MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817

Total Repeats: 67388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021827	ATAA	2	8	22121	22128	75 %	25 %	0 %	0 %	525896814
502	NC_021827	GTT	2	6	22179	22184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896814
503	NC_021827	TGT	2	6	22205	22210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896814
504	NC_021827	A	6	6	22217	22222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_021827	CACTC	2	10	22224	22233	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
506	NC_021827	TAT	2	6	22407	22412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021827	AAC	2	6	22413	22418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_021827	T	6	6	22419	22424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_021827	T	6	6	22488	22493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021827	AGG	2	6	22496	22501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_021827	ATC	2	6	22517	22522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896815
512	NC_021827	A	6	6	22523	22528	100 %	0 %	0 %	0 %	525896815
513	NC_021827	GAA	2	6	22683	22688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896815
514	NC_021827	GTT	2	6	22732	22737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896815
515	NC_021827	TCT	2	6	22853	22858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896815
516	NC_021827	CA	3	6	23065	23070	50 %	0 %	0 %	50 %	525896815
517	NC_021827	CGG	2	6	23076	23081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525896815
518	NC_021827	ATT	2	6	23167	23172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896815
519	NC_021827	A	6	6	23176	23181	100 %	0 %	0 %	0 %	525896815
520	NC_021827	TGC	2	6	23202	23207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896815
521	NC_021827	TTG	2	6	23351	23356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896815
522	NC_021827	AAAGAA	2	12	23374	23385	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525896815
523	NC_021827	A	6	6	23413	23418	100 %	0 %	0 %	0 %	525896815
524	NC_021827	GAC	2	6	23425	23430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896815
525	NC_021827	T	7	7	23488	23494	0 %	100 %	0 %	0 %	525896816
526	NC_021827	GAG	2	6	23515	23520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525896816
527	NC_021827	ATT	2	6	23661	23666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896816
528	NC_021827	A	6	6	23684	23689	100 %	0 %	0 %	0 %	525896816
529	NC_021827	ATA	2	6	23722	23727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896816
530	NC_021827	AACT	2	8	23827	23834	50 %	25 %	0 %	25 %	525896816
531	NC_021827	TGA	2	6	23864	23869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896816
532	NC_021827	CG	3	6	23988	23993	0 %	0 %	50 %	50 %	525896816
533	NC_021827	TAT	2	6	24047	24052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896816
534	NC_021827	TA	3	6	24171	24176	50 %	50 %	0 %	0 %	525896816
535	NC_021827	AGT	2	6	24227	24232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_021827	AAC	2	6	24278	24283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896817
537	NC_021827	A	7	7	24321	24327	100 %	0 %	0 %	0 %	525896817
538	NC_021827	TCA	2	6	24343	24348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896817
539	NC_021827	TTC	2	6	24393	24398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896817
540	NC_021827	TTA	2	6	24430	24435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896817
541	NC_021827	AAC	2	6	24466	24471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896817
542	NC_021827	TGT	2	6	24575	24580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896817
543	NC_021827	ATT	2	6	24595	24600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896817
544	NC_021827	AAG	2	6	24610	24615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_021827	CTT	2	6	24635	24640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_021827	ATTT	2	8	24653	24660	25 %	75 %	0 %	0 %	525896818
547	NC_021827	CTT	2	6	24666	24671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896818
548	NC_021827	TCC	2	6	24704	24709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525896818
549	NC_021827	ATC	2	6	24817	24822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896818
550	NC_021827	TCTTT	2	10	24834	24843	0 %	80 %	0 %	20 %	525896818
551	NC_021827	TTG	2	6	24873	24878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896818
552	NC_021827	T	6	6	24888	24893	0 %	100 %	0 %	0 %	525896818
553	NC_021827	TCT	2	6	24899	24904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896818
554	NC_021827	TGTT	2	8	24949	24956	0 %	75 %	25 %	0 %	525896818
555	NC_021827	TCT	2	6	25034	25039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896818
556	NC_021827	TCC	2	6	25123	25128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_021827	T	6	6	25136	25141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_021827	T	6	6	25209	25214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_021827	TCA	2	6	25274	25279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525899283
560	NC_021827	TTCA	2	8	25327	25334	25 %	50 %	0 %	25 %	525899283
561	NC_021827	CAAA	2	8	25362	25369	75 %	0 %	0 %	25 %	525899283
562	NC_021827	T	6	6	25373	25378	0 %	100 %	0 %	0 %	525899283
563	NC_021827	GAA	2	6	25384	25389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525899283
564	NC_021827	T	6	6	25395	25400	0 %	100 %	0 %	0 %	525899283
565	NC_021827	T	6	6	25409	25414	0 %	100 %	0 %	0 %	525899283
566	NC_021827	TTAAA	2	10	25455	25464	60 %	40 %	0 %	0 %	525899283
