MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK900

Total Repeats: 53710

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_021723	GAT	2	6	52368	52373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515646
1003	NC_021723	GTT	2	6	52386	52391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515646
1004	NC_021723	ATC	2	6	52521	52526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515646
1005	NC_021723	CAT	2	6	52547	52552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515646
1006	NC_021723	GAT	2	6	52569	52574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515646
1007	NC_021723	GAA	2	6	52682	52687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515646
1008	NC_021723	GTT	2	6	52701	52706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515646
1009	NC_021723	ATA	2	6	52720	52725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515646
1010	NC_021723	TGC	2	6	52772	52777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515646
1011	NC_021723	TCT	2	6	52780	52785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515646
1012	NC_021723	TTC	2	6	52993	52998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515646
1013	NC_021723	T	6	6	53009	53014	0 %	100 %	0 %	0 %	523515646
1014	NC_021723	TTG	2	6	53064	53069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515646
1015	NC_021723	GCG	2	6	53323	53328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515647
1016	NC_021723	AAT	2	6	53386	53391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515647
1017	NC_021723	ATC	2	6	53424	53429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515647
1018	NC_021723	GCT	2	6	53483	53488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515647
1019	NC_021723	AGT	2	6	53513	53518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515647
1020	NC_021723	CTT	2	6	53637	53642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515647
1021	NC_021723	TCT	2	6	53680	53685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515647
1022	NC_021723	CAG	2	6	53735	53740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515647
1023	NC_021723	CAAG	2	8	53799	53806	50 %	0 %	25 %	25 %	523515647
1024	NC_021723	GAC	2	6	53882	53887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515647
1025	NC_021723	TTC	2	6	53925	53930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515647
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1027	NC_021723	TGG	2	6	53978	53983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515647
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1029	NC_021723	AGCCC	2	10	54129	54138	20 %	0 %	20 %	60 %	523515647
1030	NC_021723	TTGGC	2	10	54212	54221	0 %	40 %	40 %	20 %	523515647
1031	NC_021723	GC	3	6	54249	54254	0 %	0 %	50 %	50 %	523515647
1032	NC_021723	GTC	2	6	54271	54276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515647
1033	NC_021723	CAT	2	6	54278	54283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515647
1034	NC_021723	TCAG	2	8	54337	54344	25 %	25 %	25 %	25 %	523515647
1035	NC_021723	TTG	2	6	54439	54444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515647
1036	NC_021723	GGCA	2	8	54549	54556	25 %	0 %	50 %	25 %	523515647
1037	NC_021723	CAT	2	6	54563	54568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515647
1038	NC_021723	CAA	2	6	54578	54583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515647
1039	NC_021723	ATT	2	6	54606	54611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515647
1040	NC_021723	AGC	2	6	54641	54646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515647
1041	NC_021723	GCC	3	9	54657	54665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515647
1042	NC_021723	CAG	2	6	54755	54760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515647
1043	NC_021723	TCG	2	6	54775	54780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515647
1044	NC_021723	ATG	2	6	54796	54801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_021723	CCT	2	6	54804	54809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_021723	TA	3	6	54810	54815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_021723	AT	3	6	54819	54824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_021723	A	6	6	54901	54906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_021723	AAAAAG	2	12	54933	54944	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_021723	CAA	2	6	54951	54956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_021723	GTT	2	6	54968	54973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_021723	GTC	2	6	55033	55038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515648
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1057	NC_021723	TGG	2	6	55308	55313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515648
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1059	NC_021723	GCA	2	6	55359	55364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515648
1060	NC_021723	GTA	2	6	55366	55371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515648
1061	NC_021723	TG	3	6	55399	55404	0 %	50 %	50 %	0 %	523515648
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1063	NC_021723	ATA	2	6	55538	55543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515648
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1066	NC_021723	GCG	2	6	55579	55584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515648
1067	NC_021723	TCA	2	6	55691	55696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515648
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1069	NC_021723	TTC	2	6	55927	55932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515648
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1082	NC_021723	CAG	2	6	56427	56432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515648
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1084	NC_021723	CAA	2	6	56612	56617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_021723	GGC	2	6	56637	56642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515649
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1088	NC_021723	CAG	2	6	56789	56794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515649
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1090	NC_021723	GCA	2	6	56807	56812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515649
1091	NC_021723	AGC	2	6	56862	56867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515649
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1094	NC_021723	AGC	2	6	56922	56927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515649
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1097	NC_021723	GAA	2	6	57009	57014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515649
