MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-1091

Total Repeats: 68153

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021825	AAT	2	6	23615	23620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880207
502	NC_021825	T	6	6	23644	23649	0 %	100 %	0 %	0 %	525880207
503	NC_021825	CTT	2	6	23656	23661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880207
504	NC_021825	T	6	6	23671	23676	0 %	100 %	0 %	0 %	525880207
505	NC_021825	T	9	9	23713	23721	0 %	100 %	0 %	0 %	525880207
506	NC_021825	CTC	2	6	23758	23763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525880207
507	NC_021825	ATTA	2	8	23771	23778	50 %	50 %	0 %	0 %	525880207
508	NC_021825	TAA	2	6	23811	23816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_021825	A	7	7	23815	23821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021825	T	6	6	23862	23867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_021825	TATT	2	8	23877	23884	25 %	75 %	0 %	0 %	525880208
512	NC_021825	TTGT	2	8	23893	23900	0 %	75 %	25 %	0 %	525880208
513	NC_021825	TCT	2	6	24018	24023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880208
514	NC_021825	T	6	6	24048	24053	0 %	100 %	0 %	0 %	525880209
515	NC_021825	CT	3	6	24088	24093	0 %	50 %	0 %	50 %	525880209
516	NC_021825	TTCTG	2	10	24115	24124	0 %	60 %	20 %	20 %	525880209
517	NC_021825	GT	3	6	24132	24137	0 %	50 %	50 %	0 %	525880209
518	NC_021825	ACT	2	6	24146	24151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880209
519	NC_021825	CGA	2	6	24255	24260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525880209
520	NC_021825	T	6	6	24288	24293	0 %	100 %	0 %	0 %	525880209
521	NC_021825	TCT	2	6	24299	24304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880209
522	NC_021825	TTTC	2	8	24309	24316	0 %	75 %	0 %	25 %	525880209
523	NC_021825	CTTT	2	8	24346	24353	0 %	75 %	0 %	25 %	525880209
524	NC_021825	TTC	2	6	24413	24418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880209
525	NC_021825	ATTG	2	8	24485	24492	25 %	50 %	25 %	0 %	525880210
526	NC_021825	T	6	6	24635	24640	0 %	100 %	0 %	0 %	525880210
527	NC_021825	AAAT	2	8	24657	24664	75 %	25 %	0 %	0 %	525880210
528	NC_021825	ACTA	2	8	24682	24689	50 %	25 %	0 %	25 %	525880210
529	NC_021825	ATA	2	6	24724	24729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021825	ACT	2	6	24770	24775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_021825	TTC	2	6	24776	24781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_021825	TCGT	2	8	24804	24811	0 %	50 %	25 %	25 %	525880211
533	NC_021825	TTC	2	6	24848	24853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880211
534	NC_021825	T	6	6	24948	24953	0 %	100 %	0 %	0 %	525880211
535	NC_021825	CTG	2	6	24964	24969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880211
536	NC_021825	ATC	2	6	25004	25009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525877710
537	NC_021825	AAT	2	6	25102	25107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525877710
538	NC_021825	ATT	2	6	25124	25129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525877710
539	NC_021825	ACT	2	6	25188	25193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525877710
540	NC_021825	CGT	2	6	25216	25221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525877710
541	NC_021825	TTC	2	6	25275	25280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525877710
542	NC_021825	ACA	2	6	25317	25322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525877710
543	NC_021825	TCA	2	6	25468	25473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525877710
544	NC_021825	CCT	2	6	25482	25487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_021825	ATT	2	6	25553	25558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880212
546	NC_021825	AAG	2	6	25577	25582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525880212
547	NC_021825	TTC	2	6	25587	25592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880212
548	NC_021825	ATC	2	6	25611	25616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880212
549	NC_021825	ATA	2	6	25627	25632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880212
550	NC_021825	TA	3	6	25668	25673	50 %	50 %	0 %	0 %	525880212
551	NC_021825	ACATTC	2	12	25687	25698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880212
552	NC_021825	TAT	2	6	25766	25771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880212
553	NC_021825	GTC	2	6	25819	25824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880212
554	NC_021825	TCT	2	6	25851	25856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880213
555	NC_021825	A	6	6	25901	25906	100 %	0 %	0 %	0 %	525880213
556	NC_021825	ATT	2	6	26004	26009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880213
557	NC_021825	AT	4	8	26054	26061	50 %	50 %	0 %	0 %	525880213
558	NC_021825	ATT	2	6	26106	26111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880213
559	NC_021825	TG	3	6	26245	26250	0 %	50 %	50 %	0 %	525880214
560	NC_021825	ATC	2	6	26332	26337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_021825	CTT	2	6	26391	26396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880215
562	NC_021825	AAC	2	6	26404	26409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880215
563	NC_021825	CAT	2	6	26505	26510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880215
564	NC_021825	T	6	6	26624	26629	0 %	100 %	0 %	0 %	525880215
565	NC_021825	TC	4	8	26655	26662	0 %	50 %	0 %	50 %	525880215
