MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 1997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021721	CAAAC	2	10	650	659	60 %	0 %	0 %	40 %	523512491
2	NC_021721	TATAT	2	10	1557	1566	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021721	CAACG	2	10	1763	1772	40 %	0 %	20 %	40 %	523512492
4	NC_021721	ATGAA	2	10	2803	2812	60 %	20 %	20 %	0 %	523512493
5	NC_021721	GAAGA	2	10	4911	4920	60 %	0 %	40 %	0 %	523512497
6	NC_021721	GGCAC	2	10	5397	5406	20 %	0 %	40 %	40 %	523512497
7	NC_021721	GACAA	2	10	5671	5680	60 %	0 %	20 %	20 %	523512497
8	NC_021721	GAAAA	2	10	7756	7765	80 %	0 %	20 %	0 %	523512498
9	NC_021721	CATTT	2	10	9996	10005	20 %	60 %	0 %	20 %	523512499
10	NC_021721	ATTGA	2	10	17559	17568	40 %	40 %	20 %	0 %	523512510
11	NC_021721	CAACC	2	10	18892	18901	40 %	0 %	0 %	60 %	523512512
12	NC_021721	GTGAT	2	10	19656	19665	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021721	TGGCT	2	10	20480	20489	0 %	40 %	40 %	20 %	523512515
14	NC_021721	GCTTT	2	10	22032	22041	0 %	60 %	20 %	20 %	523512516
15	NC_021721	CAGCG	2	10	22679	22688	20 %	0 %	40 %	40 %	523512516
16	NC_021721	GTTTT	2	10	24651	24660	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021721	TCCTG	2	10	25604	25613	0 %	40 %	20 %	40 %	523512519
18	NC_021721	TTGTT	2	10	26393	26402	0 %	80 %	20 %	0 %	523512520
19	NC_021721	AAGCC	2	10	30979	30988	40 %	0 %	20 %	40 %	523512523
20	NC_021721	CAAAG	2	10	31823	31832	60 %	0 %	20 %	20 %	523512524
21	NC_021721	CGGCA	2	10	33370	33379	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_021721	AGCGA	2	10	40085	40094	40 %	0 %	40 %	20 %	523512532
23	NC_021721	TTTCT	2	10	40332	40341	0 %	80 %	0 %	20 %	523512533
24	NC_021721	TTCGG	2	10	43359	43368	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_021721	GTTTG	2	10	45977	45986	0 %	60 %	40 %	0 %	523512539
26	NC_021721	TGGAT	2	10	46042	46051	20 %	40 %	40 %	0 %	523512539
27	NC_021721	ATAAA	2	10	46723	46732	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021721	GAAAA	2	10	48335	48344	80 %	0 %	20 %	0 %	523512543
29	NC_021721	TTGAA	2	10	48760	48769	40 %	40 %	20 %	0 %	523512543
30	NC_021721	ATAAA	2	10	48906	48915	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021721	AATAA	2	10	49152	49161	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021721	TCAAT	2	10	49771	49780	40 %	40 %	0 %	20 %	523512544
33	NC_021721	AACGC	2	10	50087	50096	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_021721	ATGAA	2	10	50521	50530	60 %	20 %	20 %	0 %	523512545
35	NC_021721	TTGCT	2	10	51632	51641	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_021721	ACAAA	2	10	52049	52058	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_021721	TTTCT	2	10	52683	52692	0 %	80 %	0 %	20 %	523512548
38	NC_021721	TCGTT	2	10	53080	53089	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_021721	TTCTT	2	10	53631	53640	0 %	80 %	0 %	20 %	523512549
40	NC_021721	TGTTT	2	10	56793	56802	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021721	TGATC	2	10	60784	60793	20 %	40 %	20 %	20 %	523512555
42	NC_021721	CAGTT	2	10	63283	63292	20 %	40 %	20 %	20 %	523512556
43	NC_021721	TTGAT	2	10	70307	70316	20 %	60 %	20 %	0 %	523512564
44	NC_021721	TTGCT	2	10	70400	70409	0 %	60 %	20 %	20 %	523512564
