MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 60036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021721	CAA	2	6	50118	50123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_021721	TC	3	6	50156	50161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_021721	A	8	8	50246	50253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_021721	A	6	6	50280	50285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021721	ATT	2	6	50445	50450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512545
1006	NC_021721	AGGG	2	8	50460	50467	25 %	0 %	75 %	0 %	523512545
1007	NC_021721	ATGAA	2	10	50521	50530	60 %	20 %	20 %	0 %	523512545
1008	NC_021721	A	6	6	50560	50565	100 %	0 %	0 %	0 %	523512545
1009	NC_021721	TAT	2	6	50567	50572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512545
1010	NC_021721	GCT	2	6	50580	50585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512545
1011	NC_021721	ACA	2	6	50747	50752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512545
1012	NC_021721	ATT	2	6	50820	50825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512545
1013	NC_021721	ATT	2	6	50950	50955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512545
1014	NC_021721	A	6	6	51130	51135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021721	T	6	6	51185	51190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_021721	AGA	2	6	51228	51233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021721	TCAA	2	8	51319	51326	50 %	25 %	0 %	25 %	523512546
1018	NC_021721	GTG	2	6	51425	51430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523512546
1019	NC_021721	CTT	2	6	51435	51440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523512546
1020	NC_021721	GGC	2	6	51444	51449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512546
1021	NC_021721	TCA	2	6	51491	51496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512546
1022	NC_021721	CGCT	2	8	51514	51521	0 %	25 %	25 %	50 %	523512546
1023	NC_021721	T	8	8	51604	51611	0 %	100 %	0 %	0 %	523512546
1024	NC_021721	AGC	2	6	51614	51619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512546
1025	NC_021721	TTGCT	2	10	51632	51641	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1026	NC_021721	TTA	2	6	51686	51691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512547
1027	NC_021721	CTAT	2	8	51786	51793	25 %	50 %	0 %	25 %	523512547
1028	NC_021721	CCG	2	6	51863	51868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523512547
1029	NC_021721	CGG	3	9	51882	51890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512547
1030	NC_021721	ATC	2	6	51950	51955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512547
1031	NC_021721	GTT	2	6	51958	51963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512547
1032	NC_021721	GAA	2	6	51966	51971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512547
1033	NC_021721	CTAG	2	8	52008	52015	25 %	25 %	25 %	25 %	523512547
1034	NC_021721	T	6	6	52019	52024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_021721	ACAAA	2	10	52049	52058	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1036	NC_021721	TTCTTT	2	12	52094	52105	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1037	NC_021721	T	7	7	52114	52120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_021721	GCT	2	6	52159	52164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_021721	ATT	2	6	52165	52170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021721	CA	3	6	52171	52176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_021721	GAG	2	6	52180	52185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021721	T	7	7	52233	52239	0 %	100 %	0 %	0 %	523512548
1043	NC_021721	CA	3	6	52257	52262	50 %	0 %	0 %	50 %	523512548
1044	NC_021721	AGC	2	6	52287	52292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512548
1045	NC_021721	CTT	2	6	52316	52321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523512548
1046	NC_021721	CAG	2	6	52455	52460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512548
1047	NC_021721	AAAT	2	8	52635	52642	75 %	25 %	0 %	0 %	523512548
1048	NC_021721	TTTCT	2	10	52683	52692	0 %	80 %	0 %	20 %	523512548
1049	NC_021721	ACA	2	6	52987	52992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512548
1050	NC_021721	CT	3	6	53028	53033	0 %	50 %	0 %	50 %	523512548
1051	NC_021721	TGT	2	6	53046	53051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512548
1052	NC_021721	GAT	2	6	53064	53069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512548
1053	NC_021721	TCGTT	2	10	53080	53089	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1054	NC_021721	GGAG	2	8	53151	53158	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_021721	T	6	6	53286	53291	0 %	100 %	0 %	0 %	523512549
1056	NC_021721	ATG	2	6	53300	53305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512549
1057	NC_021721	T	6	6	53350	53355	0 %	100 %	0 %	0 %	523512549
1058	NC_021721	ATT	2	6	53364	53369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512549
1059	NC_021721	TGAT	2	8	53409	53416	25 %	50 %	25 %	0 %	523512549
1060	NC_021721	CAAA	2	8	53470	53477	75 %	0 %	0 %	25 %	523512549
1061	NC_021721	ATG	2	6	53508	53513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512549
1062	NC_021721	TGC	2	6	53599	53604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512549
1063	NC_021721	TTCTT	2	10	53631	53640	0 %	80 %	0 %	20 %	523512549
1064	NC_021721	CGA	2	6	53694	53699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512549
1065	NC_021721	GCA	2	6	53720	53725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512549
1066	NC_021721	TTA	2	6	53768	53773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512549
1067	NC_021721	AAAT	2	8	53779	53786	75 %	25 %	0 %	0 %	523512549
1068	NC_021721	A	6	6	53822	53827	100 %	0 %	0 %	0 %	523512549
1069	NC_021721	AGC	2	6	53884	53889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512549
1070	NC_021721	TCT	2	6	53898	53903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523512549
1071	NC_021721	GTA	2	6	53982	53987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512549
1072	NC_021721	TGC	2	6	53989	53994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512549
1073	NC_021721	ATG	2	6	54027	54032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512549
1074	NC_021721	ATT	2	6	54058	54063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512549
1075	NC_021721	GGT	2	6	54145	54150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523512549
1076	NC_021721	GAG	2	6	54213	54218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523512549
1077	NC_021721	TGA	2	6	54316	54321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512549
1078	NC_021721	ATGACA	2	12	54338	54349	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	523512549
1079	NC_021721	TATT	2	8	54389	54396	25 %	75 %	0 %	0 %	523512549
1080	NC_021721	ACA	2	6	54414	54419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512549
1081	NC_021721	GGC	2	6	54542	54547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512549
