MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp4

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021234	TGGT	2	8	9	16	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021234	AGCC	2	8	930	937	25 %	0 %	25 %	50 %	501148389
3	NC_021234	TGAT	2	8	2002	2009	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021234	TTTA	2	8	2126	2133	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021234	AATC	2	8	2371	2378	50 %	25 %	0 %	25 %	501148391
6	NC_021234	CTTA	2	8	3000	3007	25 %	50 %	0 %	25 %	501148392
7	NC_021234	CAAT	2	8	3161	3168	50 %	25 %	0 %	25 %	501148392
8	NC_021234	TCTA	2	8	3171	3178	25 %	50 %	0 %	25 %	501148392
9	NC_021234	TGTC	2	8	3490	3497	0 %	50 %	25 %	25 %	501148392
10	NC_021234	CTTT	2	8	3646	3653	0 %	75 %	0 %	25 %	501148392
11	NC_021234	ATAA	2	8	4552	4559	75 %	25 %	0 %	0 %	501148392
12	NC_021234	GATC	2	8	4863	4870	25 %	25 %	25 %	25 %	501148392
13	NC_021234	CAAT	2	8	4916	4923	50 %	25 %	0 %	25 %	501148392
14	NC_021234	TTGC	2	8	5027	5034	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021234	CGAA	2	8	5790	5797	50 %	0 %	25 %	25 %	501148394
16	NC_021234	AATC	2	8	6169	6176	50 %	25 %	0 %	25 %	501148394
17	NC_021234	ATCG	2	8	6298	6305	25 %	25 %	25 %	25 %	501148394
18	NC_021234	ACTA	2	8	6369	6376	50 %	25 %	0 %	25 %	501148394
19	NC_021234	CATT	2	8	6713	6720	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021234	CTAT	2	8	7219	7226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021234	CTTA	2	8	8005	8012	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021234	TGAG	2	8	8993	9000	25 %	25 %	50 %	0 %	501148399
23	NC_021234	ACTC	2	8	9079	9086	25 %	25 %	0 %	50 %	501148399
24	NC_021234	TCAA	2	8	9410	9417	50 %	25 %	0 %	25 %	501148399
25	NC_021234	CTTT	2	8	9539	9546	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021234	ATGA	2	8	9639	9646	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021234	GTTG	2	8	10353	10360	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021234	AAAG	2	8	10428	10435	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021234	GTCA	2	8	10579	10586	25 %	25 %	25 %	25 %	501148402
30	NC_021234	AAAG	2	8	10666	10673	75 %	0 %	25 %	0 %	501148402
31	NC_021234	AGAA	2	8	10746	10753	75 %	0 %	25 %	0 %	501148402
32	NC_021234	CTAA	2	8	10856	10863	50 %	25 %	0 %	25 %	501148402
33	NC_021234	GAAA	2	8	11162	11169	75 %	0 %	25 %	0 %	501148402
34	NC_021234	TTAA	2	8	11393	11400	50 %	50 %	0 %	0 %	501148402
35	NC_021234	CTCA	2	8	11458	11465	25 %	25 %	0 %	50 %	501148402
36	NC_021234	TAAA	2	8	11484	11491	75 %	25 %	0 %	0 %	501148402
37	NC_021234	AATT	2	8	11565	11572	50 %	50 %	0 %	0 %	501148402
38	NC_021234	AACG	2	8	11618	11625	50 %	0 %	25 %	25 %	501148402
39	NC_021234	GCAA	2	8	12040	12047	50 %	0 %	25 %	25 %	501148402
40	NC_021234	TTAT	2	8	12094	12101	25 %	75 %	0 %	0 %	501148402
41	NC_021234	TTAG	2	8	13343	13350	25 %	50 %	25 %	0 %	501148404
42	NC_021234	TGAA	2	8	13643	13650	50 %	25 %	25 %	0 %	501148404
