MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-9 DNA

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020825	CTA	2	6	300	305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020825	TAG	2	6	410	415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020825	ACT	2	6	421	426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020825	AAG	2	6	641	646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279721
5	NC_020825	TCA	2	6	714	719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020825	CTC	2	6	807	812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279722
7	NC_020825	TCA	2	6	835	840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279722
8	NC_020825	AAT	2	6	974	979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279722
9	NC_020825	TCT	2	6	1000	1005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279722
10	NC_020825	CTT	2	6	1016	1021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279722
11	NC_020825	TCA	2	6	1054	1059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279722
12	NC_020825	ATT	2	6	1252	1257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020825	GAA	2	6	1276	1281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279723
14	NC_020825	AAT	2	6	1490	1495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279723
15	NC_020825	CTA	2	6	1683	1688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279723
16	NC_020825	TTG	2	6	1726	1731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279723
17	NC_020825	GTA	2	6	1791	1796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279723
18	NC_020825	TCG	2	6	1830	1835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279724
19	NC_020825	TTC	2	6	1902	1907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279724
20	NC_020825	TTG	2	6	1923	1928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279724
21	NC_020825	CGT	2	6	1989	1994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279724
22	NC_020825	GCT	2	6	2051	2056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279724
23	NC_020825	GCT	2	6	2098	2103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279724
24	NC_020825	GTT	2	6	2129	2134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279724
25	NC_020825	TAA	2	6	2157	2162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279724
26	NC_020825	GAT	2	6	2285	2290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279724
27	NC_020825	ATT	2	6	2367	2372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279724
28	NC_020825	CTG	2	6	2658	2663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279724
29	NC_020825	CTT	2	6	2729	2734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279724
30	NC_020825	ATT	2	6	2929	2934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279724
31	NC_020825	TGA	2	6	2979	2984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279724
32	NC_020825	CGG	2	6	3154	3159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020825	TGA	2	6	3328	3333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020825	GAA	2	6	3383	3388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020825	CAA	2	6	3440	3445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020825	AAC	2	6	3453	3458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020825	GCC	2	6	3515	3520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279725
38	NC_020825	ACG	2	6	3630	3635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279725
39	NC_020825	ACC	2	6	3687	3692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279725
40	NC_020825	TTA	2	6	3776	3781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279725
41	NC_020825	GAC	2	6	3894	3899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279725
42	NC_020825	AGG	2	6	4065	4070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020825	TAT	2	6	4090	4095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020825	AAG	2	6	4401	4406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020825	CTT	2	6	4431	4436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020825	ATA	2	6	4481	4486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020825	CAC	2	6	4500	4505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_020825	CAA	2	6	4672	4677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020825	AGA	2	6	4694	4699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020825	AAC	2	6	4704	4709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020825	CAA	2	6	4777	4782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020825	TAC	2	6	4810	4815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020825	CCG	2	6	4819	4824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_020825	AAT	2	6	4826	4831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020825	AAC	2	6	4869	4874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_020825	ATA	2	6	4929	4934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020825	AAG	2	6	5100	5105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279726
58	NC_020825	AAT	2	6	5150	5155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279726
59	NC_020825	GTA	2	6	5269	5274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279726
60	NC_020825	CAC	2	6	5314	5319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279726
61	NC_020825	TCC	2	6	5405	5410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279726
62	NC_020825	TAA	2	6	5521	5526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279726
63	NC_020825	CCT	2	6	5541	5546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279726
64	NC_020825	AAT	2	6	5622	5627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020825	TTA	2	6	5630	5635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020825	CAA	2	6	5704	5709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020825	CTT	2	6	5766	5771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020825	AAC	2	6	5832	5837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.