MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 60036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021721	TTG	2	6	24761	24766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512518
502	NC_021721	CGA	2	6	24777	24782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512518
503	NC_021721	TTAC	2	8	24847	24854	25 %	50 %	0 %	25 %	523512518
504	NC_021721	TGGT	2	8	24953	24960	0 %	50 %	50 %	0 %	523512518
505	NC_021721	AGC	3	9	24994	25002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512518
506	NC_021721	ATT	2	6	25004	25009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512518
507	NC_021721	AAT	2	6	25013	25018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523512518
508	NC_021721	GTG	2	6	25028	25033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523512518
509	NC_021721	GAA	2	6	25036	25041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512518
510	NC_021721	A	6	6	25062	25067	100 %	0 %	0 %	0 %	523512518
511	NC_021721	TAC	3	9	25121	25129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512518
512	NC_021721	TTC	2	6	25133	25138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523512518
513	NC_021721	GCG	2	6	25208	25213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512518
514	NC_021721	ATA	2	6	25277	25282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_021721	AATT	2	8	25309	25316	50 %	50 %	0 %	0 %	523512519
516	NC_021721	GCC	2	6	25361	25366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523512519
517	NC_021721	GGC	2	6	25429	25434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512519
518	NC_021721	CGG	2	6	25499	25504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512519
519	NC_021721	AATT	2	8	25525	25532	50 %	50 %	0 %	0 %	523512519
520	NC_021721	TCCTG	2	10	25604	25613	0 %	40 %	20 %	40 %	523512519
521	NC_021721	TG	3	6	25612	25617	0 %	50 %	50 %	0 %	523512519
522	NC_021721	GCC	2	6	25626	25631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523512519
523	NC_021721	ATTT	2	8	25743	25750	25 %	75 %	0 %	0 %	523512519
524	NC_021721	GTC	2	6	25894	25899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512519
525	NC_021721	ATG	2	6	25923	25928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512519
526	NC_021721	ATGATA	2	12	25942	25953	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	523512519
527	NC_021721	CAT	2	6	25985	25990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512519
528	NC_021721	AAG	2	6	26092	26097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512519
529	NC_021721	TTA	2	6	26158	26163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512520
530	NC_021721	TGA	2	6	26240	26245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512520
531	NC_021721	ATT	2	6	26254	26259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512520
532	NC_021721	ATTG	2	8	26289	26296	25 %	50 %	25 %	0 %	523512520
533	NC_021721	ATC	2	6	26363	26368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512520
534	NC_021721	CAT	2	6	26370	26375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512520
535	NC_021721	TTGTT	2	10	26393	26402	0 %	80 %	20 %	0 %	523512520
536	NC_021721	GGTT	2	8	26447	26454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
537	NC_021721	T	6	6	26466	26471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_021721	CATA	2	8	26493	26500	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
539	NC_021721	AGA	2	6	26507	26512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_021721	T	6	6	26556	26561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_021721	GTT	2	6	26572	26577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_021721	AGTG	2	8	26639	26646	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021721	TTG	2	6	26675	26680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512521
544	NC_021721	AGC	2	6	26818	26823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512521
545	NC_021721	GT	3	6	26837	26842	0 %	50 %	50 %	0 %	523512521
546	NC_021721	TTG	2	6	26959	26964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512521
547	NC_021721	TCT	2	6	26975	26980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523512521
548	NC_021721	A	7	7	27023	27029	100 %	0 %	0 %	0 %	523512521
549	NC_021721	A	6	6	27063	27068	100 %	0 %	0 %	0 %	523512521
550	NC_021721	AGA	2	6	27072	27077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512521
551	NC_021721	T	6	6	27100	27105	0 %	100 %	0 %	0 %	523512521
552	NC_021721	TGT	2	6	27290	27295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512521
553	NC_021721	TC	3	6	27346	27351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
554	NC_021721	CAA	2	6	27395	27400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_021721	T	6	6	27401	27406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_021721	CAT	2	6	27422	27427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_021721	AACA	2	8	27446	27453	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
558	NC_021721	GTC	2	6	27491	27496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_021721	GCC	2	6	27539	27544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_021721	TGT	2	6	27572	27577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_021721	CTT	2	6	27605	27610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_021721	TA	3	6	27650	27655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_021721	GTT	2	6	27699	27704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_021721	A	7	7	27705	27711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021721	TAA	2	6	27719	27724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_021721	AAC	2	6	27759	27764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_021721	CCT	2	6	27777	27782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_021721	AGC	2	6	27792	27797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512522
569	NC_021721	AATG	2	8	27798	27805	50 %	25 %	25 %	0 %	523512522
570	NC_021721	AGC	2	6	27822	27827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512522
571	NC_021721	CAA	2	6	27833	27838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512522
572	NC_021721	ATA	2	6	27862	27867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523512522
573	NC_021721	TTG	2	6	27869	27874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512522
574	NC_021721	ACA	2	6	27883	27888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512522