45	NC_021721	CGTTT	2	10	72300	72309	0 %	60 %	20 %	20 %	523512566
46	NC_021721	TAAGT	2	10	76158	76167	40 %	40 %	20 %	0 %	523512571
47	NC_021721	TCATC	2	10	77707	77716	20 %	40 %	0 %	40 %	523512573
48	NC_021721	TGGCA	2	10	81364	81373	20 %	20 %	40 %	20 %	523512575
49	NC_021721	GTTTC	2	10	84145	84154	0 %	60 %	20 %	20 %	523512578
50	NC_021721	TGTGC	2	10	85271	85280	0 %	40 %	40 %	20 %	523512579
51	NC_021721	AAATA	2	10	85725	85734	80 %	20 %	0 %	0 %	523512580
52	NC_021721	TGCTT	2	10	86342	86351	0 %	60 %	20 %	20 %	523512580
53	NC_021721	ATCCA	2	10	86805	86814	40 %	20 %	0 %	40 %	523512581
54	NC_021721	AACCA	2	10	87180	87189	60 %	0 %	0 %	40 %	523512581
55	NC_021721	TCTTT	2	10	87384	87393	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_021721	GTTAA	2	10	87777	87786	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021721	TACTC	2	10	89475	89484	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_021721	TCAAA	2	10	89966	89975	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_021721	GGAAC	2	10	90830	90839	40 %	0 %	40 %	20 %	523512586
60	NC_021721	GGTTG	2	10	91015	91024	0 %	40 %	60 %	0 %	523512586
61	NC_021721	AGCAT	2	10	91377	91386	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_021721	TAGCA	2	10	91737	91746	40 %	20 %	20 %	20 %	523512587
63	NC_021721	CCAAC	2	10	91830	91839	40 %	0 %	0 %	60 %	523512588
64	NC_021721	TCCCA	2	10	92877	92886	20 %	20 %	0 %	60 %	523512589
65	NC_021721	CCCAG	2	10	93510	93519	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
66	NC_021721	GCTTT	2	10	96518	96527	0 %	60 %	20 %	20 %	523512592
67	NC_021721	ATTGA	2	10	99772	99781	40 %	40 %	20 %	0 %	523512594
68	NC_021721	CAAAA	2	10	102446	102455	80 %	0 %	0 %	20 %	523512599
69	NC_021721	ATTTC	2	10	102972	102981	20 %	60 %	0 %	20 %	523512599
70	NC_021721	ATGGC	2	10	106952	106961	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_021721	GAAGA	2	10	109298	109307	60 %	0 %	40 %	0 %	523512604
72	NC_021721	GAAAA	2	10	109316	109325	80 %	0 %	20 %	0 %	523512604
73	NC_021721	CAAAG	2	10	109382	109391	60 %	0 %	20 %	20 %	523512604
74	NC_021721	TGACA	2	10	116439	116448	40 %	20 %	20 %	20 %	523512609
75	NC_021721	GACTG	2	10	116997	117006	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_021721	GTTTT	2	10	118022	118031	0 %	80 %	20 %	0 %	523512611
77	NC_021721	AGACC	2	10	121222	121231	40 %	0 %	20 %	40 %	523512612
78	NC_021721	GCTTC	2	10	121322	121331	0 %	40 %	20 %	40 %	523512612
79	NC_021721	CGGCC	2	10	123852	123861	0 %	0 %	40 %	60 %	523512614
80	NC_021721	CGTCA	2	10	124164	124173	20 %	20 %	20 %	40 %	523512614
81	NC_021721	CTCAA	2	10	124435	124444	40 %	20 %	0 %	40 %	523512614
82	NC_021721	ACCAA	2	10	124706	124715	60 %	0 %	0 %	40 %	523512614
83	NC_021721	CAAGT	2	10	125666	125675	40 %	20 %	20 %	20 %	523512615
84	NC_021721	GACCC	2	10	127114	127123	20 %	0 %	20 %	60 %	523512616
85	NC_021721	TTGGC	2	10	129218	129227	0 %	40 %	40 %	20 %	523512617
86	NC_021721	TGTGT	2	10	130755	130764	0 %	60 %	40 %	0 %	523512619
87	NC_021721	ATACT	2	10	137568	137577	40 %	40 %	0 %	20 %	523512626
88	NC_021721	TCAAA	2	10	138183	138192	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_021721	ATTGC	2	10	140681	140690	20 %	40 %	20 %	20 %	523512629
90	NC_021721	TGATC	2	10	141511	141520	20 %	40 %	20 %	20 %	523512630
