MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes strain N1-011A

Total Repeats: 44179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021826	ATT	2	6	68	73	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021826	GAA	2	6	83	88	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021826	AGT	2	6	128	133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021826	ATA	2	6	237	242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021826	TGA	2	6	310	315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021826	CTA	2	6	390	395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021826	TAT	2	6	440	445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021826	TTA	2	6	446	451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021826	TAA	2	6	472	477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021826	AGA	2	6	520	525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021826	AGA	2	6	592	597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021826	GAA	2	6	643	648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021826	AAT	2	6	688	693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021826	TGA	2	6	812	817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525888609
15	NC_021826	GTT	2	6	840	845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525888609
16	NC_021826	GAA	2	6	882	887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021826	AGA	2	6	926	931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021826	TAA	2	6	970	975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888610
19	NC_021826	AGA	2	6	989	994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888610
20	NC_021826	TAT	2	6	1004	1009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888610
21	NC_021826	TCT	2	6	1021	1026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525888610
22	NC_021826	TAA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888610
23	NC_021826	ACG	2	6	1116	1121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021826	TCG	2	6	1132	1137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021826	AAT	2	6	1153	1158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021826	TTG	2	6	1246	1251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021826	ATA	2	6	1336	1341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021826	AAT	2	6	1428	1433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021826	TCC	2	6	1554	1559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_021826	TCA	2	6	1584	1589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021826	CAT	2	6	1612	1617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021826	AAC	2	6	1618	1623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021826	AAG	2	6	1648	1653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021826	CAT	2	6	1712	1717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021826	AGA	2	6	1730	1735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021826	ATC	2	6	1772	1777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525888611
37	NC_021826	TGT	2	6	1821	1826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525888611
38	NC_021826	TTC	2	6	1899	1904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525888611
39	NC_021826	ATT	2	6	1922	1927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888611
40	NC_021826	TTA	2	6	1977	1982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888611
41	NC_021826	TTA	2	6	2010	2015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888611
42	NC_021826	TGT	2	6	2065	2070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525888611
43	NC_021826	GTG	2	6	2093	2098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525888611
44	NC_021826	TTC	2	6	2117	2122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525888611
45	NC_021826	CCT	2	6	2404	2409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525888611
46	NC_021826	TTA	2	6	2497	2502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888611
47	NC_021826	CCA	2	6	2569	2574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525888611
48	NC_021826	CAT	2	6	2584	2589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525888611
49	NC_021826	GTT	2	6	2594	2599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525888611
50	NC_021826	ATT	2	6	2638	2643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021826	AAT	2	6	2655	2660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021826	ACA	2	6	2696	2701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021826	ATA	2	6	2819	2824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021826	ATT	2	6	2919	2924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021826	CTA	2	6	2944	2949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021826	AAC	2	6	3016	3021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021826	TAA	2	6	3040	3045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021826	AAT	2	6	3056	3061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021826	CTT	2	6	3155	3160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021826	GAT	2	6	3217	3222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021826	GAA	2	6	3412	3417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888612
62	NC_021826	TCA	2	6	3423	3428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525888612
63	NC_021826	AAG	2	6	3467	3472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888612
64	NC_021826	GAG	2	6	3479	3484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525888612
65	NC_021826	AGA	2	6	3513	3518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888612
66	NC_021826	AAT	2	6	3580	3585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888612
67	NC_021826	ACA	2	6	3630	3635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525888612
68	NC_021826	AAC	2	6	3709	3714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525888613
69	NC_021826	TAC	2	6	3745	3750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525888613
70	NC_021826	ATG	2	6	3766	3771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525888613
71	NC_021826	GAA	2	6	3794	3799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888613
72	NC_021826	AAT	2	6	3841	3846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888614
