MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI06

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021498	ATC	2	6	50	55	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595902
2	NC_021498	ATA	2	6	294	299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595903
3	NC_021498	GAT	2	6	646	651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595905
4	NC_021498	ATC	2	6	686	691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595905
5	NC_021498	AGT	2	6	692	697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595905
6	NC_021498	ATT	2	6	728	733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595905
7	NC_021498	CAT	2	6	970	975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595905
8	NC_021498	ATT	2	6	1041	1046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595905
9	NC_021498	TCA	2	6	1092	1097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595905
10	NC_021498	AAT	2	6	1144	1149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595905
11	NC_021498	TAA	2	6	1217	1222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595905
12	NC_021498	ATC	2	6	1235	1240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021498	TCA	2	6	1254	1259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021498	TCC	2	6	1293	1298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_021498	AAC	2	6	1366	1371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021498	GTT	2	6	1403	1408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021498	TTA	2	6	1567	1572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021498	TTA	2	6	1654	1659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021498	TGG	2	6	1935	1940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512595906
20	NC_021498	GAT	2	6	1997	2002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595906
21	NC_021498	TTG	2	6	2039	2044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595906
22	NC_021498	TCA	2	6	2047	2052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595906
23	NC_021498	TGT	2	6	2085	2090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595906
24	NC_021498	TTC	2	6	2123	2128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595906
25	NC_021498	TTC	2	6	2136	2141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595906
26	NC_021498	AAT	2	6	2150	2155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595906
27	NC_021498	CTT	3	9	2267	2275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595906
28	NC_021498	GTA	2	6	2419	2424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595906
29	NC_021498	ATT	2	6	2570	2575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595906
30	NC_021498	CCA	2	6	2587	2592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512595906
31	NC_021498	TTA	2	6	2619	2624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595906
32	NC_021498	CAC	2	6	2734	2739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512595906
33	NC_021498	TCG	2	6	2742	2747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512595906
34	NC_021498	CTT	2	6	2846	2851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595906
35	NC_021498	CTT	2	6	3062	3067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595906
36	NC_021498	ACC	2	6	3111	3116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512595906
37	NC_021498	ATC	2	6	3138	3143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595906
38	NC_021498	TCA	2	6	3301	3306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595906
39	NC_021498	TAA	2	6	3329	3334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021498	AAG	2	6	3341	3346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021498	TAT	2	6	3760	3765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021498	AAT	2	6	3773	3778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021498	CGG	2	6	3825	3830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021498	AAG	2	6	3835	3840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021498	TCT	2	6	3849	3854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021498	ATT	2	6	3866	3871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021498	ACA	2	6	3941	3946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021498	TGG	2	6	4047	4052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512595907
49	NC_021498	CAT	2	6	4124	4129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595907
50	NC_021498	TCA	2	6	4181	4186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595908
51	NC_021498	TCA	3	9	4190	4198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595908
52	NC_021498	TCG	2	6	4208	4213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512595908
53	NC_021498	GAT	2	6	4218	4223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595908
54	NC_021498	CAT	2	6	4233	4238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595908
55	NC_021498	TTG	2	6	4305	4310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595908
56	NC_021498	AAG	2	6	4407	4412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512595908
57	NC_021498	TGA	2	6	4495	4500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595908
58	NC_021498	CAT	3	9	4512	4520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595908
59	NC_021498	CTT	2	6	4522	4527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595908
60	NC_021498	TCA	2	6	4562	4567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595908
61	NC_021498	CAT	2	6	4575	4580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595908
62	NC_021498	GTG	2	6	4685	4690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512595908
63	NC_021498	TCT	2	6	4718	4723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595908
64	NC_021498	CTA	2	6	4731	4736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595908
65	NC_021498	TTA	2	6	4940	4945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595908
66	NC_021498	ATA	2	6	4989	4994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595908
67	NC_021498	TCA	3	9	5018	5026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595908
68	NC_021498	ACC	2	6	5050	5055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512595908
69	NC_021498	ATA	2	6	5081	5086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595908
70	NC_021498	TAT	2	6	5106	5111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595908
71	NC_021498	AAT	2	6	5115	5120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595908
72	NC_021498	TTA	2	6	5177	5182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595908
73	NC_021498	TTC	2	6	5207	5212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595908
74	NC_021498	GTC	2	6	5320	5325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512595908
75	NC_021498	ATT	2	6	5335	5340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595908
76	NC_021498	TTG	2	6	5382	5387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595908
77	NC_021498	TTA	2	6	5501	5506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595908
78	NC_021498	AAT	2	6	5511	5516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595908
79	NC_021498	GAA	2	6	5555	5560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512595908
80	NC_021498	TTA	2	6	5562	5567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595908
81	NC_021498	TAA	2	6	5739	5744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595908
82	NC_021498	TAC	2	6	5766	5771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595908
83	NC_021498	CAA	2	6	5772	5777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512595908
84	NC_021498	ACT	2	6	5842	5847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595908
85	NC_021498	CAG	2	6	5982	5987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512595908
86	NC_021498	TAC	2	6	5991	5996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595908
87	NC_021498	TTG	2	6	6012	6017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595908
88	NC_021498	ACA	2	6	6029	6034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512595908
89	NC_021498	CAG	2	6	6296	6301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512595909
90	NC_021498	TTA	2	6	6319	6324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595909
91	NC_021498	CTA	2	6	6372	6377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595909
92	NC_021498	ATA	3	9	6379	6387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595909
93	NC_021498	TAA	2	6	6398	6403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595909
94	NC_021498	TAA	2	6	6468	6473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.