91	NC_021721	CATGC	2	10	142641	142650	20 %	20 %	20 %	40 %	523512631
92	NC_021721	CGATC	2	10	147823	147832	20 %	20 %	20 %	40 %	523512637
93	NC_021721	ATTTG	2	10	150603	150612	20 %	60 %	20 %	0 %	523512640
94	NC_021721	AAAGC	2	10	153887	153896	60 %	0 %	20 %	20 %	523512645
95	NC_021721	GGGAT	2	10	155049	155058	20 %	20 %	60 %	0 %	523512646
96	NC_021721	GCTCA	2	10	155384	155393	20 %	20 %	20 %	40 %	523512646
97	NC_021721	AGTCG	2	10	160237	160246	20 %	20 %	40 %	20 %	523512652
98	NC_021721	ATATT	2	10	160906	160915	40 %	60 %	0 %	0 %	523512652
99	NC_021721	TGAAC	2	10	160922	160931	40 %	20 %	20 %	20 %	523512652
100	NC_021721	ATTAC	2	10	163174	163183	40 %	40 %	0 %	20 %	523512654
101	NC_021721	TCTTT	2	10	164136	164145	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_021721	TTTTC	2	10	166564	166573	0 %	80 %	0 %	20 %	523512658
103	NC_021721	CAAGC	2	10	167954	167963	40 %	0 %	20 %	40 %	523512659
104	NC_021721	AATGA	2	10	169254	169263	60 %	20 %	20 %	0 %	523512660
105	NC_021721	CCAAC	2	10	169822	169831	40 %	0 %	0 %	60 %	523512661
106	NC_021721	GCCTT	2	10	171714	171723	0 %	40 %	20 %	40 %	523512663
107	NC_021721	GAGGC	2	10	174538	174547	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
108	NC_021721	GTAAG	2	10	175850	175859	40 %	20 %	40 %	0 %	523512667
109	NC_021721	CACAA	2	10	177284	177293	60 %	0 %	0 %	40 %	523512668
110	NC_021721	GACCA	2	10	179399	179408	40 %	0 %	20 %	40 %	523512670
111	NC_021721	TGGTC	2	10	179853	179862	0 %	40 %	40 %	20 %	523512671
112	NC_021721	AAAAG	2	10	181337	181346	80 %	0 %	20 %	0 %	523512672
113	NC_021721	TGAAT	2	10	184248	184257	40 %	40 %	20 %	0 %	523512674
114	NC_021721	ATCAA	2	10	185701	185710	60 %	20 %	0 %	20 %	523512676
115	NC_021721	CCGTC	2	10	186470	186479	0 %	20 %	20 %	60 %	523512677
116	NC_021721	AGTTG	2	10	187483	187492	20 %	40 %	40 %	0 %	523512677
117	NC_021721	CCGTT	2	10	189749	189758	0 %	40 %	20 %	40 %	523512680
118	NC_021721	CCAAC	2	10	192158	192167	40 %	0 %	0 %	60 %	523512682
119	NC_021721	GAACC	2	10	193409	193418	40 %	0 %	20 %	40 %	523512682
120	NC_021721	TGGCG	2	10	193971	193980	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
121	NC_021721	TGAAG	2	10	194807	194816	40 %	20 %	40 %	0 %	523512683
122	NC_021721	CAGCC	2	10	195719	195728	20 %	0 %	20 %	60 %	523512683
123	NC_021721	GTTCA	2	10	195799	195808	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_021721	CAATG	2	10	196086	196095	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_021721	GCGGT	2	10	196852	196861	0 %	20 %	60 %	20 %	523512686
126	NC_021721	TGAAA	2	10	198481	198490	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021721	TCCTT	2	10	199591	199600	0 %	60 %	0 %	40 %	523512688
128	NC_021721	GTTGA	2	10	204353	204362	20 %	40 %	40 %	0 %	523512691
129	NC_021721	TCGAT	2	10	205880	205889	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_021721	CGTTG	2	10	206578	206587	0 %	40 %	40 %	20 %	523512693
131	NC_021721	AGATG	2	10	207554	207563	40 %	20 %	40 %	0 %	523512694
132	NC_021721	AAGGT	2	10	209766	209775	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021721	TTCAT	2	10	210041	210050	20 %	60 %	0 %	20 %	523512698
