MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Lactobacillus acidophilus La-14

Total Repeats: 1016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021181	TGATAT	2	12	1047	1058	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	488766821
2	NC_021181	ATATTT	2	12	3589	3600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488766824
3	NC_021181	GGAGAA	2	12	4267	4278	50 %	0 %	50 %	0 %	488766824
4	NC_021181	ATCCAG	2	12	4845	4856	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	488766825
5	NC_021181	ACTAAG	2	12	5348	5359	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488766825
6	NC_021181	TGCAAG	2	12	7193	7204	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488766826
7	NC_021181	TGAAGA	2	12	7748	7759	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	488766826
8	NC_021181	TAATTT	2	12	9227	9238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488766827
9	NC_021181	GCAGAA	2	12	12457	12468	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	488766831
10	NC_021181	TGAAGT	2	12	14020	14031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488766832
11	NC_021181	GCTAAA	2	12	17636	17647	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488766836
12	NC_021181	TTCATA	2	12	18883	18894	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	488766838
13	NC_021181	TAATTA	2	12	21536	21547	50 %	50 %	0 %	0 %	488766841
14	NC_021181	AATTCA	2	12	21840	21851	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	488766841
15	NC_021181	GAAAAA	2	12	26694	26705	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	488766846
16	NC_021181	ACAAAA	2	12	27499	27510	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	488766847
17	NC_021181	TTAAAA	2	12	27537	27548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488766847
18	NC_021181	CAAGTA	2	12	32253	32264	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488766854
19	NC_021181	ATAAAA	2	12	32461	32472	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	488766854
20	NC_021181	TAAAAA	2	12	32563	32574	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	488766854
21	NC_021181	CTTTGT	2	12	35257	35268	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	488766858
22	NC_021181	ATTATG	2	12	38936	38947	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	488766860
23	NC_021181	AGTAAA	2	12	42442	42453	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488766865
24	NC_021181	TGGTGA	2	12	48674	48685	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	488766870
25	NC_021181	GCTAAT	2	12	48732	48743	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488766870
26	NC_021181	AAAGGC	2	12	48746	48757	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	488766870
27	NC_021181	ATATTT	2	12	53933	53944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488766876
28	NC_021181	ATGAAG	2	12	56072	56083	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	488766877
29	NC_021181	CATTTA	2	12	56734	56745	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	488766877
30	NC_021181	AAGCGA	3	18	59015	59032	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_021181	CGGAGC	2	12	61675	61686	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021181	AGCGAA	2	12	62898	62909	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_021181	TACTTT	2	12	64466	64477	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021181	GCAAAA	2	12	75751	75762	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	488766892
35	NC_021181	CTTTTC	2	12	78150	78161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488766894
36	NC_021181	ATTCAA	2	12	80859	80870	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	488766896
37	NC_021181	TAAAGA	2	12	87514	87525	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488766901
38	NC_021181	AATTGC	2	12	89288	89299	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488766904
39	NC_021181	TTGGAA	2	12	89444	89455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488766904
40	NC_021181	GTGCTG	2	12	90157	90168	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	488766904
41	NC_021181	TTTGGT	2	12	91052	91063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488766905
42	NC_021181	TTTTTC	2	12	94243	94254	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	488766909
43	NC_021181	AGTATT	2	12	99366	99377	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	488766915
44	NC_021181	GATATA	2	12	102050	102061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488766917
45	NC_021181	GAAAAA	2	12	102336	102347	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	488766918
46	NC_021181	TAAATT	2	12	102558	102569	50 %	50 %	0 %	0 %	488766919
47	NC_021181	TAATCC	2	12	105319	105330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488766921
48	NC_021181	CTTTTT	2	12	106975	106986	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	488766923
49	NC_021181	AACTTG	2	12	108314	108325	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488766925
50	NC_021181	TAGTAA	2	12	108388	108399	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488766925
51	NC_021181	ATAAAT	2	12	110634	110645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488766926
52	NC_021181	GCTTCT	2	12	110734	110745	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	488766926
53	NC_021181	CATAAT	2	12	112597	112608	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021181	CTTATT	2	12	113681	113692	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	488766932
55	NC_021181	ATAAAT	2	12	114228	114239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488766933
56	NC_021181	AACTTC	2	12	115530	115541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488766934
