MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-1091

Total Repeats: 68153

< Previous12...125126127128129130131132133134135136137Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
68001	NC_021825	T	6	6	2975373	2975378	0 %	100 %	0 %	0 %	525880606
68002	NC_021825	TCT	2	6	2975415	2975420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880606
68003	NC_021825	A	7	7	2975444	2975450	100 %	0 %	0 %	0 %	525880606
68004	NC_021825	TAG	2	6	2975551	2975556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880606
68005	NC_021825	A	7	7	2975575	2975581	100 %	0 %	0 %	0 %	525880606
68006	NC_021825	T	6	6	2975597	2975602	0 %	100 %	0 %	0 %	525880606
68007	NC_021825	TTC	2	6	2975615	2975620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880606
68008	NC_021825	TCT	2	6	2975652	2975657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880606
68009	NC_021825	ATT	2	6	2975711	2975716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880606
68010	NC_021825	AT	3	6	2975729	2975734	50 %	50 %	0 %	0 %	525880606
68011	NC_021825	CAT	2	6	2975806	2975811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68012	NC_021825	ATT	2	6	2975816	2975821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68013	NC_021825	T	6	6	2975893	2975898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68014	NC_021825	ACT	2	6	2975932	2975937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68015	NC_021825	TTCC	2	8	2975982	2975989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68016	NC_021825	AATAA	2	10	2976014	2976023	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68017	NC_021825	ATC	2	6	2976029	2976034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68018	NC_021825	AAAT	2	8	2976064	2976071	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68019	NC_021825	ACA	2	6	2976116	2976121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68020	NC_021825	AGAAA	2	10	2976266	2976275	80 %	0 %	20 %	0 %	525880607
68021	NC_021825	CTG	2	6	2976327	2976332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880607
68022	NC_021825	GAA	2	6	2976356	2976361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525880607
68023	NC_021825	CAA	2	6	2976408	2976413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880607
68024	NC_021825	GGT	2	6	2976416	2976421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525880607
68025	NC_021825	CT	3	6	2976490	2976495	0 %	50 %	0 %	50 %	525880607
68026	NC_021825	AAG	2	6	2976597	2976602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525880607
68027	NC_021825	GCT	2	6	2976677	2976682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880607
68028	NC_021825	TGG	2	6	2976704	2976709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525880607
68029	NC_021825	AGA	2	6	2976742	2976747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525880607
68030	NC_021825	AAG	2	6	2976867	2976872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525880607
68031	NC_021825	CCAA	2	8	2976882	2976889	50 %	0 %	0 %	50 %	525880607
68032	NC_021825	TAC	2	6	2976891	2976896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880607
68033	NC_021825	GAAA	2	8	2976907	2976914	75 %	0 %	25 %	0 %	525880607
68034	NC_021825	CGA	2	6	2976919	2976924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525880607
68035	NC_021825	AAC	2	6	2977000	2977005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880607
68036	NC_021825	TGA	2	6	2977054	2977059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880607
68037	NC_021825	A	6	6	2977071	2977076	100 %	0 %	0 %	0 %	525880607
68038	NC_021825	TTG	2	6	2977104	2977109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880607
68039	NC_021825	GATA	2	8	2977112	2977119	50 %	25 %	25 %	0 %	525880607
68040	NC_021825	CAG	2	6	2977122	2977127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525880607
68041	NC_021825	AC	3	6	2977188	2977193	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68042	NC_021825	TAG	2	6	2977240	2977245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880188
68043	NC_021825	AAG	2	6	2977279	2977284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525880188
68044	NC_021825	TAA	2	6	2977288	2977293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880188
68045	NC_021825	AAT	2	6	2977311	2977316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880188
68046	NC_021825	GAA	2	6	2977332	2977337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525880188
68047	NC_021825	AGA	2	6	2977391	2977396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525880188
68048	NC_021825	GC	3	6	2977418	2977423	0 %	0 %	50 %	50 %	525880188
68049	NC_021825	A	6	6	2977463	2977468	100 %	0 %	0 %	0 %	525880188
