MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16F

Total Repeats: 1015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021518	AGT	2	6	23877	23882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843995
502	NC_021518	TCA	2	6	23894	23899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843995
503	NC_021518	A	8	8	23915	23922	100 %	0 %	0 %	0 %	513843995
504	NC_021518	TAGT	2	8	23932	23939	25 %	50 %	25 %	0 %	513843995
505	NC_021518	TCA	2	6	23951	23956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843995
506	NC_021518	T	7	7	23984	23990	0 %	100 %	0 %	0 %	513843995
507	NC_021518	CGC	2	6	24066	24071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513843995
508	NC_021518	GCT	2	6	24242	24247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843996
509	NC_021518	AGA	2	6	24253	24258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843996
510	NC_021518	AT	3	6	24310	24315	50 %	50 %	0 %	0 %	513843996
511	NC_021518	AAG	2	6	24471	24476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843996
512	NC_021518	CCGA	2	8	24521	24528	25 %	0 %	25 %	50 %	513843996
513	NC_021518	GAA	2	6	24530	24535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843996
514	NC_021518	TGA	2	6	24537	24542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843996
515	NC_021518	TCGC	2	8	24543	24550	0 %	25 %	25 %	50 %	513843996
516	NC_021518	A	6	6	24566	24571	100 %	0 %	0 %	0 %	513843996
517	NC_021518	T	8	8	24631	24638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021518	TTA	2	6	24650	24655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021518	TCCA	2	8	24669	24676	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
520	NC_021518	GAG	2	6	24723	24728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021518	GAA	3	9	24729	24737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021518	CAA	2	6	24750	24755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843997
523	NC_021518	ATG	2	6	24758	24763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843997
524	NC_021518	AGC	2	6	24767	24772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843997
525	NC_021518	A	7	7	24824	24830	100 %	0 %	0 %	0 %	513843997
526	NC_021518	A	6	6	24834	24839	100 %	0 %	0 %	0 %	513843997
527	NC_021518	A	6	6	24886	24891	100 %	0 %	0 %	0 %	513843997
528	NC_021518	TGA	2	6	25049	25054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843997
529	NC_021518	AAT	2	6	25135	25140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843997
530	NC_021518	ATC	2	6	25180	25185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843997
531	NC_021518	GAAA	2	8	25296	25303	75 %	0 %	25 %	0 %	513843997
532	NC_021518	AGA	2	6	25419	25424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843997
533	NC_021518	AAT	2	6	25426	25431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843997
534	NC_021518	TTC	2	6	25486	25491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843997
535	NC_021518	A	6	6	25532	25537	100 %	0 %	0 %	0 %	513843997
536	NC_021518	TGAA	2	8	25541	25548	50 %	25 %	25 %	0 %	513843997
537	NC_021518	A	6	6	25552	25557	100 %	0 %	0 %	0 %	513843997
538	NC_021518	GAA	2	6	25566	25571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843997
539	NC_021518	TGA	2	6	25580	25585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843997
540	NC_021518	TGA	2	6	25593	25598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843997
541	NC_021518	CGTT	2	8	25610	25617	0 %	50 %	25 %	25 %	513843997
542	NC_021518	TTG	2	6	25805	25810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843997
543	NC_021518	GCA	2	6	25902	25907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843997
544	NC_021518	ACG	2	6	26003	26008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843997
545	NC_021518	ACA	2	6	26039	26044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843997
546	NC_021518	ATT	2	6	26063	26068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843997
547	NC_021518	ATC	2	6	26071	26076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843997
548	NC_021518	CTT	2	6	26154	26159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843997
549	NC_021518	GAA	2	6	26175	26180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843997
550	NC_021518	GATG	2	8	26193	26200	25 %	25 %	50 %	0 %	513843997
551	NC_021518	GCA	2	6	26215	26220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843997
552	NC_021518	TGA	2	6	26301	26306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843997
553	NC_021518	TGA	2	6	26348	26353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843998
554	NC_021518	ATT	2	6	26366	26371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843998
555	NC_021518	CTG	2	6	26422	26427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843998
556	NC_021518	TTA	2	6	26489	26494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843998
557	NC_021518	GATC	2	8	26517	26524	25 %	25 %	25 %	25 %	513843998
558	NC_021518	TTC	2	6	26542	26547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843998
559	NC_021518	TCTTTA	2	12	26552	26563	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	513843998
560	NC_021518	TCT	2	6	26639	26644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843998
561	NC_021518	ATC	2	6	26719	26724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843998
562	NC_021518	CGG	2	6	26744	26749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513843998
563	NC_021518	TCG	2	6	26767	26772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843998
564	NC_021518	GCT	2	6	26797	26802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843998
565	NC_021518	TCT	2	6	26876	26881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843998
566	NC_021518	GAA	2	6	26883	26888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843998
567	NC_021518	AGA	2	6	26922	26927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843998
568	NC_021518	A	6	6	26932	26937	100 %	0 %	0 %	0 %	513843998
569	NC_021518	ACTTC	2	10	26954	26963	20 %	40 %	0 %	40 %	513843998
570	NC_021518	TGT	2	6	27081	27086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843998
571	NC_021518	TGC	2	6	27095	27100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843998
572	NC_021518	GAA	2	6	27106	27111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843998
573	NC_021518	CGA	2	6	27150	27155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843998
574	NC_021518	TCGTGG	2	12	27158	27169	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	513843998