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1099	NC_021723	CAA	2	6	57134	57139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515649
1100	NC_021723	CG	3	6	57176	57181	0 %	0 %	50 %	50 %	523515649
1101	NC_021723	CAT	2	6	57182	57187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515649
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1106	NC_021723	CCGAT	2	10	57438	57447	20 %	20 %	20 %	40 %	523515649
1107	NC_021723	GCC	3	9	57484	57492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515649
1108	NC_021723	AGATGA	2	12	57503	57514	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	523515649
1109	NC_021723	TG	3	6	57704	57709	0 %	50 %	50 %	0 %	523515649
1110	NC_021723	GCT	2	6	57827	57832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515649
1111	NC_021723	AAC	2	6	57858	57863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515649
1112	NC_021723	CGT	2	6	57870	57875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515649
1113	NC_021723	CAT	2	6	57902	57907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515649
1114	NC_021723	T	7	7	57914	57920	0 %	100 %	0 %	0 %	523515649
1115	NC_021723	TAAG	2	8	57935	57942	50 %	25 %	25 %	0 %	523515649
1116	NC_021723	A	6	6	57949	57954	100 %	0 %	0 %	0 %	523515649
1117	NC_021723	ATAG	2	8	57958	57965	50 %	25 %	25 %	0 %	523515649
1118	NC_021723	CCT	2	6	58008	58013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_021723	CAGT	2	8	58093	58100	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1120	NC_021723	T	6	6	58117	58122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_021723	CG	3	6	58131	58136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_021723	AT	3	6	58161	58166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_021723	GAAG	2	8	58309	58316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_021723	GAT	2	6	58374	58379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515650
1125	NC_021723	GC	3	6	58430	58435	0 %	0 %	50 %	50 %	523515650
1126	NC_021723	CGG	2	6	58483	58488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515650
1127	NC_021723	AATC	2	8	58536	58543	50 %	25 %	0 %	25 %	523515650
1128	NC_021723	T	7	7	58698	58704	0 %	100 %	0 %	0 %	523515650
1129	NC_021723	TTG	2	6	58868	58873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515650
1130	NC_021723	GAC	2	6	58939	58944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515650
1131	NC_021723	AGC	2	6	58992	58997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515650
1132	NC_021723	TGT	2	6	59028	59033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_021723	AAGG	2	8	59072	59079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_021723	GAT	2	6	59113	59118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515651
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1141	NC_021723	ATTT	2	8	59348	59355	25 %	75 %	0 %	0 %	523515651
1142	NC_021723	TGA	2	6	59434	59439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515651
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1149	NC_021723	GGCGT	2	10	59915	59924	0 %	20 %	60 %	20 %	523515651
1150	NC_021723	CCAAG	2	10	59980	59989	40 %	0 %	20 %	40 %	523515651
1151	NC_021723	GT	3	6	60012	60017	0 %	50 %	50 %	0 %	523515651
1152	NC_021723	CAGT	2	8	60160	60167	25 %	25 %	25 %	25 %	523515652
1153	NC_021723	CAA	2	6	60223	60228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515652
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1162	NC_021723	GAT	2	6	60539	60544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515652
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1164	NC_021723	ACA	2	6	60873	60878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515652
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1168	NC_021723	AAGTG	2	10	61291	61300	40 %	20 %	40 %	0 %	523515652
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1188	NC_021723	TGG	2	6	62769	62774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1189	NC_021723	TAT	2	6	62871	62876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1190	NC_021723	TTG	2	6	62894	62899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1214	NC_021723	CAT	2	6	64082	64087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1239	NC_021723	TGA	2	6	65571	65576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1240	NC_021723	GTT	2	6	65625	65630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1241	NC_021723	TAAG	2	8	65682	65689	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1242	NC_021723	CTGT	2	8	65717	65724	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1243	NC_021723	TTC	2	6	65728	65733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1245	NC_021723	GAC	2	6	65810	65815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1246	NC_021723	T	6	6	65842	65847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1247	NC_021723	GAA	2	6	65881	65886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1248	NC_021723	GAA	2	6	65969	65974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515656
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1252	NC_021723	ACA	2	6	66260	66265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515656
1253	NC_021723	A	6	6	66375	66380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1254	NC_021723	TCA	2	6	66392	66397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1255	NC_021723	GGT	2	6	66406	66411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1256	NC_021723	TGC	2	6	66417	66422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1257	NC_021723	TTTG	2	8	66443	66450	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1258	NC_021723	CG	3	6	66484	66489	0 %	0 %	50 %	50 %	523515657
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1264	NC_021723	ATC	2	6	66725	66730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515657
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1368	NC_021723	TAA	2	6	71705	71710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515660
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1374	NC_021723	TAA	2	6	72021	72026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515660
1375	NC_021723	ATC	2	6	72125	72130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515660
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1496	NC_021723	TTGA	2	8	78334	78341	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1497	NC_021723	AAT	2	6	78366	78371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1498	NC_021723	GGGA	2	8	78398	78405	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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