MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain N1-011A

Total Repeats: 70387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021826	TTTC	2	8	218375	218382	0 %	75 %	0 %	25 %	525886302
5002	NC_021826	CGA	2	6	218446	218451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525886302
5003	NC_021826	AAAG	2	8	218500	218507	75 %	0 %	25 %	0 %	525886302
5004	NC_021826	TGT	2	6	218583	218588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525886302
5005	NC_021826	A	6	6	218631	218636	100 %	0 %	0 %	0 %	525886302
5006	NC_021826	GAGC	2	8	218646	218653	25 %	0 %	50 %	25 %	525886302
5007	NC_021826	AAG	2	6	218691	218696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525886302
5008	NC_021826	ATTT	2	8	218742	218749	25 %	75 %	0 %	0 %	525886302
5009	NC_021826	T	6	6	218747	218752	0 %	100 %	0 %	0 %	525886302
5010	NC_021826	CCT	2	6	218768	218773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525886303
5011	NC_021826	A	6	6	218946	218951	100 %	0 %	0 %	0 %	525886303
5012	NC_021826	TTG	2	6	219070	219075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525886304
5013	NC_021826	TGA	2	6	219193	219198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525886304
5014	NC_021826	TTG	2	6	219241	219246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525886304
5015	NC_021826	ATTT	2	8	219254	219261	25 %	75 %	0 %	0 %	525886304
5016	NC_021826	TGG	2	6	219274	219279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525886304
5017	NC_021826	TCT	2	6	219288	219293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525886304
5018	NC_021826	AGT	2	6	219294	219299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525886304
5019	NC_021826	TAGT	2	8	219370	219377	25 %	50 %	25 %	0 %	525886304
5020	NC_021826	TAA	2	6	219392	219397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525886304
5021	NC_021826	ATTT	2	8	219407	219414	25 %	75 %	0 %	0 %	525886304
5022	NC_021826	T	6	6	219418	219423	0 %	100 %	0 %	0 %	525886304
5023	NC_021826	CTAT	2	8	219443	219450	25 %	50 %	0 %	25 %	525886305
5024	NC_021826	T	6	6	219477	219482	0 %	100 %	0 %	0 %	525886305
5025	NC_021826	TTGA	2	8	219605	219612	25 %	50 %	25 %	0 %	525886305
5026	NC_021826	ACAAT	2	10	219669	219678	60 %	20 %	0 %	20 %	525886305
5027	NC_021826	CCA	2	6	219687	219692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525886305
5028	NC_021826	CAAT	2	8	219716	219723	50 %	25 %	0 %	25 %	525886305
5029	NC_021826	CTC	2	6	219744	219749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5030	NC_021826	ATAA	2	8	219794	219801	75 %	25 %	0 %	0 %	525886306
5031	NC_021826	TTGG	2	8	219839	219846	0 %	50 %	50 %	0 %	525886306
5032	NC_021826	AAT	2	6	219856	219861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525886306
5033	NC_021826	TGA	2	6	219886	219891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525886306
5034	NC_021826	TAA	2	6	219901	219906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525886306
5035	NC_021826	TTC	2	6	219915	219920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525886306
5036	NC_021826	T	7	7	219934	219940	0 %	100 %	0 %	0 %	525886306
5037	NC_021826	TAA	2	6	219958	219963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525886306
5038	NC_021826	T	6	6	219986	219991	0 %	100 %	0 %	0 %	525886306
5039	NC_021826	AGGA	2	8	220029	220036	50 %	0 %	50 %	0 %	525886306
5040	NC_021826	TTC	2	6	220071	220076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525886306
5041	NC_021826	ATA	2	6	220093	220098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525886306
5042	NC_021826	CAG	2	6	220122	220127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525886306
5043	NC_021826	CG	3	6	220139	220144	0 %	0 %	50 %	50 %	525886306
5044	NC_021826	AAT	2	6	220157	220162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525886306
5045	NC_021826	AT	3	6	220183	220188	50 %	50 %	0 %	0 %	525886306
5046	NC_021826	T	7	7	220225	220231	0 %	100 %	0 %	0 %	525886306
5047	NC_021826	A	7	7	220279	220285	100 %	0 %	0 %	0 %	525886306
5048	NC_021826	TAA	2	6	220290	220295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525886306
5049	NC_021826	T	6	6	220304	220309	0 %	100 %	0 %	0 %	525886306
5050	NC_021826	TAAA	2	8	220364	220371	75 %	25 %	0 %	0 %	525886306
5051	NC_021826	AAG	2	6	220405	220410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525886306
5052	NC_021826	T	7	7	220471	220477	0 %	100 %	0 %	0 %	525886306
5053	NC_021826	CTTTT	2	10	220484	220493	0 %	80 %	0 %	20 %	525886306
5054	NC_021826	T	6	6	220585	220590	0 %	100 %	0 %	0 %	525886306
5055	NC_021826	AAGTG	2	10	220623	220632	40 %	20 %	40 %	0 %	525886306
5056	NC_021826	A	8	8	220773	220780	100 %	0 %	0 %	0 %	525886306
5057	NC_021826	CTG	2	6	220834	220839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525886307
5058	NC_021826	TTA	2	6	220841	220846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525886307
