MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817

Total Repeats: 67388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021827	TCA	2	6	43860	43865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896833
1002	NC_021827	TCTAT	2	10	43989	43998	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1003	NC_021827	GAAA	2	8	44004	44011	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_021827	A	6	6	44009	44014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021827	TAGC	2	8	44019	44026	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_021827	AAC	2	6	44034	44039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_021827	TAT	2	6	44093	44098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896834
1008	NC_021827	TAT	2	6	44112	44117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896834
1009	NC_021827	GTT	2	6	44185	44190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896834
1010	NC_021827	GGAT	2	8	44221	44228	25 %	25 %	50 %	0 %	525896834
1011	NC_021827	ACC	2	6	44272	44277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896834
1012	NC_021827	TCAATG	2	12	44286	44297	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525896834
1013	NC_021827	ATTT	2	8	44351	44358	25 %	75 %	0 %	0 %	525896834
1014	NC_021827	T	7	7	44457	44463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021827	A	7	7	44465	44471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_021827	A	6	6	44485	44490	100 %	0 %	0 %	0 %	525896835
1017	NC_021827	ATT	2	6	44631	44636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896835
1018	NC_021827	TCT	2	6	44649	44654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896835
1019	NC_021827	TTC	2	6	44691	44696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896835
1020	NC_021827	AAT	2	6	44946	44951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896835
1021	NC_021827	TCC	2	6	45031	45036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525896835
1022	NC_021827	ATT	2	6	45075	45080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896835
1023	NC_021827	ACT	2	6	45139	45144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896835
1024	NC_021827	GC	3	6	45176	45181	0 %	0 %	50 %	50 %	525896835
1025	NC_021827	T	7	7	45287	45293	0 %	100 %	0 %	0 %	525896835
1026	NC_021827	CTT	2	6	45309	45314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896835
1027	NC_021827	TTC	2	6	45329	45334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896835
1028	NC_021827	TCC	2	6	45365	45370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525896836
1029	NC_021827	CTA	2	6	45393	45398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896836
1030	NC_021827	GTT	2	6	45441	45446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896836
1031	NC_021827	T	6	6	45483	45488	0 %	100 %	0 %	0 %	525896836
1032	NC_021827	CGCTCC	2	12	45502	45513	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	525896836
1033	NC_021827	AAG	2	6	45517	45522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896836
1034	NC_021827	T	6	6	45726	45731	0 %	100 %	0 %	0 %	525896836
1035	NC_021827	ATA	2	6	45758	45763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896836
1036	NC_021827	CGC	2	6	45765	45770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525896836
1037	NC_021827	CGTCC	2	10	45876	45885	0 %	20 %	20 %	60 %	525896836
1038	NC_021827	TAC	2	6	45931	45936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_021827	T	6	6	45941	45946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021827	AT	3	6	45960	45965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_021827	A	6	6	45987	45992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021827	TTC	2	6	46055	46060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896837
1043	NC_021827	GCC	2	6	46125	46130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525896837
1044	NC_021827	AAT	2	6	46188	46193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896837
1045	NC_021827	GTA	2	6	46255	46260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896837
1046	NC_021827	ACC	2	6	46302	46307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896837
1047	NC_021827	TGA	5	15	46317	46331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896837
1048	NC_021827	TTTC	2	8	46379	46386	0 %	75 %	0 %	25 %	525896837
1049	NC_021827	ACT	2	6	46399	46404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896837
1050	NC_021827	T	7	7	46412	46418	0 %	100 %	0 %	0 %	525896837
1051	NC_021827	T	6	6	46449	46454	0 %	100 %	0 %	0 %	525896837
1052	NC_021827	CAA	2	6	46487	46492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896837
1053	NC_021827	CTT	2	6	46511	46516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896837
1054	NC_021827	ATC	2	6	46548	46553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896837
1055	NC_021827	TA	3	6	46559	46564	50 %	50 %	0 %	0 %	525896837
1056	NC_021827	TTTTC	2	10	46589	46598	0 %	80 %	0 %	20 %	525896837
1057	NC_021827	T	6	6	46634	46639	0 %	100 %	0 %	0 %	525896837
1058	NC_021827	AC	3	6	46667	46672	50 %	0 %	0 %	50 %	525896837
1059	NC_021827	TTTTGT	2	12	46722	46733	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525896837
1060	NC_021827	T	7	7	46749	46755	0 %	100 %	0 %	0 %	525896837
1061	NC_021827	T	6	6	46917	46922	0 %	100 %	0 %	0 %	525896837
1062	NC_021827	ACTT	2	8	47025	47032	25 %	50 %	0 %	25 %	525896837
1063	NC_021827	T	6	6	47090	47095	0 %	100 %	0 %	0 %	525896837
1064	NC_021827	A	6	6	47147	47152	100 %	0 %	0 %	0 %	525896837
1065	NC_021827	CTA	2	6	47159	47164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896837
