MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16E

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021517	ACTT	2	8	95	102	25 %	50 %	0 %	25 %	513843591
2	NC_021517	ATTA	2	8	1091	1098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021517	TAAT	2	8	1332	1339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021517	GTGG	2	8	1789	1796	0 %	25 %	75 %	0 %	513843592
5	NC_021517	AAAC	2	8	2099	2106	75 %	0 %	0 %	25 %	513843592
6	NC_021517	TATT	2	8	2268	2275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021517	CTTA	2	8	2617	2624	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021517	TATT	2	8	2747	2754	25 %	75 %	0 %	0 %	513843593
9	NC_021517	TTGC	2	8	3801	3808	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021517	AATC	2	8	4934	4941	50 %	25 %	0 %	25 %	513843596
11	NC_021517	AAAG	2	8	5254	5261	75 %	0 %	25 %	0 %	513843596
12	NC_021517	TGAG	2	8	6113	6120	25 %	25 %	50 %	0 %	513843598
13	NC_021517	ACTC	2	8	6199	6206	25 %	25 %	0 %	50 %	513843598
14	NC_021517	TCAA	2	8	6530	6537	50 %	25 %	0 %	25 %	513843599
15	NC_021517	CTTT	2	8	6659	6666	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021517	ATGA	2	8	6759	6766	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021517	TGAT	2	8	7087	7094	25 %	50 %	25 %	0 %	513843601
18	NC_021517	CTGA	2	8	7181	7188	25 %	25 %	25 %	25 %	513843601
19	NC_021517	TTGA	2	8	7246	7253	25 %	50 %	25 %	0 %	513843601
20	NC_021517	AAAG	2	8	7786	7793	75 %	0 %	25 %	0 %	513843602
21	NC_021517	AGAA	2	8	7866	7873	75 %	0 %	25 %	0 %	513843602
22	NC_021517	GCAA	2	8	8052	8059	50 %	0 %	25 %	25 %	513843602
23	NC_021517	TGGT	2	8	8099	8106	0 %	50 %	50 %	0 %	513843602
24	NC_021517	AGTT	2	8	8817	8824	25 %	50 %	25 %	0 %	513843602
25	NC_021517	CAAA	2	8	9334	9341	75 %	0 %	0 %	25 %	513843602
26	NC_021517	AAGC	2	8	9395	9402	50 %	0 %	25 %	25 %	513843602
27	NC_021517	ATTA	2	8	9425	9432	50 %	50 %	0 %	0 %	513843602
28	NC_021517	CGGG	2	8	9993	10000	0 %	0 %	75 %	25 %	513843603
29	NC_021517	ACTT	2	8	10459	10466	25 %	50 %	0 %	25 %	513843604
30	NC_021517	GGCA	2	8	10584	10591	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021517	GCTA	2	8	10695	10702	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021517	GGCT	2	8	11225	11232	0 %	25 %	50 %	25 %	513843605
33	NC_021517	TGAC	2	8	11668	11675	25 %	25 %	25 %	25 %	513843606
34	NC_021517	ACGT	2	8	11739	11746	25 %	25 %	25 %	25 %	513843606
35	NC_021517	GGCC	2	8	12446	12453	0 %	0 %	50 %	50 %	513843606
36	NC_021517	CAAG	2	8	12908	12915	50 %	0 %	25 %	25 %	513843606
37	NC_021517	GCAA	2	8	13880	13887	50 %	0 %	25 %	25 %	513843606
38	NC_021517	ACCG	2	8	14192	14199	25 %	0 %	25 %	50 %	513843606
39	NC_021517	TTGG	2	8	14472	14479	0 %	50 %	50 %	0 %	513843606
40	NC_021517	GACC	2	8	14681	14688	25 %	0 %	25 %	50 %	513843606
41	NC_021517	ACGG	2	8	14892	14899	25 %	0 %	50 %	25 %	513843606
42	NC_021517	CTGG	2	8	14925	14932	0 %	25 %	50 %	25 %	513843606
43	NC_021517	CAGG	2	8	15270	15277	25 %	0 %	50 %	25 %	513843606
