MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK900

Total Repeats: 53710

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_021723	TTC	2	6	158972	158977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515746
3003	NC_021723	TGCG	2	8	158989	158996	0 %	25 %	50 %	25 %	523515746
3004	NC_021723	GTT	2	6	158997	159002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515746
3005	NC_021723	ATG	2	6	159071	159076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515746
3006	NC_021723	GCA	2	6	159084	159089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515746
3007	NC_021723	TAAA	2	8	159172	159179	75 %	25 %	0 %	0 %	523515747
3008	NC_021723	GAT	3	9	159246	159254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515747
3009	NC_021723	GAT	2	6	159263	159268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515747
3010	NC_021723	GCT	2	6	159269	159274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515747
3011	NC_021723	TGA	2	6	159332	159337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515747
3012	NC_021723	CGC	2	6	159383	159388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515747
3013	NC_021723	TGA	2	6	159389	159394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515747
3014	NC_021723	ATC	2	6	159421	159426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515747
3015	NC_021723	TTC	2	6	159673	159678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_021723	T	6	6	159724	159729	0 %	100 %	0 %	0 %	523515748
3017	NC_021723	ACA	2	6	159781	159786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515748
3018	NC_021723	T	6	6	159787	159792	0 %	100 %	0 %	0 %	523515748
3019	NC_021723	AT	3	6	159801	159806	50 %	50 %	0 %	0 %	523515748
3020	NC_021723	CGGT	2	8	159887	159894	0 %	25 %	50 %	25 %	523515748
3021	NC_021723	GTT	2	6	159909	159914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515748
3022	NC_021723	TTC	2	6	159961	159966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515748
3023	NC_021723	GGC	2	6	160117	160122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515748
3024	NC_021723	AAGG	2	8	160225	160232	50 %	0 %	50 %	0 %	523515748
3025	NC_021723	CGG	2	6	160275	160280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515748
3026	NC_021723	TCA	2	6	160343	160348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515748
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3028	NC_021723	GCT	2	6	160504	160509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515748
3029	NC_021723	GTT	2	6	160716	160721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515748
3030	NC_021723	GGTT	2	8	160743	160750	0 %	50 %	50 %	0 %	523515748
3031	NC_021723	CAC	2	6	160773	160778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515748
3032	NC_021723	TGG	2	6	160809	160814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515748
3033	NC_021723	TCAGT	2	10	160859	160868	20 %	40 %	20 %	20 %	523515748
3034	NC_021723	ATG	3	9	160936	160944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515748
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3036	NC_021723	CGC	2	6	161046	161051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515748
3037	NC_021723	TCT	2	6	161060	161065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515748
3038	NC_021723	ATCC	2	8	161104	161111	25 %	25 %	0 %	50 %	523515748
3039	NC_021723	AAG	2	6	161197	161202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_021723	TTAC	2	8	161218	161225	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3041	NC_021723	TAAG	2	8	161234	161241	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_021723	GCT	2	6	161246	161251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_021723	CTT	2	6	161256	161261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_021723	T	6	6	161260	161265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_021723	GTA	2	6	161279	161284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_021723	CAA	2	6	161373	161378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515749
3047	NC_021723	GCG	2	6	161473	161478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515749
3048	NC_021723	TTGC	2	8	161498	161505	0 %	50 %	25 %	25 %	523515749
3049	NC_021723	CAG	2	6	161518	161523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515749
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3051	NC_021723	GGA	2	6	161694	161699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_021723	ACG	2	6	161705	161710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_021723	A	7	7	161711	161717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_021723	GTT	2	6	161741	161746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_021723	T	6	6	161745	161750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_021723	GCA	2	6	161808	161813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515750
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3058	NC_021723	ACA	2	6	161857	161862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515750
3059	NC_021723	ACC	2	6	161883	161888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515750
