MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain C1-387

Total Repeats: 68223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42503	NC_021823	TTTA	2	8	1855990	1855997	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42504	NC_021823	T	7	7	1856028	1856034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42505	NC_021823	T	6	6	1856042	1856047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42506	NC_021823	A	7	7	1856072	1856078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42507	NC_021823	AT	3	6	1856109	1856114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42508	NC_021823	T	6	6	1856154	1856159	0 %	100 %	0 %	0 %	525868548
42509	NC_021823	TAT	2	6	1856190	1856195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868548
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42512	NC_021823	TCA	2	6	1856319	1856324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868548
42513	NC_021823	TTA	2	6	1856376	1856381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42514	NC_021823	A	6	6	1856389	1856394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42515	NC_021823	A	6	6	1856410	1856415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42516	NC_021823	A	6	6	1856486	1856491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42517	NC_021823	TAAC	2	8	1856499	1856506	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42518	NC_021823	TTA	2	6	1856539	1856544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42525	NC_021823	TAAA	2	8	1856819	1856826	75 %	25 %	0 %	0 %	525868549
42526	NC_021823	TA	3	6	1856864	1856869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42532	NC_021823	AATT	2	8	1856984	1856991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42533	NC_021823	AT	3	6	1857016	1857021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42534	NC_021823	TA	3	6	1857036	1857041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42549	NC_021823	A	6	6	1857597	1857602	100 %	0 %	0 %	0 %	525868551
42550	NC_021823	AAAT	2	8	1857677	1857684	75 %	25 %	0 %	0 %	525868551
42551	NC_021823	ATG	2	6	1857686	1857691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868551
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42558	NC_021823	GAAA	2	8	1858076	1858083	75 %	0 %	25 %	0 %	525868552
42559	NC_021823	AATA	2	8	1858089	1858096	75 %	25 %	0 %	0 %	525868552
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42561	NC_021823	GGA	2	6	1858118	1858123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525868552
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42563	NC_021823	A	7	7	1858256	1858262	100 %	0 %	0 %	0 %	525868552
42564	NC_021823	CAT	2	6	1858293	1858298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868552
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42566	NC_021823	A	6	6	1858317	1858322	100 %	0 %	0 %	0 %	525868552
42567	NC_021823	AGA	2	6	1858352	1858357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525868552
42568	NC_021823	T	9	9	1858412	1858420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42569	NC_021823	A	7	7	1858425	1858431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42577	NC_021823	TAT	2	6	1858674	1858679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868553
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42600	NC_021823	TTC	2	6	1859823	1859828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42602	NC_021823	ATC	2	6	1859899	1859904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42603	NC_021823	A	6	6	1859911	1859916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42604	NC_021823	TAAA	2	8	1859917	1859924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42605	NC_021823	CTT	2	6	1859950	1859955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42606	NC_021823	ACT	2	6	1860020	1860025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42607	NC_021823	TAAAA	2	10	1860079	1860088	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42608	NC_021823	A	7	7	1860085	1860091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42609	NC_021823	AAG	2	6	1860099	1860104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42610	NC_021823	CAA	2	6	1860111	1860116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42611	NC_021823	CTT	2	6	1860136	1860141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525868556
42612	NC_021823	GTTTT	2	10	1860251	1860260	0 %	80 %	20 %	0 %	525868556
42613	NC_021823	TTG	2	6	1860261	1860266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525868556
42614	NC_021823	T	7	7	1860312	1860318	0 %	100 %	0 %	0 %	525868556
42615	NC_021823	GTA	2	6	1860331	1860336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868556
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42621	NC_021823	T	7	7	1860720	1860726	0 %	100 %	0 %	0 %	525868556
42622	NC_021823	ATTC	2	8	1860760	1860767	25 %	50 %	0 %	25 %	525868556
42623	NC_021823	ATC	2	6	1860831	1860836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868557
42624	NC_021823	T	6	6	1860846	1860851	0 %	100 %	0 %	0 %	525868557
42625	NC_021823	AAT	2	6	1860874	1860879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868557
42626	NC_021823	ACC	2	6	1860885	1860890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525868557
42627	NC_021823	ATC	2	6	1860916	1860921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868557
42628	NC_021823	TCT	2	6	1861025	1861030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525868557
42629	NC_021823	AACA	2	8	1861041	1861048	75 %	0 %	0 %	25 %	525868557
42630	NC_021823	ACT	2	6	1861060	1861065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868557