44	NC_021517	CAGG	2	8	15501	15508	25 %	0 %	50 %	25 %	513843606
45	NC_021517	CTGG	2	8	15636	15643	0 %	25 %	50 %	25 %	513843606
46	NC_021517	GGCA	2	8	15874	15881	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021517	ACTT	2	8	16421	16428	25 %	50 %	0 %	25 %	513843607
48	NC_021517	TTAG	2	8	16646	16653	25 %	50 %	25 %	0 %	513843608
49	NC_021517	CGAT	2	8	16718	16725	25 %	25 %	25 %	25 %	513843608
50	NC_021517	GATT	2	8	16847	16854	25 %	50 %	25 %	0 %	513843608
51	NC_021517	TTCG	2	8	17226	17233	0 %	50 %	25 %	25 %	513843608
52	NC_021517	GATA	2	8	17486	17493	50 %	25 %	25 %	0 %	513843609
53	NC_021517	ATGA	2	8	17711	17718	50 %	25 %	25 %	0 %	513843610
54	NC_021517	ACTT	2	8	18203	18210	25 %	50 %	0 %	25 %	513843610
55	NC_021517	TTGA	2	8	18704	18711	25 %	50 %	25 %	0 %	513843610
56	NC_021517	AGTT	2	8	18886	18893	25 %	50 %	25 %	0 %	513843610
57	NC_021517	TTTA	2	8	18964	18971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021517	CAAA	2	8	19093	19100	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_021517	TATT	2	8	19447	19454	25 %	75 %	0 %	0 %	513843611
60	NC_021517	ATAG	2	8	19479	19486	50 %	25 %	25 %	0 %	513843611
61	NC_021517	AGGT	2	8	19684	19691	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021517	GCCA	2	8	19818	19825	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021517	TTTG	2	8	19974	19981	0 %	75 %	25 %	0 %	513843612
64	NC_021517	GAAA	2	8	20012	20019	75 %	0 %	25 %	0 %	513843612
65	NC_021517	AGAA	2	8	20029	20036	75 %	0 %	25 %	0 %	513843612
66	NC_021517	TCAG	2	8	20102	20109	25 %	25 %	25 %	25 %	513843612
67	NC_021517	TCAA	2	8	20248	20255	50 %	25 %	0 %	25 %	513843612
68	NC_021517	GGCC	2	8	20403	20410	0 %	0 %	50 %	50 %	513843612
69	NC_021517	ATTG	2	8	20472	20479	25 %	50 %	25 %	0 %	513843612
70	NC_021517	CTAT	2	8	20819	20826	25 %	50 %	0 %	25 %	513843612
71	NC_021517	TTAA	2	8	20958	20965	50 %	50 %	0 %	0 %	513843612
72	NC_021517	GAGC	2	8	21090	21097	25 %	0 %	50 %	25 %	513843612
73	NC_021517	GTTT	2	8	21192	21199	0 %	75 %	25 %	0 %	513843613
74	NC_021517	TATT	2	8	21824	21831	25 %	75 %	0 %	0 %	513843614
75	NC_021517	AATT	2	8	22333	22340	50 %	50 %	0 %	0 %	513843615
76	NC_021517	TTCA	2	8	22491	22498	25 %	50 %	0 %	25 %	513843615
77	NC_021517	AATC	2	8	22571	22578	50 %	25 %	0 %	25 %	513843615
78	NC_021517	ATTA	2	8	23034	23041	50 %	50 %	0 %	0 %	513843615
79	NC_021517	TTAT	2	8	23048	23055	25 %	75 %	0 %	0 %	513843615
80	NC_021517	GAAT	2	8	23369	23376	50 %	25 %	25 %	0 %	513843615
81	NC_021517	CCTA	2	8	23500	23507	25 %	25 %	0 %	50 %	513843615
82	NC_021517	AAAT	2	8	23882	23889	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021517	TTCC	2	8	25091	25098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021517	GATA	2	8	25342	25349	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021517	CAAT	2	8	25683	25690	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_021517	AACG	2	8	25704	25711	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021517	ATTA	2	8	25760	25767	50 %	50 %	0 %	0 %	513843620