3060	NC_021723	GAA	2	6	162031	162036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515750
3061	NC_021723	CAA	2	6	162103	162108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515751
3062	NC_021723	GAA	2	6	162166	162171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515751
3063	NC_021723	TGA	2	6	162192	162197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515751
3064	NC_021723	TCA	2	6	162213	162218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515751
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3066	NC_021723	TGCC	2	8	162289	162296	0 %	25 %	25 %	50 %	523515751
3067	NC_021723	ACA	2	6	162306	162311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515751
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3070	NC_021723	GCC	2	6	162424	162429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515751
3071	NC_021723	ATAG	2	8	162439	162446	50 %	25 %	25 %	0 %	523515751
3072	NC_021723	GAATA	2	10	162529	162538	60 %	20 %	20 %	0 %	523515751
3073	NC_021723	ATTG	2	8	162572	162579	25 %	50 %	25 %	0 %	523515751
3074	NC_021723	GAC	2	6	162583	162588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515751
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3076	NC_021723	TGGTT	2	10	162880	162889	0 %	60 %	40 %	0 %	523515752
3077	NC_021723	TGTT	2	8	162892	162899	0 %	75 %	25 %	0 %	523515752
3078	NC_021723	GC	3	6	162933	162938	0 %	0 %	50 %	50 %	523515752
3079	NC_021723	GGC	2	6	163039	163044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515752
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3081	NC_021723	GAC	2	6	163197	163202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515752
3082	NC_021723	ATCA	2	8	163204	163211	50 %	25 %	0 %	25 %	523515752
3083	NC_021723	TGTT	2	8	163214	163221	0 %	75 %	25 %	0 %	523515752
3084	NC_021723	AAT	2	6	163226	163231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515752
3085	NC_021723	GA	3	6	163235	163240	50 %	0 %	50 %	0 %	523515752
3086	NC_021723	GCT	2	6	163286	163291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515752
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3089	NC_021723	CAT	2	6	163357	163362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515752
3090	NC_021723	GAT	2	6	163474	163479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515752
3091	NC_021723	CAGC	2	8	163515	163522	25 %	0 %	25 %	50 %	523515752
3092	NC_021723	CAT	2	6	163563	163568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515752
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3094	NC_021723	TGAAC	2	10	163614	163623	40 %	20 %	20 %	20 %	523515752
3095	NC_021723	GGCCAC	2	12	163672	163683	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	523515752
3096	NC_021723	CTG	2	6	163748	163753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515752
3097	NC_021723	CAAG	2	8	163758	163765	50 %	0 %	25 %	25 %	523515752
3098	NC_021723	GAT	2	6	163800	163805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515752
3099	NC_021723	ATG	2	6	163814	163819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515752
3100	NC_021723	TCCT	2	8	163830	163837	0 %	50 %	0 %	50 %	523515753
3101	NC_021723	TGA	2	6	163845	163850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515753
3102	NC_021723	CAG	2	6	164031	164036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515753
3103	NC_021723	ATA	2	6	164051	164056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515753
3104	NC_021723	ATACG	2	10	164076	164085	40 %	20 %	20 %	20 %	523515753
3105	NC_021723	GGC	2	6	164119	164124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515753
3106	NC_021723	GGT	2	6	164183	164188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515753
3107	NC_021723	TAAG	2	8	164247	164254	50 %	25 %	25 %	0 %	523515753
3108	NC_021723	GAA	2	6	164283	164288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515753
3109	NC_021723	GTG	2	6	164349	164354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515753
3110	NC_021723	CAACTG	2	12	164376	164387	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	523515753
3111	NC_021723	AAT	2	6	164409	164414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515753
3112	NC_021723	GCCA	2	8	164465	164472	25 %	0 %	25 %	50 %	523515753
3113	NC_021723	CCA	2	6	164530	164535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515753
3114	NC_021723	CTG	2	6	164550	164555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515753
3115	NC_021723	ATG	2	6	164603	164608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515753
3116	NC_021723	TCC	2	6	164612	164617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3117	NC_021723	AAG	2	6	164774	164779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515754
3118	NC_021723	TGT	2	6	164790	164795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515754
3119	NC_021723	CTT	2	6	164843	164848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515754
3120	NC_021723	TCA	2	6	164894	164899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515754
3121	NC_021723	TGA	2	6	164940	164945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515754
