MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI03

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021496	TC	3	6	1611	1616	0 %	50 %	0 %	50 %	512594169
2	NC_021496	AT	3	6	2583	2588	50 %	50 %	0 %	0 %	512594172
3	NC_021496	TG	3	6	2794	2799	0 %	50 %	50 %	0 %	512594172
4	NC_021496	TG	3	6	3791	3796	0 %	50 %	50 %	0 %	512594176
5	NC_021496	AT	3	6	4158	4163	50 %	50 %	0 %	0 %	512594177
6	NC_021496	AT	3	6	4365	4370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021496	TC	3	6	4435	4440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021496	TA	3	6	4445	4450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021496	TG	3	6	5324	5329	0 %	50 %	50 %	0 %	512594178
10	NC_021496	TA	3	6	7106	7111	50 %	50 %	0 %	0 %	512594180
11	NC_021496	GT	3	6	8040	8045	0 %	50 %	50 %	0 %	512594182
12	NC_021496	AT	3	6	10614	10619	50 %	50 %	0 %	0 %	512594187
13	NC_021496	AT	3	6	11443	11448	50 %	50 %	0 %	0 %	512594190
14	NC_021496	TA	3	6	11563	11568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021496	GT	3	6	13364	13369	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021496	CA	3	6	13528	13533	50 %	0 %	0 %	50 %	512594194
17	NC_021496	GA	3	6	14821	14826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021496	TA	3	6	14954	14959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021496	TA	3	6	14979	14984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021496	AT	3	6	16035	16040	50 %	50 %	0 %	0 %	512594195
21	NC_021496	TG	3	6	16206	16211	0 %	50 %	50 %	0 %	512594195
22	NC_021496	AC	3	6	17121	17126	50 %	0 %	0 %	50 %	512594197
23	NC_021496	AT	3	6	17653	17658	50 %	50 %	0 %	0 %	512594198
24	NC_021496	GT	3	6	19378	19383	0 %	50 %	50 %	0 %	512594203
25	NC_021496	AT	3	6	19705	19710	50 %	50 %	0 %	0 %	512594203
26	NC_021496	AT	3	6	20698	20703	50 %	50 %	0 %	0 %	512594203
27	NC_021496	AT	3	6	21338	21343	50 %	50 %	0 %	0 %	512594203
28	NC_021496	TA	3	6	23866	23871	50 %	50 %	0 %	0 %	512594204
29	NC_021496	AT	3	6	24237	24242	50 %	50 %	0 %	0 %	512594204
30	NC_021496	AT	3	6	24760	24765	50 %	50 %	0 %	0 %	512594204
31	NC_021496	AT	3	6	25370	25375	50 %	50 %	0 %	0 %	512594205
32	NC_021496	CA	3	6	26189	26194	50 %	0 %	0 %	50 %	512594205
33	NC_021496	GA	3	6	31103	31108	50 %	0 %	50 %	0 %	512594207
34	NC_021496	TG	3	6	39265	39270	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021496	TC	3	6	39373	39378	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_021496	GT	3	6	39801	39806	0 %	50 %	50 %	0 %	512594218
37	NC_021496	AC	3	6	39986	39991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.