MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 8018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021721	CGGT	2	8	132	139	0 %	25 %	50 %	25 %	523512491
2	NC_021721	CAGC	2	8	323	330	25 %	0 %	25 %	50 %	523512491
3	NC_021721	TTTA	2	8	512	519	25 %	75 %	0 %	0 %	523512491
4	NC_021721	GCCT	2	8	816	823	0 %	25 %	25 %	50 %	523512491
5	NC_021721	GGTT	2	8	849	856	0 %	50 %	50 %	0 %	523512491
6	NC_021721	TGTC	2	8	876	883	0 %	50 %	25 %	25 %	523512491
7	NC_021721	ACGT	2	8	1002	1009	25 %	25 %	25 %	25 %	523512491
8	NC_021721	GAAA	2	8	1197	1204	75 %	0 %	25 %	0 %	523512491
9	NC_021721	AAAC	2	8	1443	1450	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021721	CTAA	2	8	2729	2736	50 %	25 %	0 %	25 %	523512492
11	NC_021721	TAAT	2	8	3230	3237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021721	GGCC	2	8	3489	3496	0 %	0 %	50 %	50 %	523512494
13	NC_021721	AATC	2	8	3640	3647	50 %	25 %	0 %	25 %	523512495
14	NC_021721	TGAC	2	8	4060	4067	25 %	25 %	25 %	25 %	523512495
15	NC_021721	AAGA	2	8	4896	4903	75 %	0 %	25 %	0 %	523512497
16	NC_021721	CCAG	2	8	4948	4955	25 %	0 %	25 %	50 %	523512497
17	NC_021721	GCTG	2	8	5078	5085	0 %	25 %	50 %	25 %	523512497
18	NC_021721	CCTG	2	8	6143	6150	0 %	25 %	25 %	50 %	523512497
19	NC_021721	TGTT	2	8	6817	6824	0 %	75 %	25 %	0 %	523512497
20	NC_021721	ATGA	2	8	7066	7073	50 %	25 %	25 %	0 %	523512498
21	NC_021721	GATT	2	8	7338	7345	25 %	50 %	25 %	0 %	523512498
22	NC_021721	CGGT	2	8	7436	7443	0 %	25 %	50 %	25 %	523512498
23	NC_021721	CTTG	2	8	8673	8680	0 %	50 %	25 %	25 %	523512498
24	NC_021721	ACGG	2	8	9075	9082	25 %	0 %	50 %	25 %	523512498
25	NC_021721	TTTG	2	8	9615	9622	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021721	TTTC	2	8	9803	9810	0 %	75 %	0 %	25 %	523512499
27	NC_021721	GACA	2	8	9974	9981	50 %	0 %	25 %	25 %	523512499
28	NC_021721	ATCA	2	8	10299	10306	50 %	25 %	0 %	25 %	523512499
29	NC_021721	GCAA	2	8	10431	10438	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021721	TTGG	2	8	10949	10956	0 %	50 %	50 %	0 %	523512501
31	NC_021721	CGTA	2	8	11770	11777	25 %	25 %	25 %	25 %	523512503
32	NC_021721	AACC	2	8	11938	11945	50 %	0 %	0 %	50 %	523512503
33	NC_021721	AAAT	2	8	12721	12728	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021721	GCTG	2	8	12920	12927	0 %	25 %	50 %	25 %	523512505
35	NC_021721	CAAT	2	8	13360	13367	50 %	25 %	0 %	25 %	523512505
36	NC_021721	ACTT	2	8	13800	13807	25 %	50 %	0 %	25 %	523512505
37	NC_021721	CTGG	2	8	14104	14111	0 %	25 %	50 %	25 %	523512505
38	NC_021721	TTCT	2	8	14647	14654	0 %	75 %	0 %	25 %	523512506
39	NC_021721	CAAT	2	8	14685	14692	50 %	25 %	0 %	25 %	523512506
40	NC_021721	AAGG	2	8	15395	15402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021721	ACAA	2	8	15940	15947	75 %	0 %	0 %	25 %	523512508
42	NC_021721	AAAG	2	8	16118	16125	75 %	0 %	25 %	0 %	523512508
43	NC_021721	TGTT	2	8	16337	16344	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021721	AAGC	2	8	16396	16403	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021721	GACT	2	8	16694	16701	25 %	25 %	25 %	25 %	523512509
46	NC_021721	AAAC	2	8	16780	16787	75 %	0 %	0 %	25 %	523512509
47	NC_021721	TAAT	2	8	17163	17170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021721	CGTT	2	8	17823	17830	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021721	ATAA	2	8	18014	18021	75 %	25 %	0 %	0 %	523512511