134	NC_021721	TGAGG	2	10	210242	210251	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021721	AAATG	2	10	211206	211215	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021721	GGCAT	2	10	212945	212954	20 %	20 %	40 %	20 %	523512703
137	NC_021721	TCGTT	2	10	213362	213371	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_021721	CGGCA	2	10	213549	213558	20 %	0 %	40 %	40 %	523512704
139	NC_021721	GCCAA	2	10	218535	218544	40 %	0 %	20 %	40 %	523512712
140	NC_021721	CTGGG	2	10	221302	221311	0 %	20 %	60 %	20 %	523512716
141	NC_021721	ACTTC	2	10	223464	223473	20 %	40 %	0 %	40 %	523512718
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145	NC_021721	CGTCA	2	10	229679	229688	20 %	20 %	20 %	40 %	523512725
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147	NC_021721	AAATC	2	10	236684	236693	60 %	20 %	0 %	20 %	523512731
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151	NC_021721	AAATG	2	10	244907	244916	60 %	20 %	20 %	0 %	523512737
152	NC_021721	CAAAA	2	10	245427	245436	80 %	0 %	0 %	20 %	523512737
153	NC_021721	ACTGG	2	10	245619	245628	20 %	20 %	40 %	20 %	523512738
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155	NC_021721	GAGTC	2	10	248589	248598	20 %	20 %	40 %	20 %	523512741
156	NC_021721	ACTCA	2	10	249562	249571	40 %	20 %	0 %	40 %	523512742
157	NC_021721	ATTTG	2	10	250208	250217	20 %	60 %	20 %	0 %	523512744
158	NC_021721	TTTGA	2	10	254101	254110	20 %	60 %	20 %	0 %	523512746
159	NC_021721	GTTGT	2	10	256427	256436	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
160	NC_021721	AGTTG	2	10	256867	256876	20 %	40 %	40 %	0 %	523512750
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162	NC_021721	TGTCA	2	10	257890	257899	20 %	40 %	20 %	20 %	523512751
163	NC_021721	TGATC	2	10	261694	261703	20 %	40 %	20 %	20 %	523512754
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165	NC_021721	AACTT	2	10	263713	263722	40 %	40 %	0 %	20 %	523512756
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168	NC_021721	CAAGC	2	10	267545	267554	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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171	NC_021721	AGATC	2	10	270750	270759	40 %	20 %	20 %	20 %	523512764
172	NC_021721	GCACT	2	10	270983	270992	20 %	20 %	20 %	40 %	523512764
173	NC_021721	GTCTG	2	10	273244	273253	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
174	NC_021721	TCGTG	2	10	273578	273587	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
175	NC_021721	TCGCA	2	10	274238	274247	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
176	NC_021721	GAGAT	2	10	277064	277073	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
177	NC_021721	ATTCG	2	10	278505	278514	20 %	40 %	20 %	20 %	523512767
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187	NC_021721	AGATA	2	10	287844	287853	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
188	NC_021721	ATTGG	2	10	288721	288730	20 %	40 %	40 %	0 %	523512778
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196	NC_021721	TGTTT	2	10	301068	301077	0 %	80 %	20 %	0 %	523512789
197	NC_021721	TTGAA	2	10	302414	302423	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
198	NC_021721	TGCCG	2	10	303681	303690	0 %	20 %	40 %	40 %	523512791
199	NC_021721	TCTGA	2	10	304605	304614	20 %	40 %	20 %	20 %	523512792
