MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-064

Total Repeats: 67131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021824	CTA	2	6	44331	44336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869804
1002	NC_021824	TCA	2	6	44345	44350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869804
1003	NC_021824	TAA	2	6	44353	44358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869804
1004	NC_021824	TTG	2	6	44413	44418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869804
1005	NC_021824	CTTT	2	8	44480	44487	0 %	75 %	0 %	25 %	525869804
1006	NC_021824	CG	3	6	44541	44546	0 %	0 %	50 %	50 %	525869804
1007	NC_021824	CAG	2	6	44598	44603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869804
1008	NC_021824	CAT	2	6	44652	44657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869804
1009	NC_021824	TCA	2	6	44658	44663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869804
1010	NC_021824	ACG	2	6	44707	44712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869804
1011	NC_021824	GC	3	6	44767	44772	0 %	0 %	50 %	50 %	525869804
1012	NC_021824	CTT	2	6	44790	44795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869804
1013	NC_021824	TAT	2	6	44865	44870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869804
1014	NC_021824	CAGT	2	8	45012	45019	25 %	25 %	25 %	25 %	525869804
1015	NC_021824	TTCA	2	8	45025	45032	25 %	50 %	0 %	25 %	525869804
1016	NC_021824	TTC	2	6	45059	45064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869804
1017	NC_021824	ATA	2	6	45095	45100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869804
1018	NC_021824	TTG	2	6	45133	45138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869804
1019	NC_021824	CTT	2	6	45186	45191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869804
1020	NC_021824	TAT	2	6	45192	45197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869804
1021	NC_021824	CTT	2	6	45249	45254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869804
1022	NC_021824	ATC	2	6	45415	45420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869804
1023	NC_021824	TTG	2	6	45466	45471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869805
1024	NC_021824	CTT	3	9	45480	45488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869805
1025	NC_021824	CTT	2	6	45567	45572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869805
1026	NC_021824	TAC	2	6	45574	45579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869805
1027	NC_021824	CAT	2	6	45589	45594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869805
1028	NC_021824	CGC	2	6	45669	45674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525869805
1029	NC_021824	CATTT	2	10	45676	45685	20 %	60 %	0 %	20 %	525869805
1030	NC_021824	TAA	2	6	45769	45774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869805
1031	NC_021824	T	6	6	45793	45798	0 %	100 %	0 %	0 %	525869805
1032	NC_021824	TTC	2	6	45841	45846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869805
1033	NC_021824	TCG	2	6	45908	45913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869805
1034	NC_021824	CTT	2	6	45915	45920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869805
1035	NC_021824	CGG	2	6	45923	45928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525869805
1036	NC_021824	ATTG	2	8	45931	45938	25 %	50 %	25 %	0 %	525869805
1037	NC_021824	GAAT	2	8	45945	45952	50 %	25 %	25 %	0 %	525869805
1038	NC_021824	ATA	2	6	46100	46105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869805
1039	NC_021824	A	6	6	46249	46254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021824	TCC	2	6	46256	46261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_021824	TTC	2	6	46330	46335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_021824	CTA	2	6	46353	46358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_021824	TAA	2	6	46360	46365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_021824	T	6	6	46369	46374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_021824	TATTT	2	10	46403	46412	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_021824	A	7	7	46427	46433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_021824	A	6	6	46476	46481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_021824	TTAT	2	8	46495	46502	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_021824	AT	3	6	46501	46506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_021824	TTG	2	6	46511	46516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_021824	ATA	2	6	46537	46542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_021824	T	6	6	46545	46550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_021824	TAA	2	6	46552	46557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_021824	GAA	2	6	46590	46595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869806
1055	NC_021824	AAT	2	6	46599	46604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869806
1056	NC_021824	GCC	2	6	46675	46680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525869806
1057	NC_021824	A	6	6	46685	46690	100 %	0 %	0 %	0 %	525869806
1058	NC_021824	ACA	2	6	46711	46716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869806
1059	NC_021824	A	7	7	46758	46764	100 %	0 %	0 %	0 %	525869806
