MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817

Total Repeats: 67388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021827	AAG	2	6	67050	67055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_021827	CGA	2	6	67093	67098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896851
1503	NC_021827	AAG	2	6	67129	67134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896851
1504	NC_021827	AAG	2	6	67290	67295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896851
1505	NC_021827	GAA	2	6	67313	67318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896851
1506	NC_021827	CGC	2	6	67325	67330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525896851
1507	NC_021827	A	8	8	67347	67354	100 %	0 %	0 %	0 %	525896851
1508	NC_021827	ATTTT	2	10	67390	67399	20 %	80 %	0 %	0 %	525896852
1509	NC_021827	CCA	2	6	67534	67539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896852
1510	NC_021827	AAT	2	6	67579	67584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896852
1511	NC_021827	CTT	2	6	67605	67610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896852
1512	NC_021827	TTC	2	6	67657	67662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896852
1513	NC_021827	TGA	2	6	67719	67724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896852
1514	NC_021827	CG	3	6	67782	67787	0 %	0 %	50 %	50 %	525896852
1515	NC_021827	GAA	2	6	67833	67838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896852
1516	NC_021827	GTAAAA	2	12	67843	67854	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525896852
1517	NC_021827	GCA	2	6	67895	67900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896852
1518	NC_021827	CCA	2	6	68007	68012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896852
1519	NC_021827	AAT	2	6	68035	68040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896852
1520	NC_021827	TCT	2	6	68045	68050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896852
1521	NC_021827	AAT	2	6	68146	68151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896852
1522	NC_021827	CTT	2	6	68157	68162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896852
1523	NC_021827	TCT	2	6	68192	68197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896852
1524	NC_021827	TGGC	2	8	68237	68244	0 %	25 %	50 %	25 %	525896852
1525	NC_021827	CTC	2	6	68280	68285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525896853
1526	NC_021827	T	6	6	68325	68330	0 %	100 %	0 %	0 %	525896853
1527	NC_021827	CTT	2	6	68359	68364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896853
1528	NC_021827	ATGA	2	8	68382	68389	50 %	25 %	25 %	0 %	525896853
1529	NC_021827	TGT	2	6	68466	68471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896853
1530	NC_021827	CCA	2	6	68476	68481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896853
1531	NC_021827	TCA	2	6	68579	68584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896854
1532	NC_021827	ATG	2	6	68729	68734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896854
1533	NC_021827	CG	3	6	68923	68928	0 %	0 %	50 %	50 %	525896854
1534	NC_021827	T	7	7	68952	68958	0 %	100 %	0 %	0 %	525896854
1535	NC_021827	ATT	2	6	68972	68977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896854
1536	NC_021827	CTT	2	6	69011	69016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896854
1537	NC_021827	AGT	2	6	69083	69088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896854
1538	NC_021827	AAT	2	6	69094	69099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896854
1539	NC_021827	ATT	2	6	69122	69127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896854
1540	NC_021827	GAG	2	6	69163	69168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525896854
1541	NC_021827	GAAA	2	8	69184	69191	75 %	0 %	25 %	0 %	525896854
1542	NC_021827	AAT	2	6	69208	69213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896854
1543	NC_021827	AAT	2	6	69234	69239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896854
1544	NC_021827	TCA	2	6	69248	69253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896854
1545	NC_021827	AATT	2	8	69256	69263	50 %	50 %	0 %	0 %	525896854
1546	NC_021827	T	6	6	69337	69342	0 %	100 %	0 %	0 %	525896855
1547	NC_021827	TCA	2	6	69374	69379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896855
1548	NC_021827	TCCT	2	8	69421	69428	0 %	50 %	0 %	50 %	525896855
1549	NC_021827	TGC	2	6	69476	69481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896855
1550	NC_021827	AAAG	2	8	69563	69570	75 %	0 %	25 %	0 %	525896855
1551	NC_021827	TTC	2	6	69613	69618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896855
1552	NC_021827	CTC	2	6	69679	69684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525896855
1553	NC_021827	ACTG	2	8	69691	69698	25 %	25 %	25 %	25 %	525896855
1554	NC_021827	T	6	6	69712	69717	0 %	100 %	0 %	0 %	525896855
1555	NC_021827	T	6	6	69724	69729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_021827	GTT	2	6	69748	69753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896856
1557	NC_021827	TCT	2	6	69807	69812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896856
1558	NC_021827	TTTTAC	2	12	69887	69898	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525896856
1559	NC_021827	AGC	2	6	70066	70071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896856
1560	NC_021827	TCA	2	6	70116	70121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896856
1561	NC_021827	A	6	6	70219	70224	100 %	0 %	0 %	0 %	525896856