5059	NC_021826	TTG	2	6	220870	220875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525886307
5060	NC_021826	ATAG	2	8	220888	220895	50 %	25 %	25 %	0 %	525886307
5061	NC_021826	GT	3	6	220963	220968	0 %	50 %	50 %	0 %	525886307
5062	NC_021826	TTC	2	6	221008	221013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525886307
5063	NC_021826	TAA	2	6	221041	221046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525886307
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5070	NC_021826	TGT	2	6	221393	221398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525886307
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5073	NC_021826	T	7	7	221546	221552	0 %	100 %	0 %	0 %	525886307
5074	NC_021826	GTC	2	6	221571	221576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525886307
5075	NC_021826	T	6	6	221577	221582	0 %	100 %	0 %	0 %	525886307
5076	NC_021826	GCT	2	6	221597	221602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525886307
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5079	NC_021826	ATG	2	6	221756	221761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525886307
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5081	NC_021826	CCT	2	6	221790	221795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5082	NC_021826	ATA	2	6	221900	221905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_021826	A	6	6	221940	221945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_021826	T	7	7	221946	221952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_021826	TGA	2	6	221959	221964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_021826	ATT	2	6	222081	222086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_021826	ATA	2	6	222132	222137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_021826	AG	3	6	222160	222165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_021826	GCG	2	6	222176	222181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_021826	TAT	2	6	222199	222204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_021826	AGG	2	6	222309	222314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_021826	TGG	2	6	222391	222396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525886308
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5095	NC_021826	AATAT	2	10	222576	222585	60 %	40 %	0 %	0 %	525886308
5096	NC_021826	TGG	2	6	222601	222606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525886308
5097	NC_021826	TAG	2	6	222621	222626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525886308
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5099	NC_021826	TTG	2	6	222657	222662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525886308
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5102	NC_021826	A	6	6	222783	222788	100 %	0 %	0 %	0 %	525886308
5103	NC_021826	CTT	2	6	222829	222834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525886308
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5106	NC_021826	TTAAA	2	10	223092	223101	60 %	40 %	0 %	0 %	525886308
5107	NC_021826	A	7	7	223099	223105	100 %	0 %	0 %	0 %	525886308
5108	NC_021826	AAG	2	6	223125	223130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525886308
5109	NC_021826	TTA	2	6	223134	223139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525886308
5110	NC_021826	AAG	2	6	223146	223151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525886308
5111	NC_021826	AATT	2	8	223182	223189	50 %	50 %	0 %	0 %	525886308
5112	NC_021826	GAA	2	6	223235	223240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525886308
5113	NC_021826	AAG	2	6	223332	223337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525886308
5114	NC_021826	A	6	6	223358	223363	100 %	0 %	0 %	0 %	525886308
5115	NC_021826	AGG	2	6	223414	223419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_021826	TGA	2	6	223504	223509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525886309
5117	NC_021826	A	6	6	223530	223535	100 %	0 %	0 %	0 %	525886309
5118	NC_021826	TAC	2	6	223627	223632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525886309
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5120	NC_021826	GAT	2	6	223789	223794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525886309
5121	NC_021826	TATG	2	8	223831	223838	25 %	50 %	25 %	0 %	525886309
5122	NC_021826	TGG	2	6	223840	223845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525886309
5123	NC_021826	AGC	2	6	223861	223866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525886309
5124	NC_021826	A	7	7	223895	223901	100 %	0 %	0 %	0 %	525886309
5125	NC_021826	A	7	7	224023	224029	100 %	0 %	0 %	0 %	525886309
5126	NC_021826	GAT	2	6	224039	224044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525886309
5127	NC_021826	TGT	2	6	224056	224061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525886309
5128	NC_021826	AAT	2	6	224126	224131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525886309