50	NC_021721	AGCT	2	8	19262	19269	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021721	GGTA	2	8	19683	19690	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021721	CAAC	2	8	20273	20280	50 %	0 %	0 %	50 %	523512515
53	NC_021721	CAAA	2	8	21949	21956	75 %	0 %	0 %	25 %	523512516
54	NC_021721	AGAC	2	8	22268	22275	50 %	0 %	25 %	25 %	523512516
55	NC_021721	AAGA	2	8	22691	22698	75 %	0 %	25 %	0 %	523512516
56	NC_021721	CTGC	2	8	23458	23465	0 %	25 %	25 %	50 %	523512516
57	NC_021721	TAGT	2	8	23692	23699	25 %	50 %	25 %	0 %	523512516
58	NC_021721	AGCC	2	8	24091	24098	25 %	0 %	25 %	50 %	523512517
59	NC_021721	TTAC	2	8	24847	24854	25 %	50 %	0 %	25 %	523512518
60	NC_021721	TGGT	2	8	24953	24960	0 %	50 %	50 %	0 %	523512518
61	NC_021721	AATT	2	8	25309	25316	50 %	50 %	0 %	0 %	523512519
62	NC_021721	AATT	2	8	25525	25532	50 %	50 %	0 %	0 %	523512519
63	NC_021721	ATTT	2	8	25743	25750	25 %	75 %	0 %	0 %	523512519
64	NC_021721	ATTG	2	8	26289	26296	25 %	50 %	25 %	0 %	523512520
65	NC_021721	GGTT	2	8	26447	26454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021721	CATA	2	8	26493	26500	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_021721	AGTG	2	8	26639	26646	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021721	AACA	2	8	27446	27453	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021721	AATG	2	8	27798	27805	50 %	25 %	25 %	0 %	523512522
70	NC_021721	TACA	2	8	28652	28659	50 %	25 %	0 %	25 %	523512522
71	NC_021721	TTGC	2	8	29348	29355	0 %	50 %	25 %	25 %	523512522
72	NC_021721	CAAA	2	8	29537	29544	75 %	0 %	0 %	25 %	523512522
73	NC_021721	CTAC	2	8	29728	29735	25 %	25 %	0 %	50 %	523512522
74	NC_021721	ATAA	2	8	30256	30263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021721	GTGC	2	8	30657	30664	0 %	25 %	50 %	25 %	523512523
76	NC_021721	GCAA	2	8	30951	30958	50 %	0 %	25 %	25 %	523512523
77	NC_021721	ATTT	2	8	31606	31613	25 %	75 %	0 %	0 %	523512524
78	NC_021721	CATT	2	8	32822	32829	25 %	50 %	0 %	25 %	523512526
79	NC_021721	GTTT	2	8	33054	33061	0 %	75 %	25 %	0 %	523512526
80	NC_021721	AGCA	2	8	33933	33940	50 %	0 %	25 %	25 %	523512527
81	NC_021721	AAGC	2	8	35090	35097	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_021721	TTCA	2	8	36270	36277	25 %	50 %	0 %	25 %	523512529
83	NC_021721	AGCA	2	8	36596	36603	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_021721	ATTT	2	8	36644	36651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021721	AAGG	2	8	38505	38512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021721	GCCG	2	8	39075	39082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_021721	AGAA	2	8	39414	39421	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021721	CTTT	2	8	42837	42844	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_021721	TCTT	2	8	42930	42937	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_021721	TTGA	2	8	43700	43707	25 %	50 %	25 %	0 %	523512537
91	NC_021721	TAAG	2	8	43926	43933	50 %	25 %	25 %	0 %	523512537
92	NC_021721	CAAA	2	8	44206	44213	75 %	0 %	0 %	25 %	523512537
93	NC_021721	TGAT	2	8	45007	45014	25 %	50 %	25 %	0 %	523512538
94	NC_021721	ATGA	2	8	45554	45561	50 %	25 %	25 %	0 %	523512539
95	NC_021721	TCAT	2	8	47101	47108	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_021721	AATC	2	8	47417	47424	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_021721	ATCC	2	8	47537	47544	25 %	25 %	0 %	50 %	523512542