43	NC_021234	GAAT	2	8	14181	14188	50 %	25 %	25 %	0 %	501148405
44	NC_021234	GCCA	2	8	14567	14574	25 %	0 %	25 %	50 %	501148405
45	NC_021234	TAAA	2	8	15570	15577	75 %	25 %	0 %	0 %	501148405
46	NC_021234	CAAG	2	8	15601	15608	50 %	0 %	25 %	25 %	501148405
47	NC_021234	GTTA	2	8	15673	15680	25 %	50 %	25 %	0 %	501148405
48	NC_021234	GTTG	2	8	18155	18162	0 %	50 %	50 %	0 %	501148408
49	NC_021234	TCAT	2	8	18479	18486	25 %	50 %	0 %	25 %	501148408
50	NC_021234	ACAA	2	8	18493	18500	75 %	0 %	0 %	25 %	501148408
51	NC_021234	CTGA	2	8	18965	18972	25 %	25 %	25 %	25 %	501148409
52	NC_021234	AATA	2	8	19220	19227	75 %	25 %	0 %	0 %	501148409
53	NC_021234	CCTT	2	8	19362	19369	0 %	50 %	0 %	50 %	501148409
54	NC_021234	TAAG	2	8	19577	19584	50 %	25 %	25 %	0 %	501148409
55	NC_021234	ATTC	2	8	19667	19674	25 %	50 %	0 %	25 %	501148409
56	NC_021234	ATAG	2	8	19790	19797	50 %	25 %	25 %	0 %	501148409
57	NC_021234	AATA	2	8	20391	20398	75 %	25 %	0 %	0 %	501148409
58	NC_021234	AATT	2	8	20898	20905	50 %	50 %	0 %	0 %	501148410
59	NC_021234	AATT	2	8	21042	21049	50 %	50 %	0 %	0 %	501148410
60	NC_021234	AATT	2	8	21665	21672	50 %	50 %	0 %	0 %	501148410
61	NC_021234	TGAC	2	8	22103	22110	25 %	25 %	25 %	25 %	501148410
62	NC_021234	CAAA	2	8	22825	22832	75 %	0 %	0 %	25 %	501148410
63	NC_021234	ATTG	2	8	23618	23625	25 %	50 %	25 %	0 %	501148410
64	NC_021234	AAAT	2	8	24423	24430	75 %	25 %	0 %	0 %	501148411
65	NC_021234	CTTT	2	8	24640	24647	0 %	75 %	0 %	25 %	501148411
66	NC_021234	TAAG	2	8	25418	25425	50 %	25 %	25 %	0 %	501148412
67	NC_021234	CTTT	2	8	25477	25484	0 %	75 %	0 %	25 %	501148412
68	NC_021234	TCCA	2	8	25739	25746	25 %	25 %	0 %	50 %	501148412
69	NC_021234	AAAT	2	8	25747	25754	75 %	25 %	0 %	0 %	501148412
70	NC_021234	TTTA	2	8	25946	25953	25 %	75 %	0 %	0 %	501148412
71	NC_021234	TAAC	2	8	25986	25993	50 %	25 %	0 %	25 %	501148412
72	NC_021234	AGTC	2	8	26196	26203	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_021234	ATTG	2	8	26219	26226	25 %	50 %	25 %	0 %	501148413
74	NC_021234	ATGG	2	8	28212	28219	25 %	25 %	50 %	0 %	501148415
75	NC_021234	TCAT	2	8	28701	28708	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021234	TTTG	2	8	29221	29228	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021234	TTCG	2	8	29410	29417	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_021234	AATG	2	8	29464	29471	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021234	TGAA	2	8	29661	29668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021234	CAAC	2	8	29733	29740	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021234	CTTT	2	8	29910	29917	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_021234	TTGC	2	8	29976	29983	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021234	GCAT	2	8	29986	29993	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_021234	AATT	2	8	30516	30523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.