MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain N1-011A

Total Repeats: 70387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021826	ATT	2	6	68	73	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021826	GAA	2	6	83	88	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021826	AGT	2	6	128	133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021826	A	6	6	155	160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021826	ATGA	2	8	197	204	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021826	T	6	6	207	212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021826	ATA	2	6	237	242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021826	AAGAA	2	10	267	276	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021826	TGA	2	6	310	315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021826	CTA	2	6	390	395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021826	TAT	2	6	440	445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021826	TTA	2	6	446	451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021826	TAA	2	6	472	477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021826	AGA	2	6	520	525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021826	GA	3	6	577	582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021826	AGA	2	6	592	597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021826	GAA	2	6	643	648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021826	AAT	2	6	688	693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021826	GA	3	6	711	716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021826	TGA	2	6	812	817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525888609
21	NC_021826	GTT	2	6	840	845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525888609
22	NC_021826	GAA	2	6	882	887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021826	A	6	6	886	891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021826	AGA	2	6	926	931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021826	A	7	7	956	962	100 %	0 %	0 %	0 %	525888610
26	NC_021826	TAA	2	6	970	975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888610
27	NC_021826	AGA	2	6	989	994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888610
28	NC_021826	TAT	2	6	1004	1009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888610
29	NC_021826	TCT	2	6	1021	1026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525888610
30	NC_021826	TAA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888610
31	NC_021826	GGAT	2	8	1097	1104	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021826	ACG	2	6	1116	1121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021826	TCG	2	6	1132	1137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021826	T	6	6	1138	1143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021826	AAT	2	6	1153	1158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021826	TA	3	6	1211	1216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021826	GTTA	2	8	1231	1238	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021826	TTG	2	6	1246	1251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021826	ATA	2	6	1336	1341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021826	ATTA	2	8	1403	1410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021826	AAT	2	6	1428	1433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021826	T	6	6	1473	1478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021826	AATCCC	2	12	1498	1509	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021826	TAAA	2	8	1534	1541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021826	TCC	2	6	1554	1559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_021826	TCA	2	6	1584	1589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021826	ATTG	2	8	1594	1601	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021826	CAT	2	6	1612	1617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021826	AAC	2	6	1618	1623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021826	AAG	2	6	1648	1653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021826	T	6	6	1688	1693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021826	CAT	2	6	1712	1717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021826	AGA	2	6	1730	1735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021826	GA	3	6	1737	1742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021826	ATC	2	6	1772	1777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525888611
56	NC_021826	TGT	2	6	1821	1826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525888611
57	NC_021826	T	7	7	1832	1838	0 %	100 %	0 %	0 %	525888611
58	NC_021826	TTC	2	6	1899	1904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525888611
59	NC_021826	ATT	2	6	1922	1927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888611
60	NC_021826	TTA	2	6	1977	1982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888611
61	NC_021826	A	8	8	1994	2001	100 %	0 %	0 %	0 %	525888611
62	NC_021826	TTA	2	6	2010	2015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888611
63	NC_021826	TGT	2	6	2065	2070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525888611
64	NC_021826	T	7	7	2070	2076	0 %	100 %	0 %	0 %	525888611
65	NC_021826	GTG	2	6	2093	2098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525888611
66	NC_021826	TTC	2	6	2117	2122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525888611
67	NC_021826	ATGT	2	8	2146	2153	25 %	50 %	25 %	0 %	525888611
68	NC_021826	TG	3	6	2208	2213	0 %	50 %	50 %	0 %	525888611
69	NC_021826	T	7	7	2273	2279	0 %	100 %	0 %	0 %	525888611
70	NC_021826	T	7	7	2344	2350	0 %	100 %	0 %	0 %	525888611
71	NC_021826	CCT	2	6	2404	2409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525888611
72	NC_021826	TTA	2	6	2497	2502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888611
73	NC_021826	CCA	2	6	2569	2574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525888611
74	NC_021826	CAT	2	6	2584	2589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525888611
75	NC_021826	GTT	2	6	2594	2599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525888611
76	NC_021826	T	6	6	2609	2614	0 %	100 %	0 %	0 %	525888611
77	NC_021826	CACCC	2	10	2615	2624	20 %	0 %	0 %	80 %	525888611