73	NC_021826	CTA	2	6	3906	3911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525888614
74	NC_021826	GAA	2	6	3995	4000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888614
75	NC_021826	AAG	2	6	4036	4041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888614
76	NC_021826	ATA	2	6	4074	4079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888614
77	NC_021826	TTA	2	6	4122	4127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888614
78	NC_021826	AGA	2	6	4162	4167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888614
79	NC_021826	CTT	2	6	4168	4173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525888614
80	NC_021826	TAA	2	6	4181	4186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888614
81	NC_021826	AAG	2	6	4233	4238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888615
82	NC_021826	ATT	2	6	4371	4376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888615
83	NC_021826	AAT	2	6	4385	4390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888615
84	NC_021826	TAA	2	6	4503	4508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888615
85	NC_021826	AAT	2	6	4526	4531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888615
86	NC_021826	TAT	2	6	4609	4614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888615
87	NC_021826	ATA	2	6	4636	4641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888615
88	NC_021826	ATT	2	6	4662	4667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021826	TGG	2	6	4714	4719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021826	AAT	2	6	4749	4754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888616
91	NC_021826	TTA	2	6	4818	4823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888616
92	NC_021826	TTA	2	6	4874	4879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888616
93	NC_021826	TTC	2	6	4885	4890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525888616
94	NC_021826	AAT	2	6	4971	4976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888616
95	NC_021826	TAT	2	6	5144	5149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888616
96	NC_021826	AGA	2	6	5232	5237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888617
97	NC_021826	TGA	2	6	5322	5327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525888617
98	NC_021826	ATG	2	6	5378	5383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525888617
99	NC_021826	TGA	2	6	5409	5414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525888617
100	NC_021826	AGT	2	6	5509	5514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525888617
101	NC_021826	ATA	2	6	5725	5730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021826	TTA	2	6	5771	5776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021826	ATA	2	6	5815	5820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021826	GAG	2	6	5855	5860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021826	TAA	2	6	5931	5936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021826	AAC	3	9	5969	5977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_021826	CAG	2	6	5985	5990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021826	AAT	2	6	6004	6009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021826	ATC	2	6	6086	6091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525888618
110	NC_021826	ACA	2	6	6104	6109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525888618
111	NC_021826	TAT	2	6	6189	6194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888618
112	NC_021826	TAC	2	6	6280	6285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525888618
113	NC_021826	CGG	2	6	6322	6327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525888618
114	NC_021826	GTT	2	6	6565	6570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525886095
115	NC_021826	TGT	2	6	6605	6610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525886095
116	NC_021826	TGG	2	6	6689	6694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525886095
117	NC_021826	TCT	2	6	6754	6759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525886095
118	NC_021826	TTC	2	6	6797	6802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525886095
119	NC_021826	AAT	2	6	6872	6877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525886096
120	NC_021826	GAA	2	6	6882	6887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525886096
121	NC_021826	GAA	2	6	6962	6967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525886096
122	NC_021826	TTG	2	6	6991	6996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525886096
123	NC_021826	TGA	2	6	7037	7042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525886096
124	NC_021826	TTG	2	6	7069	7074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525886096
125	NC_021826	TGA	3	9	7079	7087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525886096
126	NC_021826	GCT	2	6	7170	7175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525886096
127	NC_021826	GTG	2	6	7190	7195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525886096
128	NC_021826	ATT	2	6	7255	7260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525886096
129	NC_021826	TCT	2	6	7289	7294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021826	CTA	2	6	7344	7349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525886097
131	NC_021826	CAA	2	6	7374	7379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525886097
132	NC_021826	TGA	2	6	7383	7388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525886097
133	NC_021826	CTG	2	6	7500	7505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525886097
134	NC_021826	TGT	2	6	7706	7711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525886097
135	NC_021826	CTT	2	6	7722	7727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525886097
136	NC_021826	GTT	2	6	7730	7735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525886097
137	NC_021826	ATT	2	6	7828	7833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525886097
138	NC_021826	TGG	2	6	7893	7898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525886097
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163	NC_021826	ATA	2	6	9727	9732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_021826	AGT	2	6	16078	16083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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