MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16A

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021515	ATG	2	6	4	9	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021515	GGT	2	6	106	111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021515	TAG	2	6	140	145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021515	TCC	2	6	156	161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_021515	AGG	2	6	192	197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021515	AGT	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021515	CTT	2	6	313	318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021515	ATC	2	6	336	341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021515	ATT	2	6	357	362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021515	TAA	2	6	472	477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842866
11	NC_021515	GGT	2	6	561	566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513842866
12	NC_021515	TGC	2	6	577	582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513842866
13	NC_021515	ACA	2	6	628	633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513842866
14	NC_021515	ATT	2	6	655	660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842866
15	NC_021515	TTA	2	6	742	747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842866
16	NC_021515	TTC	2	6	796	801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842866
17	NC_021515	TTA	2	6	851	856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842866
18	NC_021515	AAG	2	6	876	881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513842866
19	NC_021515	TCA	2	6	883	888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842866
20	NC_021515	AGG	2	6	906	911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	513842866
21	NC_021515	ACC	2	6	924	929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513842866
22	NC_021515	AGA	2	6	939	944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513842866
23	NC_021515	CTT	2	6	974	979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842866
24	NC_021515	TTA	2	6	1052	1057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842866
25	NC_021515	TAT	2	6	1062	1067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842866
26	NC_021515	ATC	2	6	1116	1121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842866
27	NC_021515	AAT	2	6	1192	1197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842866
28	NC_021515	TGG	2	6	1290	1295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513842866
29	NC_021515	TAA	2	6	1609	1614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842866
30	NC_021515	AAG	2	6	1894	1899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513842866
31	NC_021515	ATC	2	6	1996	2001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021515	CTT	2	6	2168	2173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021515	CAA	2	6	2238	2243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021515	CCA	2	6	2476	2481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_021515	TTG	2	6	2575	2580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021515	TTG	2	6	2614	2619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021515	ATT	2	6	2695	2700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021515	TAA	2	6	2778	2783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021515	TTG	2	6	2841	2846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021515	TCA	2	6	2894	2899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021515	CTT	2	6	2959	2964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842867
42	NC_021515	TTC	2	6	3269	3274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842867
43	NC_021515	TCT	2	6	3357	3362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842867
44	NC_021515	GTT	2	6	3384	3389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513842867
45	NC_021515	ATT	2	6	3482	3487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842867
46	NC_021515	AAG	2	6	3488	3493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513842867
47	NC_021515	CAA	2	6	3547	3552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513842867
48	NC_021515	TAC	2	6	3601	3606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842867
49	NC_021515	ATC	2	6	3653	3658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842867
50	NC_021515	ATT	2	6	3668	3673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842867
51	NC_021515	GTT	2	6	3706	3711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513842867
52	NC_021515	TAT	2	6	3871	3876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021515	CAC	2	6	4101	4106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_021515	CAG	2	6	4421	4426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021515	CAA	2	6	4448	4453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021515	TAA	2	6	4598	4603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021515	TCT	2	6	4606	4611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021515	TCA	2	6	4666	4671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021515	TCA	2	6	4735	4740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021515	AAT	2	6	4791	4796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021515	CAA	2	6	4991	4996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021515	AGA	2	6	5023	5028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021515	TTA	2	6	5221	5226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021515	TGA	2	6	5337	5342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021515	AAT	2	6	5394	5399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021515	TTG	2	6	5429	5434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021515	ATC	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021515	TGA	2	6	5826	5831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021515	GCA	2	6	5995	6000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021515	GTT	2	6	6053	6058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021515	TTG	2	6	6116	6121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021515	GGT	2	6	6191	6196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021515	AAG	2	6	6367	6372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021515	TTG	2	6	6439	6444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021515	GAT	3	9	6450	6458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021515	TAT	2	6	6553	6558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021515	TGA	2	6	6559	6564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021515	AGC	2	6	6571	6576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021515	CAA	3	9	6596	6604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021515	TGG	2	6	6717	6722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021515	TCT	2	6	7048	7053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021515	TAT	2	6	7063	7068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021515	TGT	2	6	7113	7118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.