MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-1091

Total Repeats: 68153

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021825	TGCTA	2	10	45665	45674	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1002	NC_021825	ATTTC	2	10	45686	45695	20 %	60 %	0 %	20 %	525880238
1003	NC_021825	TGG	2	6	45719	45724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525880238
1004	NC_021825	TC	3	6	45732	45737	0 %	50 %	0 %	50 %	525880238
1005	NC_021825	TCG	2	6	45743	45748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880238
1006	NC_021825	A	6	6	45780	45785	100 %	0 %	0 %	0 %	525880238
1007	NC_021825	A	6	6	45800	45805	100 %	0 %	0 %	0 %	525880238
1008	NC_021825	T	6	6	45818	45823	0 %	100 %	0 %	0 %	525880238
1009	NC_021825	GC	3	6	45837	45842	0 %	0 %	50 %	50 %	525880238
1010	NC_021825	TA	3	6	45875	45880	50 %	50 %	0 %	0 %	525880238
1011	NC_021825	ATTT	2	8	46011	46018	25 %	75 %	0 %	0 %	525880238
1012	NC_021825	CAA	2	6	46054	46059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880239
1013	NC_021825	CCT	2	6	46083	46088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525880239
1014	NC_021825	ATA	2	6	46154	46159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880239
1015	NC_021825	ACT	2	6	46245	46250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880239
1016	NC_021825	TGA	2	6	46257	46262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880239
1017	NC_021825	TCT	2	6	46323	46328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880239
1018	NC_021825	AAT	2	6	46370	46375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880239
1019	NC_021825	ATCC	2	8	46435	46442	25 %	25 %	0 %	50 %	525880239
1020	NC_021825	CTT	2	6	46465	46470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880239
1021	NC_021825	CGC	2	6	46597	46602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525880239
1022	NC_021825	TTC	2	6	46650	46655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880239
1023	NC_021825	CGG	2	6	46666	46671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525880239
1024	NC_021825	CCT	2	6	46701	46706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525880239
1025	NC_021825	TAGA	2	8	46731	46738	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_021825	ATT	2	6	46767	46772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_021825	A	6	6	46799	46804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_021825	TAA	2	6	46809	46814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_021825	CTATT	2	10	46824	46833	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1030	NC_021825	AAG	2	6	46835	46840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021825	A	6	6	46884	46889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021825	ATT	2	6	46921	46926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_021825	AAG	2	6	47076	47081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021825	TCT	2	6	47137	47142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_021825	ATA	2	6	47165	47170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880240
1036	NC_021825	TCT	2	6	47202	47207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880240
1037	NC_021825	TCA	2	6	47229	47234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880240
1038	NC_021825	TGT	2	6	47258	47263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880240
1039	NC_021825	TAATT	2	10	47264	47273	40 %	60 %	0 %	0 %	525880240
1040	NC_021825	A	6	6	47300	47305	100 %	0 %	0 %	0 %	525880240
1041	NC_021825	TCT	2	6	47313	47318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880240
1042	NC_021825	TCA	2	6	47325	47330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880240
1043	NC_021825	A	6	6	47348	47353	100 %	0 %	0 %	0 %	525880240
1044	NC_021825	TAA	2	6	47434	47439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880240
1045	NC_021825	A	6	6	47460	47465	100 %	0 %	0 %	0 %	525880240
1046	NC_021825	CTT	2	6	47509	47514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880240
1047	NC_021825	TCT	2	6	47520	47525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880240
1048	NC_021825	TAT	2	6	47545	47550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880240
1049	NC_021825	ACC	2	6	47634	47639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525880241
1050	NC_021825	TCA	2	6	47647	47652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880241
1051	NC_021825	CCA	2	6	47676	47681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525880241
1052	NC_021825	CCA	2	6	47692	47697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525880241
1053	NC_021825	ATG	2	6	47715	47720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880241
1054	NC_021825	CAT	2	6	47723	47728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880241
1055	NC_021825	T	6	6	47739	47744	0 %	100 %	0 %	0 %	525880241
1056	NC_021825	TCA	2	6	47824	47829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880241
1057	NC_021825	TTA	2	6	47848	47853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880241
1058	NC_021825	T	6	6	47920	47925	0 %	100 %	0 %	0 %	525880241
1059	NC_021825	TTC	2	6	47928	47933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880241
1060	NC_021825	T	6	6	47940	47945	0 %	100 %	0 %	0 %	525880241
1061	NC_021825	ATC	2	6	48045	48050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880241
1062	NC_021825	CGC	2	6	48056	48061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525880241
1063	NC_021825	CAT	2	6	48090	48095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880241
1064	NC_021825	GGC	2	6	48117	48122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525880241
1065	NC_021825	GCG	2	6	48127	48132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525880241
1066	NC_021825	CCT	2	6	48151	48156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525880241
1067	NC_021825	CT	3	6	48174	48179	0 %	50 %	0 %	50 %	525880241
1068	NC_021825	GTTTT	2	10	48205	48214	0 %	80 %	20 %	0 %	525880241