78	NC_021826	ATT	2	6	2638	2643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021826	AAT	2	6	2655	2660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021826	AT	3	6	2666	2671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021826	ACA	2	6	2696	2701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021826	TTAATT	2	12	2733	2744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021826	AT	3	6	2745	2750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021826	ATTA	2	8	2752	2759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021826	ATA	2	6	2819	2824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021826	ATT	2	6	2919	2924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021826	CTA	2	6	2944	2949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021826	AAC	2	6	3016	3021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021826	TAA	2	6	3040	3045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021826	A	6	6	3048	3053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021826	AAT	2	6	3056	3061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021826	CTT	2	6	3155	3160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021826	GAT	2	6	3217	3222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021826	TCAG	2	8	3275	3282	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_021826	A	7	7	3339	3345	100 %	0 %	0 %	0 %	525888612
96	NC_021826	AAAAT	2	10	3383	3392	80 %	20 %	0 %	0 %	525888612
97	NC_021826	GAA	2	6	3412	3417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888612
98	NC_021826	TCA	2	6	3423	3428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525888612
99	NC_021826	AAG	2	6	3467	3472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888612
100	NC_021826	GAG	2	6	3479	3484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525888612
101	NC_021826	AGA	2	6	3513	3518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888612
102	NC_021826	AAT	2	6	3580	3585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888612
103	NC_021826	A	7	7	3590	3596	100 %	0 %	0 %	0 %	525888612
104	NC_021826	ACA	2	6	3630	3635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525888612
105	NC_021826	AAC	2	6	3709	3714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525888613
106	NC_021826	TGAATA	2	12	3731	3742	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525888613
107	NC_021826	TAC	2	6	3745	3750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525888613
108	NC_021826	ATG	2	6	3766	3771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525888613
109	NC_021826	GAA	2	6	3794	3799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888613
110	NC_021826	AAT	2	6	3841	3846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888614
111	NC_021826	A	7	7	3851	3857	100 %	0 %	0 %	0 %	525888614
112	NC_021826	CTA	2	6	3906	3911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525888614
113	NC_021826	GTAA	2	8	3968	3975	50 %	25 %	25 %	0 %	525888614
114	NC_021826	GAA	2	6	3995	4000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888614
115	NC_021826	TGGA	2	8	4018	4025	25 %	25 %	50 %	0 %	525888614
116	NC_021826	AAG	2	6	4036	4041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888614
117	NC_021826	ATA	2	6	4074	4079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888614
118	NC_021826	A	7	7	4104	4110	100 %	0 %	0 %	0 %	525888614
119	NC_021826	TTA	2	6	4122	4127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888614
120	NC_021826	AGA	2	6	4162	4167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888614
121	NC_021826	CTT	2	6	4168	4173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525888614
122	NC_021826	TAA	2	6	4181	4186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888614
123	NC_021826	A	7	7	4200	4206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021826	AAG	2	6	4233	4238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888615
125	NC_021826	A	6	6	4242	4247	100 %	0 %	0 %	0 %	525888615
126	NC_021826	CTAA	2	8	4283	4290	50 %	25 %	0 %	25 %	525888615
127	NC_021826	AATA	2	8	4291	4298	75 %	25 %	0 %	0 %	525888615
128	NC_021826	ATT	2	6	4371	4376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888615
129	NC_021826	AAT	2	6	4385	4390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888615
130	NC_021826	TAAT	2	8	4491	4498	50 %	50 %	0 %	0 %	525888615
131	NC_021826	TAA	2	6	4503	4508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888615
132	NC_021826	AAT	2	6	4526	4531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888615
133	NC_021826	TAT	2	6	4609	4614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888615
134	NC_021826	ATA	2	6	4636	4641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888615
135	NC_021826	ATT	2	6	4662	4667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021826	TGG	2	6	4714	4719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021826	AAT	2	6	4749	4754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888616
138	NC_021826	TTAA	2	8	4788	4795	50 %	50 %	0 %	0 %	525888616
139	NC_021826	TTA	2	6	4818	4823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888616
140	NC_021826	TTA	2	6	4874	4879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888616
141	NC_021826	TTC	2	6	4885	4890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525888616
142	NC_021826	AAT	2	6	4971	4976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888616
143	NC_021826	CTTA	2	8	5000	5007	25 %	50 %	0 %	25 %	525888616
144	NC_021826	TAT	2	6	5144	5149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888616
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281	NC_021826	TGA	2	6	10377	10382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525886100
282	NC_021826	ATT	2	6	10592	10597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525886100
283	NC_021826	TTGGTA	2	12	10617	10628	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525886100
284	NC_021826	TAC	2	6	10686	10691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525886100
285	NC_021826	T	6	6	10703	10708	0 %	100 %	0 %	0 %	525886100
286	NC_021826	GTA	2	6	10767	10772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525886100
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293	NC_021826	TAT	2	6	10983	10988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525886100
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301	NC_021826	A	6	6	11403	11408	100 %	0 %	0 %	0 %	525886100
302	NC_021826	TA	3	6	11433	11438	50 %	50 %	0 %	0 %	525886100
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395	NC_021826	AGG	2	6	15263	15268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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401	NC_021826	A	7	7	15445	15451	100 %	0 %	0 %	0 %	525888620
402	NC_021826	ATT	2	6	15568	15573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888620
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407	NC_021826	TGT	2	6	15763	15768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525888621
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