MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI03

Total Repeats: 822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021496	TCG	2	6	24075	24080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512594204
502	NC_021496	GAA	2	6	24086	24091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512594204
503	NC_021496	TCA	2	6	24102	24107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594204
504	NC_021496	TTC	2	6	24138	24143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594204
505	NC_021496	AT	3	6	24237	24242	50 %	50 %	0 %	0 %	512594204
506	NC_021496	GTT	2	6	24248	24253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512594204
507	NC_021496	ATG	2	6	24289	24294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512594204
508	NC_021496	ATT	2	6	24338	24343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512594204
509	NC_021496	GAT	2	6	24363	24368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512594204
510	NC_021496	TAG	2	6	24397	24402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512594204
511	NC_021496	ATC	2	6	24557	24562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594204
512	NC_021496	TAG	2	6	24565	24570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512594204
513	NC_021496	CAA	2	6	24634	24639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512594204
514	NC_021496	CCAG	2	8	24659	24666	25 %	0 %	25 %	50 %	512594204
515	NC_021496	ACT	2	6	24674	24679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594204
516	NC_021496	AT	3	6	24760	24765	50 %	50 %	0 %	0 %	512594204
517	NC_021496	ACC	2	6	24770	24775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512594204
518	NC_021496	TAA	2	6	24786	24791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512594204
519	NC_021496	ATCA	2	8	24797	24804	50 %	25 %	0 %	25 %	512594204
520	NC_021496	TTG	2	6	24889	24894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512594204
521	NC_021496	AAG	2	6	25015	25020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512594204
522	NC_021496	TGT	2	6	25064	25069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512594204
523	NC_021496	TCT	2	6	25107	25112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594204
524	NC_021496	TGCC	2	8	25211	25218	0 %	25 %	25 %	50 %	512594204
525	NC_021496	CCT	2	6	25312	25317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512594205
526	NC_021496	AT	3	6	25370	25375	50 %	50 %	0 %	0 %	512594205
527	NC_021496	ATTC	2	8	25381	25388	25 %	50 %	0 %	25 %	512594205
528	NC_021496	CCAAG	2	10	25409	25418	40 %	0 %	20 %	40 %	512594205
529	NC_021496	TAG	2	6	25420	25425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512594205
530	NC_021496	ATC	2	6	25463	25468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594205
531	NC_021496	TCA	2	6	25515	25520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594205
532	NC_021496	TGGTT	2	10	25525	25534	0 %	60 %	40 %	0 %	512594205
533	NC_021496	AAT	2	6	25568	25573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512594205
534	NC_021496	ATG	2	6	25634	25639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512594205
535	NC_021496	AATC	2	8	25663	25670	50 %	25 %	0 %	25 %	512594205
536	NC_021496	TAGG	2	8	25675	25682	25 %	25 %	50 %	0 %	512594205
537	NC_021496	TCA	2	6	25717	25722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594205
538	NC_021496	TCA	2	6	25725	25730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594205
539	NC_021496	GAA	2	6	25898	25903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512594205
540	NC_021496	AGT	2	6	26030	26035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512594205
541	NC_021496	GTT	2	6	26043	26048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512594205
542	NC_021496	ATC	3	9	26063	26071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594205
543	NC_021496	CAA	2	6	26164	26169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512594205
544	NC_021496	CA	3	6	26189	26194	50 %	0 %	0 %	50 %	512594205
545	NC_021496	CCT	2	6	26201	26206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512594206
546	NC_021496	TTGAGC	2	12	26224	26235	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512594206
547	NC_021496	GTT	2	6	26278	26283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512594206
548	NC_021496	TAA	2	6	26322	26327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512594206
549	NC_021496	TGC	2	6	26347	26352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512594206
550	NC_021496	ACT	2	6	26393	26398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594206
551	NC_021496	TAA	2	6	26426	26431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512594206
552	NC_021496	ACT	2	6	26435	26440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594206
553	NC_021496	GATG	2	8	26518	26525	25 %	25 %	50 %	0 %	512594206
554	NC_021496	AGT	2	6	26527	26532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512594206
555	NC_021496	ACC	2	6	26539	26544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512594206
556	NC_021496	AGCA	2	8	26623	26630	50 %	0 %	25 %	25 %	512594206
557	NC_021496	CCT	2	6	26777	26782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512594206
558	NC_021496	TCTG	2	8	26786	26793	0 %	50 %	25 %	25 %	512594206
559	NC_021496	AAC	2	6	26863	26868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512594206
560	NC_021496	ATC	2	6	26908	26913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594206
561	NC_021496	T	7	7	26920	26926	0 %	100 %	0 %	0 %	512594206
562	NC_021496	ACC	2	6	26977	26982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512594206
563	NC_021496	AGTG	2	8	27024	27031	25 %	25 %	50 %	0 %	512594206
564	NC_021496	TCT	2	6	27071	27076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594206
565	NC_021496	TCCAT	2	10	27100	27109	20 %	40 %	0 %	40 %	512594206
566	NC_021496	AAG	2	6	27119	27124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512594206
567	NC_021496	ATC	2	6	27164	27169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594206
568	NC_021496	TGA	2	6	27179	27184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512594206
569	NC_021496	CAT	2	6	27312	27317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594206
570	NC_021496	GAAA	2	8	27376	27383	75 %	0 %	25 %	0 %	512594206
571	NC_021496	CCA	2	6	27404	27409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512594206
572	NC_021496	ATT	2	6	27478	27483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512594206
573	NC_021496	AAC	2	6	27529	27534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512594206
574	NC_021496	TCC	2	6	27569	27574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512594206
575	NC_021496	GCC	2	6	27586	27591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512594206