1069	NC_021825	TCG	2	6	48241	48246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880241
1070	NC_021825	T	6	6	48285	48290	0 %	100 %	0 %	0 %	525880241
1071	NC_021825	ACC	2	6	48480	48485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525880241
1072	NC_021825	TTC	2	6	48498	48503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880241
1073	NC_021825	AAGGC	2	10	48583	48592	40 %	0 %	40 %	20 %	525880241
1074	NC_021825	TGG	2	6	48597	48602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525880241
1075	NC_021825	CAC	2	6	48627	48632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525880241
1076	NC_021825	TTCT	2	8	48657	48664	0 %	75 %	0 %	25 %	525880241
1077	NC_021825	TTG	2	6	48666	48671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880241
1078	NC_021825	TCTT	2	8	48730	48737	0 %	75 %	0 %	25 %	525880241
1079	NC_021825	TCA	2	6	48818	48823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880241
1080	NC_021825	TCG	2	6	48833	48838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880241
1081	NC_021825	CTT	2	6	48842	48847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880241
1082	NC_021825	GTTT	2	8	48892	48899	0 %	75 %	25 %	0 %	525880241
1083	NC_021825	TGG	2	6	48920	48925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525880241
1084	NC_021825	GT	3	6	49093	49098	0 %	50 %	50 %	0 %	525880241
1085	NC_021825	TCT	2	6	49138	49143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880241
1086	NC_021825	CTT	2	6	49148	49153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880241
1087	NC_021825	ATT	2	6	49179	49184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880241
1088	NC_021825	GTC	2	6	49248	49253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880241
1089	NC_021825	CTT	2	6	49268	49273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880241
1090	NC_021825	TCAT	2	8	49274	49281	25 %	50 %	0 %	25 %	525880241
1091	NC_021825	TCT	2	6	49327	49332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_021825	CATTT	2	10	49360	49369	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1093	NC_021825	T	7	7	49385	49391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_021825	TAA	2	6	49467	49472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_021825	TCT	2	6	49528	49533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_021825	AT	3	6	49611	49616	50 %	50 %	0 %	0 %	525880242
1097	NC_021825	GTA	2	6	49622	49627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880242
1098	NC_021825	CGTT	2	8	49651	49658	0 %	50 %	25 %	25 %	525880242
1099	NC_021825	AAT	2	6	49694	49699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880242
1100	NC_021825	TCT	2	6	49717	49722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880242
1101	NC_021825	TAA	2	6	49732	49737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880242
1102	NC_021825	T	6	6	49752	49757	0 %	100 %	0 %	0 %	525880242
1103	NC_021825	T	7	7	49760	49766	0 %	100 %	0 %	0 %	525880242
1104	NC_021825	AATTA	2	10	49777	49786	60 %	40 %	0 %	0 %	525880242
1105	NC_021825	TAA	2	6	49792	49797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880242
1106	NC_021825	GTT	2	6	49830	49835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880242
1107	NC_021825	TCT	3	9	49859	49867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880242
1108	NC_021825	ATT	2	6	49900	49905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880242
1109	NC_021825	TAT	2	6	49951	49956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880242
1110	NC_021825	ACA	2	6	49982	49987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880242
1111	NC_021825	AAT	2	6	50049	50054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880242
1112	NC_021825	TCT	2	6	50099	50104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880242
1113	NC_021825	TAA	2	6	50119	50124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880242
1114	NC_021825	T	6	6	50134	50139	0 %	100 %	0 %	0 %	525880242
1115	NC_021825	TA	3	6	50202	50207	50 %	50 %	0 %	0 %	525880242
1116	NC_021825	ATT	2	6	50215	50220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880242
1117	NC_021825	T	6	6	50226	50231	0 %	100 %	0 %	0 %	525880242
1118	NC_021825	CTG	2	6	50232	50237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880242
1119	NC_021825	T	7	7	50259	50265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_021825	TA	4	8	50348	50355	50 %	50 %	0 %	0 %	525880243
1121	NC_021825	TTC	2	6	50364	50369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880243
1122	NC_021825	T	10	10	50380	50389	0 %	100 %	0 %	0 %	525880243
1123	NC_021825	TCT	2	6	50438	50443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880243
1124	NC_021825	TGT	2	6	50444	50449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880243
1125	NC_021825	TTA	2	6	50502	50507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880243
1126	NC_021825	TCC	2	6	50522	50527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_021825	TTAT	2	8	50532	50539	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_021825	TTAATA	2	12	50551	50562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_021825	GAA	2	6	50588	50593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_021825	AAT	2	6	50685	50690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1133	NC_021825	TCT	2	6	50771	50776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1151	NC_021825	AGT	2	6	51433	51438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1152	NC_021825	GTA	2	6	51488	51493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1154	NC_021825	TTATA	2	10	51524	51533	40 %	60 %	0 %	0 %	525880245
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1472	NC_021825	A	6	6	65752	65757	100 %	0 %	0 %	0 %	525880251
1473	NC_021825	ATTT	2	8	65792	65799	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1498	NC_021825	TTC	2	6	66741	66746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525877728
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