MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817

Total Repeats: 67388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021827	AGC	2	6	195100	195105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896941
4502	NC_021827	CTA	2	6	195120	195125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896941
4503	NC_021827	TGA	2	6	195131	195136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896941
4504	NC_021827	AGAA	2	8	195172	195179	75 %	0 %	25 %	0 %	525896941
4505	NC_021827	CCG	2	6	195209	195214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525896941
4506	NC_021827	ACC	2	6	195250	195255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896941
4507	NC_021827	TTG	2	6	195294	195299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896941
4508	NC_021827	ATC	2	6	195314	195319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896941
4509	NC_021827	TCT	2	6	195410	195415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896941
4510	NC_021827	T	7	7	195447	195453	0 %	100 %	0 %	0 %	525896941
4511	NC_021827	ATTT	2	8	195476	195483	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_021827	TCA	2	6	195530	195535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_021827	T	7	7	195570	195576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_021827	AGA	2	6	195641	195646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_021827	CCT	2	6	195657	195662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4516	NC_021827	CT	3	6	195689	195694	0 %	50 %	0 %	50 %	525899334
4517	NC_021827	GTTTT	2	10	195711	195720	0 %	80 %	20 %	0 %	525899334
4518	NC_021827	ATG	2	6	195790	195795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525899334
4519	NC_021827	GAA	2	6	195813	195818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525899334
4520	NC_021827	AAG	3	9	195980	195988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525899334
4521	NC_021827	TGT	2	6	195995	196000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525899334
4522	NC_021827	TTG	2	6	196197	196202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525899334
4523	NC_021827	ATT	2	6	196243	196248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525899334
4524	NC_021827	TCA	2	6	196259	196264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525899334
4525	NC_021827	ACT	2	6	196430	196435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525899334
4526	NC_021827	CTT	2	6	196446	196451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899334
4527	NC_021827	T	6	6	196450	196455	0 %	100 %	0 %	0 %	525899334
4528	NC_021827	ATA	2	6	196543	196548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525899334
4529	NC_021827	TTC	2	6	196564	196569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899334
4530	NC_021827	T	6	6	196673	196678	0 %	100 %	0 %	0 %	525899334
4531	NC_021827	TTTG	2	8	196703	196710	0 %	75 %	25 %	0 %	525899334
4532	NC_021827	CTT	2	6	196743	196748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899334
4533	NC_021827	TCA	2	6	196761	196766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525899334
4534	NC_021827	TTG	2	6	196767	196772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525899334
4535	NC_021827	CAG	2	6	196822	196827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896942
4536	NC_021827	CG	3	6	196847	196852	0 %	0 %	50 %	50 %	525896942
4537	NC_021827	GGTA	2	8	196872	196879	25 %	25 %	50 %	0 %	525896942
4538	NC_021827	ATA	2	6	196896	196901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896942
4539	NC_021827	CG	3	6	196922	196927	0 %	0 %	50 %	50 %	525896942
4540	NC_021827	TGG	2	6	196964	196969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525896942
4541	NC_021827	GAT	2	6	197167	197172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896942
4542	NC_021827	GAT	2	6	197213	197218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896942
4543	NC_021827	CCG	2	6	197223	197228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525896942
4544	NC_021827	TGT	2	6	197313	197318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896942
4545	NC_021827	AAG	2	6	197320	197325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896942
4546	NC_021827	GTA	2	6	197458	197463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896942
4547	NC_021827	ACTA	2	8	197501	197508	50 %	25 %	0 %	25 %	525896942
4548	NC_021827	AAT	2	6	197519	197524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896942
4549	NC_021827	ATG	2	6	197548	197553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896942
4550	NC_021827	T	6	6	197618	197623	0 %	100 %	0 %	0 %	525896942
4551	NC_021827	AGC	2	6	197663	197668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896942
4552	NC_021827	GAT	2	6	197669	197674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896942
4553	NC_021827	CGC	2	6	197719	197724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525896942
4554	NC_021827	ACA	2	6	197781	197786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896942
4555	NC_021827	AGC	2	6	197789	197794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896942
4556	NC_021827	TGC	2	6	197864	197869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896942
4557	NC_021827	ATA	2	6	197880	197885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896942
4558	NC_021827	AAT	2	6	197923	197928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896942
4559	NC_021827	GAAT	2	8	197941	197948	50 %	25 %	25 %	0 %	525896942
4560	NC_021827	CAAG	2	8	197989	197996	50 %	0 %	25 %	25 %	525896942
4561	NC_021827	AAT	2	6	198008	198013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896942
4562	NC_021827	ATC	2	6	198024	198029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896942
4563	NC_021827	T	6	6	198076	198081	0 %	100 %	0 %	0 %	525896942
4564	NC_021827	TC	3	6	198125	198130	0 %	50 %	0 %	50 %	525896942
4565	NC_021827	T	7	7	198139	198145	0 %	100 %	0 %	0 %	525896942