57	NC_021181	GAAAAT	2	12	118300	118311	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021181	TGATAT	2	12	120141	120152	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	488766939
59	NC_021181	CTATTG	2	12	124817	124828	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	488766943
60	NC_021181	TTGATG	2	12	125773	125784	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	488766944
61	NC_021181	ATCAGG	2	12	128592	128603	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488766947
62	NC_021181	TAAAAG	2	12	129214	129225	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488766947
63	NC_021181	TGTTAG	2	12	129351	129362	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	488766948
64	NC_021181	GTAATT	2	12	129701	129712	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	488766948
65	NC_021181	GATAAA	2	12	130749	130760	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488766949
66	NC_021181	AGCTGC	2	12	131018	131029	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	488766949
67	NC_021181	AATAAA	2	12	132056	132067	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	488766950
68	NC_021181	TTAGTG	2	12	132968	132979	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	488766951
69	NC_021181	AATAAG	2	12	135134	135145	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488766953
70	NC_021181	CATCTT	2	12	138134	138145	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	488766955
71	NC_021181	TTTGAT	2	12	138362	138373	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	488766955
72	NC_021181	CTTTTA	2	12	140115	140126	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_021181	GAAGTC	2	12	140465	140476	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488766957
74	NC_021181	GTTTTT	2	12	140883	140894	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	488766957
75	NC_021181	TTTAAC	2	12	140929	140940	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_021181	TAAGCA	2	12	146152	146163	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488766965
77	NC_021181	AGTGAA	2	12	148520	148531	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	488766968
78	NC_021181	TTTGAT	2	12	148736	148747	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	488766968
79	NC_021181	CGATTT	2	12	149062	149073	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	488766968
80	NC_021181	CAAAGG	2	12	150343	150354	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	488766969
81	NC_021181	CTAAGA	2	12	151843	151854	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488766970
82	NC_021181	AGAATT	2	12	153832	153843	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488766971
83	NC_021181	TGGTCT	2	12	155561	155572	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	488766972
84	NC_021181	ATTGAT	2	12	155944	155955	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	488766973
85	NC_021181	AAATGA	2	12	156950	156961	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488766974
86	NC_021181	GCCTTG	2	12	157970	157981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488766975
87	NC_021181	TTCATT	2	12	159403	159414	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	488766976
88	NC_021181	ACGAAT	2	12	162393	162404	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488766977
89	NC_021181	GTAACA	2	12	162792	162803	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488766977
90	NC_021181	TTGTTC	2	12	164215	164226	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	488766979
91	NC_021181	AGCGCC	2	12	164563	164574	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	488766979
92	NC_021181	CGTTGA	2	12	167526	167537	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	488766982
93	NC_021181	AGCTTT	2	12	168002	168013	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	488766982
94	NC_021181	TAAATT	2	12	169333	169344	50 %	50 %	0 %	0 %	488766983
95	NC_021181	CATCAA	2	12	170109	170120	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	488766984
96	NC_021181	AAAGGA	2	12	174225	174236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488766987
97	NC_021181	TACGAT	2	12	174810	174821	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488766987
98	NC_021181	ATTAGA	2	12	178234	178245	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488766990
99	NC_021181	AGAGAA	2	12	180733	180744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488766994
100	NC_021181	GTTTTA	2	12	181754	181765	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	488766994
101	NC_021181	AAGAAC	2	12	191973	191984	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	488767002
102	NC_021181	CAAAAG	2	12	192180	192191	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	488767002
103	NC_021181	GTATCA	2	12	192525	192536	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488767002
104	NC_021181	TGGTGT	2	12	195375	195386	0 %	50 %	50 %	0 %	488767004
105	NC_021181	CAACTG	2	12	196456	196467	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	488767005
106	NC_021181	TCCAGA	2	12	199907	199918	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	488767008
107	NC_021181	TGACGA	2	12	202509	202520	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488767011
108	NC_021181	GATAAG	2	12	205069	205080	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	488767014
109	NC_021181	AAGATG	2	12	205205	205216	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	488767014
110	NC_021181	TCAGGT	2	12	207395	207406	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	488767017
111	NC_021181	TGAAGA	2	12	209866	209877	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	488767018
112	NC_021181	TCTAAA	2	12	210407	210418	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	488767018