575	NC_021721	GCC	2	6	27895	27900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523512522
576	NC_021721	AAC	2	6	28047	28052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512522
577	NC_021721	TGT	3	9	28053	28061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512522
578	NC_021721	ATT	2	6	28404	28409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512522
579	NC_021721	GAA	2	6	28486	28491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512522
580	NC_021721	TACA	2	8	28652	28659	50 %	25 %	0 %	25 %	523512522
581	NC_021721	AT	3	6	28671	28676	50 %	50 %	0 %	0 %	523512522
582	NC_021721	AAT	2	6	28731	28736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523512522
583	NC_021721	AGC	2	6	28815	28820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512522
584	NC_021721	TAC	2	6	28823	28828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512522
585	NC_021721	CAA	2	6	28832	28837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512522
586	NC_021721	CTG	2	6	28854	28859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512522
587	NC_021721	CCA	2	6	28885	28890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523512522
588	NC_021721	AT	3	6	28896	28901	50 %	50 %	0 %	0 %	523512522
589	NC_021721	GTT	2	6	29036	29041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512522
590	NC_021721	GCA	2	6	29050	29055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512522
591	NC_021721	CAA	2	6	29115	29120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512522
592	NC_021721	TGA	2	6	29126	29131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512522
593	NC_021721	TTGC	2	8	29348	29355	0 %	50 %	25 %	25 %	523512522
594	NC_021721	TGC	2	6	29479	29484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512522
595	NC_021721	CGC	2	6	29504	29509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523512522
596	NC_021721	CAAA	2	8	29537	29544	75 %	0 %	0 %	25 %	523512522
597	NC_021721	GCC	2	6	29545	29550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523512522
598	NC_021721	TAT	2	6	29624	29629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512522
599	NC_021721	ATT	2	6	29640	29645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512522
600	NC_021721	CTAC	2	8	29728	29735	25 %	25 %	0 %	50 %	523512522
601	NC_021721	TTG	2	6	29831	29836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512522
602	NC_021721	TTG	2	6	29896	29901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512522
603	NC_021721	TAT	2	6	29954	29959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_021721	TG	3	6	29963	29968	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_021721	T	6	6	30030	30035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_021721	TGTTTT	2	12	30045	30056	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_021721	GGA	2	6	30059	30064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_021721	A	6	6	30111	30116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_021721	TCA	2	6	30154	30159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_021721	ATAA	2	8	30256	30263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_021721	T	6	6	30269	30274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_021721	GCT	2	6	30312	30317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512523
613	NC_021721	GAT	2	6	30338	30343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512523
614	NC_021721	GGC	2	6	30367	30372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512523
615	NC_021721	GAT	2	6	30377	30382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512523
616	NC_021721	TGG	2	6	30448	30453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523512523
617	NC_021721	GGC	2	6	30485	30490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512523
618	NC_021721	TTC	2	6	30504	30509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523512523
619	NC_021721	GAT	2	6	30521	30526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512523
620	NC_021721	AAGGTT	2	12	30546	30557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512523
621	NC_021721	CTT	2	6	30637	30642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523512523
622	NC_021721	GTGC	2	8	30657	30664	0 %	25 %	50 %	25 %	523512523
623	NC_021721	AGT	2	6	30711	30716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512523
624	NC_021721	ATG	2	6	30732	30737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512523
625	NC_021721	CAA	2	6	30782	30787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512523
626	NC_021721	TAC	2	6	30802	30807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512523
627	NC_021721	GCC	2	6	30829	30834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523512523
628	NC_021721	CGG	2	6	30935	30940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512523
629	NC_021721	GCAA	2	8	30951	30958	50 %	0 %	25 %	25 %	523512523
630	NC_021721	AAGCC	2	10	30979	30988	40 %	0 %	20 %	40 %	523512523
631	NC_021721	CTC	2	6	31062	31067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_021721	T	7	7	31148	31154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_021721	GAA	2	6	31222	31227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_021721	GTC	2	6	31376	31381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512524
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652	NC_021721	ATT	2	6	31997	32002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
653	NC_021721	TA	3	6	32031	32036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
654	NC_021721	T	6	6	32062	32067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
655	NC_021721	ACT	2	6	32079	32084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
656	NC_021721	TA	3	6	32110	32115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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749	NC_021721	TCA	2	6	36670	36675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
750	NC_021721	TA	3	6	36722	36727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
751	NC_021721	TGG	2	6	36827	36832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523512530
752	NC_021721	TTC	2	6	36894	36899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523512530
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758	NC_021721	AG	3	6	37169	37174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
759	NC_021721	T	6	6	37285	37290	0 %	100 %	0 %	0 %	523512531
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