1082	NC_021721	TTAGCA	2	12	54560	54571	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	523512549
1083	NC_021721	TTG	2	6	54603	54608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512549
1084	NC_021721	TTGA	2	8	54686	54693	25 %	50 %	25 %	0 %	523512549
1085	NC_021721	TCA	2	6	54700	54705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512549
1086	NC_021721	TGAT	2	8	54741	54748	25 %	50 %	25 %	0 %	523512549
1087	NC_021721	A	6	6	54798	54803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_021721	A	7	7	54850	54856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_021721	TTG	2	6	54878	54883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_021721	ATT	2	6	54926	54931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_021721	TGAA	2	8	54965	54972	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_021721	TGAA	2	8	55007	55014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_021721	CAT	2	6	55054	55059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_021721	GCT	2	6	55101	55106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512550
1095	NC_021721	CTG	2	6	55109	55114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512550
1096	NC_021721	CCGC	2	8	55117	55124	0 %	0 %	25 %	75 %	523512550
1097	NC_021721	CAA	2	6	55138	55143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512550
1098	NC_021721	ACCG	2	8	55205	55212	25 %	0 %	25 %	50 %	523512550
1099	NC_021721	GA	3	6	55213	55218	50 %	0 %	50 %	0 %	523512550
1100	NC_021721	TTG	2	6	55277	55282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512550
1101	NC_021721	TGG	2	6	55425	55430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523512550
1102	NC_021721	CGA	2	6	55456	55461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512550
1103	NC_021721	GCC	2	6	55520	55525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523512550
1104	NC_021721	CCG	2	6	55537	55542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523512550
1105	NC_021721	GCA	2	6	55561	55566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512550
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1107	NC_021721	AAG	2	6	55662	55667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512550
1108	NC_021721	CAA	2	6	55756	55761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512550
1109	NC_021721	CAG	2	6	55798	55803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512550
1110	NC_021721	TGAG	2	8	55840	55847	25 %	25 %	50 %	0 %	523512550
1111	NC_021721	AGC	3	9	55863	55871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512550
1112	NC_021721	GTC	3	9	55896	55904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512550
1113	NC_021721	A	6	6	55972	55977	100 %	0 %	0 %	0 %	523512550
1114	NC_021721	ATA	2	6	55994	55999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523512550
1115	NC_021721	CAA	2	6	56153	56158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512550
1116	NC_021721	CTG	2	6	56428	56433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512550
1117	NC_021721	TGCG	2	8	56448	56455	0 %	25 %	50 %	25 %	523512550
1118	NC_021721	CAT	2	6	56520	56525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_021721	GCA	2	6	56526	56531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_021721	CTG	2	6	56540	56545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_021721	A	7	7	56560	56566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_021721	GCT	2	6	56617	56622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_021721	TAA	2	6	56623	56628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_021721	GTTA	2	8	56656	56663	25 %	50 %	25 %	0 %	523512551
1125	NC_021721	CCA	2	6	56671	56676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523512551
1126	NC_021721	ATT	2	6	56735	56740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512551
1127	NC_021721	AATGCC	2	12	56753	56764	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	523512551
1128	NC_021721	AAC	2	6	56781	56786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512551
1129	NC_021721	TGTTT	2	10	56793	56802	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_021721	AAG	2	6	56823	56828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1257	NC_021721	GTT	3	9	63078	63086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512556
1258	NC_021721	TGC	2	6	63117	63122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512556
1259	NC_021721	AGC	2	6	63226	63231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512556
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1261	NC_021721	CAGTT	2	10	63283	63292	20 %	40 %	20 %	20 %	523512556
1262	NC_021721	ATG	2	6	63404	63409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512556
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1265	NC_021721	CTC	2	6	63591	63596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1266	NC_021721	AT	3	6	63617	63622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1267	NC_021721	TGT	2	6	63682	63687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1270	NC_021721	CCA	2	6	63754	63759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1279	NC_021721	A	7	7	64254	64260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1280	NC_021721	GAC	2	6	64261	64266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1351	NC_021721	GTT	2	6	67875	67880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1352	NC_021721	TTCA	2	8	67905	67912	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1353	NC_021721	AG	3	6	67921	67926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1362	NC_021721	GT	3	6	68381	68386	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1377	NC_021721	A	6	6	68982	68987	100 %	0 %	0 %	0 %	523512562
1378	NC_021721	TTA	2	6	69199	69204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1379	NC_021721	AG	3	6	69280	69285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1380	NC_021721	AT	3	6	69291	69296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1381	NC_021721	T	6	6	69344	69349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1382	NC_021721	ATC	2	6	69368	69373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1383	NC_021721	CAT	3	9	69386	69394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1384	NC_021721	AGA	2	6	69415	69420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1385	NC_021721	ACT	2	6	69423	69428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1386	NC_021721	CAA	2	6	69493	69498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512563
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1497	NC_021721	GGC	2	6	74897	74902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512570
1498	NC_021721	CTT	2	6	74911	74916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523512570
1499	NC_021721	TCG	3	9	74949	74957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512570
1500	NC_021721	GCG	2	6	75135	75140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512570

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