5129	NC_021826	TTA	2	6	224135	224140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525886309
5130	NC_021826	ACC	2	6	224179	224184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525886309
5131	NC_021826	TTG	2	6	224205	224210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525886309
5132	NC_021826	TGG	2	6	224248	224253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525886309
5133	NC_021826	AAAT	2	8	224281	224288	75 %	25 %	0 %	0 %	525886309
5134	NC_021826	AAC	2	6	224376	224381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525886309
5135	NC_021826	CTT	2	6	224442	224447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525886309
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5138	NC_021826	TGT	2	6	224587	224592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525886309
5139	NC_021826	TGAA	2	8	224619	224626	50 %	25 %	25 %	0 %	525886309
5140	NC_021826	ATT	2	6	224645	224650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525886309
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5143	NC_021826	ATT	2	6	224873	224878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525886310
5144	NC_021826	CAG	2	6	224906	224911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525886310
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5146	NC_021826	ACCA	2	8	225083	225090	50 %	0 %	0 %	50 %	525886310
5147	NC_021826	GC	3	6	225107	225112	0 %	0 %	50 %	50 %	525886310
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5155	NC_021826	TTG	2	6	225458	225463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525886310
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5164	NC_021826	ATG	2	6	225859	225864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525886310
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5176	NC_021826	ATTTAG	2	12	226277	226288	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525886311
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5185	NC_021826	T	7	7	226687	226693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5186	NC_021826	TAT	2	6	226708	226713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5191	NC_021826	T	7	7	226770	226776	0 %	100 %	0 %	0 %	525886312
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5224	NC_021826	T	6	6	228057	228062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5225	NC_021826	TAA	2	6	228095	228100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5226	NC_021826	GC	3	6	228111	228116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5227	NC_021826	GTAT	2	8	228230	228237	25 %	50 %	25 %	0 %	525886314
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5233	NC_021826	CTT	2	6	228503	228508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525886314
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5237	NC_021826	A	7	7	228747	228753	100 %	0 %	0 %	0 %	525886314
5238	NC_021826	CGGT	2	8	228832	228839	0 %	25 %	50 %	25 %	525886314
5239	NC_021826	CTG	2	6	228844	228849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525886314
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5242	NC_021826	ATTT	2	8	229101	229108	25 %	75 %	0 %	0 %	525886314
5243	NC_021826	GAT	2	6	229137	229142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525886314
5244	NC_021826	ATTC	2	8	229176	229183	25 %	50 %	0 %	25 %	525886314
5245	NC_021826	AATT	2	8	229192	229199	50 %	50 %	0 %	0 %	525886314
5246	NC_021826	TG	3	6	229225	229230	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5247	NC_021826	GAA	2	6	229248	229253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5248	NC_021826	AGG	2	6	229299	229304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_021826	AGC	2	6	229409	229414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525886315
5250	NC_021826	TTCG	2	8	229416	229423	0 %	50 %	25 %	25 %	525886315
5251	NC_021826	A	6	6	229462	229467	100 %	0 %	0 %	0 %	525886315
5252	NC_021826	GTG	2	6	229474	229479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525886315
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5254	NC_021826	GTT	2	6	229704	229709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525886315
5255	NC_021826	CTT	2	6	229741	229746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525886315
5256	NC_021826	TTG	2	6	229783	229788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525886315
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5263	NC_021826	GTT	2	6	230141	230146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525886316
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5291	NC_021826	A	6	6	231277	231282	100 %	0 %	0 %	0 %	525886317
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5499	NC_021826	AGC	2	6	241007	241012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525886328
5500	NC_021826	AACAA	2	10	241090	241099	80 %	0 %	0 %	20 %	525886328

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