4566	NC_021827	TCC	2	6	198147	198152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525896943
4567	NC_021827	ATT	2	6	198239	198244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896943
4568	NC_021827	CAT	2	6	198365	198370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896943
4569	NC_021827	TCG	2	6	198546	198551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896943
4570	NC_021827	TTC	2	6	198587	198592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896943
4571	NC_021827	TGT	2	6	198618	198623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896943
4572	NC_021827	T	6	6	198656	198661	0 %	100 %	0 %	0 %	525896943
4573	NC_021827	CTG	2	6	198670	198675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896943
4574	NC_021827	T	6	6	198710	198715	0 %	100 %	0 %	0 %	525896943
4575	NC_021827	GTTT	2	8	198753	198760	0 %	75 %	25 %	0 %	525896943
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4577	NC_021827	TAAA	2	8	198806	198813	75 %	25 %	0 %	0 %	525896943
4578	NC_021827	TGA	2	6	198828	198833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896943
4579	NC_021827	AT	3	6	198971	198976	50 %	50 %	0 %	0 %	525896943
4580	NC_021827	TTTG	2	8	198980	198987	0 %	75 %	25 %	0 %	525896943
4581	NC_021827	AAG	2	6	199015	199020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896943
4582	NC_021827	ATA	2	6	199028	199033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896943
4583	NC_021827	TAG	2	6	199159	199164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896943
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4585	NC_021827	CAT	2	6	199252	199257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896943
4586	NC_021827	CAA	2	6	199267	199272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896943
4587	NC_021827	AAAAT	2	10	199338	199347	80 %	20 %	0 %	0 %	525896943
4588	NC_021827	CTT	2	6	199363	199368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896943
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4590	NC_021827	GCT	2	6	199459	199464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896943
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4593	NC_021827	AGA	2	6	199616	199621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896943
4594	NC_021827	AAT	2	6	199724	199729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896943
4595	NC_021827	AAC	2	6	199775	199780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896943
4596	NC_021827	TTG	2	6	199827	199832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896943
4597	NC_021827	TAT	2	6	199891	199896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896943
4598	NC_021827	TAATT	2	10	199943	199952	40 %	60 %	0 %	0 %	525896943
4599	NC_021827	AAT	2	6	199962	199967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896943
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4602	NC_021827	CAT	2	6	200068	200073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896943
4603	NC_021827	AT	4	8	200120	200127	50 %	50 %	0 %	0 %	525896943
4604	NC_021827	CGT	2	6	200146	200151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896943
4605	NC_021827	GAA	2	6	200337	200342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896943
4606	NC_021827	TGT	2	6	200412	200417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896943
4607	NC_021827	TAAA	2	8	200425	200432	75 %	25 %	0 %	0 %	525896943
4608	NC_021827	AAT	2	6	200510	200515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896943
4609	NC_021827	TCC	2	6	200560	200565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525896944
4610	NC_021827	AAC	2	6	200638	200643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896944
4611	NC_021827	A	6	6	200699	200704	100 %	0 %	0 %	0 %	525896944
4612	NC_021827	TAGC	2	8	200781	200788	25 %	25 %	25 %	25 %	525896944
4613	NC_021827	AAT	2	6	200806	200811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896944
4614	NC_021827	GAA	2	6	200847	200852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896944
4615	NC_021827	AGTT	2	8	200863	200870	25 %	50 %	25 %	0 %	525896944
4616	NC_021827	CTT	2	6	200928	200933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896944
4617	NC_021827	CA	3	6	200962	200967	50 %	0 %	0 %	50 %	525896944
4618	NC_021827	CTA	2	6	201009	201014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896944
4619	NC_021827	TCCA	2	8	201064	201071	25 %	25 %	0 %	50 %	525896944
4620	NC_021827	CAG	2	6	201081	201086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896944
4621	NC_021827	TAAA	3	12	201106	201117	75 %	25 %	0 %	0 %	525896944
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4623	NC_021827	CCAA	2	8	201136	201143	50 %	0 %	0 %	50 %	525896944
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4873	NC_021827	TCCAT	2	10	211435	211444	20 %	40 %	0 %	40 %	525896951
4874	NC_021827	TCC	2	6	211460	211465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525896951
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4881	NC_021827	CTA	2	6	211624	211629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896951
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4892	NC_021827	AAT	2	6	212043	212048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4981	NC_021827	TAA	2	6	216193	216198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4982	NC_021827	CATTT	2	10	216238	216247	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4993	NC_021827	GAA	2	6	216899	216904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896958
4994	NC_021827	A	6	6	216948	216953	100 %	0 %	0 %	0 %	525896958
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4997	NC_021827	TTG	2	6	217100	217105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896958
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4999	NC_021827	TAAAA	2	10	217137	217146	80 %	20 %	0 %	0 %	525896958
5000	NC_021827	GAT	2	6	217158	217163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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