MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817

Total Repeats: 67388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021827	TTC	2	6	4	9	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021827	AAC	2	6	13	18	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021827	CTT	2	6	40	45	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021827	GCG	2	6	53	58	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021827	CTG	2	6	99	104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021827	CAGG	2	8	327	334	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021827	TCC	2	6	387	392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_021827	GTTC	2	8	393	400	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021827	CGC	2	6	420	425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_021827	CT	3	6	453	458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021827	TTGAAT	2	12	471	482	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021827	AATTA	2	10	535	544	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021827	GTTT	2	8	548	555	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021827	TCT	3	9	624	632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021827	TCT	2	6	659	664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021827	AGC	2	6	676	681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021827	CAA	2	6	708	713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021827	T	6	6	724	729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021827	A	7	7	731	737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021827	TGA	2	6	748	753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021827	GTTT	2	8	763	770	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021827	AT	3	6	788	793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021827	T	7	7	853	859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021827	A	7	7	865	871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021827	AAT	2	6	936	941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896798
26	NC_021827	CGAT	2	8	987	994	25 %	25 %	25 %	25 %	525896798
27	NC_021827	CCA	2	6	1008	1013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896798
28	NC_021827	CGG	2	6	1016	1021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525896798
29	NC_021827	TCA	2	6	1071	1076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896798
30	NC_021827	CT	3	6	1115	1120	0 %	50 %	0 %	50 %	525896798
31	NC_021827	ATAA	2	8	1176	1183	75 %	25 %	0 %	0 %	525896798
32	NC_021827	TCT	2	6	1209	1214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
33	NC_021827	TTC	2	6	1221	1226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
34	NC_021827	GGTT	2	8	1265	1272	0 %	50 %	50 %	0 %	525896798
35	NC_021827	TCT	2	6	1284	1289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
36	NC_021827	A	6	6	1301	1306	100 %	0 %	0 %	0 %	525896798
37	NC_021827	T	6	6	1358	1363	0 %	100 %	0 %	0 %	525896798
38	NC_021827	CTT	2	6	1378	1383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
39	NC_021827	TGT	2	6	1499	1504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896798
40	NC_021827	TGC	2	6	1577	1582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896798
41	NC_021827	ATCC	2	8	1667	1674	25 %	25 %	0 %	50 %	525896798
42	NC_021827	TAA	2	6	1753	1758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896798
43	NC_021827	GCA	3	9	1767	1775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896798
44	NC_021827	CCA	2	6	1776	1781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896798
45	NC_021827	TTC	2	6	1889	1894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
46	NC_021827	GTT	2	6	1930	1935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896798
47	NC_021827	AAT	2	6	2060	2065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896798
48	NC_021827	TG	3	6	2163	2168	0 %	50 %	50 %	0 %	525896798
49	NC_021827	ATA	2	6	2199	2204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896798
50	NC_021827	AGC	2	6	2228	2233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896798
51	NC_021827	TTC	2	6	2234	2239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
52	NC_021827	TTC	2	6	2243	2248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
53	NC_021827	TTC	2	6	2279	2284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
54	NC_021827	CTT	2	6	2329	2334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
55	NC_021827	GACG	2	8	2359	2366	25 %	0 %	50 %	25 %	525896798
56	NC_021827	TTC	2	6	2384	2389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
57	NC_021827	CTATT	2	10	2420	2429	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_021827	T	6	6	2458	2463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021827	TTC	2	6	2546	2551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896799
60	NC_021827	GAA	2	6	2557	2562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896799
61	NC_021827	AGC	2	6	2612	2617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896799
62	NC_021827	CG	3	6	2624	2629	0 %	0 %	50 %	50 %	525896799
63	NC_021827	ATA	2	6	2654	2659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896799
64	NC_021827	T	6	6	2746	2751	0 %	100 %	0 %	0 %	525896799
65	NC_021827	TGGTTC	2	12	2756	2767	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525896799
66	NC_021827	GAA	2	6	2770	2775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896799
67	NC_021827	ATC	2	6	2811	2816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896799
68	NC_021827	TCT	2	6	2889	2894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896799
69	NC_021827	CAG	2	6	3037	3042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896799
70	NC_021827	TTC	2	6	3071	3076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896799
71	NC_021827	CCAA	2	8	3080	3087	50 %	0 %	0 %	50 %	525896799
72	NC_021827	CAG	2	6	3130	3135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896799
73	NC_021827	AAT	2	6	3230	3235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896799
74	NC_021827	TTTC	2	8	3283	3290	0 %	75 %	0 %	25 %	525896799
75	NC_021827	CAC	2	6	3292	3297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896799
76	NC_021827	TTTTTC	2	12	3320	3331	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525896799
77	NC_021827	AT	3	6	3336	3341	50 %	50 %	0 %	0 %	525896799
78	NC_021827	ACT	2	6	3477	3482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896799
79	NC_021827	T	6	6	3572	3577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021827	T	6	6	3609	3614	0 %	100 %	0 %	0 %	525896800
81	NC_021827	TTC	2	6	3632	3637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896800
82	NC_021827	T	6	6	3667	3672	0 %	100 %	0 %	0 %	525896800
83	NC_021827	CAT	3	9	3763	3771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896800
84	NC_021827	ATA	2	6	3772	3777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896800
