MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp4

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021234	CTTCA	2	10	2070	2079	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_021234	AATTA	2	10	2356	2365	60 %	40 %	0 %	0 %	501148391
3	NC_021234	ACCAT	2	10	3108	3117	40 %	20 %	0 %	40 %	501148392
4	NC_021234	GAATA	2	10	3500	3509	60 %	20 %	20 %	0 %	501148392
5	NC_021234	GATTA	2	10	4452	4461	40 %	40 %	20 %	0 %	501148392
6	NC_021234	TTGCA	2	10	4800	4809	20 %	40 %	20 %	20 %	501148392
7	NC_021234	ATTCT	2	10	5181	5190	20 %	60 %	0 %	20 %	501148393
8	NC_021234	GAAGA	2	10	5297	5306	60 %	0 %	40 %	0 %	501148393
9	NC_021234	ATTAT	2	10	7037	7046	40 %	60 %	0 %	0 %	501148395
10	NC_021234	TTAAA	2	10	7139	7148	60 %	40 %	0 %	0 %	501148395
11	NC_021234	AAAAT	2	10	7978	7987	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021234	GATTT	2	10	8086	8095	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021234	AGCGA	2	10	10261	10270	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_021234	AGCTT	2	10	12108	12117	20 %	40 %	20 %	20 %	501148402
15	NC_021234	AAATC	2	10	12522	12531	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_021234	TACCT	2	10	14824	14833	20 %	40 %	0 %	40 %	501148405
17	NC_021234	TACCT	2	10	15619	15628	20 %	40 %	0 %	40 %	501148405
18	NC_021234	AGCAA	2	10	15886	15895	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_021234	ATTTA	2	10	16276	16285	40 %	60 %	0 %	0 %	501148407
20	NC_021234	CCTCA	2	10	17543	17552	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
21	NC_021234	TTTAG	2	10	18644	18653	20 %	60 %	20 %	0 %	501148408
22	NC_021234	TGGTT	2	10	20005	20014	0 %	60 %	40 %	0 %	501148409
23	NC_021234	GACTA	2	10	23869	23878	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_021234	AAACA	2	10	24670	24679	80 %	0 %	0 %	20 %	501148411
25	NC_021234	AACAC	2	10	26152	26161	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_021234	ACTTT	2	10	29236	29245	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.