42631	NC_021823	ATC	2	6	1861111	1861116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42632	NC_021823	CAA	2	6	1861140	1861145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525868558
42633	NC_021823	ATTG	2	8	1861192	1861199	25 %	50 %	25 %	0 %	525868558
42634	NC_021823	TTG	3	9	1861197	1861205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525868558
42635	NC_021823	TCA	2	6	1861211	1861216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868558
42636	NC_021823	TGT	2	6	1861243	1861248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525868558
42637	NC_021823	TC	4	8	1861273	1861280	0 %	50 %	0 %	50 %	525868558
42638	NC_021823	TTA	2	6	1861294	1861299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868558
42639	NC_021823	TC	3	6	1861304	1861309	0 %	50 %	0 %	50 %	525868558
42640	NC_021823	TTC	2	6	1861311	1861316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525868558
42641	NC_021823	TTC	2	6	1861332	1861337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525868558
42642	NC_021823	ATC	2	6	1861365	1861370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868558
42643	NC_021823	GAA	2	6	1861428	1861433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525868558
42644	NC_021823	TTTC	2	8	1861436	1861443	0 %	75 %	0 %	25 %	525868558
42645	NC_021823	CAT	2	6	1861475	1861480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868558
42646	NC_021823	TCA	2	6	1861487	1861492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42647	NC_021823	A	6	6	1861501	1861506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42648	NC_021823	AAT	2	6	1861539	1861544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868559
42649	NC_021823	GAT	2	6	1861605	1861610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868559
42650	NC_021823	GCAC	2	8	1861611	1861618	25 %	0 %	25 %	50 %	525868559
42651	NC_021823	CCG	2	6	1861623	1861628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525868559
42652	NC_021823	GTT	2	6	1861668	1861673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525868559
42653	NC_021823	ATT	2	6	1861703	1861708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868559
42654	NC_021823	AAT	2	6	1861778	1861783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868559
42655	NC_021823	GAG	2	6	1861792	1861797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525868559
42656	NC_021823	CTG	2	6	1861807	1861812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525868559
42657	NC_021823	TGA	2	6	1862002	1862007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868559
42658	NC_021823	TAC	2	6	1862018	1862023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868559
42659	NC_021823	TTGAA	2	10	1862053	1862062	40 %	40 %	20 %	0 %	525868559
42660	NC_021823	TCA	2	6	1862067	1862072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868559
42661	NC_021823	TCG	2	6	1862103	1862108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525868559
42662	NC_021823	TTATG	2	10	1862122	1862131	20 %	60 %	20 %	0 %	525868559
42663	NC_021823	ATCT	2	8	1862291	1862298	25 %	50 %	0 %	25 %	525868559
42664	NC_021823	CAT	2	6	1862425	1862430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868559
42665	NC_021823	CAT	2	6	1862467	1862472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868559
42666	NC_021823	ACT	2	6	1862489	1862494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868559
42667	NC_021823	TGT	2	6	1862502	1862507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525868559
42668	NC_021823	TTA	2	6	1862520	1862525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868559
42669	NC_021823	TTA	2	6	1862544	1862549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868559
42670	NC_021823	TTG	2	6	1862554	1862559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525868559
42671	NC_021823	CTTG	2	8	1862685	1862692	0 %	50 %	25 %	25 %	525868559
42672	NC_021823	GGA	2	6	1862703	1862708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525868559
42673	NC_021823	ATG	2	6	1862812	1862817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868559
42674	NC_021823	GAT	2	6	1862820	1862825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868559
42675	NC_021823	TCA	2	6	1862943	1862948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868559
42676	NC_021823	TCC	2	6	1862966	1862971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525868559
42677	NC_021823	AGA	2	6	1862978	1862983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525868559
42678	NC_021823	TTGCG	2	10	1863008	1863017	0 %	40 %	40 %	20 %	525868559
42679	NC_021823	ATA	2	6	1863052	1863057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868559
42680	NC_021823	TAA	2	6	1863138	1863143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868559
42681	NC_021823	TCC	2	6	1863154	1863159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525868559
42682	NC_021823	AACTT	2	10	1863180	1863189	40 %	40 %	0 %	20 %	525868559
42683	NC_021823	CTT	2	6	1863223	1863228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525868559
42684	NC_021823	TA	3	6	1863236	1863241	50 %	50 %	0 %	0 %	525868559
42685	NC_021823	ATCC	2	8	1863294	1863301	25 %	25 %	0 %	50 %	525868559
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42687	NC_021823	T	6	6	1863415	1863420	0 %	100 %	0 %	0 %	525868559
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42690	NC_021823	GT	3	6	1863597	1863602	0 %	50 %	50 %	0 %	525868559
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42694	NC_021823	ACC	2	6	1863776	1863781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525868560
42695	NC_021823	A	6	6	1863791	1863796	100 %	0 %	0 %	0 %	525868560
42696	NC_021823	TGTTTC	2	12	1863848	1863859	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525868560
