MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16D

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021526	TG	4	8	2486	2493	0 %	50 %	50 %	0 %	513845195
2	NC_021526	TG	3	6	4318	4323	0 %	50 %	50 %	0 %	513845196
3	NC_021526	TC	3	6	5695	5700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021526	AT	3	6	10580	10585	50 %	50 %	0 %	0 %	513845203
5	NC_021526	AT	3	6	12188	12193	50 %	50 %	0 %	0 %	513845203
6	NC_021526	GA	4	8	12371	12378	50 %	0 %	50 %	0 %	513845203
7	NC_021526	GA	3	6	13917	13922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021526	TA	3	6	13941	13946	50 %	50 %	0 %	0 %	513845206
9	NC_021526	AC	4	8	15132	15139	50 %	0 %	0 %	50 %	513845207
10	NC_021526	AT	3	6	17516	17521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021526	AT	3	6	17548	17553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021526	CG	3	6	17891	17896	0 %	0 %	50 %	50 %	513845209
13	NC_021526	CA	3	6	18048	18053	50 %	0 %	0 %	50 %	513845209
14	NC_021526	TA	3	6	18380	18385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021526	AC	3	6	19043	19048	50 %	0 %	0 %	50 %	513845210
16	NC_021526	TG	3	6	21097	21102	0 %	50 %	50 %	0 %	513845211
17	NC_021526	CT	3	6	21951	21956	0 %	50 %	0 %	50 %	513845211
18	NC_021526	TA	3	6	22045	22050	50 %	50 %	0 %	0 %	513845211
19	NC_021526	AT	3	6	22677	22682	50 %	50 %	0 %	0 %	513845211
20	NC_021526	TG	3	6	24680	24685	0 %	50 %	50 %	0 %	513845212
21	NC_021526	TA	3	6	25261	25266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021526	GA	3	6	25485	25490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021526	TC	3	6	26082	26087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021526	TA	3	6	26155	26160	50 %	50 %	0 %	0 %	513845215
25	NC_021526	TG	3	6	26225	26230	0 %	50 %	50 %	0 %	513845215
26	NC_021526	AT	3	6	26374	26379	50 %	50 %	0 %	0 %	513845215
27	NC_021526	TA	3	6	26483	26488	50 %	50 %	0 %	0 %	513845216
28	NC_021526	AT	3	6	27356	27361	50 %	50 %	0 %	0 %	513845217
29	NC_021526	TG	3	6	28521	28526	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021526	TC	3	6	28725	28730	0 %	50 %	0 %	50 %	513845218
31	NC_021526	TG	3	6	29609	29614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021526	AC	3	6	29648	29653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021526	TG	3	6	29686	29691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021526	GT	3	6	29922	29927	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021526	TG	3	6	29934	29939	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021526	TA	3	6	30013	30018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021526	TG	3	6	30025	30030	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021526	TA	4	8	30202	30209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021526	TA	3	6	30376	30381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021526	AT	3	6	30535	30540	50 %	50 %	0 %	0 %	513845220
41	NC_021526	GA	3	6	31279	31284	50 %	0 %	50 %	0 %	513845221
42	NC_021526	AC	3	6	32633	32638	50 %	0 %	0 %	50 %	513845223
43	NC_021526	GA	3	6	36508	36513	50 %	0 %	50 %	0 %	513845228

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.