566	NC_021825	CTA	2	6	26844	26849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880217
567	NC_021825	CTA	2	6	26859	26864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880217
568	NC_021825	CAAA	2	8	26916	26923	75 %	0 %	0 %	25 %	525880217
569	NC_021825	TTTG	2	8	26982	26989	0 %	75 %	25 %	0 %	525880217
570	NC_021825	CTAC	2	8	27124	27131	25 %	25 %	0 %	50 %	525880218
571	NC_021825	TAA	2	6	27148	27153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880218
572	NC_021825	A	6	6	27180	27185	100 %	0 %	0 %	0 %	525880218
573	NC_021825	ATA	2	6	27192	27197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880218
574	NC_021825	TC	4	8	27205	27212	0 %	50 %	0 %	50 %	525880218
575	NC_021825	GCAA	2	8	27241	27248	50 %	0 %	25 %	25 %	525880218
576	NC_021825	ATT	2	6	27261	27266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880218
577	NC_021825	TAA	2	6	27318	27323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880218
578	NC_021825	TCT	2	6	27355	27360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880218
579	NC_021825	A	6	6	27376	27381	100 %	0 %	0 %	0 %	525880218
580	NC_021825	TAC	3	9	27399	27407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880218
581	NC_021825	TAG	2	6	27446	27451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880218
582	NC_021825	ATT	2	6	27454	27459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880218
583	NC_021825	ACCA	2	8	27515	27522	50 %	0 %	0 %	50 %	525880218
584	NC_021825	T	6	6	27564	27569	0 %	100 %	0 %	0 %	525880218
585	NC_021825	CTC	3	9	27584	27592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525880219
586	NC_021825	TAA	2	6	27678	27683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880219
587	NC_021825	AAT	2	6	27743	27748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880219
588	NC_021825	TCA	2	6	27771	27776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880219
589	NC_021825	TCC	2	6	27818	27823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525880220
590	NC_021825	TCT	2	6	27853	27858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880220
591	NC_021825	TCA	2	6	27935	27940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880220
592	NC_021825	AAAT	2	8	27984	27991	75 %	25 %	0 %	0 %	525880220
593	NC_021825	CCA	2	6	28040	28045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525880220
594	NC_021825	GTC	2	6	28126	28131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525877711
595	NC_021825	TTC	2	6	28200	28205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525877711
596	NC_021825	ATT	2	6	28216	28221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525877711
597	NC_021825	AGT	2	6	28222	28227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525877711
598	NC_021825	CAA	2	6	28325	28330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525877712
599	NC_021825	TTCTT	2	10	28368	28377	0 %	80 %	0 %	20 %	525877712
600	NC_021825	AATATC	2	12	28379	28390	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525877712
601	NC_021825	AT	3	6	28416	28421	50 %	50 %	0 %	0 %	525877712
602	NC_021825	ATTTT	3	15	28473	28487	20 %	80 %	0 %	0 %	525877712
603	NC_021825	TTCTG	2	10	28523	28532	0 %	60 %	20 %	20 %	525877712
604	NC_021825	CAA	2	6	28737	28742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525877712
605	NC_021825	T	7	7	28777	28783	0 %	100 %	0 %	0 %	525877712
606	NC_021825	CATAGC	2	12	28792	28803	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525877712
607	NC_021825	T	6	6	28804	28809	0 %	100 %	0 %	0 %	525877712
608	NC_021825	CTTT	2	8	28898	28905	0 %	75 %	0 %	25 %	525880221
609	NC_021825	TGT	2	6	28926	28931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880221
610	NC_021825	TTGTT	2	10	28941	28950	0 %	80 %	20 %	0 %	525880221
611	NC_021825	CTT	3	9	28985	28993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880221
612	NC_021825	TGT	2	6	29012	29017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880221
613	NC_021825	GTT	2	6	29057	29062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880221
614	NC_021825	TTA	2	6	29125	29130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880221
615	NC_021825	ATC	2	6	29214	29219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880221
616	NC_021825	CAAG	2	8	29224	29231	50 %	0 %	25 %	25 %	525880221
617	NC_021825	CAT	2	6	29256	29261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880221
618	NC_021825	TGT	4	12	29306	29317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880221
619	NC_021825	GTT	2	6	29353	29358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880221
620	NC_021825	TGTT	2	8	29362	29369	0 %	75 %	25 %	0 %	525880221
621	NC_021825	GT	3	6	29408	29413	0 %	50 %	50 %	0 %	525880221
622	NC_021825	TTG	2	6	29477	29482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880221
623	NC_021825	CCACTC	2	12	29628	29639	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	525880221
624	NC_021825	CAT	2	6	29658	29663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880221
625	NC_021825	T	6	6	29684	29689	0 %	100 %	0 %	0 %	525880221
626	NC_021825	TTTC	2	8	29720	29727	0 %	75 %	0 %	25 %	525880221
627	NC_021825	ACCC	2	8	29746	29753	25 %	0 %	0 %	75 %	525880221
628	NC_021825	CTT	2	6	29764	29769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_021825	T	7	7	29980	29986	0 %	100 %	0 %	0 %	525877713
630	NC_021825	T	6	6	30005	30010	0 %	100 %	0 %	0 %	525877713
631	NC_021825	T	6	6	30079	30084	0 %	100 %	0 %	0 %	525877713
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