MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-1091

Total Repeats: 2215

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021825	GATTT	2	10	1684	1693	20 %	60 %	20 %	0 %	525880189
2	NC_021825	GCGAA	2	10	4636	4645	40 %	0 %	40 %	20 %	525880195
3	NC_021825	TAACA	2	10	6017	6026	60 %	20 %	0 %	20 %	525877703
4	NC_021825	CTATT	2	10	7388	7397	20 %	60 %	0 %	20 %	525880197
5	NC_021825	TTGAT	2	10	7924	7933	20 %	60 %	20 %	0 %	525880197
6	NC_021825	TTTTG	2	10	9658	9667	0 %	80 %	20 %	0 %	525880197
7	NC_021825	TCGTT	2	10	12761	12770	0 %	60 %	20 %	20 %	525880198
8	NC_021825	CCACT	2	10	13905	13914	20 %	20 %	0 %	60 %	525877704
9	NC_021825	TTGAT	2	10	15105	15114	20 %	60 %	20 %	0 %	525880201
10	NC_021825	GATTT	3	15	15443	15457	20 %	60 %	20 %	0 %	525880202
11	NC_021825	GTTTT	2	10	16447	16456	0 %	80 %	20 %	0 %	525877706
12	NC_021825	ATTTC	2	10	17015	17024	20 %	60 %	0 %	20 %	525877706
13	NC_021825	TTAAA	2	10	17063	17072	60 %	40 %	0 %	0 %	525880204
14	NC_021825	ATCAA	2	10	19524	19533	60 %	20 %	0 %	20 %	525877707
15	NC_021825	TTTTC	2	10	21511	21520	0 %	80 %	0 %	20 %	525877708
16	NC_021825	GGATA	2	10	23116	23125	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021825	TTCTG	2	10	24115	24124	0 %	60 %	20 %	20 %	525880209
18	NC_021825	TTCTT	2	10	28368	28377	0 %	80 %	0 %	20 %	525877712
19	NC_021825	ATTTT	3	15	28473	28487	20 %	80 %	0 %	0 %	525877712
20	NC_021825	TTCTG	2	10	28523	28532	0 %	60 %	20 %	20 %	525877712
21	NC_021825	TTGTT	2	10	28941	28950	0 %	80 %	20 %	0 %	525880221
22	NC_021825	GCTTT	2	10	31082	31091	0 %	60 %	20 %	20 %	525877714
23	NC_021825	TCTTT	2	10	31536	31545	0 %	80 %	0 %	20 %	525877714
24	NC_021825	CTTCA	2	10	34101	34110	20 %	40 %	0 %	40 %	525880227
25	NC_021825	AAATC	2	10	34643	34652	60 %	20 %	0 %	20 %	525880228
26	NC_021825	AAAAG	2	10	36067	36076	80 %	0 %	20 %	0 %	525880231
27	NC_021825	TATAA	2	10	36371	36380	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021825	TGAAC	2	10	36433	36442	40 %	20 %	20 %	20 %	525880232
29	NC_021825	AATTA	2	10	37015	37024	60 %	40 %	0 %	0 %	525880233
30	NC_021825	CTTTT	2	10	37217	37226	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_021825	GAAAA	2	10	37707	37716	80 %	0 %	20 %	0 %	525880234
32	NC_021825	AATTG	2	10	37877	37886	40 %	40 %	20 %	0 %	525880234
33	NC_021825	CGATT	2	10	38234	38243	20 %	40 %	20 %	20 %	525880234
34	NC_021825	CAGCG	2	10	38912	38921	20 %	0 %	40 %	40 %	525877718
35	NC_021825	CAAGC	2	10	40967	40976	40 %	0 %	20 %	40 %	525877720
36	NC_021825	CATCC	2	10	41660	41669	20 %	20 %	0 %	60 %	525877721
37	NC_021825	GTGGG	2	10	42253	42262	0 %	20 %	80 %	0 %	525877721
38	NC_021825	GAAAA	2	10	42835	42844	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021825	AAAAT	2	10	42947	42956	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021825	ATATA	2	10	43042	43051	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021825	CAAAG	2	10	44887	44896	60 %	0 %	20 %	20 %	525880236
42	NC_021825	TGCTA	2	10	45665	45674	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_021825	ATTTC	2	10	45686	45695	20 %	60 %	0 %	20 %	525880238
44	NC_021825	CTATT	2	10	46824	46833	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_021825	TAATT	2	10	47264	47273	40 %	60 %	0 %	0 %	525880240
46	NC_021825	GTTTT	2	10	48205	48214	0 %	80 %	20 %	0 %	525880241
47	NC_021825	AAGGC	2	10	48583	48592	40 %	0 %	40 %	20 %	525880241
48	NC_021825	CATTT	2	10	49360	49369	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_021825	AATTA	2	10	49777	49786	60 %	40 %	0 %	0 %	525880242
