MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16H

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021519	AT	3	6	3471	3476	50 %	50 %	0 %	0 %	513844332
2	NC_021519	TG	3	6	4795	4800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021519	CA	3	6	5740	5745	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021519	TG	3	6	9058	9063	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021519	AT	3	6	10809	10814	50 %	50 %	0 %	0 %	513844340
6	NC_021519	AT	3	6	11006	11011	50 %	50 %	0 %	0 %	513844340
7	NC_021519	AT	3	6	11186	11191	50 %	50 %	0 %	0 %	513844340
8	NC_021519	AT	3	6	11718	11723	50 %	50 %	0 %	0 %	513844341
9	NC_021519	GA	3	6	12002	12007	50 %	0 %	50 %	0 %	513844341
10	NC_021519	GA	3	6	12077	12082	50 %	0 %	50 %	0 %	513844341
11	NC_021519	GA	3	6	12387	12392	50 %	0 %	50 %	0 %	513844341
12	NC_021519	TA	3	6	12612	12617	50 %	50 %	0 %	0 %	513844342
13	NC_021519	CA	3	6	12635	12640	50 %	0 %	0 %	50 %	513844342
14	NC_021519	GA	3	6	13110	13115	50 %	0 %	50 %	0 %	513844342
15	NC_021519	AG	3	6	13852	13857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021519	AT	3	6	14440	14445	50 %	50 %	0 %	0 %	513844344
17	NC_021519	TA	3	6	14632	14637	50 %	50 %	0 %	0 %	513844344
18	NC_021519	AT	3	6	14675	14680	50 %	50 %	0 %	0 %	513844344
19	NC_021519	AG	3	6	15665	15670	50 %	0 %	50 %	0 %	513844345
20	NC_021519	AG	3	6	15687	15692	50 %	0 %	50 %	0 %	513844345
21	NC_021519	AT	3	6	15946	15951	50 %	50 %	0 %	0 %	513844345
22	NC_021519	AT	3	6	16515	16520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021519	TA	3	6	17250	17255	50 %	50 %	0 %	0 %	513844346
24	NC_021519	TA	3	6	17429	17434	50 %	50 %	0 %	0 %	513844346
25	NC_021519	TA	3	6	17569	17574	50 %	50 %	0 %	0 %	513844346
26	NC_021519	TC	3	6	17783	17788	0 %	50 %	0 %	50 %	513844347
27	NC_021519	TA	3	6	17920	17925	50 %	50 %	0 %	0 %	513844347
28	NC_021519	AT	3	6	18116	18121	50 %	50 %	0 %	0 %	513844347
29	NC_021519	AT	3	6	18343	18348	50 %	50 %	0 %	0 %	513844347
30	NC_021519	CG	3	6	20311	20316	0 %	0 %	50 %	50 %	513844348
31	NC_021519	TA	3	6	20320	20325	50 %	50 %	0 %	0 %	513844348
32	NC_021519	CT	3	6	22707	22712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021519	CA	3	6	22828	22833	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021519	CG	3	6	23733	23738	0 %	0 %	50 %	50 %	513844353
35	NC_021519	GA	3	6	27626	27631	50 %	0 %	50 %	0 %	513844356
36	NC_021519	TG	3	6	28358	28363	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021519	TA	3	6	28521	28526	50 %	50 %	0 %	0 %	513844357
38	NC_021519	TA	3	6	28752	28757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021519	TG	3	6	28876	28881	0 %	50 %	50 %	0 %	513844358
40	NC_021519	CA	3	6	29031	29036	50 %	0 %	0 %	50 %	513844358
41	NC_021519	TC	3	6	29173	29178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021519	CG	3	6	30741	30746	0 %	0 %	50 %	50 %	513844359
43	NC_021519	CA	3	6	31048	31053	50 %	0 %	0 %	50 %	513844359
44	NC_021519	TA	3	6	31333	31338	50 %	50 %	0 %	0 %	513844359
45	NC_021519	AC	3	6	31388	31393	50 %	0 %	0 %	50 %	513844359
46	NC_021519	TA	3	6	34518	34523	50 %	50 %	0 %	0 %	513844362
47	NC_021519	CT	3	6	37425	37430	0 %	50 %	0 %	50 %	513844367
48	NC_021519	CT	3	6	37482	37487	0 %	50 %	0 %	50 %	513844367
49	NC_021519	AG	3	6	41199	41204	50 %	0 %	50 %	0 %	513844370
50	NC_021519	GC	3	6	43392	43397	0 %	0 %	50 %	50 %	513844370
51	NC_021519	GC	3	6	43681	43686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021519	GC	3	6	44189	44194	0 %	0 %	50 %	50 %	513844372
53	NC_021519	TG	3	6	44939	44944	0 %	50 %	50 %	0 %	513844373
54	NC_021519	TG	3	6	47799	47804	0 %	50 %	50 %	0 %	513844375
55	NC_021519	TA	3	6	48455	48460	50 %	50 %	0 %	0 %	513844376
56	NC_021519	TG	3	6	49212	49217	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021519	GC	3	6	51915	51920	0 %	0 %	50 %	50 %	513844382
58	NC_021519	CG	3	6	54061	54066	0 %	0 %	50 %	50 %	513844385
59	NC_021519	GC	3	6	55961	55966	0 %	0 %	50 %	50 %	513844386
60	NC_021519	TA	3	6	56975	56980	50 %	50 %	0 %	0 %	513844387
61	NC_021519	TG	3	6	59461	59466	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021519	TA	3	6	59483	59488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021519	TA	3	6	60474	60479	50 %	50 %	0 %	0 %	513844391
64	NC_021519	TA	3	6	62139	62144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021519	CG	3	6	62621	62626	0 %	0 %	50 %	50 %	513844392
66	NC_021519	GT	3	6	64576	64581	0 %	50 %	50 %	0 %	513844395
67	NC_021519	CG	3	6	66308	66313	0 %	0 %	50 %	50 %	513844397
68	NC_021519	AC	3	6	70888	70893	50 %	0 %	0 %	50 %	513844399
69	NC_021519	TG	3	6	73176	73181	0 %	50 %	50 %	0 %	513844401
70	NC_021519	TA	3	6	73969	73974	50 %	50 %	0 %	0 %	513844402
71	NC_021519	GA	3	6	74040	74045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021519	CT	3	6	74064	74069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.