MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK908

Total Repeats: 55772

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021725	GTTG	2	8	26621	26628	0 %	50 %	50 %	0 %	523518490
502	NC_021725	TTA	2	6	26662	26667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518490
503	NC_021725	CAA	2	6	26672	26677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518490
504	NC_021725	TCA	2	6	26683	26688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518490
505	NC_021725	CTG	2	6	26693	26698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518490
506	NC_021725	GGT	2	6	26852	26857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518490
507	NC_021725	CGG	2	6	26886	26891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518490
508	NC_021725	GGCA	2	8	27045	27052	25 %	0 %	50 %	25 %	523518490
509	NC_021725	GAT	2	6	27111	27116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518490
510	NC_021725	TGGTG	2	10	27147	27156	0 %	40 %	60 %	0 %	523518490
511	NC_021725	TTG	2	6	27169	27174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518490
512	NC_021725	TG	3	6	27185	27190	0 %	50 %	50 %	0 %	523518490
513	NC_021725	TTG	2	6	27245	27250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518490
514	NC_021725	GCA	2	6	27294	27299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518490
515	NC_021725	ATG	2	6	27314	27319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518490
516	NC_021725	TGG	2	6	27452	27457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518490
517	NC_021725	AGTT	2	8	27497	27504	25 %	50 %	25 %	0 %	523518490
518	NC_021725	TGA	2	6	27536	27541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518490
519	NC_021725	ATT	2	6	27600	27605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518491
520	NC_021725	GGT	2	6	27606	27611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518491
521	NC_021725	AGC	2	6	27614	27619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518491
522	NC_021725	GGTATC	2	12	27627	27638	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	523518491
523	NC_021725	AAC	2	6	27646	27651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518491
524	NC_021725	GAA	2	6	27684	27689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518491
525	NC_021725	TTG	2	6	27861	27866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518491
526	NC_021725	CG	3	6	27901	27906	0 %	0 %	50 %	50 %	523518491
527	NC_021725	ACT	2	6	27924	27929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518491
528	NC_021725	CGT	2	6	27959	27964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518491
529	NC_021725	ACC	2	6	27966	27971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523518491
530	NC_021725	ATC	2	6	28021	28026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518491
531	NC_021725	TTG	2	6	28161	28166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518491
532	NC_021725	AC	3	6	28225	28230	50 %	0 %	0 %	50 %	523518491
533	NC_021725	GGC	2	6	28231	28236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518491
534	NC_021725	AGA	2	6	28285	28290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518491
535	NC_021725	GACG	2	8	28347	28354	25 %	0 %	50 %	25 %	523518491
536	NC_021725	ACG	2	6	28362	28367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518491
537	NC_021725	ATT	2	6	28427	28432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518491
538	NC_021725	ATG	2	6	28441	28446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518491
539	NC_021725	TGA	2	6	28469	28474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518491
540	NC_021725	TTG	2	6	28498	28503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518491
541	NC_021725	TGA	2	6	28655	28660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518491
542	NC_021725	CTG	2	6	28688	28693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518491
543	NC_021725	AGG	2	6	28711	28716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_021725	A	6	6	28787	28792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_021725	GTT	2	6	28822	28827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021725	TTAT	2	8	28835	28842	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021725	GGGT	2	8	28899	28906	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
548	NC_021725	GCT	2	6	28933	28938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518492
549	NC_021725	GCC	2	6	29074	29079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518492
550	NC_021725	CAG	2	6	29091	29096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518492
551	NC_021725	GAT	2	6	29104	29109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518492
552	NC_021725	CTG	2	6	29115	29120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518492
553	NC_021725	GCT	2	6	29147	29152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518492
554	NC_021725	TGCC	2	8	29193	29200	0 %	25 %	25 %	50 %	523518492
555	NC_021725	AGT	2	6	29293	29298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518492
556	NC_021725	TGC	2	6	29301	29306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518492
557	NC_021725	GAA	2	6	29336	29341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518492
