MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp4

Total Repeats: 611

Go To Repeat Summary Page

< Previous 12Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021234	T	6	6	25009	25014	0 %	100 %	0 %	0 %	501148412
502	NC_021234	TAC	2	6	25034	25039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148412
503	NC_021234	T	8	8	25117	25124	0 %	100 %	0 %	0 %	501148412
504	NC_021234	TCA	2	6	25153	25158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148412
505	NC_021234	CAA	2	6	25180	25185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148412
506	NC_021234	TA	3	6	25222	25227	50 %	50 %	0 %	0 %	501148412
507	NC_021234	ATT	2	6	25335	25340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148412
508	NC_021234	AAT	2	6	25373	25378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148412
509	NC_021234	TAAG	2	8	25418	25425	50 %	25 %	25 %	0 %	501148412
510	NC_021234	T	7	7	25442	25448	0 %	100 %	0 %	0 %	501148412
511	NC_021234	CTTT	2	8	25477	25484	0 %	75 %	0 %	25 %	501148412
512	NC_021234	T	7	7	25511	25517	0 %	100 %	0 %	0 %	501148412
513	NC_021234	ATT	2	6	25589	25594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148412
514	NC_021234	ATC	2	6	25602	25607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148412
515	NC_021234	TA	3	6	25609	25614	50 %	50 %	0 %	0 %	501148412
516	NC_021234	TAG	2	6	25624	25629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148412
517	NC_021234	CTT	2	6	25663	25668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148412
518	NC_021234	GTG	2	6	25722	25727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148412
519	NC_021234	TCCA	2	8	25739	25746	25 %	25 %	0 %	50 %	501148412
520	NC_021234	AAAT	2	8	25747	25754	75 %	25 %	0 %	0 %	501148412
521	NC_021234	TGA	2	6	25811	25816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148412
522	NC_021234	ATA	2	6	25833	25838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148412
523	NC_021234	TGG	2	6	25862	25867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148412
524	NC_021234	AC	3	6	25872	25877	50 %	0 %	0 %	50 %	501148412
525	NC_021234	TTTA	2	8	25946	25953	25 %	75 %	0 %	0 %	501148412
526	NC_021234	GAA	2	6	25960	25965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148412
527	NC_021234	TAAC	2	8	25986	25993	50 %	25 %	0 %	25 %	501148412
528	NC_021234	TAA	2	6	26017	26022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148412
529	NC_021234	TAG	2	6	26090	26095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148412
530	NC_021234	AAC	2	6	26098	26103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148412
531	NC_021234	TA	3	6	26110	26115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021234	AACAC	2	10	26152	26161	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
533	NC_021234	AGTC	2	8	26196	26203	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
534	NC_021234	ATTG	2	8	26219	26226	25 %	50 %	25 %	0 %	501148413
535	NC_021234	T	6	6	26272	26277	0 %	100 %	0 %	0 %	501148413
536	NC_021234	AGA	2	6	26410	26415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_021234	AT	3	6	26420	26425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_021234	T	8	8	26425	26432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_021234	T	6	6	26442	26447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_021234	CCT	2	6	26451	26456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_021234	CTA	2	6	26502	26507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_021234	TGA	2	6	26512	26517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021234	TAC	2	6	26631	26636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_021234	TTC	2	6	26658	26663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_021234	T	6	6	26699	26704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021234	ATT	2	6	26850	26855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148414
547	NC_021234	A	6	6	26900	26905	100 %	0 %	0 %	0 %	501148414
548	NC_021234	AAC	2	6	26968	26973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148414
549	NC_021234	CTG	2	6	27158	27163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148414
550	NC_021234	CGT	2	6	27286	27291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_021234	CCA	2	6	27344	27349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_021234	GCC	2	6	27511	27516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_021234	CAA	2	6	27567	27572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_021234	ACG	2	6	27579	27584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_021234	T	7	7	27627	27633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_021234	GTA	2	6	27754	27759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021234	ACG	2	6	27801	27806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_021234	CTC	2	6	27900	27905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_021234	CAG	2	6	27934	27939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_021234	T	7	7	28052	28058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_021234	ATT	2	6	28091	28096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_021234	TAA	2	6	28115	28120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_021234	GGA	2	6	28162	28167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_021234	ATGG	2	8	28212	28219	25 %	25 %	50 %	0 %	501148415
565	NC_021234	CAA	2	6	28304	28309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148415
566	NC_021234	GCA	2	6	28353	28358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148415
567	NC_021234	GGC	2	6	28360	28365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148415
568	NC_021234	GTT	2	6	28390	28395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148415
569	NC_021234	GGC	2	6	28413	28418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148415
570	NC_021234	GAT	2	6	28426	28431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148415
571	NC_021234	TG	3	6	28445	28450	0 %	50 %	50 %	0 %	501148415
572	NC_021234	CAA	2	6	28466	28471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148415
573	NC_021234	TGC	2	6	28635	28640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_021234	TCAT	2	8	28701	28708	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
575	NC_021234	TGG	2	6	28755	28760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_021234	CA	3	6	28785	28790	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
577	NC_021234	AAT	2	6	28913	28918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021234	GATATG	2	12	29033	29044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_021234	ATG	3	9	29057	29065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_021234	ATG	2	6	29078	29083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_021234	TTG	2	6	29202	29207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021234	ATC	2	6	29213	29218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_021234	TTTG	2	8	29221	29228	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
584	NC_021234	ACTTT	2	10	29236	29245	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
585	NC_021234	ATG	2	6	29306	29311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_021234	CAA	2	6	29371	29376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_021234	CTT	2	6	29377	29382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_021234	TTCG	2	8	29410	29417	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
589	NC_021234	AATG	2	8	29464	29471	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
590	NC_021234	GGC	2	6	29506	29511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_021234	AAG	2	6	29559	29564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_021234	TTA	2	6	29637	29642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021234	TGAA	2	8	29661	29668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
594	NC_021234	CTG	2	6	29688	29693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_021234	TGG	2	6	29725	29730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_021234	CAAC	2	8	29733	29740	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
597	NC_021234	AGA	2	6	29845	29850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_021234	ATT	2	6	29903	29908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_021234	CTTT	2	8	29910	29917	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
600	NC_021234	TTGC	2	8	29976	29983	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
601	NC_021234	GCAT	2	8	29986	29993	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
602	NC_021234	CTA	2	6	30027	30032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_021234	ATG	2	6	30168	30173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_021234	TTA	2	6	30191	30196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_021234	GCC	2	6	30206	30211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_021234	AAT	2	6	30218	30223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_021234	GCT	2	6	30407	30412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_021234	GCT	2	6	30422	30427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_021234	AATT	2	8	30516	30523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_021234	GAT	2	6	30641	30646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_021234	ATT	2	6	30656	30661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous 12Next >