MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp2

Total Repeats: 899

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021225	AAT	2	6	26725	26730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_021225	GCAA	2	8	26742	26749	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
503	NC_021225	ATTG	2	8	26853	26860	25 %	50 %	25 %	0 %	501148270
504	NC_021225	GATC	2	8	26906	26913	25 %	25 %	25 %	25 %	501148270
505	NC_021225	T	6	6	26921	26926	0 %	100 %	0 %	0 %	501148270
506	NC_021225	TGT	2	6	26958	26963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148270
507	NC_021225	TGCAA	2	10	26967	26976	40 %	20 %	20 %	20 %	501148270
508	NC_021225	ATA	2	6	26981	26986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148270
509	NC_021225	A	6	6	27027	27032	100 %	0 %	0 %	0 %	501148270
510	NC_021225	TGG	2	6	27063	27068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148270
511	NC_021225	GGC	2	6	27069	27074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148270
512	NC_021225	A	7	7	27135	27141	100 %	0 %	0 %	0 %	501148270
513	NC_021225	GTT	2	6	27202	27207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148270
514	NC_021225	TAT	2	6	27215	27220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148270
515	NC_021225	TGA	2	6	27272	27277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148270
516	NC_021225	TAATC	2	10	27315	27324	40 %	40 %	0 %	20 %	501148270
517	NC_021225	TTA	2	6	27357	27362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148270
518	NC_021225	TA	3	6	27509	27514	50 %	50 %	0 %	0 %	501148270
519	NC_021225	ATT	2	6	27670	27675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148270
520	NC_021225	TTA	2	6	27752	27757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148270
521	NC_021225	A	6	6	27774	27779	100 %	0 %	0 %	0 %	501148270
522	NC_021225	TAA	2	6	27818	27823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148270
523	NC_021225	A	6	6	27857	27862	100 %	0 %	0 %	0 %	501148270
524	NC_021225	ACT	2	6	27907	27912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148270
525	NC_021225	T	6	6	27976	27981	0 %	100 %	0 %	0 %	501148270
526	NC_021225	TAT	2	6	28074	28079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148270
527	NC_021225	GAAA	2	8	28122	28129	75 %	0 %	25 %	0 %	501148270
528	NC_021225	CTT	2	6	28144	28149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148270
529	NC_021225	CT	3	6	28165	28170	0 %	50 %	0 %	50 %	501148270
530	NC_021225	TATTC	2	10	28267	28276	20 %	60 %	0 %	20 %	501148270
531	NC_021225	GACA	2	8	28279	28286	50 %	0 %	25 %	25 %	501148270
532	NC_021225	TGT	2	6	28383	28388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148270
533	NC_021225	ATC	2	6	28457	28462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148270
534	NC_021225	TTA	2	6	28544	28549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148270
535	NC_021225	AAC	2	6	28556	28561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148270
536	NC_021225	CAG	2	6	28562	28567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148270
537	NC_021225	TAGA	2	8	28598	28605	50 %	25 %	25 %	0 %	501148270
538	NC_021225	GATT	2	8	28607	28614	25 %	50 %	25 %	0 %	501148270
539	NC_021225	GGCG	2	8	28615	28622	0 %	0 %	75 %	25 %	501148270
540	NC_021225	ATGGT	2	10	28659	28668	20 %	40 %	40 %	0 %	501148270
541	NC_021225	AGA	2	6	28689	28694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148270
542	NC_021225	TTAT	2	8	28705	28712	25 %	75 %	0 %	0 %	501148270
543	NC_021225	ATC	2	6	28754	28759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148270
544	NC_021225	TAAG	2	8	28769	28776	50 %	25 %	25 %	0 %	501148270
545	NC_021225	AGT	2	6	28795	28800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021225	CAA	2	6	28808	28813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_021225	TAA	2	6	28875	28880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_021225	TAT	2	6	28915	28920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_021225	TGC	2	6	28986	28991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_021225	CTA	2	6	29021	29026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_021225	TGA	2	6	29055	29060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021225	TTA	2	6	29092	29097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_021225	AGT	2	6	29110	29115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_021225	GAT	2	6	29161	29166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_021225	ATC	2	6	29179	29184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148271
556	NC_021225	AAC	2	6	29213	29218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148271
557	NC_021225	AAC	2	6	29317	29322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148271
558	NC_021225	GATT	2	8	29398	29405	25 %	50 %	25 %	0 %	501148271
559	NC_021225	TAATT	2	10	29411	29420	40 %	60 %	0 %	0 %	501148271
560	NC_021225	CGA	2	6	29445	29450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148271
561	NC_021225	ACA	2	6	29585	29590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148271
562	NC_021225	T	6	6	29612	29617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_021225	TAAA	2	8	29643	29650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_021225	TGAAG	2	10	29697	29706	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021225	ATT	2	6	29724	29729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_021225	AAT	2	6	29743	29748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021225	TAAT	2	8	29766	29773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_021225	A	6	6	29807	29812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_021225	AT	3	6	29819	29824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_021225	T	6	6	29836	29841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_021225	GAAC	2	8	29879	29886	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