50	NC_021825	TTATA	2	10	51524	51533	40 %	60 %	0 %	0 %	525880245
51	NC_021825	GTTTT	2	10	52522	52531	0 %	80 %	20 %	0 %	525880246
52	NC_021825	AAGGC	2	10	52900	52909	40 %	0 %	40 %	20 %	525880246
53	NC_021825	CCTCT	2	10	54949	54958	0 %	40 %	0 %	60 %	525880250
54	NC_021825	CTTCT	2	10	58526	58535	0 %	60 %	0 %	40 %	525877722
55	NC_021825	TTTGT	2	10	60008	60017	0 %	80 %	20 %	0 %	525877723
56	NC_021825	AGTAA	2	10	60104	60113	60 %	20 %	20 %	0 %	525877723
57	NC_021825	GTTTT	2	10	61432	61441	0 %	80 %	20 %	0 %	525877725
58	NC_021825	ATAAA	2	10	67296	67305	80 %	20 %	0 %	0 %	525880252
59	NC_021825	AGACT	2	10	70293	70302	40 %	20 %	20 %	20 %	525877731
60	NC_021825	AATCA	2	10	70322	70331	60 %	20 %	0 %	20 %	525877731
61	NC_021825	CATAA	2	10	71209	71218	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_021825	TAACT	2	10	71758	71767	40 %	40 %	0 %	20 %	525877732
63	NC_021825	TAAAA	2	10	73074	73083	80 %	20 %	0 %	0 %	525877733
64	NC_021825	TAGCA	2	10	73242	73251	40 %	20 %	20 %	20 %	525877733
65	NC_021825	CTTTT	2	10	73766	73775	0 %	80 %	0 %	20 %	525877735
66	NC_021825	CTAAG	2	10	74667	74676	40 %	20 %	20 %	20 %	525877736
67	NC_021825	ATTTC	2	10	74766	74775	20 %	60 %	0 %	20 %	525877736
68	NC_021825	TTTTG	2	10	74916	74925	0 %	80 %	20 %	0 %	525877736
69	NC_021825	AAGTA	2	10	75422	75431	60 %	20 %	20 %	0 %	525877737
70	NC_021825	TCTAC	2	10	76405	76414	20 %	40 %	0 %	40 %	525877739
71	NC_021825	ACCAT	2	10	76454	76463	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_021825	AAAAT	2	10	78620	78629	80 %	20 %	0 %	0 %	525877741
73	NC_021825	CTTTT	2	10	78669	78678	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_021825	CAAGT	2	10	78705	78714	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_021825	ATGTC	2	10	78990	78999	20 %	40 %	20 %	20 %	525880253
76	NC_021825	TAAAA	2	10	80202	80211	80 %	20 %	0 %	0 %	525880254
77	NC_021825	TTGGT	2	10	81318	81327	0 %	60 %	40 %	0 %	525880255
78	NC_021825	TCTTT	2	10	82830	82839	0 %	80 %	0 %	20 %	525880257
79	NC_021825	AAAAT	2	10	84043	84052	80 %	20 %	0 %	0 %	525880257
80	NC_021825	GTTTT	2	10	85531	85540	0 %	80 %	20 %	0 %	525880258
81	NC_021825	AAAAT	2	10	89158	89167	80 %	20 %	0 %	0 %	525877744
82	NC_021825	TAATT	2	10	89763	89772	40 %	60 %	0 %	0 %	525877744
83	NC_021825	ATTTC	2	10	91761	91770	20 %	60 %	0 %	20 %	525877746
84	NC_021825	TTTTC	2	10	92917	92926	0 %	80 %	0 %	20 %	525877747
85	NC_021825	CAAAA	2	10	93020	93029	80 %	0 %	0 %	20 %	525877747
86	NC_021825	AATAG	2	10	94003	94012	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021825	CCTTT	2	10	94499	94508	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_021825	ATTTT	2	10	94906	94915	20 %	80 %	0 %	0 %	525880260
89	NC_021825	CAATT	2	10	95159	95168	40 %	40 %	0 %	20 %	525880260
90	NC_021825	TATCT	2	10	95470	95479	20 %	60 %	0 %	20 %	525880261
91	NC_021825	TTTTC	2	10	95727	95736	0 %	80 %	0 %	20 %	525880261
92	NC_021825	TATGG	2	10	96572	96581	20 %	40 %	40 %	0 %	525880262
93	NC_021825	AAACC	2	10	97872	97881	60 %	0 %	0 %	40 %	525880263
94	NC_021825	GATTT	2	10	99898	99907	20 %	60 %	20 %	0 %	525877751
95	NC_021825	TCCAT	2	10	101255	101264	20 %	40 %	0 %	40 %	525877752
96	NC_021825	AATAA	2	10	102646	102655	80 %	20 %	0 %	0 %	525877754
97	NC_021825	CATTT	2	10	104606	104615	20 %	60 %	0 %	20 %	525877756
98	NC_021825	CATTT	2	10	106058	106067	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_021825	AATCC	2	10	106613	106622	40 %	20 %	0 %	40 %	525877759
