MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes strain C1-387

Total Repeats: 42701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021823	AGC	2	6	28	33	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021823	ATG	2	6	86	91	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021823	CAG	2	6	99	104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021823	TTC	2	6	164	169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021823	TAC	2	6	273	278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021823	AAT	2	6	311	316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021823	ATA	2	6	471	476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021823	AAT	2	6	557	562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021823	TTC	2	6	644	649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021823	ATT	2	6	698	703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021823	GAA	2	6	739	744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021823	GTT	2	6	771	776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525865814
13	NC_021823	ATT	2	6	781	786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865814
14	NC_021823	ATT	2	6	791	796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865814
15	NC_021823	TAT	2	6	861	866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865814
16	NC_021823	TTC	2	6	1034	1039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865814
17	NC_021823	ATA	2	6	1042	1047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865814
18	NC_021823	ATT	2	6	1101	1106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865814
19	NC_021823	ATA	2	6	1114	1119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865814
20	NC_021823	TGG	2	6	1183	1188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525865814
21	NC_021823	ATG	2	6	1195	1200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865814
22	NC_021823	ATA	2	6	1204	1209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865814
23	NC_021823	TTG	2	6	1237	1242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525865814
24	NC_021823	ATG	2	6	1255	1260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865814
25	NC_021823	AGA	2	6	1439	1444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865814
26	NC_021823	ATG	2	6	1506	1511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865814
27	NC_021823	TAT	2	6	1708	1713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865814
28	NC_021823	TAT	2	6	1747	1752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865814
29	NC_021823	TTA	2	6	1840	1845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865814
30	NC_021823	CAC	2	6	1850	1855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525865814
31	NC_021823	TGG	2	6	1930	1935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525865814
32	NC_021823	GCT	2	6	2057	2062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525865815
33	NC_021823	GCA	2	6	2103	2108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525865815
34	NC_021823	ACC	2	6	2166	2171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525865815
35	NC_021823	ACT	2	6	2194	2199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865815
36	NC_021823	AAG	2	6	2257	2262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865815
37	NC_021823	GCA	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525865815
38	NC_021823	GCG	2	6	2658	2663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525865815
39	NC_021823	AGA	2	6	2672	2677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865815
40	NC_021823	GAT	2	6	2793	2798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865815
41	NC_021823	AGT	2	6	2828	2833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865815
42	NC_021823	AAC	2	6	2957	2962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525865815
43	NC_021823	AAC	3	9	3014	3022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525865815
44	NC_021823	TCA	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865815
45	NC_021823	GAA	2	6	3396	3401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865815
46	NC_021823	GTT	2	6	3471	3476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525865815
47	NC_021823	AGA	2	6	3494	3499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865815
48	NC_021823	ATG	2	6	3544	3549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865815
49	NC_021823	AGA	2	6	3602	3607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865815
50	NC_021823	AAT	3	9	3636	3644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865815
51	NC_021823	GAC	2	6	3666	3671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525865815
52	NC_021823	ACA	2	6	3685	3690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525865815
53	NC_021823	AAC	2	6	3748	3753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525865815
54	NC_021823	CAA	2	6	3850	3855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525865815
55	NC_021823	TTG	2	6	3892	3897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525865815
56	NC_021823	GAA	2	6	3951	3956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865815
57	NC_021823	TAA	2	6	3977	3982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865815
58	NC_021823	AAG	2	6	3985	3990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865815
59	NC_021823	CGT	2	6	4022	4027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525865815
60	NC_021823	CTA	2	6	4047	4052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865815
61	NC_021823	GAG	2	6	4084	4089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525865815
62	NC_021823	GAA	2	6	4100	4105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865816
63	NC_021823	TCA	2	6	4162	4167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865816
64	NC_021823	ATT	2	6	4212	4217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865816
65	NC_021823	TTA	2	6	4218	4223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865816
66	NC_021823	TAT	2	6	4319	4324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865816
67	NC_021823	AAG	2	6	4441	4446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865816
68	NC_021823	TCA	2	6	4591	4596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865816
69	NC_021823	TTA	2	6	4713	4718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865816
70	NC_021823	GAT	2	6	4725	4730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865816
71	NC_021823	TGT	2	6	4744	4749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525865816
72	NC_021823	GAA	2	6	4821	4826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865816
73	NC_021823	AGG	2	6	4977	4982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021823	GGA	2	6	5001	5006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021823	AGA	2	6	5020	5025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865817
76	NC_021823	TTA	2	6	5042	5047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865817
77	NC_021823	ATC	2	6	5533	5538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865817
78	NC_021823	ATT	2	6	5609	5614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865817
79	NC_021823	TCT	2	6	5652	5657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865817
80	NC_021823	GTC	2	6	5809	5814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525865817
81	NC_021823	CTT	2	6	5823	5828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865817
82	NC_021823	TAA	2	6	5979	5984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865818
83	NC_021823	GAT	4	12	6048	6059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865818
84	NC_021823	TGA	2	6	6090	6095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865818
85	NC_021823	GAA	2	6	6157	6162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865818
86	NC_021823	GAA	3	9	6247	6255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865819
87	NC_021823	ATT	2	6	6415	6420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865819
88	NC_021823	GCA	2	6	6511	6516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525865819
89	NC_021823	AAG	2	6	6518	6523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865819
90	NC_021823	GGC	2	6	6541	6546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525865819
91	NC_021823	CGA	2	6	6582	6587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525865819
92	NC_021823	CAG	2	6	6731	6736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525865819
93	NC_021823	AGA	2	6	7074	7079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865819
94	NC_021823	ATG	2	6	7136	7141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865819
95	NC_021823	GGT	2	6	7180	7185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525865819
96	NC_021823	CAA	2	6	7240	7245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525865819