575	NC_021518	GAA	2	6	27178	27183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843998
576	NC_021518	CAAA	2	8	27224	27231	75 %	0 %	0 %	25 %	513843998
577	NC_021518	TGA	2	6	27323	27328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843998
578	NC_021518	A	6	6	27352	27357	100 %	0 %	0 %	0 %	513843998
579	NC_021518	CTT	2	6	27483	27488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843998
580	NC_021518	GATC	2	8	27521	27528	25 %	25 %	25 %	25 %	513843998
581	NC_021518	GGC	3	9	27568	27576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513843998
582	NC_021518	CTT	2	6	27594	27599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843998
583	NC_021518	ATC	2	6	27760	27765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843998
584	NC_021518	ATC	2	6	27772	27777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843998
585	NC_021518	TCA	2	6	27794	27799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843998
586	NC_021518	CGAT	2	8	27836	27843	25 %	25 %	25 %	25 %	513843998
587	NC_021518	GCT	2	6	27880	27885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843998
588	NC_021518	GAA	2	6	27901	27906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843998
589	NC_021518	GCA	2	6	27911	27916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843998
590	NC_021518	ATAA	2	8	28024	28031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_021518	AAG	2	6	28067	28072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_021518	GAA	2	6	28124	28129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021518	GCT	2	6	28130	28135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_021518	T	6	6	28193	28198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_021518	TGG	2	6	28221	28226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_021518	TTC	2	6	28243	28248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_021518	T	6	6	28257	28262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_021518	CGA	2	6	28309	28314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_021518	TCA	2	6	28325	28330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_021518	ATC	2	6	28350	28355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_021518	TC	3	6	28390	28395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
602	NC_021518	CGAA	2	8	28417	28424	50 %	0 %	25 %	25 %	513843999
603	NC_021518	AGT	2	6	28523	28528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843999
604	NC_021518	A	7	7	28653	28659	100 %	0 %	0 %	0 %	513843999
605	NC_021518	TGA	2	6	28687	28692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843999
606	NC_021518	ACTA	2	8	28704	28711	50 %	25 %	0 %	25 %	513843999
607	NC_021518	T	8	8	28721	28728	0 %	100 %	0 %	0 %	513843999
608	NC_021518	TGA	2	6	28744	28749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843999
609	NC_021518	ACT	2	6	28761	28766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843999
610	NC_021518	GGTC	2	8	28778	28785	0 %	25 %	50 %	25 %	513843999
611	NC_021518	TGCT	2	8	28890	28897	0 %	50 %	25 %	25 %	513843999
612	NC_021518	CAT	2	6	28898	28903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843999
613	NC_021518	ATC	2	6	28923	28928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843999
614	NC_021518	CCT	2	6	28981	28986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_021518	TTGT	2	8	28991	28998	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
616	NC_021518	AAC	2	6	29015	29020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844000
617	NC_021518	CCCG	2	8	29035	29042	0 %	0 %	25 %	75 %	513844000
618	NC_021518	AGG	2	6	29058	29063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	513844000
619	NC_021518	CTG	2	6	29115	29120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844000
620	NC_021518	T	7	7	29135	29141	0 %	100 %	0 %	0 %	513844000
621	NC_021518	CTT	2	6	29147	29152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844000
622	NC_021518	TCA	2	6	29169	29174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844000
623	NC_021518	TTC	2	6	29210	29215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844000
624	NC_021518	TTC	2	6	29222	29227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844000
625	NC_021518	CTTG	2	8	29283	29290	0 %	50 %	25 %	25 %	513844000
626	NC_021518	TGTT	2	8	29310	29317	0 %	75 %	25 %	0 %	513844000
627	NC_021518	CTTT	2	8	29336	29343	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
628	NC_021518	TTTAG	2	10	29352	29361	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
629	NC_021518	C	6	6	29417	29422	0 %	0 %	0 %	100 %	513844001
630	NC_021518	TGC	2	6	29502	29507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844001
631	NC_021518	TAA	2	6	29598	29603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844001
632	NC_021518	TGT	2	6	29661	29666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844001
633	NC_021518	TTTG	2	8	29692	29699	0 %	75 %	25 %	0 %	513844001
634	NC_021518	CAT	2	6	29752	29757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844001
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638	NC_021518	TGT	2	6	30010	30015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844001
639	NC_021518	CTG	2	6	30200	30205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844001
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641	NC_021518	AAT	2	6	30249	30254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844001
642	NC_021518	TAA	2	6	30263	30268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844001
643	NC_021518	CGT	2	6	30354	30359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844001
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650	NC_021518	CTT	2	6	30714	30719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844001
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652	NC_021518	TCT	2	6	30746	30751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844001
653	NC_021518	ATCCG	2	10	30831	30840	20 %	20 %	20 %	40 %	513844001
654	NC_021518	T	7	7	30846	30852	0 %	100 %	0 %	0 %	513844001
655	NC_021518	GCC	2	6	30889	30894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513844001
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664	NC_021518	TCTT	2	8	31239	31246	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
665	NC_021518	T	6	6	31296	31301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
666	NC_021518	CTT	2	6	31357	31362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
