	25 %	525896816
66	NC_021827	ATTT	2	8	24653	24660	25 %	75 %	0 %	0 %	525896818
67	NC_021827	TGTT	2	8	24949	24956	0 %	75 %	25 %	0 %	525896818
68	NC_021827	TTCA	2	8	25327	25334	25 %	50 %	0 %	25 %	525899283
69	NC_021827	CAAA	2	8	25362	25369	75 %	0 %	0 %	25 %	525899283
70	NC_021827	GATT	2	8	26071	26078	25 %	50 %	25 %	0 %	525896819
71	NC_021827	TTTG	2	8	26222	26229	0 %	75 %	25 %	0 %	525896819
72	NC_021827	TTCA	2	8	26244	26251	25 %	50 %	0 %	25 %	525896819
73	NC_021827	TCAC	2	8	26515	26522	25 %	25 %	0 %	50 %	525896819
74	NC_021827	TTTC	2	8	26530	26537	0 %	75 %	0 %	25 %	525896819
75	NC_021827	AATT	2	8	26684	26691	50 %	50 %	0 %	0 %	525899284
76	NC_021827	TTTC	2	8	26796	26803	0 %	75 %	0 %	25 %	525899284
77	NC_021827	TTGT	2	8	26853	26860	0 %	75 %	25 %	0 %	525899284
78	NC_021827	TAAG	2	8	27978	27985	50 %	25 %	25 %	0 %	525899284
79	NC_021827	GGTC	2	8	28092	28099	0 %	25 %	50 %	25 %	525899284
80	NC_021827	ACTT	2	8	28265	28272	25 %	50 %	0 %	25 %	525899284
81	NC_021827	CGCA	2	8	28442	28449	25 %	0 %	25 %	50 %	525899284
82	NC_021827	CTCC	2	8	28474	28481	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
83	NC_021827	ATTT	2	8	29508	29515	25 %	75 %	0 %	0 %	525896820
84	NC_021827	AAGT	2	8	30226	30233	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021827	AGCT	2	8	30739	30746	25 %	25 %	25 %	25 %	525896821
86	NC_021827	ATTT	2	8	30808	30815	25 %	75 %	0 %	0 %	525896821
87	NC_021827	GAAG	2	8	31096	31103	50 %	0 %	50 %	0 %	525896821
88	NC_021827	AATT	2	8	31471	31478	50 %	50 %	0 %	0 %	525896821
89	NC_021827	TTGA	2	8	31795	31802	25 %	50 %	25 %	0 %	525896821
90	NC_021827	ACTA	2	8	32080	32087	50 %	25 %	0 %	25 %	525896821
91	NC_021827	TGCT	2	8	32247	32254	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_021827	CCAA	2	8	33025	33032	50 %	0 %	0 %	50 %	525896822
93	NC_021827	ACAA	2	8	33278	33285	75 %	0 %	0 %	25 %	525896822
94	NC_021827	TAAA	2	8	33407	33414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021827	CTTT	2	8	33502	33509	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_021827	TTTA	2	8	34266	34273	25 %	75 %	0 %	0 %	525896823
97	NC_021827	TGCA	2	8	34896	34903	25 %	25 %	25 %	25 %	525896824
98	NC_021827	ATCA	2	8	35064	35071	50 %	25 %	0 %	25 %	525896824
99	NC_021827	TTGA	2	8	35114	35121	25 %	50 %	25 %	0 %	525896824
100	NC_021827	CAAC	2	8	35592	35599	50 %	0 %	0 %	50 %	525896825
101	NC_021827	ACCA	2	8	35663	35670	50 %	0 %	0 %	50 %	525896825
102	NC_021827	GTAA	2	8	36133	36140	50 %	25 %	25 %	0 %	525896825
103	NC_021827	ATGA	2	8	36766	36773	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021827	TTTG	2	8	36862	36869	0 %	75 %	25 %	0 %	525899285
105	NC_021827	ATTA	2	8	37009	37016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021827	ATTG	2	8	37231	37238	25 %	50 %	25 %	0 %	525896826
107	NC_021827	AGCA	2	8	37959	37966	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_021827	AATT	2	8	38381	38388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021827	TTAT	2	8	38532	38539	25 %	75 %	0 %	0 %	525896828
110	NC_021827	TTTC	2	8	39201	39208	0 %	75 %	0 %	25 %	525896828
111	NC_021827	AGGA	2	8	40521	40528	50 %	0 %	50 %	0 %	525896830
112	NC_021827	TTTC	2	8	40835	40842	0 %	75 %	0 %	25 %	525896830
113	NC_021827	TCTT	2	8	40900	40907	0 %	75 %	0 %	25 %	525896830
114	NC_021827	ATTC	2	8	41220	41227	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_021827	TTTC	2	8	41375	41382	0 %	75 %	0 %	25 %	525896831
116	NC_021827	TCAT	2	8	42755	42762	25 %	50 %	0 %	25 %	525896832
117	NC_021827	TTTC	2	8	42903	42910	0 %	75 %	0 %	25 %	525896832
118	NC_021827	TCAT	2	8	43068	43075	25 %	50 %	0 %	25 %	525896833
119	NC_021827	AGCA	2	8	43450	43457	50 %	0 %	25 %	25 %	525896833
120	NC_021827	GAAA	2	8	44004	44011	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021827	TAGC	2	8	44019	44026	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_021827	GGAT	2	8	44221	44228	25 %	25 %	50 %	0 %	525896834
123	NC_021827	ATTT	2	8	44351	44358	25 %	75 %	0 %	0 %	525896834
124	NC_021827	TTTC	2	8	46379	46386	0 %	75 %	0 %	25 %	525896837
125	NC_021827	ACTT	2	8	47025	47032	25 %	50 %	0 %	25 %	525896837
126	NC_021827	CAAT	2	8	47532	47539	50 %	25 %	0 %	25 %	525896838
127	NC_021827	AACT	2	8	47631	47638	50 %	25 %	0 %	25 %	525896838
128	NC_021827	GAAC	2	8	49030	49037	50 %	0 %	25 %	25 %	525896839
129	NC_021827	ATTA	2	8	49467	49474	50 %	50 %	0 %	0 %	525896839
130	NC_021827	TTTC	2	8	50057	50064	0 %	75 %	0 %	25 %	525896839
131	NC_021827	ACGA	2	8	50499	50506	50 %	0 %	25 %	25 %	525896840
132	NC_021827	TTTC	2	8	50801	50808	0 %	75 %	0 %	25 %	525896840
133	NC_021827	GAGT	2	8	50972	50979	25 %	25 %	50 %	0 %	525896840
134	NC_021827	TCAT	2	8	51145	51152	25 %	50 %	0 %	25 %	525896840
135	NC_021827	CAAT	2	8	51410	51417	50 %	25 %	0 %	25 %	525896840
136	NC_021827	TTGA	2	8	51572	51579	25 %	50 %	25 %	0 %	525896840
137	NC_021827	CCGT	2	8	52090	52097	0 %	25 %	25 %	50 %	525896840
138	NC_021827	TTTC	2	8	52294	52301	0 %	75 %	0 %	25 %	525896840
139	NC_021827	CATC	2	8	52355	52362	25 %	25 %	0 %	50 %	525896840
140	NC_021827	CTTT	2	8	52372	52379	0 %	75 %	0 %	25 %	525896841
141	NC_021827	CATA	2	8	52816	52823	50 %	25 %	0 %	25 %	525896841
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