576	NC_021496	GTTTA	2	10	27604	27613	20 %	60 %	20 %	0 %	512594206
577	NC_021496	CAC	2	6	27711	27716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512594206
578	NC_021496	CAT	2	6	27774	27779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594206
579	NC_021496	TTGC	2	8	27783	27790	0 %	50 %	25 %	25 %	512594206
580	NC_021496	ATT	2	6	27832	27837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512594206
581	NC_021496	TGT	2	6	27971	27976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512594206
582	NC_021496	ATTG	2	8	27996	28003	25 %	50 %	25 %	0 %	512594206
583	NC_021496	GCG	2	6	28030	28035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512594206
584	NC_021496	TGCAG	2	10	28052	28061	20 %	20 %	40 %	20 %	512594206
585	NC_021496	TTGAC	2	10	28108	28117	20 %	40 %	20 %	20 %	512594206
586	NC_021496	GCA	2	6	28244	28249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512594206
587	NC_021496	CAA	2	6	28263	28268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512594206
588	NC_021496	TGC	2	6	28420	28425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512594206
589	NC_021496	GTT	3	9	28490	28498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512594206
590	NC_021496	TCTA	2	8	28513	28520	25 %	50 %	0 %	25 %	512594206
591	NC_021496	AAGC	2	8	28698	28705	50 %	0 %	25 %	25 %	512594206
592	NC_021496	AGC	2	6	28723	28728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512594206
593	NC_021496	CAG	2	6	28797	28802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512594206
594	NC_021496	A	6	6	28846	28851	100 %	0 %	0 %	0 %	512594206
595	NC_021496	TGG	2	6	28868	28873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512594206
596	NC_021496	ACG	2	6	28894	28899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512594206
597	NC_021496	TAG	2	6	28941	28946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512594206
598	NC_021496	ACC	2	6	28960	28965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512594206
599	NC_021496	TAA	2	6	28974	28979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512594206
600	NC_021496	CGAGT	2	10	29010	29019	20 %	20 %	40 %	20 %	512594206
601	NC_021496	TCA	2	6	29166	29171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594206
602	NC_021496	TAT	2	6	29172	29177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512594206
603	NC_021496	CTT	2	6	29184	29189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594206
604	NC_021496	CTT	2	6	29220	29225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594206
605	NC_021496	TCA	2	6	29309	29314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594206
606	NC_021496	TTA	2	6	29558	29563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512594206
607	NC_021496	CATT	2	8	29622	29629	25 %	50 %	0 %	25 %	512594206
608	NC_021496	AGC	2	6	29719	29724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512594206
609	NC_021496	TGAAAC	2	12	29752	29763	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	512594206
610	NC_021496	TTGAA	2	10	29779	29788	40 %	40 %	20 %	0 %	512594206
611	NC_021496	GAT	2	6	29798	29803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512594206
612	NC_021496	TTCA	2	8	29842	29849	25 %	50 %	0 %	25 %	512594206
613	NC_021496	GTT	2	6	29946	29951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512594206
614	NC_021496	AAG	2	6	29962	29967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512594206
615	NC_021496	CTT	2	6	30096	30101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594206
616	NC_021496	CTT	2	6	30124	30129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594206
617	NC_021496	AGC	2	6	30160	30165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512594206
618	NC_021496	TGT	3	9	30170	30178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512594206
619	NC_021496	CAG	2	6	30252	30257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512594206
620	NC_021496	TTG	2	6	30277	30282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512594206
621	NC_021496	GCT	2	6	30291	30296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512594206
622	NC_021496	CTT	2	6	30366	30371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594206
623	NC_021496	CTT	2	6	30388	30393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594206
624	NC_021496	GTT	2	6	30444	30449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512594206
625	NC_021496	CATC	2	8	30483	30490	25 %	25 %	0 %	50 %	512594206
626	NC_021496	GCA	2	6	30521	30526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512594206
627	NC_021496	CTT	2	6	30558	30563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594206
628	NC_021496	GAT	2	6	30584	30589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512594206
629	NC_021496	ATC	2	6	30688	30693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_021496	CTTT	2	8	30697	30704	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
631	NC_021496	GCG	2	6	30750	30755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_021496	AAT	2	6	30764	30769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_021496	GTA	2	6	30833	30838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_021496	CTT	2	6	30941	30946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_021496	ATTT	2	8	30950	30957	25 %	75 %	0 %	0 %	512594207
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646	NC_021496	CAA	2	6	31326	31331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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653	NC_021496	TACC	2	8	31760	31767	25 %	25 %	0 %	50 %	512594208
654	NC_021496	TGT	2	6	31793	31798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512594208
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666	NC_021496	CTT	2	6	32525	32530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594210
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742	NC_021496	AAAAG	2	10	36298	36307	80 %	0 %	20 %	0 %	512594215
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745	NC_021496	TTA	2	6	36454	36459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512594215
746	NC_021496	AATA	2	8	36536	36543	75 %	25 %	0 %	0 %	512594215
747	NC_021496	TTC	2	6	36550	36555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594215
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749	NC_021496	CCT	2	6	36684	36689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
750	NC_021496	GCTA	2	8	36700	36707	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
751	NC_021496	GATA	2	8	36716	36723	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
752	NC_021496	AAG	2	6	36779	36784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
753	NC_021496	GCT	2	6	36809	36814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.