97	NC_021823	AGC	2	6	7344	7349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525865819
98	NC_021823	TGA	2	6	7359	7364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865819
99	NC_021823	TAA	2	6	7379	7384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865819
100	NC_021823	ATA	2	6	7385	7390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865819
101	NC_021823	CTG	2	6	7397	7402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525865819
102	NC_021823	CGG	2	6	7452	7457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525865819
103	NC_021823	GGT	2	6	7522	7527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525865819
104	NC_021823	TCC	2	6	7575	7580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_021823	TAT	2	6	7601	7606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865820
106	NC_021823	AAT	2	6	7664	7669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865820
107	NC_021823	AAT	2	6	7839	7844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865820
108	NC_021823	CAT	2	6	8094	8099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865820
109	NC_021823	GCA	2	6	8241	8246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525865820
110	NC_021823	ATC	2	6	8324	8329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865820
111	NC_021823	AAT	2	6	8452	8457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865820
112	NC_021823	TCA	2	6	8480	8485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865820
113	NC_021823	TTA	2	6	8501	8506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865820
114	NC_021823	TGA	2	6	8527	8532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865820
115	NC_021823	ATG	2	6	8689	8694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021823	AGA	2	6	8699	8704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021823	AGG	2	6	8727	8732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021823	TAT	2	6	8739	8744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865821
119	NC_021823	TGG	2	6	8772	8777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525865821
120	NC_021823	TTG	2	6	8801	8806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525865821
121	NC_021823	TTA	2	6	8813	8818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865821
122	NC_021823	TAG	2	6	8855	8860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865821
123	NC_021823	AGC	2	6	8922	8927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525865821
124	NC_021823	CGT	2	6	8962	8967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525865821
125	NC_021823	ACA	2	6	8995	9000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525865821
126	NC_021823	TTA	2	6	9016	9021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865821
127	NC_021823	ATC	2	6	9064	9069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865821
128	NC_021823	AGA	2	6	9141	9146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865821
129	NC_021823	CAG	2	6	9194	9199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525865821
130	NC_021823	TTC	2	6	9218	9223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865821
131	NC_021823	AGA	3	9	9309	9317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865821
132	NC_021823	TTC	2	6	9322	9327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865821
133	NC_021823	CTT	2	6	9468	9473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865821
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259	NC_021823	TCT	2	6	17312	17317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865828
260	NC_021823	ACC	3	9	17395	17403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525865828
261	NC_021823	AAC	2	6	17413	17418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525865828
262	NC_021823	ACC	2	6	17464	17469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525865828
263	NC_021823	CCT	2	6	17511	17516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
264	NC_021823	CAC	2	6	17573	17578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525865829
265	NC_021823	AAT	2	6	17680	17685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865829
266	NC_021823	AAT	2	6	17707	17712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865829
267	NC_021823	TCC	2	6	17896	17901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525865829
268	NC_021823	GCC	2	6	17988	17993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525865829
269	NC_021823	ATG	2	6	18174	18179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865830
270	NC_021823	GAT	2	6	18320	18325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865830
271	NC_021823	ATG	2	6	18366	18371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865830
272	NC_021823	ATA	2	6	18375	18380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865830
273	NC_021823	TCC	2	6	18457	18462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
274	NC_021823	CCA	2	6	18490	18495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
275	NC_021823	AGT	2	6	18549	18554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865831
276	NC_021823	TAA	2	6	18584	18589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865831
277	NC_021823	CTA	2	6	18617	18622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865831
278	NC_021823	TGA	2	6	18877	18882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865831
279	NC_021823	ACC	2	6	19011	19016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525865831
280	NC_021823	TGA	2	6	19040	19045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865831
281	NC_021823	CAA	2	6	19079	19084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525865831
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283	NC_021823	TAT	2	6	19235	19240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865831
284	NC_021823	TCG	2	6	19318	19323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525865831
285	NC_021823	GTT	2	6	19418	19423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525865831
286	NC_021823	ATA	2	6	19535	19540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865831
287	NC_021823	TGC	2	6	19593	19598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525865831
288	NC_021823	GCG	2	6	19645	19650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525865831
289	NC_021823	ATT	2	6	19710	19715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865831
290	NC_021823	TCC	2	6	19762	19767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
291	NC_021823	TAA	2	6	19821	19826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_021823	ATT	2	6	20004	20009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_021823	GAA	2	6	20026	20031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865832
294	NC_021823	CTT	2	6	20101	20106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865832
295	NC_021823	CGA	2	6	20131	20136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525865832
296	NC_021823	TTC	2	6	20148	20153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865832
297	NC_021823	CTC	2	6	20156	20161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525865832
298	NC_021823	CTT	2	6	20203	20208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865832
299	NC_021823	ACA	2	6	20247	20252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525865832
300	NC_021823	TTC	2	6	20267	20272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865832
301	NC_021823	TTC	2	6	20300	20305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865832
302	NC_021823	CTT	2	6	20365	20370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865832
303	NC_021823	AAT	2	6	20546	20551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865832
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309	NC_021823	CAT	2	6	20978	20983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
310	NC_021823	ATT	2	6	21192	21197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
311	NC_021823	AGA	2	6	21200	21205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
312	NC_021823	ATT	3	9	21209	21217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
313	NC_021823	ATT	2	6	21299	21304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
314	NC_021823	ATG	2	6	21362	21367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865833
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322	NC_021823	CCA	2	6	21818	21823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525865833
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370	NC_021823	TGT	2	6	25275	25280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
371	NC_021823	AGG	2	6	25305	25310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
372	NC_021823	ATC	2	6	25339	25344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865836
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