MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-8 DNA

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020828	CAA	2	6	37	42	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020828	GCT	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020828	TGT	2	6	635	640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020828	CTG	2	6	737	742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020828	TGA	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020828	AAG	2	6	1151	1156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020828	ATT	2	6	1159	1164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020828	CTG	2	6	1201	1206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020828	GTG	2	6	1640	1645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020828	ATT	2	6	1983	1988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279774
11	NC_020828	AAC	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279774
12	NC_020828	AAT	2	6	2073	2078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279774
13	NC_020828	GAT	2	6	2088	2093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279774
14	NC_020828	GTA	2	6	2140	2145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279774
15	NC_020828	TTG	2	6	2194	2199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279774
16	NC_020828	CTT	2	6	2253	2258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279774
17	NC_020828	AAT	2	6	2259	2264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279774
18	NC_020828	AAC	2	6	2357	2362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279774
19	NC_020828	AGA	2	6	2384	2389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279774
20	NC_020828	AGA	2	6	2471	2476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279774
21	NC_020828	AAG	2	6	2782	2787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279774
22	NC_020828	TGA	2	6	2847	2852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279775
23	NC_020828	CAA	2	6	3004	3009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279775
24	NC_020828	CAA	2	6	3036	3041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279775
25	NC_020828	AAT	2	6	3046	3051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279775
26	NC_020828	AAG	2	6	3069	3074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279775
27	NC_020828	TAC	2	6	3114	3119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279775
28	NC_020828	CAA	2	6	3127	3132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279775
29	NC_020828	CAA	3	9	3163	3171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279775
30	NC_020828	AAC	2	6	3180	3185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279775
31	NC_020828	AGA	2	6	3189	3194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279775
32	NC_020828	AGA	2	6	3282	3287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279775
33	NC_020828	TGG	2	6	3319	3324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279775
34	NC_020828	TTA	2	6	3401	3406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020828	GAA	2	6	3418	3423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020828	AAT	2	6	3494	3499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020828	GAT	2	6	3685	3690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279776
38	NC_020828	TGA	2	6	3709	3714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279776
39	NC_020828	TAT	2	6	3943	3948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279776
40	NC_020828	ATT	3	9	4021	4029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279776
41	NC_020828	GAC	2	6	4172	4177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020828	AGC	2	6	4275	4280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020828	AGT	2	6	4330	4335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020828	ATG	2	6	4355	4360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020828	ATT	2	6	4477	4482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020828	AAT	2	6	4748	4753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020828	ATG	2	6	4774	4779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020828	TGC	2	6	4944	4949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020828	TAC	2	6	4967	4972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279777
50	NC_020828	GTG	2	6	5076	5081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279777
51	NC_020828	CAA	2	6	5232	5237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279777
52	NC_020828	TAG	2	6	5280	5285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279777
53	NC_020828	TAT	2	6	5562	5567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020828	CAA	2	6	5597	5602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020828	TGC	2	6	5734	5739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279778
56	NC_020828	TCA	2	6	5767	5772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279778
57	NC_020828	AGC	2	6	5789	5794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279778
58	NC_020828	AGT	2	6	5816	5821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279778
59	NC_020828	CTT	2	6	5847	5852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279778
60	NC_020828	AGT	2	6	5861	5866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279778
61	NC_020828	CTA	2	6	5886	5891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279778
62	NC_020828	CTA	2	6	5895	5900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279778
63	NC_020828	CAA	2	6	5903	5908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279778
64	NC_020828	TTC	2	6	5914	5919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279778
65	NC_020828	AGT	2	6	5930	5935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279778
66	NC_020828	CAG	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279778
67	NC_020828	TAC	2	6	5962	5967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279778
68	NC_020828	AAC	2	6	6242	6247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_020828	CGC	2	6	6297	6302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_020828	TCT	2	6	6376	6381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279779
71	NC_020828	ATC	2	6	6657	6662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279779
72	NC_020828	ATA	2	6	6663	6668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279779
73	NC_020828	TTC	2	6	6766	6771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279779
74	NC_020828	TTA	2	6	6856	6861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279779
75	NC_020828	TCT	2	6	7003	7008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279779
76	NC_020828	TGT	2	6	7041	7046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279779
77	NC_020828	ATC	2	6	7065	7070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279779
78	NC_020828	ATC	2	6	7074	7079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279779
79	NC_020828	ACT	2	6	7098	7103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279779
80	NC_020828	ATA	2	6	7171	7176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279779
81	NC_020828	ATC	2	6	7260	7265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279779
82	NC_020828	ATT	2	6	7372	7377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020828	CTT	2	6	7395	7400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020828	GCG	2	6	7535	7540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020828	CCA	2	6	7685	7690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_020828	TTC	2	6	7745	7750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020828	CTT	2	6	7897	7902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020828	TCA	2	6	7910	7915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020828	AAT	2	6	7925	7930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020828	ATT	2	6	7943	7948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020828	TCT	2	6	7949	7954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020828	TTC	2	6	7957	7962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020828	TCA	2	6	7988	7993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020828	TAA	2	6	8035	8040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020828	ACT	2	6	8062	8067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_020828	GAT	2	6	8076	8081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020828	ATC	2	6	8406	8411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020828	GTT	2	6	8420	8425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020828	TAA	2	6	8426	8431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020828	AGC	2	6	8448	8453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020828	TAA	2	6	8492	8497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020828	ATT	3	9	8520	8528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.