558	NC_021725	GTTG	2	8	29344	29351	0 %	50 %	50 %	0 %	523518492
559	NC_021725	CTG	2	6	29375	29380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518492
560	NC_021725	GCT	2	6	29465	29470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518492
561	NC_021725	AACTG	2	10	29806	29815	40 %	20 %	20 %	20 %	523518492
562	NC_021725	CTTT	2	8	29820	29827	0 %	75 %	0 %	25 %	523518492
563	NC_021725	GTT	2	6	29854	29859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518492
564	NC_021725	AGC	2	6	29884	29889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518492
565	NC_021725	TTG	2	6	29984	29989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518492
566	NC_021725	GCT	2	6	30011	30016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518492
567	NC_021725	TAA	2	6	30028	30033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523518492
568	NC_021725	GATGC	2	10	30056	30065	20 %	20 %	40 %	20 %	523518492
569	NC_021725	CTG	2	6	30123	30128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518492
570	NC_021725	TCA	2	6	30138	30143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518492
571	NC_021725	TTAA	3	12	30177	30188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_021725	GTT	2	6	30243	30248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518493
573	NC_021725	A	6	6	30322	30327	100 %	0 %	0 %	0 %	523518493
574	NC_021725	CAT	2	6	30449	30454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518494
575	NC_021725	GAATA	2	10	30527	30536	60 %	20 %	20 %	0 %	523518494
576	NC_021725	TGG	2	6	30655	30660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518494
577	NC_021725	TGT	2	6	30691	30696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518494
578	NC_021725	GAC	2	6	30710	30715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518494
579	NC_021725	TGT	2	6	30778	30783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518494
580	NC_021725	GGT	3	9	30800	30808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518494
581	NC_021725	ATG	2	6	30830	30835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518494
582	NC_021725	CAG	2	6	30839	30844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518494
583	NC_021725	CTG	3	9	30866	30874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518494
584	NC_021725	ACGA	2	8	30890	30897	50 %	0 %	25 %	25 %	523518494
585	NC_021725	GTT	2	6	30931	30936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518494
586	NC_021725	AG	3	6	30950	30955	50 %	0 %	50 %	0 %	523518494
587	NC_021725	CAG	2	6	31018	31023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518494
588	NC_021725	TCG	2	6	31024	31029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518494
589	NC_021725	TGC	2	6	31213	31218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518494
590	NC_021725	T	6	6	31270	31275	0 %	100 %	0 %	0 %	523518494
591	NC_021725	CCG	2	6	31419	31424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518494
592	NC_021725	TGAA	2	8	31495	31502	50 %	25 %	25 %	0 %	523518494
593	NC_021725	GCG	2	6	31578	31583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518494
594	NC_021725	CAC	2	6	31607	31612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523518494
595	NC_021725	GAT	2	6	31613	31618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518494
596	NC_021725	AGC	2	6	31650	31655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518494
597	NC_021725	GAT	2	6	31766	31771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518494
598	NC_021725	ACC	2	6	31772	31777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523518494
599	NC_021725	GCA	2	6	31794	31799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518494
600	NC_021725	CTT	2	6	31873	31878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518494
601	NC_021725	GGT	2	6	31895	31900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518494
602	NC_021725	GAA	3	9	31925	31933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518494
603	NC_021725	GGC	2	6	31955	31960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518494
604	NC_021725	ATC	2	6	32003	32008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518494
605	NC_021725	TGG	2	6	32040	32045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518494
606	NC_021725	GGCA	2	8	32126	32133	25 %	0 %	50 %	25 %	523518494
607	NC_021725	TGG	2	6	32155	32160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518494
608	NC_021725	CGC	2	6	32171	32176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518494
609	NC_021725	CAGG	2	8	32341	32348	25 %	0 %	50 %	25 %	523518494
610	NC_021725	GCT	2	6	32486	32491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518494
611	NC_021725	TCA	2	6	32559	32564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518494
612	NC_021725	GGC	2	6	32578	32583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518494
613	NC_021725	GATT	2	8	32602	32609	25 %	50 %	25 %	0 %	523518494
614	NC_021725	T	6	6	32617	32622	0 %	100 %	0 %	0 %	523518494
615	NC_021725	ACA	2	6	32640	32645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518494
616	NC_021725	TGAC	2	8	32704	32711	25 %	25 %	25 %	25 %	523518494
617	NC_021725	AGT	2	6	32744	32749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518494