113	NC_021181	ATCTGA	2	12	213230	213241	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488767021
114	NC_021181	AACTTT	2	12	217236	217247	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	488767026
115	NC_021181	TCAACT	2	12	218271	218282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488767027
116	NC_021181	AGACTA	2	12	218886	218897	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488767028
117	NC_021181	GCTTCA	2	12	219227	219238	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	488767028
118	NC_021181	AAGAAA	2	12	219545	219556	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	488767028
119	NC_021181	CTCGTG	2	12	221016	221027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488767029
120	NC_021181	CGTCAC	2	12	230840	230851	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	488767038
121	NC_021181	AAAATG	2	12	231621	231632	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488767039
122	NC_021181	GTATTC	2	12	231960	231971	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	488767039
123	NC_021181	TTGATC	2	12	233196	233207	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	488767041
124	NC_021181	ATTTTA	2	12	235477	235488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488767043
125	NC_021181	GCCTAA	2	12	235813	235824	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	488767044
126	NC_021181	AACGGC	2	12	236875	236886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488767044
127	NC_021181	CACCGA	2	12	237094	237105	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	488767045
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129	NC_021181	GCAATT	2	12	244286	244297	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_021181	AAAGAA	2	12	245191	245202	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021181	CAACTC	2	12	247959	247970	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	488767057
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140	NC_021181	CTGGTA	2	12	270139	270150	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	488767080
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159	NC_021181	CTGATG	2	12	304561	304572	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	488767121
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167	NC_021181	TGATAA	2	12	318191	318202	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488767136
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181	NC_021181	TCGAAG	2	12	339957	339968	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488767162
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226	NC_021181	CGGAGC	2	12	436663	436674	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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228	NC_021181	CTTTGG	2	12	441598	441609	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	488767252
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230	NC_021181	AATAAA	2	12	448667	448678	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
231	NC_021181	GATACT	2	12	449083	449094	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488767258
232	NC_021181	TAAGTT	2	12	450714	450725	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
233	NC_021181	TAAATT	2	12	450910	450921	50 %	50 %	0 %	0 %	488767259
234	NC_021181	CTTAGG	2	12	452429	452440	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	488767260
235	NC_021181	CATCTT	2	12	454155	454166	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	488767262
236	NC_021181	ACCTGA	2	12	454363	454374	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	488767262
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462	NC_021181	ACATTT	2	12	892850	892861	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	488767687
463	NC_021181	GCTAAG	2	12	894633	894644	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488767689
464	NC_021181	TAAAGT	2	12	897705	897716	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488767693
465	NC_021181	TTGATA	2	12	900753	900764	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	488767696
466	NC_021181	GCAGTA	2	12	902986	902997	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488767699
467	NC_021181	TAATAT	2	12	903603	903614	50 %	50 %	0 %	0 %	488767699
468	NC_021181	AAATTC	2	12	907656	907667	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	488767703
469	NC_021181	AAGTTG	2	12	910439	910450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488767706
470	NC_021181	TATTGA	2	12	910644	910655	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	488767706
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472	NC_021181	AAAATA	2	12	914134	914145	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	488767708
473	NC_021181	AATTAA	2	12	919222	919233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488767713
474	NC_021181	AAGAAA	2	12	923609	923620	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	488767717
475	NC_021181	TTTATC	2	12	924039	924050	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	488767717
476	NC_021181	TGATTT	2	12	924129	924140	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	488767717
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481	NC_021181	AAGGTA	2	12	939458	939469	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	488767732
482	NC_021181	ATATTA	2	12	939699	939710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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492	NC_021181	GCAATG	2	12	950592	950603	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488767745
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496	NC_021181	CGTCTT	2	12	962328	962339	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	488767755
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