MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp1

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021233	AC	3	6	1604	1609	50 %	0 %	0 %	50 %	501148330
2	NC_021233	TG	3	6	1679	1684	0 %	50 %	50 %	0 %	501148330
3	NC_021233	AT	3	6	5791	5796	50 %	50 %	0 %	0 %	501148336
4	NC_021233	TA	4	8	7167	7174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021233	AT	3	6	7221	7226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021233	TA	5	10	7287	7296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021233	TA	3	6	7299	7304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021233	CA	3	6	7757	7762	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021233	AC	3	6	7997	8002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021233	AC	3	6	8017	8022	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021233	GT	3	6	8290	8295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021233	TA	3	6	8325	8330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021233	AT	3	6	8463	8468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021233	TA	3	6	8513	8518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021233	GT	3	6	8528	8533	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021233	CT	3	6	8663	8668	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021233	AG	3	6	8717	8722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021233	GT	3	6	9569	9574	0 %	50 %	50 %	0 %	501148339
19	NC_021233	TC	3	6	9876	9881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021233	TA	4	8	10041	10048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021233	AT	4	8	10061	10068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021233	TA	4	8	10070	10077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021233	TA	3	6	10079	10084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021233	GA	3	6	10881	10886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021233	AG	3	6	12346	12351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021233	TA	3	6	12808	12813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021233	AT	3	6	12954	12959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021233	AG	3	6	13055	13060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021233	TA	3	6	13137	13142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021233	TA	3	6	14433	14438	50 %	50 %	0 %	0 %	501148343
31	NC_021233	AT	3	6	14611	14616	50 %	50 %	0 %	0 %	501148343
32	NC_021233	GA	3	6	15178	15183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021233	CT	4	8	19423	19430	0 %	50 %	0 %	50 %	501148347
34	NC_021233	GA	3	6	21039	21044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021233	CG	3	6	21258	21263	0 %	0 %	50 %	50 %	501148349
36	NC_021233	CA	3	6	21415	21420	50 %	0 %	0 %	50 %	501148349
37	NC_021233	TA	3	6	21756	21761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021233	TA	3	6	24286	24291	50 %	50 %	0 %	0 %	501148352
39	NC_021233	TA	4	8	24881	24888	50 %	50 %	0 %	0 %	501148352
40	NC_021233	AC	3	6	25051	25056	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021233	AT	3	6	25624	25629	50 %	50 %	0 %	0 %	501148353
42	NC_021233	TC	3	6	28127	28132	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021233	TA	3	6	30276	30281	50 %	50 %	0 %	0 %	501148359
44	NC_021233	AT	3	6	31579	31584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021233	CT	3	6	33107	33112	0 %	50 %	0 %	50 %	501148363
46	NC_021233	AC	3	6	33963	33968	50 %	0 %	0 %	50 %	501148364
47	NC_021233	TA	3	6	35140	35145	50 %	50 %	0 %	0 %	501148366
48	NC_021233	AT	3	6	37845	37850	50 %	50 %	0 %	0 %	501148369
49	NC_021233	TG	4	8	38143	38150	0 %	50 %	50 %	0 %	501148369
50	NC_021233	GT	3	6	38256	38261	0 %	50 %	50 %	0 %	501148369
51	NC_021233	TA	3	6	39506	39511	50 %	50 %	0 %	0 %	501148370
52	NC_021233	AC	3	6	40312	40317	50 %	0 %	0 %	50 %	501148371
53	NC_021233	CG	3	6	40443	40448	0 %	0 %	50 %	50 %	501148372
54	NC_021233	AC	3	6	42503	42508	50 %	0 %	0 %	50 %	501148375
55	NC_021233	AT	3	6	44796	44801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021233	GA	3	6	46914	46919	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021233	TG	3	6	47248	47253	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021233	AT	3	6	48311	48316	50 %	50 %	0 %	0 %	501148381

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.