1060	NC_021824	A	6	6	46795	46800	100 %	0 %	0 %	0 %	525869806
1061	NC_021824	TCT	2	6	46858	46863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869806
1062	NC_021824	GGAAA	2	10	46871	46880	60 %	0 %	40 %	0 %	525869806
1063	NC_021824	A	7	7	46878	46884	100 %	0 %	0 %	0 %	525869806
1064	NC_021824	ACG	2	6	46958	46963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869806
1065	NC_021824	TTA	2	6	46984	46989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869806
1066	NC_021824	CAG	2	6	46997	47002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869806
1067	NC_021824	A	7	7	47137	47143	100 %	0 %	0 %	0 %	525869806
1068	NC_021824	GAA	2	6	47146	47151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869806
1069	NC_021824	ACTTC	2	10	47201	47210	20 %	40 %	0 %	40 %	525869806
1070	NC_021824	TGA	2	6	47289	47294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869806
1071	NC_021824	AGC	2	6	47346	47351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869806
1072	NC_021824	A	6	6	47356	47361	100 %	0 %	0 %	0 %	525869806
1073	NC_021824	A	6	6	47375	47380	100 %	0 %	0 %	0 %	525869806
1074	NC_021824	ATC	2	6	47388	47393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869806
1075	NC_021824	ATTAAC	2	12	47439	47450	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525869806
1076	NC_021824	A	6	6	47461	47466	100 %	0 %	0 %	0 %	525869806
1077	NC_021824	ACT	2	6	47488	47493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869806
1078	NC_021824	CAAAA	2	10	47508	47517	80 %	0 %	0 %	20 %	525869806
1079	NC_021824	CAA	2	6	47534	47539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869806
1080	NC_021824	TCC	2	6	47568	47573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525869806
1081	NC_021824	A	6	6	47602	47607	100 %	0 %	0 %	0 %	525869806
1082	NC_021824	A	7	7	47663	47669	100 %	0 %	0 %	0 %	525869806
1083	NC_021824	T	6	6	47695	47700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_021824	TATTT	2	10	47702	47711	20 %	80 %	0 %	0 %	525869807
1085	NC_021824	AAC	2	6	47721	47726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869807
1086	NC_021824	GTAAT	2	10	47746	47755	40 %	40 %	20 %	0 %	525869807
1087	NC_021824	TGAA	2	8	47769	47776	50 %	25 %	25 %	0 %	525869807
1088	NC_021824	ATC	2	6	47805	47810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869807
1089	NC_021824	T	6	6	47811	47816	0 %	100 %	0 %	0 %	525869807
1090	NC_021824	TGT	2	6	47823	47828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869807
1091	NC_021824	ACA	2	6	47905	47910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869807
1092	NC_021824	CTT	2	6	47939	47944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869807
1093	NC_021824	TTA	2	6	47947	47952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869807
1094	NC_021824	TCA	2	6	47960	47965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869807
1095	NC_021824	ATC	2	6	48021	48026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869807
1096	NC_021824	GC	3	6	48137	48142	0 %	0 %	50 %	50 %	525869807
1097	NC_021824	T	6	6	48171	48176	0 %	100 %	0 %	0 %	525869807
1098	NC_021824	CTTTTT	2	12	48233	48244	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525869807
1099	NC_021824	AGT	2	6	48275	48280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869807
1100	NC_021824	CTT	2	6	48296	48301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869807
1101	NC_021824	GAG	2	6	48466	48471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525869807
1102	NC_021824	ACTAAA	2	12	48490	48501	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525869807
1103	NC_021824	TC	3	6	48542	48547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_021824	T	6	6	48549	48554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_021824	T	7	7	48569	48575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021824	TTC	2	6	48584	48589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_021824	AAG	2	6	48626	48631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869808
1108	NC_021824	ATA	2	6	48668	48673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869808
1109	NC_021824	AAT	2	6	48814	48819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869808
1110	NC_021824	AAT	2	6	48853	48858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869808
1111	NC_021824	GCT	2	6	48887	48892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869808
1112	NC_021824	AGC	2	6	48952	48957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869808
1113	NC_021824	GTAATA	2	12	49026	49037	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525869808
1114	NC_021824	ATA	2	6	49046	49051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869808
1115	NC_021824	GC	3	6	49105	49110	0 %	0 %	50 %	50 %	525869808
1116	NC_021824	T	6	6	49120	49125	0 %	100 %	0 %	0 %	525869808
1117	NC_021824	GTTA	2	8	49129	49136	25 %	50 %	25 %	0 %	525869808
1118	NC_021824	TAA	2	6	49144	49149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869808
1119	NC_021824	A	7	7	49169	49175	100 %	0 %	0 %	0 %	525869808
1120	NC_021824	AAT	2	6	49181	49186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869808
1121	NC_021824	CAT	2	6	49228	49233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869808
