MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16H

Total Repeats: 1477

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021519	CCA	2	6	21739	21744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513844351
502	NC_021519	CAAC	2	8	21910	21917	50 %	0 %	0 %	50 %	513844351
503	NC_021519	ATG	2	6	21975	21980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844351
504	NC_021519	CAC	2	6	21993	21998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513844351
505	NC_021519	CAG	2	6	22030	22035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844351
506	NC_021519	GTT	2	6	22109	22114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844351
507	NC_021519	GAT	2	6	22252	22257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844351
508	NC_021519	TAG	2	6	22338	22343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844351
509	NC_021519	CTT	2	6	22375	22380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_021519	T	6	6	22439	22444	0 %	100 %	0 %	0 %	513844352
511	NC_021519	T	7	7	22462	22468	0 %	100 %	0 %	0 %	513844352
512	NC_021519	TCTT	2	8	22550	22557	0 %	75 %	0 %	25 %	513844352
513	NC_021519	TGG	2	6	22581	22586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844352
514	NC_021519	TCTT	2	8	22680	22687	0 %	75 %	0 %	25 %	513844352
515	NC_021519	CT	3	6	22707	22712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
516	NC_021519	CA	3	6	22828	22833	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
517	NC_021519	ATC	2	6	22876	22881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_021519	ACC	2	6	22891	22896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_021519	AAG	2	6	22921	22926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021519	CAA	2	6	22957	22962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_021519	TCGT	2	8	22969	22976	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
522	NC_021519	AGCA	2	8	23005	23012	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
523	NC_021519	TTA	2	6	23133	23138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_021519	CAA	2	6	23148	23153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_021519	AGA	2	6	23234	23239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844353
526	NC_021519	AAC	3	9	23318	23326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844353
527	NC_021519	AATT	2	8	23363	23370	50 %	50 %	0 %	0 %	513844353
528	NC_021519	GCA	2	6	23391	23396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844353
529	NC_021519	TAA	2	6	23400	23405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844353
530	NC_021519	ATT	2	6	23468	23473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844353
531	NC_021519	ATA	2	6	23543	23548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844353
532	NC_021519	GAC	2	6	23662	23667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844353
533	NC_021519	A	6	6	23725	23730	100 %	0 %	0 %	0 %	513844353
534	NC_021519	CG	3	6	23733	23738	0 %	0 %	50 %	50 %	513844353
535	NC_021519	A	6	6	23777	23782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_021519	A	6	6	23784	23789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_021519	AAATG	2	10	23858	23867	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
538	NC_021519	ATA	2	6	23879	23884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_021519	TAAA	2	8	23896	23903	75 %	25 %	0 %	0 %	513844354
540	NC_021519	TGG	2	6	24034	24039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844354
541	NC_021519	GTG	2	6	24040	24045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844354
542	NC_021519	TTA	2	6	24058	24063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844354
543	NC_021519	TGG	2	6	24108	24113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844354
544	NC_021519	GTT	2	6	24186	24191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844354
545	NC_021519	TTCAGT	2	12	24202	24213	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	513844354
546	NC_021519	GCT	2	6	24217	24222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844354
547	NC_021519	GGC	2	6	24231	24236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513844354
548	NC_021519	TCA	2	6	24296	24301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844354
549	NC_021519	ACA	2	6	24398	24403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844354
550	NC_021519	CAG	2	6	24438	24443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844354
551	NC_021519	CTT	2	6	24494	24499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844354
552	NC_021519	CTT	2	6	24539	24544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844354
553	NC_021519	AAG	2	6	24586	24591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844354
554	NC_021519	AGT	2	6	24683	24688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844354
555	NC_021519	CAG	2	6	24725	24730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844354
556	NC_021519	GTT	2	6	24763	24768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844354
557	NC_021519	GTTAA	2	10	24844	24853	40 %	40 %	20 %	0 %	513844354
558	NC_021519	TTA	2	6	24901	24906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844354
559	NC_021519	AGC	2	6	24970	24975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844354
560	NC_021519	GGT	2	6	24995	25000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844354
561	NC_021519	TTCA	2	8	25062	25069	25 %	50 %	0 %	25 %	513844354
562	NC_021519	CCT	2	6	25079	25084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_021519	TAGA	2	8	25199	25206	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
564	NC_021519	T	6	6	25242	25247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021519	TAAG	2	8	25295	25302	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
566	NC_021519	T	6	6	25513	25518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021519	GAT	2	6	25599	25604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_021519	AAT	2	6	25666	25671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_021519	ATT	2	6	25683	25688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_021519	TTAA	2	8	25795	25802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_021519	AATT	2	8	25850	25857	50 %	50 %	0 %	0 %	513844355