98	NC_021721	CAAT	2	8	47622	47629	50 %	25 %	0 %	25 %	523512542
99	NC_021721	GTCA	2	8	47933	47940	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_021721	AATG	2	8	48164	48171	50 %	25 %	25 %	0 %	523512543
101	NC_021721	GAAA	2	8	48545	48552	75 %	0 %	25 %	0 %	523512543
102	NC_021721	AAAT	2	8	48586	48593	75 %	25 %	0 %	0 %	523512543
103	NC_021721	CAAA	2	8	48784	48791	75 %	0 %	0 %	25 %	523512543
104	NC_021721	AAAG	2	8	48842	48849	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021721	CAAA	2	8	49167	49174	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_021721	AGGG	2	8	50460	50467	25 %	0 %	75 %	0 %	523512545
107	NC_021721	TCAA	2	8	51319	51326	50 %	25 %	0 %	25 %	523512546
108	NC_021721	CGCT	2	8	51514	51521	0 %	25 %	25 %	50 %	523512546
109	NC_021721	CTAT	2	8	51786	51793	25 %	50 %	0 %	25 %	523512547
110	NC_021721	CTAG	2	8	52008	52015	25 %	25 %	25 %	25 %	523512547
111	NC_021721	AAAT	2	8	52635	52642	75 %	25 %	0 %	0 %	523512548
112	NC_021721	GGAG	2	8	53151	53158	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021721	TGAT	2	8	53409	53416	25 %	50 %	25 %	0 %	523512549
114	NC_021721	CAAA	2	8	53470	53477	75 %	0 %	0 %	25 %	523512549
115	NC_021721	AAAT	2	8	53779	53786	75 %	25 %	0 %	0 %	523512549
116	NC_021721	TATT	2	8	54389	54396	25 %	75 %	0 %	0 %	523512549
117	NC_021721	TTGA	2	8	54686	54693	25 %	50 %	25 %	0 %	523512549
118	NC_021721	TGAT	2	8	54741	54748	25 %	50 %	25 %	0 %	523512549
119	NC_021721	TGAA	2	8	54965	54972	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021721	TGAA	2	8	55007	55014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021721	CCGC	2	8	55117	55124	0 %	0 %	25 %	75 %	523512550
122	NC_021721	ACCG	2	8	55205	55212	25 %	0 %	25 %	50 %	523512550
123	NC_021721	GGCC	2	8	55573	55580	0 %	0 %	50 %	50 %	523512550
124	NC_021721	TGAG	2	8	55840	55847	25 %	25 %	50 %	0 %	523512550
125	NC_021721	TGCG	2	8	56448	56455	0 %	25 %	50 %	25 %	523512550
126	NC_021721	GTTA	2	8	56656	56663	25 %	50 %	25 %	0 %	523512551
127	NC_021721	AAAG	2	8	57710	57717	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021721	TCTG	2	8	57892	57899	0 %	50 %	25 %	25 %	523512553
129	NC_021721	GGTG	2	8	57957	57964	0 %	25 %	75 %	0 %	523512553
130	NC_021721	CCAC	2	8	58024	58031	25 %	0 %	0 %	75 %	523512553
131	NC_021721	AACA	2	8	58445	58452	75 %	0 %	0 %	25 %	523512553
132	NC_021721	AAAT	2	8	58914	58921	75 %	25 %	0 %	0 %	523512554
133	NC_021721	ATAC	2	8	59330	59337	50 %	25 %	0 %	25 %	523512554
134	NC_021721	GTCA	2	8	59870	59877	25 %	25 %	25 %	25 %	523512555
135	NC_021721	GTTG	2	8	60871	60878	0 %	50 %	50 %	0 %	523512555
136	NC_021721	TTAA	2	8	61116	61123	50 %	50 %	0 %	0 %	523512555
137	NC_021721	TGGC	2	8	61164	61171	0 %	25 %	50 %	25 %	523512555
138	NC_021721	GCTG	2	8	61330	61337	0 %	25 %	50 %	25 %	523512555
139	NC_021721	AGGT	2	8	61662	61669	25 %	25 %	50 %	0 %	523512555
140	NC_021721	TTGG	2	8	61844	61851	0 %	50 %	50 %	0 %	523512555
141	NC_021721	TCGT	2	8	62188	62195	0 %	50 %	25 %	25 %	523512555
142	NC_021721	CAGT	2	8	62752	62759	25 %	25 %	25 %	25 %	523512555
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144	NC_021721	TAAG	2	8	64096	64103	50 %	25 %	25 %	0 %	523512557
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