88	NC_021517	AGAA	2	8	26066	26073	75 %	0 %	25 %	0 %	513843620
89	NC_021517	TTGT	2	8	26102	26109	0 %	75 %	25 %	0 %	513843620
90	NC_021517	AACT	2	8	26329	26336	50 %	25 %	0 %	25 %	513843620
91	NC_021517	ACCA	2	8	26771	26778	50 %	0 %	0 %	50 %	513843621
92	NC_021517	AACT	2	8	27065	27072	50 %	25 %	0 %	25 %	513843621
93	NC_021517	TGAT	2	8	27095	27102	25 %	50 %	25 %	0 %	513843621
94	NC_021517	TTTG	2	8	27157	27164	0 %	75 %	25 %	0 %	513843621
95	NC_021517	AGCA	2	8	27458	27465	50 %	0 %	25 %	25 %	513843621
96	NC_021517	GTTG	2	8	28579	28586	0 %	50 %	50 %	0 %	513843622
97	NC_021517	AACG	2	8	29173	29180	50 %	0 %	25 %	25 %	513843622
98	NC_021517	AATC	2	8	29183	29190	50 %	25 %	0 %	25 %	513843622
99	NC_021517	ATGA	2	8	29314	29321	50 %	25 %	25 %	0 %	513843623
100	NC_021517	TTCG	2	8	29670	29677	0 %	50 %	25 %	25 %	513843623
101	NC_021517	AGCG	2	8	29925	29932	25 %	0 %	50 %	25 %	513843623
102	NC_021517	TGTT	2	8	31147	31154	0 %	75 %	25 %	0 %	513843623
103	NC_021517	CGAT	2	8	31160	31167	25 %	25 %	25 %	25 %	513843623
104	NC_021517	TCTT	2	8	32089	32096	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_021517	TTGA	2	8	32687	32694	25 %	50 %	25 %	0 %	513843624
106	NC_021517	TTAA	2	8	32708	32715	50 %	50 %	0 %	0 %	513843624
107	NC_021517	AACT	2	8	32941	32948	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_021517	TGAT	2	8	32966	32973	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021517	AATT	2	8	34224	34231	50 %	50 %	0 %	0 %	513843626
110	NC_021517	TGAT	2	8	35044	35051	25 %	50 %	25 %	0 %	513843627
111	NC_021517	CAAC	2	8	35113	35120	50 %	0 %	0 %	50 %	513843627
112	NC_021517	AATG	2	8	35928	35935	50 %	25 %	25 %	0 %	513843627
113	NC_021517	CATG	2	8	35941	35948	25 %	25 %	25 %	25 %	513843627
114	NC_021517	CTAA	2	8	36034	36041	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_021517	TTGG	2	8	36149	36156	0 %	50 %	50 %	0 %	513843628
116	NC_021517	TACC	2	8	36587	36594	25 %	25 %	0 %	50 %	513843628
117	NC_021517	GCTA	2	8	36843	36850	25 %	25 %	25 %	25 %	513843628
118	NC_021517	AGTC	2	8	37149	37156	25 %	25 %	25 %	25 %	513843629
119	NC_021517	GGAA	2	8	37245	37252	50 %	0 %	50 %	0 %	513843629
120	NC_021517	ACCT	2	8	37580	37587	25 %	25 %	0 %	50 %	513843629
121	NC_021517	TGGA	2	8	37652	37659	25 %	25 %	50 %	0 %	513843629
122	NC_021517	TCCC	2	8	37978	37985	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
123	NC_021517	AGGA	2	8	37998	38005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021517	TCAA	2	8	38250	38257	50 %	25 %	0 %	25 %	513843630
125	NC_021517	TGGT	2	8	38609	38616	0 %	50 %	50 %	0 %	513843630
126	NC_021517	AACA	2	8	38787	38794	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_021517	TAAG	2	8	39102	39109	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021517	TAAT	2	8	39378	39385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021517	ATTT	2	8	39431	39438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021517	ATGA	2	8	39750	39757	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.