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42698	NC_021823	CAA	2	6	1863934	1863939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525868560
42699	NC_021823	TA	3	6	1863996	1864001	50 %	50 %	0 %	0 %	525868560
42700	NC_021823	T	7	7	1864016	1864022	0 %	100 %	0 %	0 %	525868560
42701	NC_021823	TATT	2	8	1864026	1864033	25 %	75 %	0 %	0 %	525868560
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42704	NC_021823	T	7	7	1864217	1864223	0 %	100 %	0 %	0 %	525868560
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42710	NC_021823	ATT	2	6	1864674	1864679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868560
42711	NC_021823	TTC	2	6	1864862	1864867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525868560
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42713	NC_021823	AACA	2	8	1864894	1864901	75 %	0 %	0 %	25 %	525868560
42714	NC_021823	TA	3	6	1864924	1864929	50 %	50 %	0 %	0 %	525868560
42715	NC_021823	ATA	2	6	1864967	1864972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868560
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42720	NC_021823	ATT	2	6	1865211	1865216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868560
42721	NC_021823	ATGA	2	8	1865233	1865240	50 %	25 %	25 %	0 %	525868560
42722	NC_021823	TAA	2	6	1865298	1865303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868561
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42724	NC_021823	TCC	2	6	1865342	1865347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525868561
42725	NC_021823	TTA	2	6	1865375	1865380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868561
42726	NC_021823	CTG	2	6	1865427	1865432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525868561
42727	NC_021823	TCA	2	6	1865603	1865608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868561
42728	NC_021823	TTG	2	6	1865652	1865657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525868561
42729	NC_021823	CATT	2	8	1865703	1865710	25 %	50 %	0 %	25 %	525868561
42730	NC_021823	AAT	2	6	1865725	1865730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868561
42731	NC_021823	CAG	2	6	1865763	1865768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525868561
42732	NC_021823	AAG	2	6	1865805	1865810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525868561
42733	NC_021823	T	6	6	1865830	1865835	0 %	100 %	0 %	0 %	525868561
42734	NC_021823	CGC	2	6	1865848	1865853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525868561
42735	NC_021823	T	6	6	1865926	1865931	0 %	100 %	0 %	0 %	525868561
42736	NC_021823	T	6	6	1866055	1866060	0 %	100 %	0 %	0 %	525868561
42737	NC_021823	TTG	2	6	1866091	1866096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525868561
42738	NC_021823	T	6	6	1866116	1866121	0 %	100 %	0 %	0 %	525868561
42739	NC_021823	CAG	2	6	1866153	1866158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525868561
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42741	NC_021823	TTA	2	6	1866257	1866262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868561
42742	NC_021823	ATA	2	6	1866280	1866285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868561
42743	NC_021823	TAC	2	6	1866294	1866299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868561
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42746	NC_021823	ATTTG	2	10	1866366	1866375	20 %	60 %	20 %	0 %	525868561
42747	NC_021823	TTA	2	6	1866407	1866412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868561
42748	NC_021823	TTA	2	6	1866425	1866430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868561
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42751	NC_021823	GTA	2	6	1866650	1866655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868561
42752	NC_021823	TTC	2	6	1866661	1866666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525868561
42753	NC_021823	CAT	2	6	1866684	1866689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868561
42754	NC_021823	ATT	2	6	1866715	1866720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868561
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42772	NC_021823	AATT	2	8	1867342	1867349	50 %	50 %	0 %	0 %	525868561
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42828	NC_021823	TAA	2	6	1870335	1870340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42841	NC_021823	TTAAAT	2	12	1870790	1870801	50 %	50 %	0 %	0 %	525868563
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42843	NC_021823	CTCA	2	8	1870836	1870843	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42844	NC_021823	TTA	2	6	1870862	1870867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868564
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42847	NC_021823	TTGCTT	2	12	1870990	1871001	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525868564
42848	NC_021823	CTG	2	6	1871053	1871058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525868564
42849	NC_021823	CCA	4	12	1871202	1871213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525868564
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42851	NC_021823	T	6	6	1871281	1871286	0 %	100 %	0 %	0 %	525868564
42852	NC_021823	ATTT	2	8	1871323	1871330	25 %	75 %	0 %	0 %	525868564
42853	NC_021823	CGCT	2	8	1871396	1871403	0 %	25 %	25 %	50 %	525868564
42854	NC_021823	TAAT	2	8	1871476	1871483	50 %	50 %	0 %	0 %	525868564
42855	NC_021823	TC	3	6	1871511	1871516	0 %	50 %	0 %	50 %	525868564
42856	NC_021823	ATA	2	6	1871576	1871581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868565
42857	NC_021823	CAT	2	6	1871606	1871611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868565
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