85	NC_021827	AAT	2	6	3813	3818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896800
86	NC_021827	TAATTT	2	12	3970	3981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896800
87	NC_021827	AGC	2	6	3989	3994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896800
88	NC_021827	CTT	2	6	4081	4086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896801
89	NC_021827	GGA	2	6	4132	4137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525896801
90	NC_021827	TAA	2	6	4145	4150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896801
91	NC_021827	CTT	2	6	4163	4168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896801
92	NC_021827	T	6	6	4205	4210	0 %	100 %	0 %	0 %	525896801
93	NC_021827	TTCC	2	8	4241	4248	0 %	50 %	0 %	50 %	525896801
94	NC_021827	GTC	2	6	4293	4298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896801
95	NC_021827	T	6	6	4320	4325	0 %	100 %	0 %	0 %	525896801
96	NC_021827	TTC	2	6	4377	4382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896801
97	NC_021827	TAAA	2	8	4422	4429	75 %	25 %	0 %	0 %	525896801
98	NC_021827	GC	3	6	4507	4512	0 %	0 %	50 %	50 %	525896802
99	NC_021827	TTCC	2	8	4584	4591	0 %	50 %	0 %	50 %	525896802
100	NC_021827	AGT	2	6	4606	4611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896802
101	NC_021827	TCA	2	6	4682	4687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896802
102	NC_021827	CGT	2	6	4691	4696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896802
103	NC_021827	AAT	2	6	4750	4755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896802
104	NC_021827	TAA	2	6	4801	4806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896802
105	NC_021827	TCTT	2	8	4808	4815	0 %	75 %	0 %	25 %	525896802
106	NC_021827	CAAA	2	8	4864	4871	75 %	0 %	0 %	25 %	525896802
107	NC_021827	T	6	6	4915	4920	0 %	100 %	0 %	0 %	525896802
108	NC_021827	AT	3	6	5007	5012	50 %	50 %	0 %	0 %	525896802
109	NC_021827	AAT	2	6	5047	5052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896802
110	NC_021827	TTC	2	6	5062	5067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896802
111	NC_021827	CCA	2	6	5108	5113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896802
112	NC_021827	AAT	2	6	5119	5124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896802
113	NC_021827	TGC	2	6	5125	5130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896802
114	NC_021827	TCT	2	6	5135	5140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896802
115	NC_021827	CTT	2	6	5166	5171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896802
116	NC_021827	AT	3	6	5180	5185	50 %	50 %	0 %	0 %	525896802
117	NC_021827	CTT	2	6	5260	5265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896802
118	NC_021827	TAT	2	6	5293	5298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896802
119	NC_021827	A	7	7	5325	5331	100 %	0 %	0 %	0 %	525896802
120	NC_021827	G	6	6	5397	5402	0 %	0 %	100 %	0 %	525896802
121	NC_021827	AGA	2	6	5403	5408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896802
122	NC_021827	TTG	2	6	5424	5429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896802
123	NC_021827	TA	3	6	5442	5447	50 %	50 %	0 %	0 %	525896802
124	NC_021827	TGG	2	6	5461	5466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525896802
125	NC_021827	T	8	8	5507	5514	0 %	100 %	0 %	0 %	525896802
126	NC_021827	T	7	7	5520	5526	0 %	100 %	0 %	0 %	525896802
127	NC_021827	A	6	6	5532	5537	100 %	0 %	0 %	0 %	525896802
128	NC_021827	G	6	6	5604	5609	0 %	0 %	100 %	0 %	525896802
129	NC_021827	AGA	2	6	5610	5615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896802
130	NC_021827	TTG	2	6	5631	5636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896802
131	NC_021827	TA	3	6	5649	5654	50 %	50 %	0 %	0 %	525896802
132	NC_021827	TGG	2	6	5668	5673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525896802
133	NC_021827	T	7	7	5715	5721	0 %	100 %	0 %	0 %	525896802
134	NC_021827	T	7	7	5727	5733	0 %	100 %	0 %	0 %	525896802
135	NC_021827	A	6	6	5739	5744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021827	TTG	2	6	5834	5839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021827	TA	3	6	5852	5857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021827	TGG	2	6	5871	5876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021827	T	7	7	5918	5924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021827	T	7	7	5930	5936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021827	A	6	6	5942	5947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021827	TTG	2	6	6038	6043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_021827	TAT	2	6	11243	11248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_021827	AATT	2	8	11422	11429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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406	NC_021827	TGT	2	6	18073	18078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896811
407	NC_021827	TGG	2	6	18089	18094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525896811
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410	NC_021827	CCAT	2	8	18121	18128	25 %	25 %	0 %	50 %	525896811
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413	NC_021827	T	6	6	18225	18230	0 %	100 %	0 %	0 %	525896811
414	NC_021827	TCA	2	6	18304	18309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896811
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421	NC_021827	T	6	6	18822	18827	0 %	100 %	0 %	0 %	525896811
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436	NC_021827	TCT	3	9	19330	19338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896811
437	NC_021827	TTTC	2	8	19370	19377	0 %	75 %	0 %	25 %	525896811
438	NC_021827	TTTTC	2	10	19400	19409	0 %	80 %	0 %	20 %	525896811
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453	NC_021827	TCGA	2	8	19905	19912	25 %	25 %	25 %	25 %	525896811
454	NC_021827	AAAG	2	8	19921	19928	75 %	0 %	25 %	0 %	525896811
455	NC_021827	ATC	2	6	19932	19937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896811
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457	NC_021827	CTTTTT	2	12	20060	20071	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525896811
458	NC_021827	AT	3	6	20112	20117	50 %	50 %	0 %	0 %	525896811
459	NC_021827	TTG	2	6	20121	20126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896811
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461	NC_021827	GAA	2	6	20203	20208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_021827	T	6	6	20647	20652	0 %	100 %	0 %	0 %	525896812
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477	NC_021827	ATTTT	2	10	20938	20947	20 %	80 %	0 %	0 %	525896813
478	NC_021827	ATAG	2	8	21051	21058	50 %	25 %	25 %	0 %	525896813
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487	NC_021827	TTAT	2	8	21579	21586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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