572	NC_021225	T	6	6	29915	29920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_021225	TAAG	2	8	29968	29975	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
574	NC_021225	GA	3	6	29976	29981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_021225	CAAAT	2	10	30033	30042	60 %	20 %	0 %	20 %	501148272
576	NC_021225	A	6	6	30069	30074	100 %	0 %	0 %	0 %	501148272
577	NC_021225	ACT	2	6	30101	30106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148272
578	NC_021225	CG	3	6	30195	30200	0 %	0 %	50 %	50 %	501148272
579	NC_021225	GTT	2	6	30223	30228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148272
580	NC_021225	CA	3	6	30352	30357	50 %	0 %	0 %	50 %	501148272
581	NC_021225	GTT	2	6	30391	30396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148272
582	NC_021225	TGA	2	6	30424	30429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148272
583	NC_021225	CAGAT	2	10	30431	30440	40 %	20 %	20 %	20 %	501148272
584	NC_021225	GAT	2	6	30478	30483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148272
585	NC_021225	ACGC	2	8	30508	30515	25 %	0 %	25 %	50 %	501148272
586	NC_021225	AGC	2	6	30516	30521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148272
587	NC_021225	ATTT	2	8	30557	30564	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_021225	AAT	2	6	30600	30605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_021225	AGT	2	6	30636	30641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_021225	TA	3	6	30693	30698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_021225	AGTT	2	8	30787	30794	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
592	NC_021225	ATA	2	6	30847	30852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021225	GATG	2	8	30863	30870	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
594	NC_021225	CAA	2	6	30926	30931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_021225	TAA	2	6	30933	30938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_021225	TAT	2	6	30998	31003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_021225	TAA	2	6	31020	31025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_021225	GCT	2	6	31090	31095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148273
599	NC_021225	AAT	2	6	31170	31175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148273
600	NC_021225	CTA	2	6	31211	31216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148273
601	NC_021225	CTT	2	6	31250	31255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148273
602	NC_021225	TCGC	2	8	31290	31297	0 %	25 %	25 %	50 %	501148273
603	NC_021225	CAG	2	6	31427	31432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148273
604	NC_021225	ATC	2	6	31434	31439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148273
605	NC_021225	CTA	2	6	31445	31450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148273
606	NC_021225	ATT	2	6	31474	31479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148273
607	NC_021225	TGA	2	6	31497	31502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148274
608	NC_021225	AGC	2	6	31514	31519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148274
609	NC_021225	CAA	2	6	31579	31584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148274
610	NC_021225	AAT	2	6	31598	31603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148274
611	NC_021225	GAA	2	6	31643	31648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148274
612	NC_021225	A	6	6	31683	31688	100 %	0 %	0 %	0 %	501148274
613	NC_021225	ACC	2	6	31708	31713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148274
614	NC_021225	TCA	2	6	31774	31779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148274
615	NC_021225	ATT	2	6	31844	31849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148274
616	NC_021225	GAC	2	6	31939	31944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148274
617	NC_021225	TAA	2	6	32036	32041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148274
618	NC_021225	TAGA	2	8	32119	32126	50 %	25 %	25 %	0 %	501148274
619	NC_021225	GAA	2	6	32141	32146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148274
620	NC_021225	TAA	2	6	32195	32200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148274
621	NC_021225	AAC	2	6	32210	32215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148274
622	NC_021225	TCC	2	6	32277	32282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501148274
623	NC_021225	TCA	3	9	32283	32291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148274
624	NC_021225	CGC	2	6	32452	32457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501148274
625	NC_021225	AAT	2	6	32510	32515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148274
626	NC_021225	ACA	2	6	32523	32528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148274
627	NC_021225	TAA	2	6	32561	32566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148274
628	NC_021225	GACA	2	8	32831	32838	50 %	0 %	25 %	25 %	501148274
629	NC_021225	TAG	2	6	32840	32845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148274
630	NC_021225	TCT	2	6	32994	32999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_021225	TTC	2	6	33053	33058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_021225	T	7	7	33146	33152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_021225	ATT	2	6	33166	33171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_021225	ATT	2	6	33210	33215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148275
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899	NC_021225	TTTG	2	8	46497	46504	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.