68050	NC_021825	AGA	2	6	2977507	2977512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525880188
68051	NC_021825	ACA	2	6	2977616	2977621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68052	NC_021825	T	6	6	2977656	2977661	0 %	100 %	0 %	0 %	525880608
68053	NC_021825	T	6	6	2977684	2977689	0 %	100 %	0 %	0 %	525880608
68054	NC_021825	ATA	2	6	2977702	2977707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880608
68055	NC_021825	AT	3	6	2977854	2977859	50 %	50 %	0 %	0 %	525880608
68056	NC_021825	ATAA	2	8	2977915	2977922	75 %	25 %	0 %	0 %	525880608
68057	NC_021825	GTG	2	6	2977924	2977929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525880608
68058	NC_021825	AGG	2	6	2977933	2977938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525880608
68059	NC_021825	GTTA	2	8	2977959	2977966	25 %	50 %	25 %	0 %	525880608
68060	NC_021825	T	6	6	2977977	2977982	0 %	100 %	0 %	0 %	525880608
68061	NC_021825	GGTT	2	8	2978006	2978013	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68062	NC_021825	T	6	6	2978107	2978112	0 %	100 %	0 %	0 %	525880609
68063	NC_021825	T	6	6	2978128	2978133	0 %	100 %	0 %	0 %	525880609
68064	NC_021825	T	7	7	2978145	2978151	0 %	100 %	0 %	0 %	525880609
68065	NC_021825	TTC	2	6	2978167	2978172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880609
68066	NC_021825	CTT	2	6	2978200	2978205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880609
68067	NC_021825	CAT	2	6	2978227	2978232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880609
68068	NC_021825	TC	4	8	2978246	2978253	0 %	50 %	0 %	50 %	525880609
68069	NC_021825	ATC	2	6	2978306	2978311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880609
68070	NC_021825	TTGG	2	8	2978324	2978331	0 %	50 %	50 %	0 %	525880609
68071	NC_021825	TAA	2	6	2978342	2978347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880609
68072	NC_021825	TCT	2	6	2978367	2978372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880609
68073	NC_021825	TAT	2	6	2978428	2978433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880609
68074	NC_021825	TTCT	2	8	2978483	2978490	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68075	NC_021825	CAT	2	6	2978521	2978526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68076	NC_021825	AT	3	6	2978571	2978576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68077	NC_021825	TC	3	6	2978578	2978583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68078	NC_021825	ATT	2	6	2978629	2978634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68079	NC_021825	GTGC	2	8	2978659	2978666	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68080	NC_021825	TAA	2	6	2978684	2978689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68081	NC_021825	TCC	2	6	2978738	2978743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68082	NC_021825	TTA	2	6	2978777	2978782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68083	NC_021825	TAT	2	6	2978810	2978815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68084	NC_021825	TAA	2	6	2978883	2978888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68085	NC_021825	CAA	2	6	2978893	2978898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68086	NC_021825	TTA	2	6	2978907	2978912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68087	NC_021825	AAAT	2	8	2979006	2979013	75 %	25 %	0 %	0 %	525880610
68088	NC_021825	TACC	2	8	2979032	2979039	25 %	25 %	0 %	50 %	525880610
68089	NC_021825	AT	3	6	2979050	2979055	50 %	50 %	0 %	0 %	525880610
68090	NC_021825	ATT	2	6	2979060	2979065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880610
68091	NC_021825	T	6	6	2979082	2979087	0 %	100 %	0 %	0 %	525880610
68092	NC_021825	TTA	2	6	2979112	2979117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880610
68093	NC_021825	AAC	2	6	2979165	2979170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880610
68094	NC_021825	AAT	2	6	2979172	2979177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880610
68095	NC_021825	TAT	2	6	2979260	2979265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880610
68096	NC_021825	TCAAA	2	10	2979352	2979361	60 %	20 %	0 %	20 %	525880611
68097	NC_021825	TGC	2	6	2979418	2979423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880611
68098	NC_021825	CAA	2	6	2979445	2979450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880611
68099	NC_021825	CCA	2	6	2979534	2979539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525880611
68100	NC_021825	CAT	2	6	2979559	2979564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880611
68101	NC_021825	TTG	2	6	2979647	2979652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880611
68102	NC_021825	CAG	2	6	2979676	2979681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525880611
