MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri I5007

Total Repeats: 42583

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_021494	ATCA	2	8	1943796	1943803	50 %	25 %	0 %	25 %	512592399
42502	NC_021494	CTG	2	6	1943891	1943896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512592399
42503	NC_021494	TTC	2	6	1943937	1943942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512592399
42504	NC_021494	GAT	2	6	1944042	1944047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512592399
42505	NC_021494	AAG	2	6	1944096	1944101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512592399
42506	NC_021494	GTT	2	6	1944113	1944118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512592399
42507	NC_021494	TCT	2	6	1944124	1944129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512592399
42508	NC_021494	TCG	2	6	1944149	1944154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512592399
42509	NC_021494	TTC	2	6	1944159	1944164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512592399
42510	NC_021494	CAT	2	6	1944170	1944175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512592399
42511	NC_021494	GAC	2	6	1944350	1944355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512592399
42512	NC_021494	GAG	2	6	1944497	1944502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512592399
42513	NC_021494	CTT	2	6	1944533	1944538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512592399
42514	NC_021494	CAT	2	6	1944638	1944643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512592399
42515	NC_021494	TGC	2	6	1944696	1944701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512592399
42516	NC_021494	A	7	7	1944751	1944757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42517	NC_021494	TAA	2	6	1944776	1944781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42518	NC_021494	ACT	2	6	1944812	1944817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42519	NC_021494	CAA	2	6	1944874	1944879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42520	NC_021494	GTG	2	6	1944948	1944953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512592400
42521	NC_021494	ATT	2	6	1944954	1944959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512592400
42522	NC_021494	ACT	2	6	1945033	1945038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512592400
42523	NC_021494	CGC	2	6	1945044	1945049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512592400
42524	NC_021494	CTT	2	6	1945073	1945078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512592400
42525	NC_021494	AT	3	6	1945148	1945153	50 %	50 %	0 %	0 %	512592400
42526	NC_021494	TAA	2	6	1945256	1945261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512592400
42527	NC_021494	TTG	2	6	1945356	1945361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512592400
42528	NC_021494	CCG	2	6	1945362	1945367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512592400
42529	NC_021494	CAG	2	6	1945376	1945381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512592400
42530	NC_021494	TTC	2	6	1945455	1945460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512592400
42531	NC_021494	TTA	2	6	1945490	1945495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512592400
42532	NC_021494	CGT	2	6	1945516	1945521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512592400
42533	NC_021494	GAA	2	6	1945553	1945558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512592400
42534	NC_021494	CTTTT	2	10	1945608	1945617	0 %	80 %	0 %	20 %	512592400
42535	NC_021494	CTT	2	6	1945619	1945624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512592400
42536	NC_021494	TTG	2	6	1945628	1945633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512592400
42537	NC_021494	TAAT	2	8	1945671	1945678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42538	NC_021494	TAAA	2	8	1945701	1945708	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42539	NC_021494	CAA	2	6	1945717	1945722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42540	NC_021494	TAA	2	6	1945741	1945746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42541	NC_021494	CCG	2	6	1945754	1945759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512592401
42542	NC_021494	TTCACG	2	12	1945829	1945840	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512592401
42543	NC_021494	TAC	2	6	1945898	1945903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512592401
42544	NC_021494	GAA	2	6	1945943	1945948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512592401
42545	NC_021494	T	7	7	1945992	1945998	0 %	100 %	0 %	0 %	512592401
42546	NC_021494	AAT	2	6	1946040	1946045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512592401
42547	NC_021494	ATG	2	6	1946061	1946066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512592401
42548	NC_021494	CTT	2	6	1946212	1946217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512592401
42549	NC_021494	TGA	2	6	1946270	1946275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512592401
42550	NC_021494	GAG	2	6	1946302	1946307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512592401
42551	NC_021494	TCA	2	6	1946323	1946328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512592401
42552	NC_021494	TTTG	2	8	1946334	1946341	0 %	75 %	25 %	0 %	512592401
42553	NC_021494	GAT	3	9	1946372	1946380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512592401
42554	NC_021494	AGCA	2	8	1946509	1946516	50 %	0 %	25 %	25 %	512592401
42555	NC_021494	T	7	7	1946561	1946567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42556	NC_021494	T	6	6	1946596	1946601	0 %	100 %	0 %	0 %	512592402
42557	NC_021494	TAA	2	6	1946732	1946737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512592402
42558	NC_021494	CGC	2	6	1946751	1946756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512592402
42559	NC_021494	TCT	2	6	1946788	1946793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512592402
42560	NC_021494	T	6	6	1946913	1946918	0 %	100 %	0 %	0 %	512592402
42561	NC_021494	CTGCC	2	10	1947029	1947038	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
42562	NC_021494	CA	3	6	1947040	1947045	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42563	NC_021494	A	7	7	1947048	1947054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42564	NC_021494	ATA	2	6	1947085	1947090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512592403
42565	NC_021494	CTT	2	6	1947185	1947190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512592403
42566	NC_021494	CCT	2	6	1947221	1947226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42567	NC_021494	TGGTT	2	10	1947239	1947248	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
42568	NC_021494	GTA	2	6	1947287	1947292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42569	NC_021494	AC	3	6	1947295	1947300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42570	NC_021494	TAA	2	6	1947311	1947316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42571	NC_021494	T	7	7	1947337	1947343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42572	NC_021494	ATT	2	6	1947345	1947350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42573	NC_021494	AAT	2	6	1947365	1947370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42574	NC_021494	CAA	2	6	1947411	1947416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42575	NC_021494	ACC	2	6	1947469	1947474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42576	NC_021494	CT	3	6	1947492	1947497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42577	NC_021494	ACT	2	6	1947503	1947508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42578	NC_021494	ATT	2	6	1947586	1947591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42579	NC_021494	AC	3	6	1947597	1947602	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42580	NC_021494	T	6	6	1947617	1947622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42581	NC_021494	ATT	2	6	1947623	1947628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42582	NC_021494	AGG	2	6	1947693	1947698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42583	NC_021494	ATT	2	6	1947701	1947706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.