618	NC_021725	ATA	2	6	32859	32864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523518494
619	NC_021725	ATG	2	6	32865	32870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518494
620	NC_021725	TCG	2	6	32985	32990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518495
621	NC_021725	TGC	2	6	32995	33000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518495
622	NC_021725	CAT	2	6	33010	33015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518495
623	NC_021725	CAA	2	6	33022	33027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518495
624	NC_021725	TGA	2	6	33064	33069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518495
625	NC_021725	TCA	2	6	33159	33164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518495
626	NC_021725	TTC	2	6	33183	33188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518495
627	NC_021725	TGC	2	6	33216	33221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518495
628	NC_021725	GTG	2	6	33288	33293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518495
629	NC_021725	AGCC	2	8	33319	33326	25 %	0 %	25 %	50 %	523518495
630	NC_021725	GTC	2	6	33345	33350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518495
631	NC_021725	AAAAC	2	10	33378	33387	80 %	0 %	0 %	20 %	523518495
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636	NC_021725	GTT	2	6	33709	33714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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654	NC_021725	GCC	2	6	34380	34385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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723	NC_021725	TAAAGG	2	12	37504	37515	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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739	NC_021725	AAT	2	6	38422	38427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523518502
740	NC_021725	T	6	6	38456	38461	0 %	100 %	0 %	0 %	523518502
741	NC_021725	CAA	2	6	38534	38539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
742	NC_021725	GAT	2	6	38542	38547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
743	NC_021725	GTAT	2	8	38552	38559	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
744	NC_021725	AG	3	6	38580	38585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
745	NC_021725	T	6	6	38632	38637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
746	NC_021725	A	6	6	38675	38680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
747	NC_021725	TTG	2	6	38790	38795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518503
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753	NC_021725	GGC	2	6	39280	39285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518503
754	NC_021725	TGA	2	6	39298	39303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518503
755	NC_021725	GATT	2	8	39343	39350	25 %	50 %	25 %	0 %	523518503
756	NC_021725	GAT	2	6	39362	39367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518503
757	NC_021725	ATC	2	6	39408	39413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518503
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760	NC_021725	AGA	2	6	39510	39515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518503
761	NC_021725	AGC	2	6	39617	39622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518503
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772	NC_021725	AGAA	2	8	40297	40304	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
773	NC_021725	TCT	2	6	40307	40312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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778	NC_021725	CG	3	6	40707	40712	0 %	0 %	50 %	50 %	523518504
779	NC_021725	ATC	2	6	40716	40721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518504
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785	NC_021725	TTG	2	6	41139	41144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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802	NC_021725	TAT	2	6	41858	41863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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811	NC_021725	TGA	2	6	42240	42245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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831	NC_021725	T	6	6	42950	42955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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838	NC_021725	CCTT	2	8	43274	43281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
839	NC_021725	TAGT	2	8	43296	43303	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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882	NC_021725	TA	3	6	46436	46441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
883	NC_021725	T	7	7	46452	46458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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886	NC_021725	AC	3	6	46476	46481	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
887	NC_021725	T	6	6	46518	46523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
888	NC_021725	AAT	2	6	46540	46545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
889	NC_021725	TAGAT	2	10	46568	46577	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
890	NC_021725	ATGA	2	8	46643	46650	50 %	25 %	25 %	0 %	523518507
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