68103	NC_021825	CTT	2	6	2979689	2979694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880611
68104	NC_021825	TAT	2	6	2979706	2979711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880611
68105	NC_021825	AAT	2	6	2979736	2979741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880611
68106	NC_021825	CAT	2	6	2979904	2979909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880611
68107	NC_021825	ATA	2	6	2979926	2979931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880611
68108	NC_021825	TAA	2	6	2979982	2979987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880611
68109	NC_021825	AAT	2	6	2979991	2979996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880611
68110	NC_021825	T	7	7	2980020	2980026	0 %	100 %	0 %	0 %	525880611
68111	NC_021825	TAA	2	6	2980076	2980081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880611
68112	NC_021825	TCT	2	6	2980161	2980166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880611
68113	NC_021825	TTTA	2	8	2980181	2980188	25 %	75 %	0 %	0 %	525880611
68114	NC_021825	TTG	2	6	2980193	2980198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880611
68115	NC_021825	CTTA	2	8	2980226	2980233	25 %	50 %	0 %	25 %	525880611
68116	NC_021825	CTG	2	6	2980292	2980297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880611
68117	NC_021825	TCAA	2	8	2980314	2980321	50 %	25 %	0 %	25 %	525880611
68118	NC_021825	A	6	6	2980328	2980333	100 %	0 %	0 %	0 %	525880611
68119	NC_021825	CTT	2	6	2980462	2980467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880611
68120	NC_021825	T	6	6	2980466	2980471	0 %	100 %	0 %	0 %	525880611
68121	NC_021825	TCTT	2	8	2980583	2980590	0 %	75 %	0 %	25 %	525880611
68122	NC_021825	ATT	2	6	2980611	2980616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880611
68123	NC_021825	AG	3	6	2980624	2980629	50 %	0 %	50 %	0 %	525880611
68124	NC_021825	ATA	2	6	2980646	2980651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880611
68125	NC_021825	TAT	2	6	2980687	2980692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880611
68126	NC_021825	TCCT	2	8	2980738	2980745	0 %	50 %	0 %	50 %	525880611
68127	NC_021825	A	6	6	2980773	2980778	100 %	0 %	0 %	0 %	525880611
68128	NC_021825	AAC	2	6	2980814	2980819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68129	NC_021825	GTA	2	6	2980836	2980841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68130	NC_021825	ATT	2	6	2980843	2980848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68131	NC_021825	ATAA	2	8	2980886	2980893	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68132	NC_021825	TTA	2	6	2980910	2980915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68133	NC_021825	ATT	2	6	2980921	2980926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68134	NC_021825	GTTT	2	8	2980980	2980987	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68135	NC_021825	GAA	2	6	2981068	2981073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68136	NC_021825	AAG	2	6	2981117	2981122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68137	NC_021825	TGT	2	6	2981138	2981143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880612
68138	NC_021825	TGTC	2	8	2981243	2981250	0 %	50 %	25 %	25 %	525880612
68139	NC_021825	T	7	7	2981268	2981274	0 %	100 %	0 %	0 %	525880612
68140	NC_021825	TA	3	6	2981327	2981332	50 %	50 %	0 %	0 %	525880612
68141	NC_021825	A	6	6	2981353	2981358	100 %	0 %	0 %	0 %	525880613
68142	NC_021825	TCT	2	6	2981364	2981369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880613
68143	NC_021825	ATT	2	6	2981382	2981387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880613
68144	NC_021825	ATG	2	6	2981465	2981470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880613
68145	NC_021825	CAT	2	6	2981548	2981553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880613
68146	NC_021825	ACA	2	6	2981585	2981590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68147	NC_021825	TAA	2	6	2981654	2981659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68148	NC_021825	ATT	2	6	2981684	2981689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68149	NC_021825	T	6	6	2981720	2981725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68150	NC_021825	T	7	7	2981768	2981774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68151	NC_021825	A	7	7	2981779	2981785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68152	NC_021825	TC	3	6	2981851	2981856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68153	NC_021825	TTC	2	6	2981857	2981862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

< Previous12...125126127128129130131132133134135136137Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.