1562	NC_021827	TTA	2	6	70230	70235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896856
1563	NC_021827	ATCAAC	2	12	70250	70261	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525896856
1564	NC_021827	TCA	2	6	70296	70301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896856
1565	NC_021827	TCT	2	6	70404	70409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896856
1566	NC_021827	AATTC	2	10	70446	70455	40 %	40 %	0 %	20 %	525896856
1567	NC_021827	CAA	2	6	70468	70473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896856
1568	NC_021827	ATA	2	6	70517	70522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896856
1569	NC_021827	AACT	2	8	70594	70601	50 %	25 %	0 %	25 %	525896857
1570	NC_021827	TCT	2	6	70659	70664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896857
1571	NC_021827	CAG	2	6	70786	70791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896857
1572	NC_021827	AAT	2	6	70796	70801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896857
1573	NC_021827	ATCTT	2	10	70817	70826	20 %	60 %	0 %	20 %	525896857
1574	NC_021827	TAAT	2	8	70863	70870	50 %	50 %	0 %	0 %	525896857
1575	NC_021827	TGA	2	6	70908	70913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896857
1576	NC_021827	CACT	2	8	70937	70944	25 %	25 %	0 %	50 %	525896857
1577	NC_021827	CT	3	6	70943	70948	0 %	50 %	0 %	50 %	525896857
1578	NC_021827	CTT	2	6	70962	70967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896857
1579	NC_021827	CTG	3	9	71019	71027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896857
1580	NC_021827	TTGA	2	8	71085	71092	25 %	50 %	25 %	0 %	525896857
1581	NC_021827	TGT	2	6	71119	71124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896857
1582	NC_021827	ATA	3	9	71130	71138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896857
1583	NC_021827	TTC	2	6	71155	71160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896857
1584	NC_021827	CAG	2	6	71170	71175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896857
1585	NC_021827	T	6	6	71199	71204	0 %	100 %	0 %	0 %	525896857
1586	NC_021827	ACT	2	6	71222	71227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896857
1587	NC_021827	ATTCC	2	10	71238	71247	20 %	40 %	0 %	40 %	525896857
1588	NC_021827	GC	3	6	71271	71276	0 %	0 %	50 %	50 %	525896857
1589	NC_021827	GAT	2	6	71331	71336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896857
1590	NC_021827	CAAG	2	8	71375	71382	50 %	0 %	25 %	25 %	525896857
1591	NC_021827	A	6	6	71406	71411	100 %	0 %	0 %	0 %	525896857
1592	NC_021827	AATA	2	8	71468	71475	75 %	25 %	0 %	0 %	525896857
1593	NC_021827	A	6	6	71511	71516	100 %	0 %	0 %	0 %	525896857
1594	NC_021827	A	6	6	71566	71571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_021827	A	7	7	71637	71643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_021827	AGT	2	6	71744	71749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_021827	TAT	2	6	71750	71755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_021827	ATGA	2	8	71782	71789	50 %	25 %	25 %	0 %	525896858
1599	NC_021827	GAA	2	6	71830	71835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896858
1600	NC_021827	ATT	2	6	71836	71841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896858
1601	NC_021827	GAAAAC	2	12	71866	71877	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525896858
1602	NC_021827	CGC	2	6	71900	71905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525896858
1603	NC_021827	GC	3	6	71922	71927	0 %	0 %	50 %	50 %	525896858
1604	NC_021827	AACA	2	8	71936	71943	75 %	0 %	0 %	25 %	525896858
1605	NC_021827	A	6	6	71974	71979	100 %	0 %	0 %	0 %	525896858
1606	NC_021827	T	6	6	71983	71988	0 %	100 %	0 %	0 %	525896858
1607	NC_021827	CG	3	6	72021	72026	0 %	0 %	50 %	50 %	525896858
1608	NC_021827	TTA	2	6	72059	72064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896858
1609	NC_021827	CTG	2	6	72098	72103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896858
1610	NC_021827	ATG	2	6	72125	72130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896858
1611	NC_021827	TCA	2	6	72151	72156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896858
1612	NC_021827	AAC	3	9	72242	72250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896858
1613	NC_021827	AGA	2	6	72261	72266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896858
1614	NC_021827	TCCT	2	8	72308	72315	0 %	50 %	0 %	50 %	525896858
1615	NC_021827	CAAA	2	8	72368	72375	75 %	0 %	0 %	25 %	525896858
1616	NC_021827	TGA	2	6	72432	72437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896858
1617	NC_021827	CTT	2	6	72481	72486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896858
1618	NC_021827	ATTT	2	8	72498	72505	25 %	75 %	0 %	0 %	525896858
1619	NC_021827	CCAA	2	8	72513	72520	50 %	0 %	0 %	50 %	525896858
1620	NC_021827	CAA	2	6	72529	72534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896858
1621	NC_021827	TA	3	6	72612	72617	50 %	50 %	0 %	0 %	525896858
1622	NC_021827	TAT	2	6	72638	72643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_021827	T	6	6	72653	72658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_021827	ATT	2	6	72660	72665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896859
1625	NC_021827	TTC	2	6	72666	72671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896859
1626	NC_021827	GTG	2	6	72732	72737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525896859
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