667	NC_021518	ATC	2	6	31364	31369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
668	NC_021518	AAT	2	6	31371	31376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
669	NC_021518	CAC	2	6	31381	31386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
670	NC_021518	TGT	2	6	31505	31510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
671	NC_021518	ATT	2	6	31705	31710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
672	NC_021518	TGGA	2	8	31722	31729	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
673	NC_021518	AAG	2	6	31760	31765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844002
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675	NC_021518	A	7	7	31802	31808	100 %	0 %	0 %	0 %	513844002
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685	NC_021518	T	6	6	32272	32277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
686	NC_021518	CAA	2	6	32391	32396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844004
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690	NC_021518	TAT	2	6	32666	32671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
691	NC_021518	CTG	2	6	32704	32709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
692	NC_021518	ACG	2	6	32722	32727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
693	NC_021518	CATGC	2	10	32853	32862	20 %	20 %	20 %	40 %	513844005
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702	NC_021518	TCAC	2	8	33417	33424	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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710	NC_021518	TTC	2	6	34268	34273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844006
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712	NC_021518	GTTA	2	8	34351	34358	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
713	NC_021518	AAAAG	2	10	34378	34387	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
714	NC_021518	T	6	6	34469	34474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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727	NC_021518	TCG	2	6	35264	35269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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729	NC_021518	TAA	2	6	35298	35303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
730	NC_021518	TAG	2	6	35347	35352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
731	NC_021518	AGA	2	6	35432	35437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
732	NC_021518	GCTAA	2	10	35528	35537	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
733	NC_021518	TCA	2	6	35538	35543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844008
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750	NC_021518	AGT	2	6	36462	36467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
751	NC_021518	ATT	2	6	36475	36480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
752	NC_021518	CTT	2	6	36507	36512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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757	NC_021518	AGT	2	6	36761	36766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844011
758	NC_021518	ACC	2	6	36836	36841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
759	NC_021518	ATG	2	6	36851	36856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
760	NC_021518	ATT	2	6	36894	36899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844012
761	NC_021518	T	7	7	36952	36958	0 %	100 %	0 %	0 %	513844012
762	NC_021518	TCA	2	6	36983	36988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844012
763	NC_021518	TTC	2	6	36997	37002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844012
764	NC_021518	ATA	4	12	37015	37026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844012
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768	NC_021518	TTC	2	6	37321	37326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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770	NC_021518	ATA	2	6	37394	37399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
771	NC_021518	TCA	2	6	37453	37458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
772	NC_021518	A	6	6	37523	37528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
773	NC_021518	T	6	6	37554	37559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
774	NC_021518	GGC	2	6	37586	37591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
775	NC_021518	T	6	6	37639	37644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
776	NC_021518	AAAG	2	8	37663	37670	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
777	NC_021518	TAC	2	6	37848	37853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844013
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784	NC_021518	T	7	7	38016	38022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
785	NC_021518	TTGAC	2	10	38032	38041	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
786	NC_021518	CTA	2	6	38141	38146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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791	NC_021518	A	6	6	38254	38259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
792	NC_021518	TAG	2	6	38265	38270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
793	NC_021518	TGA	2	6	38275	38280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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795	NC_021518	ACC	2	6	38342	38347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
796	NC_021518	CAC	2	6	38376	38381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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802	NC_021518	T	6	6	38582	38587	0 %	100 %	0 %	0 %	513844014
803	NC_021518	CTT	2	6	38596	38601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844014
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810	NC_021518	TA	3	6	38916	38921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
811	NC_021518	GTT	2	6	38997	39002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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853	NC_021518	T	6	6	41189	41194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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891	NC_021518	AAAC	2	8	43833	43840	75 %	0 %	0 %	25 %	513844020
892	NC_021518	CAA	2	6	43929	43934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844020
893	NC_021518	GAC	2	6	43952	43957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844020
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