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206	NC_021721	TTTTG	2	10	314786	314795	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
207	NC_021721	TCCAG	2	10	315168	315177	20 %	20 %	20 %	40 %	523512802
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209	NC_021721	GTTTA	2	10	318259	318268	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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245	NC_021721	AGCAT	2	10	372452	372461	40 %	20 %	20 %	20 %	523512857
246	NC_021721	CTTAC	2	10	372811	372820	20 %	40 %	0 %	40 %	523512858
247	NC_021721	TATAA	2	10	373939	373948	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
248	NC_021721	CTATG	2	10	380225	380234	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
249	NC_021721	ATCAA	2	10	380823	380832	60 %	20 %	0 %	20 %	523512864
250	NC_021721	CCTGG	2	10	381023	381032	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
251	NC_021721	AAGAA	2	10	384056	384065	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
252	NC_021721	CCTTG	2	10	385490	385499	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
253	NC_021721	TTGCT	2	10	389928	389937	0 %	60 %	20 %	20 %	523512873
254	NC_021721	CAAGA	2	10	389966	389975	60 %	0 %	20 %	20 %	523512873
255	NC_021721	CGTCC	2	10	390402	390411	0 %	20 %	20 %	60 %	523512874
256	NC_021721	TCAGA	2	10	394226	394235	40 %	20 %	20 %	20 %	523512878
257	NC_021721	GAAGG	2	10	394915	394924	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
258	NC_021721	ATCCA	2	10	397144	397153	40 %	20 %	0 %	40 %	523512882
259	NC_021721	AAGAT	2	10	401268	401277	60 %	20 %	20 %	0 %	523512886
260	NC_021721	AACCA	2	10	402073	402082	60 %	0 %	0 %	40 %	523512887
261	NC_021721	GATGT	2	10	402536	402545	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
262	NC_021721	TGGGA	2	10	407172	407181	20 %	20 %	60 %	0 %	523512892
263	NC_021721	TGGCT	2	10	412160	412169	0 %	40 %	40 %	20 %	523512896
264	NC_021721	TGAAC	2	10	413941	413950	40 %	20 %	20 %	20 %	523512899
265	NC_021721	GTTTG	2	10	416547	416556	0 %	60 %	40 %	0 %	523512901
266	NC_021721	ATAAA	2	10	416987	416996	80 %	20 %	0 %	0 %	523512902
267	NC_021721	AGATG	2	10	425510	425519	40 %	20 %	40 %	0 %	523512908
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269	NC_021721	AACTC	2	10	426554	426563	40 %	20 %	0 %	40 %	523512909
270	NC_021721	ACAGC	2	10	426591	426600	40 %	0 %	20 %	40 %	523512909
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279	NC_021721	ACTGG	2	10	444358	444367	20 %	20 %	40 %	20 %	523512926
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283	NC_021721	TAAAT	2	10	448338	448347	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_021721	AGTTG	2	10	449017	449026	20 %	40 %	40 %	0 %	523512930
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395	NC_021721	AAGCA	2	10	610488	610497	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
396	NC_021721	ATGAA	2	10	610566	610575	60 %	20 %	20 %	0 %	523513078
397	NC_021721	CTTGC	2	10	614356	614365	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
398	NC_021721	AATTT	2	10	614962	614971	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_021721	CCAGC	2	10	765014	765023	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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