567	NC_021827	TAT	2	6	25492	25497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525899283
568	NC_021827	TA	3	6	25564	25569	50 %	50 %	0 %	0 %	525899283
569	NC_021827	TCC	2	6	25583	25588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_021827	AT	3	6	25596	25601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_021827	AT	3	6	25626	25631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_021827	T	7	7	25655	25661	0 %	100 %	0 %	0 %	525896819
573	NC_021827	CTA	2	6	25757	25762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896819
574	NC_021827	T	6	6	25770	25775	0 %	100 %	0 %	0 %	525896819
575	NC_021827	TCT	2	6	25879	25884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896819
576	NC_021827	TGG	2	6	25944	25949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525896819
577	NC_021827	ATT	2	6	25968	25973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896819
578	NC_021827	TAA	2	6	26002	26007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896819
579	NC_021827	GATT	2	8	26071	26078	25 %	50 %	25 %	0 %	525896819
580	NC_021827	TAT	2	6	26129	26134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896819
581	NC_021827	ATA	2	6	26178	26183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896819
582	NC_021827	AT	3	6	26205	26210	50 %	50 %	0 %	0 %	525896819
583	NC_021827	TTTG	2	8	26222	26229	0 %	75 %	25 %	0 %	525896819
584	NC_021827	TTCA	2	8	26244	26251	25 %	50 %	0 %	25 %	525896819
585	NC_021827	T	6	6	26291	26296	0 %	100 %	0 %	0 %	525896819
586	NC_021827	G	6	6	26406	26411	0 %	0 %	100 %	0 %	525896819
587	NC_021827	TCA	2	6	26422	26427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896819
588	NC_021827	T	6	6	26499	26504	0 %	100 %	0 %	0 %	525896819
589	NC_021827	TCAC	2	8	26515	26522	25 %	25 %	0 %	50 %	525896819
590	NC_021827	TTTC	2	8	26530	26537	0 %	75 %	0 %	25 %	525896819
591	NC_021827	T	6	6	26556	26561	0 %	100 %	0 %	0 %	525899284
592	NC_021827	CGT	2	6	26630	26635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525899284
593	NC_021827	TTC	2	6	26648	26653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899284
594	NC_021827	TCT	2	6	26667	26672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899284
595	NC_021827	AATT	2	8	26684	26691	50 %	50 %	0 %	0 %	525899284
596	NC_021827	CTT	2	6	26695	26700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899284
597	NC_021827	CAG	2	6	26707	26712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525899284
598	NC_021827	T	7	7	26717	26723	0 %	100 %	0 %	0 %	525899284
599	NC_021827	ATT	2	6	26732	26737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525899284
600	NC_021827	TTTC	2	8	26796	26803	0 %	75 %	0 %	25 %	525899284
601	NC_021827	CTT	2	6	26809	26814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899284
602	NC_021827	TTGT	2	8	26853	26860	0 %	75 %	25 %	0 %	525899284
603	NC_021827	TGC	2	6	26933	26938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525899284
604	NC_021827	T	8	8	26968	26975	0 %	100 %	0 %	0 %	525899284
605	NC_021827	T	7	7	26995	27001	0 %	100 %	0 %	0 %	525899284
606	NC_021827	T	6	6	27044	27049	0 %	100 %	0 %	0 %	525899284
607	NC_021827	GC	3	6	27073	27078	0 %	0 %	50 %	50 %	525899284
608	NC_021827	GCT	2	6	27116	27121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525899284
609	NC_021827	A	6	6	27141	27146	100 %	0 %	0 %	0 %	525899284
610	NC_021827	TCT	3	9	27207	27215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899284
611	NC_021827	TTC	2	6	27269	27274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899284
612	NC_021827	ACC	2	6	27287	27292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525899284
613	NC_021827	CTT	2	6	27307	27312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899284
614	NC_021827	TGG	2	6	27323	27328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525899284
615	NC_021827	TCT	2	6	27444	27449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899284
616	NC_021827	AAG	2	6	27509	27514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525899284
617	NC_021827	GGT	3	9	27558	27566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525899284
618	NC_021827	AAG	2	6	27614	27619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525899284
619	NC_021827	GGT	2	6	27666	27671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525899284
620	NC_021827	TCT	2	6	27703	27708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899284
621	NC_021827	TAA	2	6	27713	27718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525899284
622	NC_021827	CAA	2	6	27745	27750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525899284
623	NC_021827	TTC	2	6	27756	27761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899284
624	NC_021827	TCG	2	6	27774	27779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525899284
625	NC_021827	T	7	7	27814	27820	0 %	100 %	0 %	0 %	525899284
626	NC_021827	GTT	2	6	27841	27846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525899284
627	NC_021827	T	6	6	27944	27949	0 %	100 %	0 %	0 %	525899284
628	NC_021827	TTG	2	6	27961	27966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525899284
629	NC_021827	TAAG	2	8	27978	27985	50 %	25 %	25 %	0 %	525899284
630	NC_021827	GAT	2	6	28005	28010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525899284
631	NC_021827	CTT	2	6	28023	28028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899284
632	NC_021827	T	7	7	28027	28033	0 %	100 %	0 %	0 %	525899284
633	NC_021827	GAC	2	6	28069	28074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525899284
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