1122	NC_021824	AAT	2	6	49253	49258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869808
1123	NC_021824	TCT	2	6	49339	49344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869809
1124	NC_021824	TGCGTT	2	12	49387	49398	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525869809
1125	NC_021824	CAT	2	6	49427	49432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869809
1126	NC_021824	TTC	2	6	49539	49544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869809
1127	NC_021824	CAA	2	6	49634	49639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869809
1128	NC_021824	GAT	2	6	49710	49715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869809
1129	NC_021824	AGG	2	6	49744	49749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525869809
1130	NC_021824	TCA	2	6	49798	49803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869809
1131	NC_021824	GTT	2	6	49821	49826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869809
1132	NC_021824	GCT	2	6	49853	49858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869809
1133	NC_021824	CCG	2	6	49864	49869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525869809
1134	NC_021824	TTTTC	2	10	49891	49900	0 %	80 %	0 %	20 %	525869809
1135	NC_021824	CAA	2	6	49910	49915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869809
1136	NC_021824	T	6	6	49946	49951	0 %	100 %	0 %	0 %	525869809
1137	NC_021824	ATA	2	6	50012	50017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869809
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1140	NC_021824	A	7	7	50325	50331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_021824	CTG	2	6	50337	50342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1142	NC_021824	GCA	2	6	50355	50360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1143	NC_021824	T	6	6	50361	50366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1144	NC_021824	CTTC	2	8	50379	50386	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1145	NC_021824	GTT	2	6	50406	50411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1146	NC_021824	ATT	2	6	50444	50449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1147	NC_021824	CCA	2	6	50484	50489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1148	NC_021824	ATT	2	6	50511	50516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1149	NC_021824	T	6	6	50553	50558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1150	NC_021824	TAG	2	6	50573	50578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1151	NC_021824	ATTT	2	8	50609	50616	25 %	75 %	0 %	0 %	525869810
1152	NC_021824	TAA	2	6	50631	50636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869810
1153	NC_021824	TAT	2	6	50640	50645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869810
1154	NC_021824	CTGT	2	8	50646	50653	0 %	50 %	25 %	25 %	525869810
1155	NC_021824	TAT	2	6	50718	50723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869810
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1158	NC_021824	CTC	2	6	50806	50811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1160	NC_021824	GAAA	2	8	50850	50857	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1161	NC_021824	T	6	6	50917	50922	0 %	100 %	0 %	0 %	525869811
1162	NC_021824	CCG	2	6	50942	50947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525869811
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1165	NC_021824	TCT	2	6	51104	51109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869811
1166	NC_021824	TTTG	2	8	51129	51136	0 %	75 %	25 %	0 %	525869811
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1171	NC_021824	TCTT	2	8	51323	51330	0 %	75 %	0 %	25 %	525869811
1172	NC_021824	ATC	2	6	51373	51378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869811
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1189	NC_021824	A	7	7	51949	51955	100 %	0 %	0 %	0 %	525869811
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1205	NC_021824	TTC	3	9	52801	52809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869813
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1224	NC_021824	A	6	6	53656	53661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1225	NC_021824	AAC	2	6	53715	53720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1248	NC_021824	CTC	2	6	54602	54607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1249	NC_021824	TTC	3	9	54655	54663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869816
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1251	NC_021824	TAGT	2	8	54696	54703	25 %	50 %	25 %	0 %	525869816
1252	NC_021824	CTT	2	6	54747	54752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869816
1253	NC_021824	CGG	2	6	54824	54829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525869816
1254	NC_021824	TTC	2	6	54865	54870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869816
1255	NC_021824	TGCTTT	2	12	54934	54945	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525869816
1256	NC_021824	CTCC	2	8	54995	55002	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1257	NC_021824	CTA	3	9	55012	55020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1259	NC_021824	A	7	7	55063	55069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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