MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16D

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021526	AACTT	2	10	772	781	40 %	40 %	0 %	20 %	513845192
2	NC_021526	CATTT	2	10	1761	1770	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_021526	AAAAT	2	10	2278	2287	80 %	20 %	0 %	0 %	513845194
4	NC_021526	AGTTA	2	10	2669	2678	40 %	40 %	20 %	0 %	513845195
5	NC_021526	TTTTG	2	10	3095	3104	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021526	CCTCA	2	10	9396	9405	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
7	NC_021526	CTCAT	2	10	10689	10698	20 %	40 %	0 %	40 %	513845203
8	NC_021526	AGTTT	2	10	12457	12466	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021526	TTAAT	2	10	12959	12968	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021526	GCAGT	2	10	14058	14067	20 %	20 %	40 %	20 %	513845206
11	NC_021526	GCAGT	2	10	14136	14145	20 %	20 %	40 %	20 %	513845206
12	NC_021526	GCAGT	2	10	14175	14184	20 %	20 %	40 %	20 %	513845206
13	NC_021526	GCAGT	2	10	14214	14223	20 %	20 %	40 %	20 %	513845206
14	NC_021526	GCAGT	2	10	14253	14262	20 %	20 %	40 %	20 %	513845206
15	NC_021526	GCAGT	2	10	14292	14301	20 %	20 %	40 %	20 %	513845206
16	NC_021526	TAATT	2	10	17109	17118	40 %	60 %	0 %	0 %	513845208
17	NC_021526	ATTGA	2	10	17393	17402	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021526	CAAAT	2	10	17729	17738	60 %	20 %	0 %	20 %	513845209
19	NC_021526	CAGAT	2	10	18127	18136	40 %	20 %	20 %	20 %	513845209
20	NC_021526	TTCCA	2	10	18799	18808	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_021526	TACCT	2	10	20357	20366	20 %	40 %	0 %	40 %	513845211
22	NC_021526	AGTTA	2	10	24527	24536	40 %	40 %	20 %	0 %	513845212
23	NC_021526	TCTCT	2	10	25896	25905	0 %	60 %	0 %	40 %	513845214
24	NC_021526	TGACA	2	10	28405	28414	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_021526	GATTT	2	10	28644	28653	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021526	GTTTT	2	10	30459	30468	0 %	80 %	20 %	0 %	513845220
27	NC_021526	ATGAC	2	10	30936	30945	40 %	20 %	20 %	20 %	513845220
28	NC_021526	ATTTT	2	10	31613	31622	20 %	80 %	0 %	0 %	513845222
29	NC_021526	CTTCA	2	10	35676	35685	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_021526	GCTAA	2	10	35779	35788	40 %	20 %	20 %	20 %	513845227
31	NC_021526	AAATC	2	10	36584	36593	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.