100	NC_021825	TAAAA	2	10	106957	106966	80 %	20 %	0 %	0 %	525877759
101	NC_021825	GATTT	2	10	107735	107744	20 %	60 %	20 %	0 %	525877760
102	NC_021825	TTAAT	2	10	108196	108205	40 %	60 %	0 %	0 %	525877760
103	NC_021825	AATTA	2	10	109713	109722	60 %	40 %	0 %	0 %	525880264
104	NC_021825	CATTC	2	10	111090	111099	20 %	40 %	0 %	40 %	525877763
105	NC_021825	TTCAT	2	10	112832	112841	20 %	60 %	0 %	20 %	525877764
106	NC_021825	TAATA	2	10	114284	114293	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021825	TACAA	2	10	114441	114450	60 %	20 %	0 %	20 %	525880265
108	NC_021825	CATAC	2	10	118793	118802	40 %	20 %	0 %	40 %	525877766
109	NC_021825	TAAAA	2	10	119736	119745	80 %	20 %	0 %	0 %	525877767
110	NC_021825	CGTCC	2	10	120156	120165	0 %	20 %	20 %	60 %	525877768
111	NC_021825	TTTTC	2	10	123348	123357	0 %	80 %	0 %	20 %	525877769
112	NC_021825	GTTTT	2	10	125089	125098	0 %	80 %	20 %	0 %	525877770
113	NC_021825	AATGA	2	10	125301	125310	60 %	20 %	20 %	0 %	525877770
114	NC_021825	ATAAA	2	10	127957	127966	80 %	20 %	0 %	0 %	525877773
115	NC_021825	TTAAT	2	10	129428	129437	40 %	60 %	0 %	0 %	525877774
116	NC_021825	AATAA	2	10	129581	129590	80 %	20 %	0 %	0 %	525877774
117	NC_021825	TTTAA	2	10	129598	129607	40 %	60 %	0 %	0 %	525877774
118	NC_021825	TTGGT	2	10	129991	130000	0 %	60 %	40 %	0 %	525877774
119	NC_021825	ATGTA	2	10	131872	131881	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021825	ATATG	2	10	132860	132869	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021825	AAACA	2	10	133960	133969	80 %	0 %	0 %	20 %	525877779
122	NC_021825	AAGAA	2	10	134469	134478	80 %	0 %	20 %	0 %	525877779
123	NC_021825	CTTTA	2	10	137221	137230	20 %	60 %	0 %	20 %	525877782
124	NC_021825	GTAAA	2	10	138687	138696	60 %	20 %	20 %	0 %	525877783
125	NC_021825	ACTTA	2	10	139798	139807	40 %	40 %	0 %	20 %	525877784
126	NC_021825	AAATC	2	10	141881	141890	60 %	20 %	0 %	20 %	525877786
127	NC_021825	CGCTG	2	10	142165	142174	0 %	20 %	40 %	40 %	525877787
128	NC_021825	AAACA	2	10	144274	144283	80 %	0 %	0 %	20 %	525877789
129	NC_021825	TTTTA	2	10	144473	144482	20 %	80 %	0 %	0 %	525877789
130	NC_021825	TAGTT	2	10	147248	147257	20 %	60 %	20 %	0 %	525877790
131	NC_021825	GTTTT	2	10	150737	150746	0 %	80 %	20 %	0 %	525877793
132	NC_021825	TGGGA	2	10	150939	150948	20 %	20 %	60 %	0 %	525877793
133	NC_021825	TTTAA	2	10	154264	154273	40 %	60 %	0 %	0 %	525877796
134	NC_021825	TCAAA	2	10	158347	158356	60 %	20 %	0 %	20 %	525877799
135	NC_021825	AAAGA	2	10	160116	160125	80 %	0 %	20 %	0 %	525877802
136	NC_021825	AAGAC	2	10	161507	161516	60 %	0 %	20 %	20 %	525877805
137	NC_021825	GGTTA	2	10	162393	162402	20 %	40 %	40 %	0 %	525877805
138	NC_021825	TTTCT	2	10	163853	163862	0 %	80 %	0 %	20 %	525877806
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264	NC_021825	TCTAA	2	10	378079	378088	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
265	NC_021825	TTGTA	2	10	378300	378309	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
266	NC_021825	ACAAA	2	10	378509	378518	80 %	0 %	0 %	20 %	525877977
267	NC_021825	ATATG	2	10	380720	380729	40 %	40 %	20 %	0 %	525877979
268	NC_021825	ATTTT	2	10	381707	381716	20 %	80 %	0 %	0 %	525877980
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404	NC_021825	TTCAT	2	10	555044	555053	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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497	NC_021825	GGATT	2	10	679050	679059	20 %	40 %	40 %	0 %	525878261
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