572	NC_021519	AGC	2	6	25959	25964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844355
573	NC_021519	CGG	2	6	26080	26085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513844355
574	NC_021519	TCG	2	6	26117	26122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844355
575	NC_021519	TAT	2	6	26124	26129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844355
576	NC_021519	TTG	2	6	26167	26172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844355
577	NC_021519	CTT	2	6	26214	26219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844355
578	NC_021519	TTG	2	6	26263	26268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844355
579	NC_021519	CAT	2	6	26274	26279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844355
580	NC_021519	TTAA	2	8	26332	26339	50 %	50 %	0 %	0 %	513844355
581	NC_021519	CGT	2	6	26439	26444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844355
582	NC_021519	TGGC	2	8	26478	26485	0 %	25 %	50 %	25 %	513844355
583	NC_021519	GAAC	2	8	26609	26616	50 %	0 %	25 %	25 %	513844355
584	NC_021519	A	6	6	26642	26647	100 %	0 %	0 %	0 %	513844355
585	NC_021519	ATT	2	6	26740	26745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844355
586	NC_021519	CAAA	2	8	26754	26761	75 %	0 %	0 %	25 %	513844355
587	NC_021519	GCAA	2	8	26819	26826	50 %	0 %	25 %	25 %	513844355
588	NC_021519	CTT	2	6	26835	26840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844355
589	NC_021519	TCA	2	6	26847	26852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844355
590	NC_021519	GCT	2	6	27016	27021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844355
591	NC_021519	CTGG	2	8	27078	27085	0 %	25 %	50 %	25 %	513844355
592	NC_021519	GAC	2	6	27153	27158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844355
593	NC_021519	GAA	2	6	27169	27174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844355
594	NC_021519	A	6	6	27245	27250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_021519	CGAA	2	8	27328	27335	50 %	0 %	25 %	25 %	513844356
596	NC_021519	CAA	2	6	27408	27413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844356
597	NC_021519	A	6	6	27528	27533	100 %	0 %	0 %	0 %	513844356
598	NC_021519	CTA	2	6	27594	27599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844356
599	NC_021519	GA	3	6	27626	27631	50 %	0 %	50 %	0 %	513844356
600	NC_021519	ATG	2	6	27686	27691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844356
601	NC_021519	TTA	2	6	27767	27772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844356
602	NC_021519	ATCG	2	8	27779	27786	25 %	25 %	25 %	25 %	513844356
603	NC_021519	GAC	2	6	27826	27831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844356
604	NC_021519	ACTA	2	8	27850	27857	50 %	25 %	0 %	25 %	513844356
605	NC_021519	GTA	2	6	27996	28001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844356
606	NC_021519	ACG	3	9	28079	28087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844356
607	NC_021519	CAA	2	6	28211	28216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_021519	T	6	6	28223	28228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_021519	ATA	2	6	28230	28235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_021519	ATTTT	2	10	28246	28255	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_021519	GAT	2	6	28268	28273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_021519	ACGC	2	8	28298	28305	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
613	NC_021519	TG	3	6	28358	28363	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
614	NC_021519	AGA	2	6	28426	28431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_021519	AGT	2	6	28450	28455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844357
616	NC_021519	TA	3	6	28521	28526	50 %	50 %	0 %	0 %	513844357
617	NC_021519	TCTA	2	8	28543	28550	25 %	50 %	0 %	25 %	513844357
618	NC_021519	ATA	2	6	28577	28582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844357
619	NC_021519	ATT	2	6	28594	28599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844357
620	NC_021519	TA	3	6	28752	28757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_021519	TTGC	2	8	28768	28775	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
622	NC_021519	AGG	2	6	28823	28828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_021519	ATG	2	6	28834	28839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844358
624	NC_021519	CAAA	2	8	28840	28847	75 %	0 %	0 %	25 %	513844358
625	NC_021519	TG	3	6	28876	28881	0 %	50 %	50 %	0 %	513844358
626	NC_021519	TGAT	2	8	28934	28941	25 %	50 %	25 %	0 %	513844358
627	NC_021519	GTG	2	6	28943	28948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844358
628	NC_021519	CA	3	6	29031	29036	50 %	0 %	0 %	50 %	513844358
629	NC_021519	ATT	2	6	29071	29076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844358
630	NC_021519	AGT	2	6	29118	29123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844358
631	NC_021519	TTC	3	9	29125	29133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_021519	T	7	7	29144	29150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_021519	TC	3	6	29173	29178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
634	NC_021519	AGTA	2	8	29179	29186	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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785	NC_021519	AAT	2	6	36656	36661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
786	NC_021519	ATTT	2	8	36666	36673	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
787	NC_021519	ATA	2	6	36699	36704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
788	NC_021519	ATA	2	6	36711	36716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
789	NC_021519	GCCA	2	8	36860	36867	25 %	0 %	25 %	50 %	513844366
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795	NC_021519	T	7	7	37160	37166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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824	NC_021519	GCTA	2	8	38583	38590	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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832	NC_021519	A	6	6	38829	38834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
833	NC_021519	GAA	2	6	38872	38877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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