3122	NC_021723	TCA	2	6	164963	164968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515754
3123	NC_021723	CCA	2	6	165066	165071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515754
3124	NC_021723	GTTG	2	8	165110	165117	0 %	50 %	50 %	0 %	523515754
3125	NC_021723	AAT	2	6	165178	165183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515754
3126	NC_021723	GAC	2	6	165441	165446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515754
3127	NC_021723	GTTG	2	8	165509	165516	0 %	50 %	50 %	0 %	523515754
3128	NC_021723	TTTG	2	8	165575	165582	0 %	75 %	25 %	0 %	523515754
3129	NC_021723	TTG	2	6	165634	165639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515754
3130	NC_021723	ATG	2	6	165674	165679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515754
3131	NC_021723	CAT	2	6	165768	165773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515754
3132	NC_021723	T	6	6	165786	165791	0 %	100 %	0 %	0 %	523515754
3133	NC_021723	TGG	2	6	165819	165824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515754
3134	NC_021723	ACC	2	6	165865	165870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515754
3135	NC_021723	CCG	3	9	165908	165916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515754
3136	NC_021723	GTC	2	6	165973	165978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515754
3137	NC_021723	ATC	2	6	166066	166071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515754
3138	NC_021723	ATATT	2	10	166172	166181	40 %	60 %	0 %	0 %	523515754
3139	NC_021723	CAC	2	6	166350	166355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515754
3140	NC_021723	AAT	2	6	166375	166380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515754
3141	NC_021723	TCC	2	6	166401	166406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523515755
3142	NC_021723	AGC	2	6	166475	166480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515755
3143	NC_021723	GC	3	6	166546	166551	0 %	0 %	50 %	50 %	523515755
3144	NC_021723	CAA	2	6	166690	166695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515755
3145	NC_021723	CCG	2	6	166716	166721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515755
3146	NC_021723	GTGAA	2	10	166771	166780	40 %	20 %	40 %	0 %	523515755
3147	NC_021723	AAC	2	6	166791	166796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515755
3148	NC_021723	GTG	2	6	166830	166835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515755
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3151	NC_021723	TCC	2	6	166895	166900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523515755
3152	NC_021723	AAT	2	6	166926	166931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515755
3153	NC_021723	T	6	6	167042	167047	0 %	100 %	0 %	0 %	523515755
3154	NC_021723	TAG	2	6	167087	167092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515755
3155	NC_021723	AT	3	6	167127	167132	50 %	50 %	0 %	0 %	523515755
3156	NC_021723	GAA	2	6	167222	167227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515755
3157	NC_021723	GCCA	2	8	167294	167301	25 %	0 %	25 %	50 %	523515755
3158	NC_021723	TGAT	2	8	167384	167391	25 %	50 %	25 %	0 %	523515755
3159	NC_021723	AGC	2	6	167432	167437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515755
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3161	NC_021723	TAG	2	6	167486	167491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515755
3162	NC_021723	CGC	2	6	167536	167541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515755
3163	NC_021723	TA	3	6	167570	167575	50 %	50 %	0 %	0 %	523515755
3164	NC_021723	TGA	2	6	167618	167623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515755
3165	NC_021723	CA	3	6	167643	167648	50 %	0 %	0 %	50 %	523515755
3166	NC_021723	C	6	6	167735	167740	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3167	NC_021723	TAT	2	6	167764	167769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3168	NC_021723	GAT	2	6	167840	167845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3171	NC_021723	AAT	2	6	168068	168073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515756
3172	NC_021723	ATA	2	6	168078	168083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515756
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3181	NC_021723	T	6	6	168488	168493	0 %	100 %	0 %	0 %	523515756
3182	NC_021723	TTCA	2	8	168536	168543	25 %	50 %	0 %	25 %	523515756
3183	NC_021723	CGC	2	6	168605	168610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515756
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3187	NC_021723	CAA	2	6	168887	168892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3188	NC_021723	A	6	6	168891	168896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3189	NC_021723	GAA	2	6	169080	169085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515757
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3197	NC_021723	TGCCAA	2	12	169713	169724	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	523515757
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3202	NC_021723	AAG	2	6	169818	169823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515758