1066	NC_021827	TGA	2	6	47205	47210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896837
1067	NC_021827	CTG	2	6	47224	47229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896837
1068	NC_021827	TA	3	6	47275	47280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_021827	GAA	2	6	47290	47295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_021827	T	6	6	47303	47308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_021827	A	6	6	47342	47347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_021827	ATT	2	6	47375	47380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_021827	TCA	2	6	47464	47469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_021827	CAAT	2	8	47532	47539	50 %	25 %	0 %	25 %	525896838
1075	NC_021827	TTTTA	2	10	47541	47550	20 %	80 %	0 %	0 %	525896838
1076	NC_021827	T	7	7	47556	47562	0 %	100 %	0 %	0 %	525896838
1077	NC_021827	ATTTC	2	10	47597	47606	20 %	60 %	0 %	20 %	525896838
1078	NC_021827	T	6	6	47621	47626	0 %	100 %	0 %	0 %	525896838
1079	NC_021827	AACT	2	8	47631	47638	50 %	25 %	0 %	25 %	525896838
1080	NC_021827	TAA	2	6	47709	47714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896838
1081	NC_021827	TCC	2	6	47778	47783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525896838
1082	NC_021827	CTT	2	6	47864	47869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896838
1083	NC_021827	CTT	2	6	47879	47884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896838
1084	NC_021827	AAC	2	6	47895	47900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896838
1085	NC_021827	TCT	2	6	47902	47907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896838
1086	NC_021827	CTT	2	6	47945	47950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896838
1087	NC_021827	ACT	2	6	48043	48048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896838
1088	NC_021827	GT	3	6	48054	48059	0 %	50 %	50 %	0 %	525896838
1089	NC_021827	CGA	2	6	48128	48133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896838
1090	NC_021827	TTA	2	6	48190	48195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896838
1091	NC_021827	CAC	2	6	48201	48206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896838
1092	NC_021827	CTT	2	6	48248	48253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896838
1093	NC_021827	ATC	3	9	48258	48266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896838
1094	NC_021827	TCC	2	6	48315	48320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_021827	TAA	2	6	48321	48326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_021827	TAT	2	6	48340	48345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_021827	A	7	7	48367	48373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_021827	TGG	2	6	48387	48392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_021827	TTGAT	2	10	48409	48418	20 %	60 %	20 %	0 %	525896839
1100	NC_021827	TCA	2	6	48514	48519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896839
1101	NC_021827	TTC	3	9	48531	48539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896839
1102	NC_021827	TAA	2	6	48615	48620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896839
1103	NC_021827	TGA	2	6	48641	48646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896839
1104	NC_021827	TAA	2	6	48668	48673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896839
1105	NC_021827	GTA	3	9	48681	48689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896839
1106	NC_021827	CTT	2	6	48716	48721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896839
1107	NC_021827	GTT	2	6	48723	48728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896839
1108	NC_021827	TAT	2	6	48794	48799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896839
1109	NC_021827	ATG	2	6	48853	48858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896839
1110	NC_021827	ATC	2	6	48924	48929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896839
1111	NC_021827	TTC	2	6	48963	48968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896839
1112	NC_021827	AT	3	6	48979	48984	50 %	50 %	0 %	0 %	525896839
1113	NC_021827	TCA	2	6	48995	49000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896839
1114	NC_021827	GAAC	2	8	49030	49037	50 %	0 %	25 %	25 %	525896839
1115	NC_021827	ATT	2	6	49089	49094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896839
1116	NC_021827	ATT	2	6	49251	49256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896839
1117	NC_021827	TCA	2	6	49316	49321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896839
1118	NC_021827	CTT	2	6	49340	49345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896839
1119	NC_021827	ATTA	2	8	49467	49474	50 %	50 %	0 %	0 %	525896839
1120	NC_021827	TCA	2	6	49517	49522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896839
1121	NC_021827	TAT	2	6	49523	49528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896839
1122	NC_021827	T	6	6	49575	49580	0 %	100 %	0 %	0 %	525896839
1123	NC_021827	T	6	6	49610	49615	0 %	100 %	0 %	0 %	525896839
1124	NC_021827	TCA	2	6	49744	49749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896839
1125	NC_021827	AAC	2	6	49761	49766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896839
1126	NC_021827	T	6	6	49853	49858	0 %	100 %	0 %	0 %	525896839
1127	NC_021827	AAT	2	6	49946	49951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896839
1128	NC_021827	T	7	7	50039	50045	0 %	100 %	0 %	0 %	525896839
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1130	NC_021827	TTTC	2	8	50057	50064	0 %	75 %	0 %	25 %	525896839
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