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3205	NC_021723	CTT	2	6	169907	169912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515758
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3211	NC_021723	CTT	2	6	170366	170371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3212	NC_021723	GGA	2	6	170390	170395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3213	NC_021723	GTG	2	6	170408	170413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3214	NC_021723	CTT	2	6	170526	170531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515759
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3221	NC_021723	GTTCA	2	10	170803	170812	20 %	40 %	20 %	20 %	523515759
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3224	NC_021723	CAT	2	6	171072	171077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515759
3225	NC_021723	ATC	2	6	171091	171096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515759
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3228	NC_021723	AAAG	2	8	171202	171209	75 %	0 %	25 %	0 %	523515759
3229	NC_021723	GAT	2	6	171252	171257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515759
3230	NC_021723	TTGA	2	8	171274	171281	25 %	50 %	25 %	0 %	523515759
3231	NC_021723	T	7	7	171285	171291	0 %	100 %	0 %	0 %	523515759
3232	NC_021723	GTG	2	6	171336	171341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515759
3233	NC_021723	GAT	2	6	171363	171368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515759
3234	NC_021723	AGTA	2	8	171420	171427	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3235	NC_021723	TTTG	2	8	171706	171713	0 %	75 %	25 %	0 %	523515760
3236	NC_021723	TTG	2	6	171750	171755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515760
3237	NC_021723	CG	3	6	171780	171785	0 %	0 %	50 %	50 %	523515760
3238	NC_021723	ATG	2	6	171845	171850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515760
3239	NC_021723	TTTG	2	8	172010	172017	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3240	NC_021723	CGG	2	6	172087	172092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515761
3241	NC_021723	TGC	2	6	172120	172125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515761
3242	NC_021723	ATG	2	6	172145	172150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515761
3243	NC_021723	TGG	2	6	172177	172182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515761
3244	NC_021723	A	6	6	172250	172255	100 %	0 %	0 %	0 %	523515761
3245	NC_021723	TCACT	2	10	172279	172288	20 %	40 %	0 %	40 %	523515761
3246	NC_021723	TGGC	2	8	172308	172315	0 %	25 %	50 %	25 %	523515761
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3260	NC_021723	T	7	7	172993	172999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3372	NC_021723	GCA	3	9	179587	179595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515768
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3391	NC_021723	TCC	2	6	180804	180809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3392	NC_021723	TAAGC	2	10	180810	180819	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3393	NC_021723	TG	3	6	180841	180846	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3394	NC_021723	CA	3	6	180896	180901	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3395	NC_021723	GTT	2	6	180956	180961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3397	NC_021723	AAT	2	6	181009	181014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3452	NC_021723	ACCA	2	8	184394	184401	50 %	0 %	0 %	50 %	523515772
3453	NC_021723	TCA	2	6	184456	184461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515772
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3463	NC_021723	GTC	2	6	184884	184889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3464	NC_021723	TAC	2	6	184919	184924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3466	NC_021723	GAC	2	6	184992	184997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515773
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3470	NC_021723	AAG	2	6	185146	185151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515773
3471	NC_021723	AGA	2	6	185160	185165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515773
3472	NC_021723	TGA	2	6	185234	185239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515773
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3483	NC_021723	GAAT	2	8	186125	186132	50 %	25 %	25 %	0 %	523515773
3484	NC_021723	TGG	2	6	186150	186155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515773
3485	NC_021723	CATG	2	8	186156	186163	25 %	25 %	25 %	25 %	523515773
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3487	NC_021723	TCA	3	9	186284	186292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515773
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3491	NC_021723	GC	3	6	186681	186686	0 %	0 %	50 %	50 %	523515774
3492	NC_021723	CAT	2	6	186740	186745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515774
3493	NC_021723	AAG	2	6	186955	186960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515774
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